Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C423

Protein Details
Accession Q6C423    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-75HCPTCTKTKGPSLYKRQSKRKKIDIDYAAMHydrophilic
468-487DIDIRKKKGESKEKHKIESQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
473-481KKKGESKEK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 5.5, cyto_pero 4.5, pero 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041070  JHD  
IPR003347  JmjC_dom  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0032452  F:histone demethylase activity  
GO:0140680  F:histone H3K36me/H3K36me2 demethylase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006482  P:protein demethylation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG yli:YALI0E30393g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17811  JHD  
PF02373  JmjC  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51184  JMJC  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15517  PHD_TCF19_like  
Amino Acid Sequences MPNRCDFCTSSSTKDKQQWTQCDGCDRWVHDVCVSITDPVSYAKYHCPTCTKTKGPSLYKRQSKRKKIDIDYAAMHSGNVDMSLRTRHVHSSRFTDVAASAQNKEPFKRVSGTELTLDWAQSSDGLNEPVIVPKEYKDTLGMYIPEDLTVRQVAEAVGMESPVEVINVVSQNGSPGWNMGKWTEYYEDIEGRDTILNVISLEISASALGKTIVRPTLVRELDLVDRVWPTNTDAARESKPRVSLYALMSVEDSFTDFHIDFAGSSVFYHVLKGRKSFMFIRPTARNLAAYSQWCLSADQNVVFLPDVLSPDSDIYTVHLSPGDTMYIPSGWIHAVHSPQDSLVVGGNFITPLNMKTQIDIAGIEVRTKVPMKFRYPLFAGVMWYYVLQLLANPERLNTMSTKERDGLNSVAEYLSGFIKTMSPTMKDVQYRRFVANFPMEIRPFPGKTLLDYCAMLDFYPKGVQETVDIDIRKKKGESKEKHKIESQLPEEKILQGSKLESKEEVQTENF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.64
3 0.65
4 0.71
5 0.72
6 0.7
7 0.72
8 0.68
9 0.68
10 0.62
11 0.59
12 0.55
13 0.49
14 0.49
15 0.47
16 0.45
17 0.37
18 0.4
19 0.34
20 0.32
21 0.31
22 0.24
23 0.2
24 0.19
25 0.18
26 0.16
27 0.17
28 0.14
29 0.16
30 0.22
31 0.28
32 0.31
33 0.34
34 0.39
35 0.43
36 0.51
37 0.58
38 0.56
39 0.57
40 0.64
41 0.69
42 0.72
43 0.77
44 0.78
45 0.79
46 0.83
47 0.86
48 0.88
49 0.89
50 0.91
51 0.9
52 0.9
53 0.89
54 0.87
55 0.87
56 0.81
57 0.76
58 0.68
59 0.61
60 0.53
61 0.42
62 0.34
63 0.24
64 0.19
65 0.13
66 0.1
67 0.08
68 0.06
69 0.08
70 0.12
71 0.13
72 0.14
73 0.16
74 0.24
75 0.28
76 0.34
77 0.36
78 0.4
79 0.43
80 0.42
81 0.4
82 0.34
83 0.29
84 0.26
85 0.27
86 0.22
87 0.2
88 0.24
89 0.3
90 0.31
91 0.32
92 0.34
93 0.31
94 0.32
95 0.34
96 0.3
97 0.31
98 0.33
99 0.34
100 0.3
101 0.28
102 0.28
103 0.25
104 0.23
105 0.17
106 0.12
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.08
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.13
117 0.14
118 0.14
119 0.13
120 0.13
121 0.18
122 0.18
123 0.18
124 0.16
125 0.16
126 0.17
127 0.19
128 0.19
129 0.15
130 0.17
131 0.16
132 0.15
133 0.14
134 0.12
135 0.11
136 0.1
137 0.1
138 0.07
139 0.08
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.03
152 0.03
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.07
162 0.07
163 0.09
164 0.09
165 0.1
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.15
173 0.16
174 0.17
175 0.16
176 0.16
177 0.14
178 0.13
179 0.12
180 0.1
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.06
185 0.07
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.03
192 0.04
193 0.03
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.07
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.12
203 0.21
204 0.21
205 0.21
206 0.19
207 0.2
208 0.2
209 0.21
210 0.18
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.09
216 0.09
217 0.13
218 0.13
219 0.14
220 0.15
221 0.19
222 0.21
223 0.23
224 0.24
225 0.22
226 0.25
227 0.23
228 0.23
229 0.21
230 0.22
231 0.21
232 0.25
233 0.22
234 0.2
235 0.2
236 0.18
237 0.16
238 0.12
239 0.11
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.09
257 0.13
258 0.15
259 0.17
260 0.2
261 0.2
262 0.23
263 0.26
264 0.29
265 0.32
266 0.33
267 0.38
268 0.36
269 0.38
270 0.37
271 0.34
272 0.29
273 0.22
274 0.22
275 0.19
276 0.18
277 0.18
278 0.15
279 0.15
280 0.14
281 0.14
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.11
286 0.12
287 0.11
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.06
301 0.07
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.09
310 0.07
311 0.07
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.09
321 0.1
322 0.12
323 0.13
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.11
328 0.1
329 0.1
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.05
338 0.06
339 0.09
340 0.12
341 0.12
342 0.13
343 0.14
344 0.15
345 0.15
346 0.14
347 0.13
348 0.14
349 0.14
350 0.14
351 0.13
352 0.12
353 0.14
354 0.16
355 0.17
356 0.2
357 0.27
358 0.32
359 0.38
360 0.39
361 0.42
362 0.43
363 0.44
364 0.38
365 0.32
366 0.29
367 0.23
368 0.22
369 0.17
370 0.14
371 0.11
372 0.09
373 0.08
374 0.06
375 0.06
376 0.1
377 0.12
378 0.15
379 0.15
380 0.15
381 0.16
382 0.17
383 0.18
384 0.15
385 0.17
386 0.22
387 0.24
388 0.27
389 0.28
390 0.29
391 0.29
392 0.32
393 0.29
394 0.23
395 0.21
396 0.19
397 0.17
398 0.15
399 0.13
400 0.1
401 0.09
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.09
406 0.1
407 0.13
408 0.15
409 0.16
410 0.19
411 0.23
412 0.29
413 0.34
414 0.38
415 0.43
416 0.48
417 0.49
418 0.5
419 0.48
420 0.44
421 0.44
422 0.46
423 0.4
424 0.35
425 0.39
426 0.37
427 0.35
428 0.38
429 0.37
430 0.31
431 0.3
432 0.33
433 0.26
434 0.3
435 0.33
436 0.31
437 0.28
438 0.27
439 0.26
440 0.22
441 0.22
442 0.17
443 0.15
444 0.14
445 0.13
446 0.16
447 0.16
448 0.16
449 0.16
450 0.17
451 0.17
452 0.19
453 0.2
454 0.22
455 0.23
456 0.24
457 0.31
458 0.33
459 0.34
460 0.34
461 0.4
462 0.45
463 0.55
464 0.62
465 0.65
466 0.74
467 0.78
468 0.81
469 0.8
470 0.77
471 0.74
472 0.73
473 0.7
474 0.68
475 0.61
476 0.59
477 0.54
478 0.49
479 0.45
480 0.36
481 0.31
482 0.23
483 0.26
484 0.29
485 0.31
486 0.3
487 0.28
488 0.29
489 0.35
490 0.36