Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CAZ0

Protein Details
Accession Q6CAZ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
538-562NEFDSDEPRKRQRRRTKAAAEEQEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
546-553RKRQRRRT
Subcellular Location(s) cyto 12.5cyto_nucl 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022712  Beta_Casp  
IPR027075  CPSF2  
IPR025069  Cpsf2_C  
IPR001279  Metallo-B-lactamas  
IPR036866  RibonucZ/Hydroxyglut_hydro  
Gene Ontology GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
KEGG yli:YALI0C23232g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10996  Beta-Casp  
PF13299  CPSF100_C  
PF16661  Lactamase_B_6  
Amino Acid Sequences MLNLEPIGKSTLLSFGETRVLIDFALDSQEAAERGDSFFETLNLVLFTHANAAHLGAYALACKLYPALAAVPAYGTLPVINMGRIATLEAYRSQGLLSSEHITATEIEIIFDNITSIKYLQPIGIGVRSKGEVATTATEDGNSTELTTTQVTTHETLTITAFNSGHSLGGTIWRLQHQQDNVVYAVDWNHAKDSHLSGAAFLQKGGQIVSALHRPTVMVCGSQTGLRLKRRDILLWSSIQKALKRGGSVLLPTSVGSRVLEVIHMLDDLWTNNQNSQQGVTLVLLTHLGARLLEYASSMLEWMSPSIIAEWEKKNESPFQTRNFKIVHSMDQFDKVVKGGNGQFVVVSVGEDLESGFSRLLFNRLASDERNSVLFTERSEGNSLATELQDKWEKTERDGNSAKMDFQTTLKMPTYTPLSEAEMKEYRTTVESQQKDLQMVKAMELRNKELLEEAEAEEMMDSSDDEDVSRMQGSGQEYGFLHGTVLDVDVRDAVGSLRNFPFYQKRQRVSEYGIPIHPSDFARVEERPEVAWKERDRNEFDSDEPRKRQRRRTKAAAEEQEERVVEDADDAPETITSLDNQPIRVSYEDVDLNIICHVDFVDLSGRIDERSLGMIMHSIHPKKLLLLDDSRRADDLCSYLKREDDTDVHVLRGLTTAGTHSFAVDIQLTPELSRLLNWQQLSGGLSLAHVVGKVAKNEDKSEDTPLAALALQPIVDAADLAVAPRIEPLRVGDIRLAELKQALGKLGFRAVFQAGGVLVVDGKVSIRKVDESNLVVDGGIGSDFYAIKEVVRAQLAQIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.23
4 0.23
5 0.22
6 0.18
7 0.17
8 0.14
9 0.14
10 0.13
11 0.09
12 0.12
13 0.11
14 0.09
15 0.09
16 0.12
17 0.12
18 0.12
19 0.13
20 0.11
21 0.11
22 0.13
23 0.13
24 0.12
25 0.13
26 0.12
27 0.13
28 0.12
29 0.12
30 0.11
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.12
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.12
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.08
54 0.09
55 0.11
56 0.12
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.1
62 0.09
63 0.06
64 0.06
65 0.08
66 0.09
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.09
74 0.09
75 0.11
76 0.12
77 0.15
78 0.15
79 0.15
80 0.14
81 0.15
82 0.16
83 0.15
84 0.17
85 0.17
86 0.17
87 0.17
88 0.17
89 0.15
90 0.14
91 0.14
92 0.16
93 0.12
94 0.13
95 0.13
96 0.14
97 0.13
98 0.12
99 0.11
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.12
109 0.13
110 0.14
111 0.19
112 0.19
113 0.17
114 0.19
115 0.19
116 0.19
117 0.17
118 0.15
119 0.12
120 0.13
121 0.16
122 0.15
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.15
127 0.14
128 0.13
129 0.1
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.1
137 0.11
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.15
142 0.14
143 0.15
144 0.15
145 0.15
146 0.13
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.13
151 0.12
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.07
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.15
160 0.17
161 0.19
162 0.21
163 0.26
164 0.23
165 0.28
166 0.28
167 0.29
168 0.26
169 0.24
170 0.22
171 0.17
172 0.17
173 0.13
174 0.13
175 0.11
176 0.13
177 0.13
178 0.14
179 0.16
180 0.18
181 0.18
182 0.19
183 0.18
184 0.17
185 0.19
186 0.22
187 0.2
188 0.16
189 0.14
190 0.13
191 0.13
192 0.13
193 0.11
194 0.07
195 0.08
196 0.11
197 0.15
198 0.15
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.17
204 0.14
205 0.1
206 0.1
207 0.12
208 0.12
209 0.13
210 0.15
211 0.18
212 0.24
213 0.29
214 0.32
215 0.32
216 0.37
217 0.38
218 0.39
219 0.37
220 0.36
221 0.34
222 0.35
223 0.35
224 0.32
225 0.33
226 0.33
227 0.3
228 0.27
229 0.28
230 0.26
231 0.25
232 0.23
233 0.22
234 0.21
235 0.21
236 0.19
237 0.15
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.11
242 0.1
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.08
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.14
261 0.15
262 0.15
263 0.15
264 0.14
265 0.12
266 0.13
267 0.11
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.06
295 0.08
296 0.11
297 0.13
298 0.16
299 0.18
300 0.19
301 0.21
302 0.25
303 0.28
304 0.32
305 0.35
306 0.4
307 0.46
308 0.46
309 0.48
310 0.44
311 0.4
312 0.37
313 0.35
314 0.34
315 0.28
316 0.29
317 0.26
318 0.28
319 0.28
320 0.22
321 0.2
322 0.14
323 0.13
324 0.11
325 0.13
326 0.12
327 0.15
328 0.15
329 0.14
330 0.14
331 0.11
332 0.12
333 0.09
334 0.07
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.05
345 0.06
346 0.06
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.09
351 0.11
352 0.13
353 0.13
354 0.15
355 0.14
356 0.14
357 0.14
358 0.13
359 0.12
360 0.13
361 0.12
362 0.1
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.14
367 0.14
368 0.12
369 0.12
370 0.12
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.07
375 0.1
376 0.13
377 0.13
378 0.15
379 0.22
380 0.22
381 0.23
382 0.31
383 0.3
384 0.33
385 0.35
386 0.33
387 0.3
388 0.3
389 0.28
390 0.21
391 0.21
392 0.14
393 0.13
394 0.15
395 0.11
396 0.14
397 0.14
398 0.14
399 0.13
400 0.14
401 0.17
402 0.14
403 0.15
404 0.13
405 0.16
406 0.19
407 0.19
408 0.21
409 0.2
410 0.2
411 0.2
412 0.19
413 0.16
414 0.14
415 0.16
416 0.18
417 0.24
418 0.25
419 0.28
420 0.32
421 0.32
422 0.32
423 0.31
424 0.26
425 0.22
426 0.21
427 0.18
428 0.19
429 0.19
430 0.21
431 0.21
432 0.23
433 0.21
434 0.21
435 0.19
436 0.16
437 0.15
438 0.14
439 0.14
440 0.12
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.08
445 0.07
446 0.05
447 0.04
448 0.03
449 0.03
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.05
455 0.05
456 0.06
457 0.05
458 0.05
459 0.08
460 0.1
461 0.12
462 0.11
463 0.12
464 0.12
465 0.14
466 0.14
467 0.11
468 0.09
469 0.07
470 0.07
471 0.05
472 0.06
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.08
482 0.09
483 0.12
484 0.13
485 0.15
486 0.15
487 0.18
488 0.27
489 0.29
490 0.4
491 0.45
492 0.49
493 0.51
494 0.55
495 0.56
496 0.53
497 0.53
498 0.48
499 0.43
500 0.39
501 0.36
502 0.32
503 0.29
504 0.25
505 0.19
506 0.16
507 0.14
508 0.15
509 0.16
510 0.16
511 0.19
512 0.19
513 0.19
514 0.17
515 0.19
516 0.21
517 0.21
518 0.27
519 0.28
520 0.34
521 0.4
522 0.45
523 0.47
524 0.48
525 0.49
526 0.44
527 0.43
528 0.45
529 0.45
530 0.46
531 0.47
532 0.52
533 0.57
534 0.63
535 0.72
536 0.73
537 0.78
538 0.8
539 0.85
540 0.86
541 0.86
542 0.88
543 0.85
544 0.78
545 0.72
546 0.64
547 0.56
548 0.46
549 0.36
550 0.27
551 0.19
552 0.14
553 0.11
554 0.1
555 0.08
556 0.08
557 0.08
558 0.08
559 0.07
560 0.07
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.08
565 0.13
566 0.14
567 0.14
568 0.15
569 0.15
570 0.17
571 0.17
572 0.17
573 0.14
574 0.16
575 0.16
576 0.16
577 0.16
578 0.14
579 0.13
580 0.12
581 0.11
582 0.07
583 0.06
584 0.06
585 0.05
586 0.05
587 0.06
588 0.09
589 0.1
590 0.1
591 0.11
592 0.11
593 0.11
594 0.12
595 0.11
596 0.08
597 0.09
598 0.09
599 0.08
600 0.08
601 0.1
602 0.11
603 0.15
604 0.21
605 0.21
606 0.21
607 0.23
608 0.23
609 0.22
610 0.25
611 0.24
612 0.22
613 0.28
614 0.33
615 0.4
616 0.42
617 0.41
618 0.38
619 0.35
620 0.31
621 0.25
622 0.24
623 0.22
624 0.23
625 0.25
626 0.26
627 0.27
628 0.28
629 0.27
630 0.28
631 0.24
632 0.26
633 0.3
634 0.29
635 0.27
636 0.28
637 0.26
638 0.22
639 0.21
640 0.16
641 0.09
642 0.08
643 0.1
644 0.09
645 0.11
646 0.11
647 0.1
648 0.1
649 0.1
650 0.11
651 0.11
652 0.09
653 0.09
654 0.11
655 0.11
656 0.11
657 0.12
658 0.11
659 0.1
660 0.11
661 0.14
662 0.17
663 0.22
664 0.22
665 0.22
666 0.21
667 0.22
668 0.23
669 0.19
670 0.15
671 0.1
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.08
676 0.06
677 0.06
678 0.11
679 0.14
680 0.16
681 0.2
682 0.24
683 0.27
684 0.3
685 0.34
686 0.35
687 0.34
688 0.38
689 0.35
690 0.31
691 0.28
692 0.25
693 0.21
694 0.15
695 0.14
696 0.09
697 0.08
698 0.07
699 0.07
700 0.07
701 0.06
702 0.06
703 0.05
704 0.04
705 0.05
706 0.05
707 0.05
708 0.08
709 0.07
710 0.07
711 0.11
712 0.12
713 0.11
714 0.12
715 0.15
716 0.21
717 0.22
718 0.24
719 0.23
720 0.24
721 0.26
722 0.29
723 0.26
724 0.19
725 0.19
726 0.19
727 0.19
728 0.18
729 0.17
730 0.16
731 0.17
732 0.17
733 0.22
734 0.21
735 0.19
736 0.21
737 0.21
738 0.19
739 0.17
740 0.17
741 0.11
742 0.1
743 0.1
744 0.07
745 0.06
746 0.06
747 0.06
748 0.05
749 0.06
750 0.09
751 0.09
752 0.12
753 0.14
754 0.18
755 0.2
756 0.25
757 0.3
758 0.3
759 0.31
760 0.3
761 0.27
762 0.23
763 0.21
764 0.16
765 0.1
766 0.08
767 0.06
768 0.05
769 0.06
770 0.07
771 0.07
772 0.09
773 0.09
774 0.09
775 0.12
776 0.14
777 0.17
778 0.19
779 0.19