Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A084QB86

Protein Details
Accession A0A084QB86    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-83ASPVSTKKQKPVKKVVTESEVVEKPTKSKAKKSKPAKKAEVEAEHydrophilic
270-291WDTKIQKEKAKRGKQAAKLKALHydrophilic
357-380ISAPKPKSIKGKAGKGSRTKKARAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-55RKRKSAAEVKKPDAAPAKIAEKAATKGKRKAAEEASPVSTKKQKPVKKVV
61-77VEKPTKSKAKKSKPAKK
276-287KEKAKRGKQAAK
359-380APKPKSIKGKAGKGSRTKKARA
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPELRKRKSAAEVKKPDAAPAKIAEKAATKGKRKAAEEASPVSTKKQKPVKKVVTESEVVEKPTKSKAKKSKPAKKAEVEAEEPVQDETTLRVSDGESDSEEEEGVQELAEQLDPEDEEATGKELFKPGQDVGKIPEPSKTKGAKADGEEEEPGVIYIGRIPHGFYEHEMRQYFSQFGPVSKLRISRNKKTGASKHFAFVEFAEASTAEIAAKTMDNYLLFGHILKCKVLPKEQVREDLFKGANHRFKKIPWNKMAGRQLEKPLTESAWDTKIQKEKAKRGKQAAKLKALGYDFEAPELKKAPPPPPVVAIENEDKEPKAIEDVPAEGGAVPKKEDQPVEEDKAEEATTEEVPKSISAPKPKSIKGKAGKGSRTKKARA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.76
3 0.7
4 0.67
5 0.64
6 0.56
7 0.48
8 0.44
9 0.43
10 0.39
11 0.39
12 0.35
13 0.3
14 0.33
15 0.38
16 0.42
17 0.45
18 0.49
19 0.56
20 0.61
21 0.61
22 0.66
23 0.64
24 0.63
25 0.61
26 0.59
27 0.56
28 0.51
29 0.49
30 0.46
31 0.47
32 0.42
33 0.46
34 0.51
35 0.54
36 0.6
37 0.71
38 0.75
39 0.77
40 0.81
41 0.78
42 0.74
43 0.69
44 0.61
45 0.57
46 0.49
47 0.42
48 0.37
49 0.31
50 0.28
51 0.35
52 0.41
53 0.39
54 0.47
55 0.55
56 0.63
57 0.73
58 0.82
59 0.83
60 0.85
61 0.91
62 0.89
63 0.85
64 0.82
65 0.79
66 0.74
67 0.66
68 0.59
69 0.49
70 0.4
71 0.34
72 0.27
73 0.19
74 0.13
75 0.1
76 0.09
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.14
83 0.15
84 0.15
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.04
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.06
107 0.06
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.11
114 0.11
115 0.14
116 0.13
117 0.17
118 0.17
119 0.17
120 0.19
121 0.27
122 0.27
123 0.25
124 0.3
125 0.28
126 0.31
127 0.37
128 0.36
129 0.31
130 0.35
131 0.38
132 0.36
133 0.35
134 0.39
135 0.33
136 0.32
137 0.29
138 0.24
139 0.2
140 0.16
141 0.13
142 0.07
143 0.05
144 0.03
145 0.05
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.16
155 0.16
156 0.21
157 0.21
158 0.22
159 0.21
160 0.22
161 0.22
162 0.15
163 0.19
164 0.15
165 0.15
166 0.19
167 0.18
168 0.19
169 0.19
170 0.24
171 0.23
172 0.33
173 0.4
174 0.43
175 0.49
176 0.54
177 0.56
178 0.6
179 0.63
180 0.6
181 0.59
182 0.51
183 0.46
184 0.42
185 0.38
186 0.31
187 0.23
188 0.2
189 0.14
190 0.13
191 0.11
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.09
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.13
215 0.16
216 0.19
217 0.23
218 0.3
219 0.34
220 0.42
221 0.45
222 0.51
223 0.49
224 0.5
225 0.47
226 0.44
227 0.38
228 0.31
229 0.33
230 0.33
231 0.37
232 0.36
233 0.38
234 0.34
235 0.36
236 0.46
237 0.49
238 0.52
239 0.5
240 0.57
241 0.56
242 0.63
243 0.68
244 0.63
245 0.59
246 0.54
247 0.54
248 0.5
249 0.47
250 0.41
251 0.35
252 0.29
253 0.25
254 0.23
255 0.19
256 0.18
257 0.2
258 0.19
259 0.23
260 0.3
261 0.34
262 0.39
263 0.44
264 0.52
265 0.61
266 0.69
267 0.71
268 0.74
269 0.79
270 0.82
271 0.84
272 0.81
273 0.78
274 0.72
275 0.64
276 0.58
277 0.5
278 0.41
279 0.35
280 0.32
281 0.24
282 0.23
283 0.25
284 0.2
285 0.22
286 0.24
287 0.21
288 0.2
289 0.25
290 0.29
291 0.34
292 0.39
293 0.39
294 0.42
295 0.44
296 0.42
297 0.39
298 0.38
299 0.36
300 0.32
301 0.31
302 0.28
303 0.25
304 0.23
305 0.22
306 0.18
307 0.17
308 0.16
309 0.17
310 0.17
311 0.19
312 0.2
313 0.18
314 0.18
315 0.14
316 0.15
317 0.15
318 0.14
319 0.15
320 0.17
321 0.21
322 0.25
323 0.27
324 0.26
325 0.31
326 0.37
327 0.41
328 0.38
329 0.36
330 0.32
331 0.32
332 0.3
333 0.23
334 0.17
335 0.13
336 0.14
337 0.15
338 0.15
339 0.13
340 0.14
341 0.14
342 0.16
343 0.21
344 0.26
345 0.33
346 0.39
347 0.46
348 0.53
349 0.6
350 0.68
351 0.67
352 0.71
353 0.7
354 0.75
355 0.76
356 0.78
357 0.81
358 0.81
359 0.83
360 0.82