FuNGI

Q6CH96

Protein Details

Accession

Q6CH96

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
314-333	REEPKKSKPQERGPKRIRYD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
311-330	KRPREEPKKSKPQERGPKRI

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity GO:0043137 P:DNA replication, removal of RNA primer GO:0090502 P:RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic
KEGG	yli:YALI0A10989g -
Pfam	View protein in Pfam PF00075 RNase_H
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1

Amino Acid Sequences

MNGKGLFSDSEPNGIRTCDWHADVKWYDASDVLDNPFDQEDDGYGADSEDTDDDDTDFDVSITTFPYPWLSKLVVTHNQKPAAIIHKKPVEMTMMYQGRPVALFYRRFSSILEEMTNDLTFTTTPKKEARQPLLLSVTPHTPSAHTAAEYSMPTTTAEHSGLIKIDDTHDSNNSDWYSPPEPLEQISQVVPFEYHNNGYYSYATPDTPCPASPYVTCSSDFGSLEECSRVFPLEHRVDKYCDTPGEPSPTLPCVIDSSDDDYPESVISLSSGDDSVICLSSDDDASDCDSVISLSSTESDSVIFVGASTLKRPREEPKKSKPQERGPKRIRYDPALEESTLQAYVSPGNSQRTYYAVKYSRHPGVFTDFNVALNHSTRPEDVHRFDDLQDAAYFLESRPKFFEATQRQHLNIRGRPVFEVFSDGSSKVDSDGKQWGGFGVWFGHYHPDNVAGPLTGDLQDPLQGELRGLLEAYKVLYNRHDDLLYTIYCDCYAVVQKLNAGKSFPRKYHTIVTSIQLYKQLLGMKVMLRHIVGHCGHPGNERADILAKMGRVRRDGRISCMNAVMEDRYRRTIGEDSAYPFNGVKLDYLLDRRDWPQKMGAQKRRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.27
3	0.23
4	0.29
5	0.27
6	0.28
7	0.32
8	0.31
9	0.39
10	0.4
11	0.4
12	0.37
13	0.32
14	0.3
15	0.26
16	0.27
17	0.22
18	0.22
19	0.21
20	0.19
21	0.19
22	0.2
23	0.19
24	0.17
25	0.14
26	0.12
27	0.11
28	0.11
29	0.12
30	0.11
31	0.1
32	0.1
33	0.09
34	0.09
35	0.09
36	0.07
37	0.09
38	0.09
39	0.09
40	0.09
41	0.1
42	0.1
43	0.09
44	0.09
45	0.07
46	0.07
47	0.07
48	0.07
49	0.08
50	0.09
51	0.08
52	0.09
53	0.14
54	0.15
55	0.16
56	0.2
57	0.2
58	0.21
59	0.25
60	0.32
61	0.36
62	0.42
63	0.49
64	0.52
65	0.53
66	0.51
67	0.48
68	0.45
69	0.46
70	0.46
71	0.41
72	0.43
73	0.45
74	0.46
75	0.45
76	0.43
77	0.37
78	0.31
79	0.31
80	0.32
81	0.3
82	0.29
83	0.3
84	0.28
85	0.24
86	0.23
87	0.22
88	0.17
89	0.2
90	0.24
91	0.25
92	0.3
93	0.31
94	0.31
95	0.31
96	0.32
97	0.29
98	0.27
99	0.26
100	0.22
101	0.22
102	0.23
103	0.22
104	0.16
105	0.13
106	0.1
107	0.09
108	0.11
109	0.17
110	0.17
111	0.21
112	0.26
113	0.31
114	0.39
115	0.49
116	0.53
117	0.54
118	0.54
119	0.56
120	0.57
121	0.53
122	0.46
123	0.38
124	0.35
125	0.28
126	0.27
127	0.22
128	0.17
129	0.18
130	0.2
131	0.19
132	0.16
133	0.15
134	0.15
135	0.17
136	0.16
137	0.15
138	0.11
139	0.11
140	0.11
141	0.11
142	0.12
143	0.12
144	0.12
145	0.12
146	0.13
147	0.14
148	0.14
149	0.13
150	0.12
151	0.1
152	0.11
153	0.13
154	0.14
155	0.15
156	0.17
157	0.19
158	0.19
159	0.22
160	0.21
161	0.19
162	0.18
163	0.21
164	0.21
165	0.2
166	0.21
167	0.19
168	0.19
169	0.19
170	0.21
171	0.16
172	0.15
173	0.15
174	0.14
175	0.12
176	0.12
177	0.11
178	0.09
179	0.11
180	0.12
181	0.13
182	0.13
183	0.14
184	0.15
185	0.16
186	0.16
187	0.15
188	0.15
189	0.15
190	0.14
191	0.14
192	0.15
193	0.17
194	0.16
195	0.16
196	0.17
197	0.17
198	0.19
199	0.18
200	0.21
201	0.22
202	0.22
203	0.22
204	0.19
205	0.2
206	0.21
207	0.2
208	0.16
209	0.15
210	0.13
211	0.14
212	0.14
213	0.12
214	0.1
215	0.1
216	0.1
217	0.08
218	0.1
219	0.17
220	0.24
221	0.28
222	0.3
223	0.32
224	0.34
225	0.35
226	0.35
227	0.29
228	0.23
229	0.21
230	0.21
231	0.22
232	0.26
233	0.25
234	0.23
235	0.22
236	0.22
237	0.21
238	0.18
239	0.15
240	0.1
241	0.1
242	0.11
243	0.1
244	0.14
245	0.14
246	0.14
247	0.13
248	0.12
249	0.12
250	0.1
251	0.09
252	0.05
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.05
259	0.04
260	0.04
261	0.05
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.06
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.05
294	0.05
295	0.07
296	0.11
297	0.13
298	0.14
299	0.16
300	0.25
301	0.34
302	0.44
303	0.52
304	0.58
305	0.68
306	0.73
307	0.79
308	0.79
309	0.78
310	0.79
311	0.79
312	0.8
313	0.76
314	0.8
315	0.76
316	0.75
317	0.68
318	0.61
319	0.57
320	0.49
321	0.46
322	0.38
323	0.34
324	0.27
325	0.25
326	0.21
327	0.15
328	0.12
329	0.07
330	0.06
331	0.07
332	0.07
333	0.08
334	0.09
335	0.13
336	0.14
337	0.14
338	0.14
339	0.17
340	0.19
341	0.19
342	0.24
343	0.27
344	0.28
345	0.31
346	0.36
347	0.39
348	0.37
349	0.36
350	0.3
351	0.29
352	0.29
353	0.27
354	0.26
355	0.2
356	0.2
357	0.2
358	0.19
359	0.15
360	0.14
361	0.14
362	0.11
363	0.11
364	0.1
365	0.13
366	0.18
367	0.23
368	0.24
369	0.27
370	0.27
371	0.28
372	0.28
373	0.29
374	0.24
375	0.2
376	0.17
377	0.14
378	0.12
379	0.11
380	0.11
381	0.07
382	0.16
383	0.14
384	0.16
385	0.18
386	0.2
387	0.21
388	0.21
389	0.32
390	0.33
391	0.4
392	0.47
393	0.47
394	0.47
395	0.5
396	0.55
397	0.52
398	0.46
399	0.47
400	0.41
401	0.39
402	0.39
403	0.37
404	0.32
405	0.24
406	0.25
407	0.18
408	0.17
409	0.17
410	0.16
411	0.15
412	0.14
413	0.14
414	0.11
415	0.15
416	0.13
417	0.14
418	0.2
419	0.21
420	0.21
421	0.2
422	0.19
423	0.16
424	0.15
425	0.14
426	0.1
427	0.09
428	0.09
429	0.1
430	0.15
431	0.15
432	0.16
433	0.15
434	0.17
435	0.17
436	0.17
437	0.17
438	0.12
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.09
443	0.09
444	0.08
445	0.08
446	0.1
447	0.11
448	0.11
449	0.13
450	0.12
451	0.12
452	0.13
453	0.13
454	0.11
455	0.1
456	0.09
457	0.07
458	0.07
459	0.09
460	0.1
461	0.1
462	0.11
463	0.15
464	0.2
465	0.22
466	0.24
467	0.23
468	0.2
469	0.22
470	0.25
471	0.21
472	0.18
473	0.16
474	0.14
475	0.14
476	0.14
477	0.11
478	0.1
479	0.14
480	0.15
481	0.17
482	0.18
483	0.21
484	0.26
485	0.29
486	0.27
487	0.25
488	0.28
489	0.36
490	0.43
491	0.43
492	0.42
493	0.43
494	0.47
495	0.54
496	0.51
497	0.46
498	0.41
499	0.41
500	0.45
501	0.42
502	0.39
503	0.34
504	0.32
505	0.27
506	0.28
507	0.28
508	0.21
509	0.22
510	0.23
511	0.22
512	0.24
513	0.25
514	0.24
515	0.2
516	0.22
517	0.21
518	0.26
519	0.24
520	0.23
521	0.26
522	0.27
523	0.28
524	0.29
525	0.32
526	0.28
527	0.29
528	0.27
529	0.24
530	0.24
531	0.23
532	0.22
533	0.2
534	0.19
535	0.22
536	0.26
537	0.29
538	0.32
539	0.36
540	0.42
541	0.49
542	0.51
543	0.52
544	0.57
545	0.57
546	0.53
547	0.53
548	0.45
549	0.36
550	0.35
551	0.32
552	0.29
553	0.31
554	0.31
555	0.32
556	0.32
557	0.32
558	0.34
559	0.35
560	0.33
561	0.33
562	0.34
563	0.34
564	0.38
565	0.38
566	0.35
567	0.3
568	0.27
569	0.23
570	0.2
571	0.16
572	0.13
573	0.14
574	0.17
575	0.21
576	0.23
577	0.24
578	0.28
579	0.32
580	0.39
581	0.4
582	0.4
583	0.43
584	0.46
585	0.54
586	0.61

Q6CH96

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer