Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C1J2

Protein Details
Accession Q6C1J2    Localization Confidence Low Confidence Score 6.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-63DDLKRLERLKQMKRQRELDREEBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 11.833, nucl 7.5, mito_nucl 5.666, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR039979  PRPF18  
Gene Ontology GO:0071021  C:U2-type post-spliceosomal complex  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0005682  C:U5 snRNP  
GO:0000350  P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step  
KEGG yli:YALI0F15807g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
Amino Acid Sequences MDFAALIQGEISKKKAGTGVADYGCKAAAPKPAQTTVSDNSDDLKRLERLKQMKRQRELDREEERLEREEAKRAKQESLAKAPASTTSTVSTEHDVATSEPIETVEEMAANDARTNVRIDWSDVATKKDATRDSETKKKLAMQLRVFLARLLSEWEGTLDKGAAAQASGAAEEVSEAANAYKRHTIFEETQTSLSSLMVLLRHNGLQDEVLAMLSKVMYHVQHEEHHQAYDVYLKLCIGNACWPVGVASIGIHARASQNKTIASARNSKQVAHIVNDDTRQWLVCIKRLLTFAEGYESCVRKALLTVVDMEDRGNRVNEPRGRDVKGTVLEEAGVDGNSETDQNAEVEQKEASE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.25
3 0.24
4 0.27
5 0.3
6 0.36
7 0.36
8 0.37
9 0.35
10 0.32
11 0.29
12 0.24
13 0.2
14 0.16
15 0.21
16 0.23
17 0.29
18 0.34
19 0.38
20 0.39
21 0.41
22 0.43
23 0.38
24 0.4
25 0.36
26 0.3
27 0.3
28 0.31
29 0.3
30 0.25
31 0.26
32 0.25
33 0.28
34 0.34
35 0.4
36 0.47
37 0.55
38 0.63
39 0.69
40 0.75
41 0.78
42 0.82
43 0.82
44 0.82
45 0.79
46 0.79
47 0.75
48 0.69
49 0.65
50 0.59
51 0.52
52 0.45
53 0.41
54 0.37
55 0.32
56 0.37
57 0.38
58 0.41
59 0.45
60 0.45
61 0.45
62 0.46
63 0.52
64 0.5
65 0.54
66 0.52
67 0.46
68 0.44
69 0.41
70 0.37
71 0.32
72 0.25
73 0.19
74 0.16
75 0.17
76 0.18
77 0.19
78 0.19
79 0.17
80 0.16
81 0.14
82 0.13
83 0.12
84 0.13
85 0.12
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.11
103 0.1
104 0.12
105 0.12
106 0.14
107 0.15
108 0.17
109 0.21
110 0.21
111 0.23
112 0.22
113 0.23
114 0.22
115 0.25
116 0.25
117 0.25
118 0.31
119 0.36
120 0.41
121 0.49
122 0.5
123 0.47
124 0.46
125 0.44
126 0.44
127 0.44
128 0.46
129 0.4
130 0.43
131 0.43
132 0.43
133 0.39
134 0.32
135 0.25
136 0.16
137 0.13
138 0.11
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.03
152 0.03
153 0.04
154 0.03
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.07
166 0.07
167 0.09
168 0.13
169 0.13
170 0.14
171 0.15
172 0.19
173 0.19
174 0.25
175 0.27
176 0.25
177 0.25
178 0.24
179 0.23
180 0.19
181 0.16
182 0.1
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.06
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.06
206 0.07
207 0.1
208 0.12
209 0.14
210 0.18
211 0.21
212 0.2
213 0.2
214 0.19
215 0.17
216 0.15
217 0.17
218 0.15
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.08
226 0.12
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.12
232 0.12
233 0.11
234 0.06
235 0.05
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.1
242 0.16
243 0.19
244 0.2
245 0.22
246 0.23
247 0.26
248 0.29
249 0.31
250 0.3
251 0.36
252 0.35
253 0.41
254 0.41
255 0.39
256 0.39
257 0.4
258 0.38
259 0.32
260 0.34
261 0.29
262 0.31
263 0.32
264 0.28
265 0.24
266 0.22
267 0.19
268 0.16
269 0.18
270 0.17
271 0.21
272 0.25
273 0.25
274 0.28
275 0.29
276 0.31
277 0.28
278 0.27
279 0.22
280 0.24
281 0.23
282 0.23
283 0.29
284 0.28
285 0.26
286 0.27
287 0.26
288 0.2
289 0.21
290 0.21
291 0.17
292 0.17
293 0.19
294 0.19
295 0.2
296 0.2
297 0.2
298 0.18
299 0.17
300 0.18
301 0.17
302 0.16
303 0.2
304 0.29
305 0.34
306 0.38
307 0.46
308 0.5
309 0.52
310 0.53
311 0.5
312 0.48
313 0.49
314 0.44
315 0.36
316 0.3
317 0.26
318 0.24
319 0.23
320 0.16
321 0.1
322 0.09
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.1
332 0.13
333 0.13
334 0.14