Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A072PB23

Protein Details
Accession A0A072PB23    Localization Confidence High Confidence Score 25.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-31STDLPAKKSKKSRTATDEDIHydrophilic
95-123VNVSTVPDLRKKRKNKKNKKEQHDELLSAHydrophilic
210-231DTSSKLKLSKKKDKEVREKLSQHydrophilic
353-380TEVQWDKKNAREKKKRNRKARQLEALGLHydrophilic
444-468EDAEAGKKSKRSKNSKKNKTILGANHydrophilic
527-557PVATKGKVKAGEKKKKDRKNITKARGPKSAIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-114RKKRKNKKNKK
331-373ANKKFRKIPHEKLERERLAAPKTEVQWDKKNAREKKKRNRKAR
449-462GKKSKRSKNSKKNK
531-556KGKVKAGEKKKKDRKNITKARGPKSA
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1, cyto 1, cysk 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MGDKKRKATPVSTDLPAKKSKKSRTATDEDISKTQVTKPAEKPDKASHVQKADVAVSKKSRKHAVDFMSDDEATADQSKLSSEPKKIKHSTPVEVNVSTVPDLRKKRKNKKNKKEQHDELLSADGVNGVVEHEGREDLETATSHKPVASSMQAEAERTVDQELKDDFGGFSEGQAEEAAPGEIETEDNAAVLLAGFDSDGEDQYEDENLDTSSKLKLSKKKDKEVREKLSQVQHSGSNEGPGTVYVGRIPHGFYEKEMHEYFSQFGEISKLRLSRNKHTGASKHFAFIEFSSNEVAKIVSETMDNYLLFGHLLKCKYAQPDSLHPDTWKGANKKFRKIPHEKLERERLAAPKTEVQWDKKNAREKKKRNRKARQLEALGLELPASTLKKSSEALKQRQLEHAKEGSLLKNDDSQVAPTGAIKALNGLPKDELAILETTKSENLEDAEAGKKSKRSKNSKKNKTILGANAEATSVALIEDAQEVKKAIQGTAGKVVSGNETTDPVISTTEEFIALAADEEHSDSVEEPVATKGKVKAGEKKKKDRKNITKARGPKSAITSAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.6
3 0.62
4 0.57
5 0.58
6 0.62
7 0.67
8 0.68
9 0.71
10 0.76
11 0.76
12 0.8
13 0.78
14 0.75
15 0.71
16 0.65
17 0.6
18 0.53
19 0.45
20 0.38
21 0.34
22 0.35
23 0.34
24 0.38
25 0.42
26 0.51
27 0.58
28 0.59
29 0.62
30 0.64
31 0.68
32 0.65
33 0.66
34 0.63
35 0.59
36 0.58
37 0.54
38 0.48
39 0.44
40 0.44
41 0.39
42 0.38
43 0.41
44 0.48
45 0.5
46 0.54
47 0.58
48 0.57
49 0.61
50 0.63
51 0.61
52 0.61
53 0.59
54 0.56
55 0.52
56 0.46
57 0.39
58 0.31
59 0.25
60 0.18
61 0.17
62 0.13
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.12
67 0.18
68 0.22
69 0.29
70 0.38
71 0.45
72 0.55
73 0.6
74 0.63
75 0.66
76 0.67
77 0.66
78 0.65
79 0.65
80 0.6
81 0.55
82 0.5
83 0.41
84 0.36
85 0.29
86 0.24
87 0.2
88 0.23
89 0.32
90 0.4
91 0.49
92 0.58
93 0.69
94 0.76
95 0.85
96 0.89
97 0.91
98 0.94
99 0.95
100 0.94
101 0.94
102 0.91
103 0.89
104 0.84
105 0.74
106 0.64
107 0.56
108 0.45
109 0.34
110 0.26
111 0.16
112 0.1
113 0.08
114 0.06
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.13
128 0.15
129 0.15
130 0.15
131 0.14
132 0.14
133 0.13
134 0.17
135 0.16
136 0.15
137 0.15
138 0.2
139 0.2
140 0.21
141 0.21
142 0.18
143 0.15
144 0.14
145 0.15
146 0.12
147 0.12
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.15
153 0.13
154 0.11
155 0.13
156 0.1
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.03
180 0.02
181 0.02
182 0.02
183 0.02
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.09
201 0.14
202 0.2
203 0.28
204 0.37
205 0.48
206 0.55
207 0.65
208 0.71
209 0.76
210 0.81
211 0.84
212 0.82
213 0.78
214 0.73
215 0.69
216 0.68
217 0.6
218 0.51
219 0.42
220 0.37
221 0.31
222 0.3
223 0.24
224 0.18
225 0.16
226 0.14
227 0.12
228 0.09
229 0.1
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.16
242 0.15
243 0.2
244 0.19
245 0.2
246 0.18
247 0.19
248 0.18
249 0.14
250 0.14
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.11
257 0.14
258 0.15
259 0.2
260 0.25
261 0.3
262 0.37
263 0.4
264 0.41
265 0.43
266 0.46
267 0.47
268 0.47
269 0.4
270 0.34
271 0.3
272 0.27
273 0.24
274 0.2
275 0.19
276 0.13
277 0.14
278 0.13
279 0.13
280 0.12
281 0.11
282 0.11
283 0.05
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.12
302 0.15
303 0.19
304 0.2
305 0.23
306 0.23
307 0.3
308 0.36
309 0.37
310 0.36
311 0.32
312 0.32
313 0.28
314 0.28
315 0.28
316 0.26
317 0.3
318 0.38
319 0.44
320 0.5
321 0.56
322 0.6
323 0.62
324 0.67
325 0.71
326 0.72
327 0.77
328 0.74
329 0.74
330 0.77
331 0.68
332 0.62
333 0.56
334 0.5
335 0.42
336 0.39
337 0.34
338 0.29
339 0.29
340 0.33
341 0.34
342 0.34
343 0.39
344 0.44
345 0.47
346 0.49
347 0.57
348 0.59
349 0.66
350 0.72
351 0.75
352 0.8
353 0.86
354 0.9
355 0.91
356 0.93
357 0.93
358 0.93
359 0.93
360 0.91
361 0.83
362 0.77
363 0.67
364 0.57
365 0.46
366 0.35
367 0.25
368 0.15
369 0.11
370 0.09
371 0.07
372 0.06
373 0.08
374 0.08
375 0.1
376 0.12
377 0.16
378 0.24
379 0.33
380 0.4
381 0.47
382 0.51
383 0.51
384 0.59
385 0.6
386 0.53
387 0.5
388 0.45
389 0.37
390 0.35
391 0.35
392 0.3
393 0.28
394 0.26
395 0.21
396 0.23
397 0.23
398 0.23
399 0.21
400 0.19
401 0.17
402 0.17
403 0.16
404 0.12
405 0.13
406 0.12
407 0.11
408 0.1
409 0.1
410 0.13
411 0.17
412 0.17
413 0.16
414 0.16
415 0.16
416 0.17
417 0.15
418 0.12
419 0.1
420 0.11
421 0.1
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.11
426 0.11
427 0.1
428 0.09
429 0.11
430 0.11
431 0.11
432 0.12
433 0.15
434 0.15
435 0.17
436 0.19
437 0.22
438 0.3
439 0.37
440 0.46
441 0.54
442 0.64
443 0.74
444 0.82
445 0.89
446 0.9
447 0.9
448 0.88
449 0.83
450 0.78
451 0.74
452 0.69
453 0.6
454 0.51
455 0.43
456 0.35
457 0.29
458 0.21
459 0.15
460 0.08
461 0.05
462 0.04
463 0.03
464 0.04
465 0.06
466 0.08
467 0.08
468 0.09
469 0.1
470 0.11
471 0.14
472 0.14
473 0.12
474 0.18
475 0.21
476 0.23
477 0.3
478 0.3
479 0.27
480 0.27
481 0.27
482 0.24
483 0.22
484 0.2
485 0.13
486 0.15
487 0.15
488 0.15
489 0.15
490 0.12
491 0.12
492 0.12
493 0.12
494 0.12
495 0.12
496 0.12
497 0.11
498 0.1
499 0.09
500 0.08
501 0.07
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.08
506 0.08
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.09
511 0.11
512 0.11
513 0.11
514 0.15
515 0.17
516 0.17
517 0.2
518 0.23
519 0.26
520 0.33
521 0.38
522 0.45
523 0.53
524 0.64
525 0.7
526 0.78
527 0.83
528 0.86
529 0.91
530 0.93
531 0.93
532 0.93
533 0.94
534 0.92
535 0.92
536 0.92
537 0.88
538 0.86
539 0.79
540 0.74
541 0.7