Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C480

Protein Details
Accession Q6C480    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-37NFHVALKHHKMPPKKKSKLFNARRIIVQNHydrophilic
84-112RSLRRRAASHDVKRIPKRLRARARQEMANHydrophilic
210-233FSIPEKPSQKCYRKTHRGIKHEGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-26HKMPPKKKSK
86-106LRRRAASHDVKRIPKRLRARA
Subcellular Location(s) mito 15, cyto 8, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0090502  P:RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG yli:YALI0E29007g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MQCGRILVNFHVALKHHKMPPKKKSKLFNARRIIVQNTDDALKDGRINVPAFVNARQREIEKLATAMQSSRTAASQRSFQSLPRSLRRRAASHDVKRIPKRLRARARQEMANDDPSCHTRAATGKNKIGKLRGHKRLLAILDQRKHVVGDRQKNATPMALLQPKDVTGKDQTATPPVGKLRFEHRQKDKTWLPTHVWHAKRAHFENRWGFSIPEKPSQKCYRKTHRGIKHEGATVWDSSYTATFRIEATTEYLKQLMAGWFGKKVLRKRYVSGEYCFSGEIKPEEVSLGPAQVLWESESSVILRVHPCMTSMVLPLLNKERLENASHKFHYTDLRYAIGSIGIGGPKALQVLNTVLCPSDERSSSAKMFRSLSYLATLDSLPENAVMNLRVHDPRLHPAKLKLPRTSNEQSIMETLIAWPGALVEENKTNGNFTVFSGEARQESYAKQMSLKGINQHRTNKLRGQEDGKTKAEIPITIIRNGAHLSILLPWFWVLPVWFALNHIPCVSFIGYQQLHQIAYETGKPFFPNDYPQTEAGQAAEVFRGMGLEQKYNRTPPAKRVSYYAELGNAFVCDWSLLKTNEQETDVGVANNLKRVSVKYLHRGTPYDRARIYRIPEDKKQQWLDARKLDPENVDDYPICPSREHLIGFVTTGDVNLQEGCGFGIGSVITIPEDDLVVVRNCGQGVGRVAKIELIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.43
3 0.43
4 0.49
5 0.58
6 0.65
7 0.75
8 0.78
9 0.81
10 0.82
11 0.85
12 0.89
13 0.9
14 0.9
15 0.9
16 0.88
17 0.82
18 0.81
19 0.75
20 0.68
21 0.63
22 0.54
23 0.47
24 0.39
25 0.36
26 0.3
27 0.27
28 0.24
29 0.2
30 0.2
31 0.19
32 0.2
33 0.23
34 0.23
35 0.23
36 0.23
37 0.26
38 0.26
39 0.29
40 0.35
41 0.32
42 0.34
43 0.35
44 0.35
45 0.36
46 0.38
47 0.36
48 0.28
49 0.28
50 0.28
51 0.27
52 0.27
53 0.23
54 0.22
55 0.21
56 0.22
57 0.21
58 0.2
59 0.2
60 0.24
61 0.25
62 0.28
63 0.28
64 0.33
65 0.33
66 0.34
67 0.41
68 0.45
69 0.51
70 0.54
71 0.58
72 0.57
73 0.64
74 0.67
75 0.62
76 0.61
77 0.64
78 0.65
79 0.67
80 0.73
81 0.72
82 0.76
83 0.79
84 0.8
85 0.76
86 0.75
87 0.76
88 0.77
89 0.8
90 0.81
91 0.83
92 0.85
93 0.84
94 0.8
95 0.73
96 0.69
97 0.63
98 0.61
99 0.52
100 0.43
101 0.4
102 0.37
103 0.35
104 0.28
105 0.23
106 0.19
107 0.25
108 0.33
109 0.39
110 0.44
111 0.48
112 0.55
113 0.59
114 0.59
115 0.59
116 0.57
117 0.58
118 0.61
119 0.65
120 0.64
121 0.63
122 0.62
123 0.61
124 0.57
125 0.54
126 0.52
127 0.51
128 0.49
129 0.48
130 0.47
131 0.41
132 0.39
133 0.35
134 0.35
135 0.36
136 0.41
137 0.45
138 0.49
139 0.5
140 0.51
141 0.49
142 0.41
143 0.32
144 0.24
145 0.26
146 0.27
147 0.25
148 0.25
149 0.25
150 0.25
151 0.26
152 0.24
153 0.2
154 0.18
155 0.2
156 0.2
157 0.22
158 0.22
159 0.24
160 0.26
161 0.23
162 0.23
163 0.24
164 0.27
165 0.24
166 0.25
167 0.29
168 0.37
169 0.44
170 0.5
171 0.55
172 0.6
173 0.6
174 0.67
175 0.66
176 0.66
177 0.63
178 0.59
179 0.54
180 0.52
181 0.58
182 0.58
183 0.54
184 0.51
185 0.51
186 0.51
187 0.54
188 0.53
189 0.54
190 0.49
191 0.55
192 0.57
193 0.55
194 0.52
195 0.46
196 0.42
197 0.35
198 0.4
199 0.35
200 0.36
201 0.38
202 0.37
203 0.44
204 0.54
205 0.59
206 0.61
207 0.67
208 0.69
209 0.75
210 0.83
211 0.85
212 0.84
213 0.84
214 0.82
215 0.79
216 0.73
217 0.66
218 0.56
219 0.49
220 0.41
221 0.33
222 0.25
223 0.19
224 0.13
225 0.11
226 0.11
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.12
236 0.14
237 0.15
238 0.15
239 0.15
240 0.14
241 0.13
242 0.15
243 0.12
244 0.12
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.15
249 0.17
250 0.2
251 0.26
252 0.33
253 0.39
254 0.41
255 0.44
256 0.52
257 0.57
258 0.56
259 0.52
260 0.46
261 0.39
262 0.37
263 0.34
264 0.25
265 0.17
266 0.15
267 0.13
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.1
275 0.09
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.11
303 0.14
304 0.15
305 0.14
306 0.14
307 0.15
308 0.15
309 0.19
310 0.21
311 0.21
312 0.26
313 0.27
314 0.27
315 0.25
316 0.25
317 0.28
318 0.26
319 0.25
320 0.2
321 0.21
322 0.2
323 0.19
324 0.18
325 0.12
326 0.09
327 0.06
328 0.06
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.05
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.1
347 0.1
348 0.13
349 0.15
350 0.18
351 0.2
352 0.23
353 0.22
354 0.22
355 0.24
356 0.21
357 0.22
358 0.2
359 0.19
360 0.17
361 0.15
362 0.13
363 0.12
364 0.11
365 0.09
366 0.08
367 0.08
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.05
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.1
377 0.1
378 0.11
379 0.14
380 0.15
381 0.21
382 0.26
383 0.27
384 0.27
385 0.3
386 0.38
387 0.43
388 0.47
389 0.46
390 0.45
391 0.46
392 0.52
393 0.52
394 0.47
395 0.43
396 0.37
397 0.32
398 0.28
399 0.27
400 0.18
401 0.14
402 0.11
403 0.08
404 0.07
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.05
411 0.06
412 0.08
413 0.09
414 0.1
415 0.1
416 0.11
417 0.1
418 0.11
419 0.1
420 0.09
421 0.12
422 0.11
423 0.11
424 0.13
425 0.13
426 0.12
427 0.13
428 0.13
429 0.11
430 0.11
431 0.16
432 0.17
433 0.16
434 0.17
435 0.19
436 0.21
437 0.24
438 0.26
439 0.28
440 0.33
441 0.39
442 0.44
443 0.49
444 0.54
445 0.54
446 0.57
447 0.55
448 0.54
449 0.5
450 0.48
451 0.46
452 0.45
453 0.48
454 0.5
455 0.46
456 0.41
457 0.38
458 0.38
459 0.33
460 0.26
461 0.23
462 0.25
463 0.26
464 0.25
465 0.25
466 0.22
467 0.22
468 0.22
469 0.18
470 0.11
471 0.08
472 0.08
473 0.1
474 0.1
475 0.09
476 0.08
477 0.08
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.05
482 0.06
483 0.07
484 0.08
485 0.08
486 0.09
487 0.14
488 0.15
489 0.15
490 0.15
491 0.14
492 0.13
493 0.16
494 0.16
495 0.12
496 0.11
497 0.18
498 0.18
499 0.18
500 0.21
501 0.19
502 0.18
503 0.18
504 0.19
505 0.12
506 0.13
507 0.17
508 0.16
509 0.16
510 0.16
511 0.17
512 0.17
513 0.19
514 0.2
515 0.23
516 0.26
517 0.29
518 0.31
519 0.32
520 0.33
521 0.3
522 0.28
523 0.21
524 0.19
525 0.15
526 0.12
527 0.11
528 0.09
529 0.08
530 0.07
531 0.07
532 0.05
533 0.1
534 0.11
535 0.16
536 0.19
537 0.24
538 0.28
539 0.31
540 0.37
541 0.39
542 0.41
543 0.45
544 0.53
545 0.53
546 0.51
547 0.53
548 0.54
549 0.52
550 0.5
551 0.42
552 0.36
553 0.3
554 0.3
555 0.25
556 0.18
557 0.14
558 0.11
559 0.1
560 0.06
561 0.06
562 0.08
563 0.13
564 0.14
565 0.17
566 0.21
567 0.23
568 0.26
569 0.27
570 0.24
571 0.2
572 0.22
573 0.2
574 0.16
575 0.15
576 0.16
577 0.15
578 0.2
579 0.19
580 0.16
581 0.17
582 0.19
583 0.25
584 0.29
585 0.35
586 0.4
587 0.48
588 0.52
589 0.55
590 0.56
591 0.55
592 0.57
593 0.55
594 0.54
595 0.49
596 0.48
597 0.5
598 0.52
599 0.53
600 0.52
601 0.56
602 0.56
603 0.61
604 0.67
605 0.67
606 0.71
607 0.68
608 0.66
609 0.66
610 0.67
611 0.68
612 0.66
613 0.64
614 0.61
615 0.61
616 0.57
617 0.51
618 0.45
619 0.41
620 0.33
621 0.33
622 0.27
623 0.24
624 0.27
625 0.28
626 0.27
627 0.22
628 0.24
629 0.25
630 0.29
631 0.3
632 0.25
633 0.24
634 0.23
635 0.23
636 0.21
637 0.17
638 0.13
639 0.12
640 0.11
641 0.08
642 0.08
643 0.08
644 0.08
645 0.07
646 0.07
647 0.07
648 0.07
649 0.06
650 0.05
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.06
658 0.07
659 0.06
660 0.06
661 0.06
662 0.06
663 0.1
664 0.11
665 0.11
666 0.13
667 0.14
668 0.14
669 0.15
670 0.15
671 0.16
672 0.21
673 0.26
674 0.26
675 0.25
676 0.25