Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C4Q1

Protein Details
Accession Q6C4Q1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1026-1048MAKSLEQRQREEREQRHKLNSYVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
391-416REKIRANAQKARESRQAAKAPQGKKK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 8.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0005844  C:polysome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG yli:YALI0E24629g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MTTIMDKRIQLREGNKRAWDGDMDVFQIAEKPDSSLKGNTVFIRRLRMQLKADQEPAILEELHTLSLEKYLGEAINALLEGLLKLKTRGDFSVAVQVTSIMHQRFFHQFTPQFLTVFFQGLESTLTEDRAKRTELAPIRKILCRLCVDLWLVGIITPEYFNKNIPSWIEGTPQAISQAGPPPLVIFRHILGTDLKDFDYADLVLSLAKHFPFLVGGADEEGQAEALGVTEAVPKMAKLVKSYCLHMQKRVKMMAILLGRQRRKFEKHYIQVGRMTTGREDSLNELETQLSTMVSTCTQLSEALGIEMQSLTDCYKEEDTITLDASFDGQPLWDSEDDMLFYTEVPDLADKVSEQVLSGGVDVADAELNDMVEKNKAARQKELLQQAVEKEREKIRANAQKARESRQAAKAPQGKKKSTTDGGESDDSDYVSEEEEEEPVKDMSPKGIQMTEFLERLSQARSKEEIDAMTIEFCHLNNKASLNRLLRHFREFSLHKAFMLPFYARMVATLGPYFPKLRASVIERLFARLRSYTRGNSRRSMERRLASFQFLSELTKFGLVPKHYIFHLLNFMGSRLNYMNLESLSKIFHCCGQFLWRNASTHQDMEELMESMMQRRTKGYLSISEILMVEELLSLVKFRGGAGETTNKRHVVSSTPIQVFLDRLYYIELSTEVAEQVAQLTLKLDWSDEEITCPTLFRIFTETWRVSHGNMAAVAAVLSRIAPSHPVFAQKVIETVLENIRQCLELNSYSLNQIRLSQVEFVSELYNQGLLNHTCILDMLFMIICYDHRRGRPTAGVYCPKDPPDSFFRIRLVLNALVTCQQKLVSDVNSSELEFFIAFFQYYIFTKTRLPMELKIDFRTLFVDLQLEQQLYSTLDGAARGLESALKGKFGERFEEEQKEQQKHKLAVEETKVDTSTVASPVPTPEFVSRKTADDIQAEQDFDREFSEMMKEAGGQGTGSFDRPVPSAKVLTQHISGASLNGAKLFSLKDGNTGPSIMGNKMGFTLLSKRGSKMQGRLVALPANSKMAKSLEQRQREEREQRHKLNSYVMAHADMEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.62
3 0.6
4 0.58
5 0.54
6 0.47
7 0.4
8 0.35
9 0.3
10 0.28
11 0.24
12 0.23
13 0.2
14 0.2
15 0.17
16 0.15
17 0.13
18 0.14
19 0.18
20 0.21
21 0.24
22 0.24
23 0.27
24 0.29
25 0.33
26 0.35
27 0.39
28 0.42
29 0.41
30 0.46
31 0.46
32 0.5
33 0.49
34 0.51
35 0.5
36 0.51
37 0.57
38 0.55
39 0.55
40 0.48
41 0.45
42 0.38
43 0.35
44 0.29
45 0.21
46 0.14
47 0.14
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.12
52 0.1
53 0.12
54 0.12
55 0.09
56 0.09
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.14
73 0.17
74 0.2
75 0.22
76 0.25
77 0.25
78 0.26
79 0.35
80 0.32
81 0.29
82 0.26
83 0.25
84 0.21
85 0.2
86 0.24
87 0.15
88 0.17
89 0.18
90 0.22
91 0.29
92 0.33
93 0.33
94 0.36
95 0.38
96 0.42
97 0.49
98 0.47
99 0.4
100 0.36
101 0.36
102 0.28
103 0.26
104 0.21
105 0.13
106 0.12
107 0.12
108 0.13
109 0.1
110 0.13
111 0.12
112 0.14
113 0.17
114 0.19
115 0.22
116 0.24
117 0.26
118 0.25
119 0.25
120 0.32
121 0.38
122 0.45
123 0.46
124 0.49
125 0.51
126 0.52
127 0.55
128 0.48
129 0.47
130 0.41
131 0.41
132 0.36
133 0.36
134 0.34
135 0.3
136 0.28
137 0.21
138 0.17
139 0.13
140 0.12
141 0.09
142 0.07
143 0.08
144 0.09
145 0.12
146 0.13
147 0.14
148 0.17
149 0.19
150 0.21
151 0.22
152 0.23
153 0.23
154 0.24
155 0.26
156 0.23
157 0.24
158 0.21
159 0.2
160 0.18
161 0.15
162 0.13
163 0.13
164 0.18
165 0.17
166 0.17
167 0.16
168 0.17
169 0.19
170 0.2
171 0.19
172 0.14
173 0.14
174 0.17
175 0.17
176 0.18
177 0.17
178 0.19
179 0.2
180 0.2
181 0.19
182 0.16
183 0.16
184 0.15
185 0.15
186 0.12
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.04
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.1
222 0.14
223 0.15
224 0.17
225 0.2
226 0.27
227 0.29
228 0.33
229 0.38
230 0.44
231 0.45
232 0.51
233 0.57
234 0.55
235 0.6
236 0.59
237 0.52
238 0.43
239 0.41
240 0.39
241 0.32
242 0.3
243 0.29
244 0.34
245 0.38
246 0.4
247 0.44
248 0.44
249 0.49
250 0.52
251 0.57
252 0.6
253 0.64
254 0.71
255 0.72
256 0.68
257 0.66
258 0.6
259 0.51
260 0.42
261 0.35
262 0.26
263 0.22
264 0.19
265 0.15
266 0.16
267 0.16
268 0.18
269 0.17
270 0.16
271 0.15
272 0.14
273 0.14
274 0.13
275 0.1
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.08
301 0.1
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.13
306 0.14
307 0.14
308 0.12
309 0.11
310 0.1
311 0.12
312 0.1
313 0.08
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.1
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.08
361 0.11
362 0.16
363 0.18
364 0.22
365 0.26
366 0.32
367 0.38
368 0.43
369 0.42
370 0.38
371 0.38
372 0.37
373 0.38
374 0.34
375 0.29
376 0.26
377 0.27
378 0.32
379 0.33
380 0.33
381 0.37
382 0.43
383 0.47
384 0.51
385 0.51
386 0.54
387 0.54
388 0.56
389 0.53
390 0.5
391 0.49
392 0.51
393 0.53
394 0.46
395 0.52
396 0.53
397 0.52
398 0.56
399 0.58
400 0.52
401 0.51
402 0.54
403 0.52
404 0.5
405 0.46
406 0.42
407 0.38
408 0.39
409 0.35
410 0.31
411 0.26
412 0.21
413 0.18
414 0.14
415 0.11
416 0.08
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.07
423 0.07
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.08
429 0.1
430 0.11
431 0.12
432 0.12
433 0.13
434 0.13
435 0.13
436 0.16
437 0.15
438 0.14
439 0.13
440 0.12
441 0.11
442 0.12
443 0.13
444 0.13
445 0.12
446 0.14
447 0.16
448 0.18
449 0.18
450 0.19
451 0.16
452 0.14
453 0.14
454 0.12
455 0.1
456 0.08
457 0.08
458 0.07
459 0.06
460 0.08
461 0.08
462 0.09
463 0.1
464 0.12
465 0.14
466 0.16
467 0.22
468 0.22
469 0.24
470 0.28
471 0.33
472 0.33
473 0.35
474 0.34
475 0.29
476 0.32
477 0.31
478 0.32
479 0.34
480 0.32
481 0.28
482 0.28
483 0.28
484 0.22
485 0.23
486 0.17
487 0.1
488 0.11
489 0.12
490 0.1
491 0.1
492 0.1
493 0.08
494 0.09
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.08
499 0.09
500 0.08
501 0.1
502 0.09
503 0.1
504 0.12
505 0.16
506 0.23
507 0.23
508 0.27
509 0.25
510 0.28
511 0.28
512 0.26
513 0.23
514 0.18
515 0.18
516 0.18
517 0.21
518 0.23
519 0.32
520 0.38
521 0.4
522 0.43
523 0.45
524 0.51
525 0.52
526 0.53
527 0.5
528 0.46
529 0.45
530 0.45
531 0.43
532 0.36
533 0.31
534 0.25
535 0.2
536 0.17
537 0.16
538 0.12
539 0.11
540 0.09
541 0.09
542 0.09
543 0.09
544 0.13
545 0.12
546 0.15
547 0.15
548 0.16
549 0.16
550 0.2
551 0.18
552 0.15
553 0.18
554 0.15
555 0.15
556 0.14
557 0.14
558 0.11
559 0.11
560 0.11
561 0.08
562 0.09
563 0.08
564 0.09
565 0.1
566 0.09
567 0.1
568 0.09
569 0.09
570 0.09
571 0.09
572 0.09
573 0.08
574 0.12
575 0.12
576 0.12
577 0.12
578 0.19
579 0.23
580 0.24
581 0.3
582 0.28
583 0.29
584 0.29
585 0.33
586 0.27
587 0.23
588 0.22
589 0.17
590 0.14
591 0.14
592 0.14
593 0.1
594 0.08
595 0.09
596 0.08
597 0.09
598 0.13
599 0.12
600 0.12
601 0.13
602 0.15
603 0.15
604 0.18
605 0.18
606 0.19
607 0.23
608 0.25
609 0.24
610 0.23
611 0.22
612 0.19
613 0.16
614 0.12
615 0.06
616 0.04
617 0.04
618 0.03
619 0.03
620 0.03
621 0.03
622 0.04
623 0.04
624 0.04
625 0.06
626 0.07
627 0.08
628 0.1
629 0.19
630 0.21
631 0.25
632 0.28
633 0.27
634 0.26
635 0.26
636 0.25
637 0.21
638 0.24
639 0.24
640 0.29
641 0.29
642 0.29
643 0.28
644 0.28
645 0.24
646 0.19
647 0.16
648 0.08
649 0.08
650 0.09
651 0.09
652 0.09
653 0.08
654 0.08
655 0.07
656 0.07
657 0.07
658 0.06
659 0.06
660 0.05
661 0.05
662 0.05
663 0.05
664 0.05
665 0.04
666 0.05
667 0.05
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.09
673 0.11
674 0.1
675 0.12
676 0.12
677 0.13
678 0.13
679 0.13
680 0.1
681 0.1
682 0.1
683 0.1
684 0.14
685 0.13
686 0.16
687 0.24
688 0.25
689 0.23
690 0.27
691 0.27
692 0.23
693 0.25
694 0.24
695 0.17
696 0.16
697 0.16
698 0.11
699 0.1
700 0.1
701 0.06
702 0.05
703 0.03
704 0.03
705 0.03
706 0.03
707 0.04
708 0.07
709 0.08
710 0.12
711 0.13
712 0.17
713 0.18
714 0.2
715 0.21
716 0.18
717 0.18
718 0.16
719 0.15
720 0.11
721 0.13
722 0.15
723 0.17
724 0.17
725 0.17
726 0.16
727 0.16
728 0.16
729 0.15
730 0.15
731 0.12
732 0.13
733 0.15
734 0.15
735 0.17
736 0.19
737 0.18
738 0.15
739 0.16
740 0.17
741 0.16
742 0.17
743 0.17
744 0.15
745 0.14
746 0.14
747 0.13
748 0.13
749 0.12
750 0.11
751 0.08
752 0.09
753 0.08
754 0.08
755 0.11
756 0.11
757 0.13
758 0.13
759 0.13
760 0.12
761 0.12
762 0.12
763 0.08
764 0.07
765 0.06
766 0.05
767 0.05
768 0.05
769 0.05
770 0.06
771 0.09
772 0.14
773 0.17
774 0.2
775 0.25
776 0.27
777 0.32
778 0.37
779 0.39
780 0.41
781 0.45
782 0.51
783 0.5
784 0.51
785 0.5
786 0.46
787 0.45
788 0.39
789 0.36
790 0.34
791 0.38
792 0.37
793 0.37
794 0.37
795 0.35
796 0.34
797 0.31
798 0.29
799 0.23
800 0.22
801 0.18
802 0.18
803 0.2
804 0.21
805 0.19
806 0.15
807 0.14
808 0.13
809 0.16
810 0.18
811 0.16
812 0.17
813 0.18
814 0.21
815 0.21
816 0.21
817 0.18
818 0.15
819 0.13
820 0.1
821 0.1
822 0.08
823 0.07
824 0.07
825 0.07
826 0.07
827 0.08
828 0.09
829 0.13
830 0.13
831 0.14
832 0.16
833 0.2
834 0.23
835 0.26
836 0.29
837 0.3
838 0.36
839 0.42
840 0.42
841 0.41
842 0.4
843 0.36
844 0.32
845 0.29
846 0.24
847 0.18
848 0.16
849 0.14
850 0.12
851 0.15
852 0.17
853 0.16
854 0.13
855 0.13
856 0.14
857 0.13
858 0.13
859 0.1
860 0.08
861 0.09
862 0.09
863 0.09
864 0.08
865 0.07
866 0.07
867 0.06
868 0.07
869 0.07
870 0.11
871 0.12
872 0.13
873 0.13
874 0.15
875 0.21
876 0.21
877 0.26
878 0.27
879 0.32
880 0.36
881 0.44
882 0.44
883 0.47
884 0.53
885 0.54
886 0.52
887 0.54
888 0.56
889 0.53
890 0.54
891 0.54
892 0.49
893 0.5
894 0.52
895 0.5
896 0.44
897 0.42
898 0.39
899 0.31
900 0.28
901 0.22
902 0.19
903 0.16
904 0.14
905 0.13
906 0.13
907 0.17
908 0.19
909 0.18
910 0.18
911 0.23
912 0.26
913 0.28
914 0.34
915 0.32
916 0.33
917 0.36
918 0.38
919 0.36
920 0.35
921 0.36
922 0.34
923 0.35
924 0.33
925 0.29
926 0.26
927 0.22
928 0.19
929 0.18
930 0.13
931 0.11
932 0.11
933 0.14
934 0.13
935 0.13
936 0.13
937 0.12
938 0.12
939 0.13
940 0.12
941 0.09
942 0.08
943 0.12
944 0.12
945 0.13
946 0.13
947 0.13
948 0.15
949 0.16
950 0.2
951 0.19
952 0.22
953 0.24
954 0.25
955 0.3
956 0.32
957 0.34
958 0.32
959 0.3
960 0.27
961 0.26
962 0.24
963 0.18
964 0.17
965 0.15
966 0.14
967 0.14
968 0.13
969 0.11
970 0.12
971 0.12
972 0.13
973 0.16
974 0.16
975 0.2
976 0.23
977 0.26
978 0.25
979 0.25
980 0.22
981 0.22
982 0.24
983 0.2
984 0.22
985 0.2
986 0.19
987 0.19
988 0.19
989 0.15
990 0.15
991 0.21
992 0.23
993 0.3
994 0.32
995 0.33
996 0.4
997 0.48
998 0.52
999 0.53
1000 0.55
1001 0.55
1002 0.57
1003 0.58
1004 0.54
1005 0.5
1006 0.44
1007 0.41
1008 0.33
1009 0.32
1010 0.29
1011 0.26
1012 0.26
1013 0.24
1014 0.3
1015 0.33
1016 0.42
1017 0.45
1018 0.54
1019 0.6
1020 0.66
1021 0.71
1022 0.74
1023 0.78
1024 0.78
1025 0.79
1026 0.81
1027 0.83
1028 0.84
1029 0.81
1030 0.74
1031 0.72
1032 0.7
1033 0.63
1034 0.57
1035 0.5
1036 0.43
1037 0.37