FuNGI

A0A072NVJ1

Protein Details

Accession

A0A072NVJ1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-38	MRPSSANSGPPRRPRKPDYNHIHRNLLP	Hydrophilic
126-151	AEENTAQRRQERRRQKLERARKEQEE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
133-146	RRQERRRQKLERAR

Subcellular Location(s)

nucl 9, cyto_nucl 9, mito 7, cyto 7, plas 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011856 tRNA_endonuc-like_dom_sf IPR036167 tRNA_intron_Endo_cat-like_sf IPR006677 tRNA_intron_Endonuc_cat-like IPR006676 tRNA_splic IPR016589 tRNA_splic_SEN2
Gene Ontology	GO:0000214 C:tRNA-intron endonuclease complex GO:0016829 F:lyase activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000213 F:tRNA-intron endonuclease activity GO:0006388 P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation
Pfam	View protein in Pfam PF01974 tRNA_int_endo
CDD	cd22363 tRNA-intron_lyase_C

Amino Acid Sequences

MAASTFVSESMRPSSANSGPPRRPRKPDYNHIHRNLLPVPVYPLPPLIPHNPLSLVAIALSYLVQVLATPPRPTYKGYFSSATSSIHVTDADTIRKLWEMGFFGRGNLSRSEPTWLENRKKKGVTAEENTAQRRQERRRQKLERARKEQEEVDQKLSDESQPNGRANGHVNGAHQENILKTNATDISDIGSVLDSASGPVTSDVVEEEKENGPIQGFDEWKRSIEANGILTPPPTSTSSEASHIEGRPTQRLQRTKTVRFSPTIEAREFDLSSPVISPIKSPGSSPLEPATPIEAAPVQEAQEHLTLSTEEAFFLSYGLGVLDVYCDDSETVLPSSSLLSLFRRHSYHPPRSISMPAAPDDPFIVSYAVYHHYRSLGWVVRSGIKFSTDYLLYNRGPAFSHADFAVVIVPSYSDPYWTGDDKKQQSKDWWWLHGVNRVQAQVRKQLVLCYVDIPPPLKEDEKRKDVDIGLLLSRYKVRDINVRRWTPNRSRD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.28
3	0.36
4	0.42
5	0.48
6	0.55
7	0.65
8	0.73
9	0.75
10	0.8
11	0.8
12	0.83
13	0.83
14	0.85
15	0.86
16	0.86
17	0.88
18	0.85
19	0.83
20	0.73
21	0.7
22	0.61
23	0.55
24	0.45
25	0.36
26	0.36
27	0.32
28	0.32
29	0.27
30	0.26
31	0.22
32	0.23
33	0.27
34	0.25
35	0.26
36	0.27
37	0.28
38	0.28
39	0.27
40	0.27
41	0.23
42	0.18
43	0.14
44	0.12
45	0.09
46	0.08
47	0.07
48	0.05
49	0.04
50	0.04
51	0.03
52	0.04
53	0.06
54	0.12
55	0.15
56	0.17
57	0.18
58	0.23
59	0.25
60	0.29
61	0.32
62	0.34
63	0.37
64	0.4
65	0.41
66	0.38
67	0.41
68	0.4
69	0.36
70	0.29
71	0.25
72	0.21
73	0.19
74	0.18
75	0.13
76	0.17
77	0.18
78	0.19
79	0.19
80	0.18
81	0.18
82	0.19
83	0.19
84	0.14
85	0.16
86	0.16
87	0.17
88	0.22
89	0.21
90	0.21
91	0.24
92	0.24
93	0.23
94	0.21
95	0.23
96	0.2
97	0.2
98	0.25
99	0.22
100	0.23
101	0.29
102	0.35
103	0.42
104	0.48
105	0.54
106	0.57
107	0.58
108	0.58
109	0.58
110	0.6
111	0.58
112	0.56
113	0.56
114	0.54
115	0.57
116	0.57
117	0.51
118	0.44
119	0.42
120	0.45
121	0.47
122	0.51
123	0.58
124	0.66
125	0.74
126	0.81
127	0.85
128	0.87
129	0.9
130	0.91
131	0.89
132	0.86
133	0.79
134	0.75
135	0.67
136	0.64
137	0.62
138	0.54
139	0.49
140	0.42
141	0.38
142	0.34
143	0.32
144	0.27
145	0.21
146	0.19
147	0.22
148	0.25
149	0.26
150	0.26
151	0.26
152	0.24
153	0.25
154	0.26
155	0.21
156	0.18
157	0.18
158	0.19
159	0.2
160	0.18
161	0.15
162	0.14
163	0.12
164	0.13
165	0.13
166	0.11
167	0.09
168	0.12
169	0.13
170	0.13
171	0.12
172	0.1
173	0.12
174	0.12
175	0.12
176	0.09
177	0.07
178	0.06
179	0.05
180	0.06
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.05
191	0.05
192	0.06
193	0.06
194	0.09
195	0.09
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.09
200	0.09
201	0.1
202	0.1
203	0.11
204	0.12
205	0.16
206	0.16
207	0.17
208	0.18
209	0.17
210	0.14
211	0.15
212	0.16
213	0.13
214	0.14
215	0.14
216	0.13
217	0.13
218	0.13
219	0.1
220	0.1
221	0.1
222	0.1
223	0.12
224	0.15
225	0.16
226	0.18
227	0.19
228	0.19
229	0.2
230	0.19
231	0.18
232	0.17
233	0.18
234	0.19
235	0.2
236	0.23
237	0.27
238	0.32
239	0.36
240	0.43
241	0.49
242	0.52
243	0.57
244	0.58
245	0.54
246	0.5
247	0.49
248	0.46
249	0.44
250	0.41
251	0.35
252	0.3
253	0.28
254	0.28
255	0.25
256	0.19
257	0.14
258	0.11
259	0.1
260	0.1
261	0.1
262	0.09
263	0.08
264	0.09
265	0.1
266	0.13
267	0.13
268	0.13
269	0.18
270	0.24
271	0.24
272	0.26
273	0.24
274	0.22
275	0.22
276	0.22
277	0.18
278	0.11
279	0.11
280	0.1
281	0.09
282	0.09
283	0.09
284	0.09
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.08
292	0.08
293	0.08
294	0.08
295	0.09
296	0.08
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.04
312	0.04
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.06
317	0.07
318	0.08
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.08
326	0.09
327	0.14
328	0.17
329	0.2
330	0.22
331	0.25
332	0.35
333	0.44
334	0.51
335	0.55
336	0.57
337	0.56
338	0.56
339	0.56
340	0.48
341	0.43
342	0.35
343	0.28
344	0.26
345	0.24
346	0.21
347	0.19
348	0.16
349	0.12
350	0.11
351	0.1
352	0.07
353	0.08
354	0.1
355	0.13
356	0.14
357	0.14
358	0.14
359	0.15
360	0.15
361	0.17
362	0.21
363	0.22
364	0.22
365	0.24
366	0.25
367	0.31
368	0.31
369	0.31
370	0.26
371	0.23
372	0.22
373	0.21
374	0.22
375	0.17
376	0.17
377	0.19
378	0.24
379	0.22
380	0.25
381	0.24
382	0.21
383	0.21
384	0.22
385	0.26
386	0.2
387	0.22
388	0.18
389	0.19
390	0.17
391	0.17
392	0.17
393	0.1
394	0.09
395	0.07
396	0.08
397	0.07
398	0.11
399	0.1
400	0.09
401	0.1
402	0.14
403	0.18
404	0.2
405	0.25
406	0.28
407	0.38
408	0.45
409	0.53
410	0.55
411	0.56
412	0.6
413	0.63
414	0.68
415	0.64
416	0.6
417	0.56
418	0.57
419	0.56
420	0.56
421	0.52
422	0.47
423	0.44
424	0.43
425	0.43
426	0.42
427	0.42
428	0.44
429	0.43
430	0.42
431	0.39
432	0.4
433	0.4
434	0.38
435	0.35
436	0.29
437	0.28
438	0.27
439	0.29
440	0.27
441	0.23
442	0.23
443	0.26
444	0.28
445	0.33
446	0.4
447	0.47
448	0.53
449	0.55
450	0.54
451	0.56
452	0.52
453	0.5
454	0.44
455	0.37
456	0.32
457	0.31
458	0.29
459	0.25
460	0.27
461	0.24
462	0.23
463	0.23
464	0.25
465	0.34
466	0.41
467	0.5
468	0.57
469	0.63
470	0.66
471	0.7
472	0.76

A0A072NVJ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer