Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A072PM79

Protein Details
Accession A0A072PM79    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
221-241IYGVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
128-158SRSPVKNGGGTPVRARSPPRRLDRDRVRPRG
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 10, cyto 7, cysk 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MNHLQSEPGEQTWRPLWTETVVVHHDQVPAAEIQERNGSMRTIENQVEALGVMRVAGGDLGQNRAIKKTGNGSAADRESTHIETGTVIGTEGVMEVGEIEESMIEVTGTGAGVVIDHHSEWSHRHSRSRSPVKNGGGTPVRARSPPRRLDRDRVRPRGDQAKSEENPSKSAASPRPGQAQPAANGGAMAVDEDEDDAFLRRAMGFASFKSTHNTKVPGNQIYGVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPSRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.26
4 0.24
5 0.27
6 0.24
7 0.25
8 0.25
9 0.25
10 0.25
11 0.25
12 0.24
13 0.21
14 0.2
15 0.17
16 0.14
17 0.13
18 0.16
19 0.14
20 0.15
21 0.19
22 0.19
23 0.19
24 0.2
25 0.19
26 0.16
27 0.19
28 0.2
29 0.21
30 0.21
31 0.2
32 0.19
33 0.19
34 0.18
35 0.14
36 0.12
37 0.07
38 0.06
39 0.05
40 0.04
41 0.04
42 0.04
43 0.04
44 0.03
45 0.05
46 0.06
47 0.09
48 0.11
49 0.14
50 0.14
51 0.16
52 0.17
53 0.16
54 0.18
55 0.22
56 0.25
57 0.26
58 0.27
59 0.28
60 0.32
61 0.32
62 0.3
63 0.24
64 0.21
65 0.2
66 0.2
67 0.18
68 0.13
69 0.12
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.07
74 0.05
75 0.05
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.03
80 0.03
81 0.02
82 0.02
83 0.03
84 0.03
85 0.02
86 0.02
87 0.02
88 0.02
89 0.03
90 0.02
91 0.02
92 0.02
93 0.02
94 0.03
95 0.03
96 0.02
97 0.02
98 0.02
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.05
107 0.07
108 0.13
109 0.19
110 0.21
111 0.26
112 0.29
113 0.37
114 0.46
115 0.56
116 0.54
117 0.55
118 0.61
119 0.58
120 0.59
121 0.52
122 0.47
123 0.39
124 0.35
125 0.3
126 0.26
127 0.24
128 0.21
129 0.26
130 0.29
131 0.35
132 0.43
133 0.49
134 0.55
135 0.59
136 0.68
137 0.74
138 0.76
139 0.78
140 0.78
141 0.75
142 0.69
143 0.69
144 0.69
145 0.6
146 0.54
147 0.49
148 0.49
149 0.45
150 0.48
151 0.49
152 0.4
153 0.4
154 0.37
155 0.33
156 0.25
157 0.31
158 0.3
159 0.28
160 0.31
161 0.32
162 0.37
163 0.36
164 0.37
165 0.35
166 0.34
167 0.31
168 0.3
169 0.28
170 0.21
171 0.2
172 0.18
173 0.13
174 0.08
175 0.07
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.11
191 0.12
192 0.12
193 0.2
194 0.21
195 0.22
196 0.27
197 0.29
198 0.3
199 0.34
200 0.38
201 0.33
202 0.39
203 0.46
204 0.44
205 0.44
206 0.43
207 0.43
208 0.45
209 0.5
210 0.51
211 0.51
212 0.5
213 0.53
214 0.58
215 0.63
216 0.67
217 0.7
218 0.71
219 0.74
220 0.79
221 0.82
222 0.82
223 0.78
224 0.72
225 0.64
226 0.56
227 0.54
228 0.5
229 0.45
230 0.4
231 0.38