FuNGI

Q6C4H3

Protein Details

Accession

Q6C4H3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-48	PMPPKAPSAFKREWKRKPKPAPAPAPAPA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-45	PKAPSAFKREWKRKPKPAPAPAP

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 12, cyto 9.5, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
KEGG	yli:YALI0E26807g -
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MDVGDIIERDIEDTPAPLPPMPPKAPSAFKREWKRKPKPAPAPAPAPAPAPVNNQAPPAKPTVAGRFQNDYPSDQKLTEAEEIHLENLSKLAKMSPEEIEAQRQEIMESMDENVLMALMRRAKIKEDDMEPPQQEPTVEEPEEVFNKSKPVKEEPQSEHAREEPTITEVRDDVKAELEQTKETKEAERSLGDDLKSSLGAREVKPSDMESKYDVEDEDDDDKPATTPGTPKKETKTATASEMDFDSSATPKKVKFEAKEDGDEKGKDKAESQKSGVQAVHFPKPPTFAADDEDPMSIDDEDFMEKLHEKYFPDLPKEPSKMAWMTDARHRVVEERGPDGEMTAKIIQDTSDAPLPKTMLPSEIRFDFKGNIITPKTSRNIPMNLGLHHHGENPEMAGYTIPELAQLARSSVSGQRCIAIRTLGRILYRLGNPTVMEKEYGKTIGMGLRGLIDQGRVIESITEATHAKQMNVAAYATEALWLWKQGGSDTRQAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.14
3	0.16
4	0.15
5	0.17
6	0.22
7	0.3
8	0.32
9	0.34
10	0.36
11	0.41
12	0.49
13	0.51
14	0.54
15	0.54
16	0.61
17	0.69
18	0.75
19	0.8
20	0.82
21	0.88
22	0.9
23	0.92
24	0.94
25	0.93
26	0.93
27	0.93
28	0.89
29	0.85
30	0.77
31	0.7
32	0.6
33	0.51
34	0.42
35	0.35
36	0.31
37	0.3
38	0.32
39	0.32
40	0.32
41	0.35
42	0.37
43	0.36
44	0.36
45	0.35
46	0.31
47	0.29
48	0.32
49	0.35
50	0.41
51	0.43
52	0.44
53	0.45
54	0.45
55	0.5
56	0.47
57	0.43
58	0.37
59	0.38
60	0.36
61	0.31
62	0.31
63	0.24
64	0.27
65	0.27
66	0.25
67	0.2
68	0.21
69	0.22
70	0.21
71	0.21
72	0.17
73	0.13
74	0.14
75	0.13
76	0.11
77	0.1
78	0.12
79	0.13
80	0.15
81	0.17
82	0.17
83	0.19
84	0.23
85	0.24
86	0.29
87	0.26
88	0.26
89	0.25
90	0.23
91	0.2
92	0.17
93	0.17
94	0.12
95	0.12
96	0.11
97	0.1
98	0.1
99	0.1
100	0.08
101	0.07
102	0.06
103	0.06
104	0.07
105	0.1
106	0.11
107	0.15
108	0.16
109	0.19
110	0.24
111	0.27
112	0.3
113	0.3
114	0.35
115	0.37
116	0.43
117	0.4
118	0.37
119	0.33
120	0.28
121	0.25
122	0.21
123	0.22
124	0.21
125	0.2
126	0.2
127	0.2
128	0.22
129	0.24
130	0.23
131	0.2
132	0.14
133	0.2
134	0.23
135	0.25
136	0.26
137	0.32
138	0.38
139	0.43
140	0.52
141	0.51
142	0.57
143	0.6
144	0.57
145	0.51
146	0.45
147	0.41
148	0.32
149	0.28
150	0.2
151	0.17
152	0.18
153	0.16
154	0.15
155	0.13
156	0.15
157	0.15
158	0.15
159	0.13
160	0.13
161	0.13
162	0.14
163	0.16
164	0.15
165	0.15
166	0.16
167	0.17
168	0.16
169	0.17
170	0.18
171	0.18
172	0.2
173	0.2
174	0.2
175	0.2
176	0.22
177	0.24
178	0.2
179	0.18
180	0.16
181	0.15
182	0.14
183	0.13
184	0.1
185	0.11
186	0.14
187	0.14
188	0.2
189	0.2
190	0.21
191	0.22
192	0.23
193	0.25
194	0.23
195	0.23
196	0.18
197	0.19
198	0.18
199	0.18
200	0.16
201	0.12
202	0.11
203	0.12
204	0.14
205	0.12
206	0.12
207	0.12
208	0.12
209	0.11
210	0.1
211	0.09
212	0.06
213	0.12
214	0.19
215	0.27
216	0.29
217	0.32
218	0.36
219	0.42
220	0.42
221	0.41
222	0.39
223	0.33
224	0.33
225	0.33
226	0.29
227	0.23
228	0.22
229	0.17
230	0.12
231	0.11
232	0.08
233	0.07
234	0.08
235	0.08
236	0.1
237	0.1
238	0.13
239	0.18
240	0.23
241	0.25
242	0.3
243	0.37
244	0.38
245	0.42
246	0.41
247	0.37
248	0.35
249	0.32
250	0.27
251	0.24
252	0.23
253	0.18
254	0.2
255	0.27
256	0.31
257	0.33
258	0.35
259	0.34
260	0.34
261	0.36
262	0.34
263	0.25
264	0.24
265	0.24
266	0.27
267	0.26
268	0.26
269	0.24
270	0.26
271	0.26
272	0.23
273	0.22
274	0.17
275	0.18
276	0.18
277	0.19
278	0.17
279	0.16
280	0.13
281	0.12
282	0.12
283	0.08
284	0.07
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.08
293	0.09
294	0.11
295	0.12
296	0.15
297	0.22
298	0.24
299	0.29
300	0.32
301	0.35
302	0.41
303	0.42
304	0.4
305	0.35
306	0.35
307	0.31
308	0.28
309	0.29
310	0.24
311	0.23
312	0.29
313	0.33
314	0.3
315	0.3
316	0.3
317	0.26
318	0.27
319	0.29
320	0.24
321	0.22
322	0.22
323	0.21
324	0.21
325	0.19
326	0.18
327	0.14
328	0.15
329	0.13
330	0.12
331	0.12
332	0.12
333	0.12
334	0.1
335	0.11
336	0.1
337	0.14
338	0.14
339	0.15
340	0.16
341	0.18
342	0.18
343	0.19
344	0.17
345	0.17
346	0.19
347	0.21
348	0.24
349	0.25
350	0.27
351	0.26
352	0.27
353	0.24
354	0.23
355	0.26
356	0.23
357	0.27
358	0.26
359	0.28
360	0.28
361	0.32
362	0.33
363	0.31
364	0.34
365	0.34
366	0.36
367	0.35
368	0.41
369	0.38
370	0.36
371	0.37
372	0.34
373	0.31
374	0.28
375	0.28
376	0.21
377	0.19
378	0.19
379	0.16
380	0.14
381	0.12
382	0.11
383	0.09
384	0.08
385	0.08
386	0.09
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.08
391	0.1
392	0.1
393	0.1
394	0.1
395	0.1
396	0.12
397	0.17
398	0.2
399	0.21
400	0.21
401	0.23
402	0.24
403	0.25
404	0.25
405	0.25
406	0.22
407	0.24
408	0.27
409	0.27
410	0.26
411	0.26
412	0.27
413	0.28
414	0.29
415	0.28
416	0.26
417	0.25
418	0.25
419	0.28
420	0.29
421	0.24
422	0.24
423	0.21
424	0.22
425	0.23
426	0.23
427	0.19
428	0.16
429	0.17
430	0.18
431	0.18
432	0.16
433	0.13
434	0.14
435	0.14
436	0.14
437	0.13
438	0.1
439	0.1
440	0.1
441	0.12
442	0.1
443	0.1
444	0.1
445	0.1
446	0.11
447	0.11
448	0.12
449	0.11
450	0.12
451	0.18
452	0.18
453	0.18
454	0.19
455	0.21
456	0.21
457	0.22
458	0.21
459	0.16
460	0.15
461	0.16
462	0.13
463	0.12
464	0.09
465	0.09
466	0.11
467	0.11
468	0.12
469	0.13
470	0.13
471	0.16
472	0.23
473	0.25

Q6C4H3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer