Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C9W1

Protein Details
Accession Q6C9W1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MTKVKGKPKRVRISRVAGTDHydrophilic
172-192KTEIKAVAKKKTKPYERARPYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
170-189RAKTEIKAVAKKKTKPYERA
Subcellular Location(s) mito 19.5, mito_nucl 13.333, nucl 6, cyto_nucl 4.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG yli:YALI0D07876g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTKVKGKPKRVRISRVAGTDAPSTPQMSDQEYAAALAQQQQAYMPKNLASKAGPSSSLANSPATNSLAETHTVKREGGGKKWEDPSLLEWDPTHFRLFVGNLSGEVTTENVHRAFQKYKSLSKAKVVKDKISEKCAGYGFVSFSDPDDYFKAFKEMDGKYIGNHPVQLKRAKTEIKAVAKKKTKPYERARPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.76
3 0.7
4 0.61
5 0.55
6 0.48
7 0.4
8 0.33
9 0.27
10 0.24
11 0.19
12 0.21
13 0.19
14 0.19
15 0.2
16 0.17
17 0.17
18 0.16
19 0.16
20 0.13
21 0.11
22 0.08
23 0.12
24 0.14
25 0.13
26 0.13
27 0.14
28 0.18
29 0.21
30 0.22
31 0.18
32 0.19
33 0.21
34 0.22
35 0.22
36 0.19
37 0.19
38 0.21
39 0.21
40 0.19
41 0.18
42 0.2
43 0.19
44 0.2
45 0.19
46 0.17
47 0.16
48 0.16
49 0.16
50 0.14
51 0.13
52 0.11
53 0.12
54 0.11
55 0.13
56 0.14
57 0.14
58 0.16
59 0.17
60 0.16
61 0.16
62 0.22
63 0.24
64 0.26
65 0.31
66 0.3
67 0.34
68 0.37
69 0.36
70 0.29
71 0.27
72 0.25
73 0.25
74 0.23
75 0.19
76 0.16
77 0.18
78 0.19
79 0.19
80 0.17
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.12
85 0.11
86 0.1
87 0.09
88 0.08
89 0.09
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.06
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.09
100 0.13
101 0.16
102 0.18
103 0.26
104 0.28
105 0.33
106 0.4
107 0.44
108 0.43
109 0.48
110 0.54
111 0.51
112 0.57
113 0.55
114 0.52
115 0.54
116 0.6
117 0.57
118 0.54
119 0.51
120 0.42
121 0.43
122 0.39
123 0.33
124 0.25
125 0.21
126 0.17
127 0.15
128 0.15
129 0.11
130 0.12
131 0.14
132 0.13
133 0.14
134 0.15
135 0.16
136 0.16
137 0.17
138 0.19
139 0.15
140 0.17
141 0.21
142 0.2
143 0.22
144 0.25
145 0.25
146 0.23
147 0.29
148 0.31
149 0.25
150 0.28
151 0.29
152 0.31
153 0.36
154 0.42
155 0.39
156 0.4
157 0.46
158 0.48
159 0.46
160 0.49
161 0.52
162 0.56
163 0.62
164 0.64
165 0.67
166 0.7
167 0.75
168 0.77
169 0.78
170 0.78
171 0.79
172 0.84