FuNGI

Q6C9H2

Protein Details

Accession

Q6C9H2

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-22	MPREVKKRGRRAAAKRAEEEKE	Basic
244-263	SSVLRSKKSRTARRNIDIKD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
5-16	VKKRGRRAAAKR
653-705	KRFGRGGARIITRGGGTFPRGGGRGRGGFRGGRGGAPRGGFGGSDRGGFKRAN
717-720	SRKK

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 8.5, mito 3, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR040000 NOP9 IPR001313 Pumilio_RNA-bd_rpt
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0005730 C:nucleolus GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0003723 F:RNA binding GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
KEGG	yli:YALI0D11242g -
Pfam	View protein in Pfam PF00806 PUF

Amino Acid Sequences

MPREVKKRGRRAAAKRAEEEKEDVDLKVYENDEDYVTFDADGGVAGGHDDEENDGYDNETPYNPLDLKQMPFFGFLDDQESEYFKTAESTLAVDAFGSPEEKLGFISGLLDEARGKELKLVTNQICSKLMERLILLANDEQIRALFEVFSGYFVDLSRHKYSSHCVETLLVRGAAIVEKEVLDPNFDGDSEDSMEKRFLTLANDMKDYIQDLISNPYASHVIRVLLLILGGQTLPSPTSSEGNSSVLRSKKSRTARRNIDIKDSEENDRAYQIPGAFHDALEAIVSGFSKRLKPTAARELAIGQVSSPVVQLLIDSEATTSEQRPLLNTIFADTEDRDSSEEAFVEHLLSDAVGSHFLQNVLQKAPEAFVERLYRLYMSQRVQKLVRRDYAGFVIETCMQRLPEADVHHIIDTAMGEIPYLVENNNLTMVRILLTRAAAANYKATDVANAVLKTFDTDSTDPKLLQKVLQLDEKNPYKPHEASSPGLHRCLVLQQLVEASPEVLATAFVGLNSGDVDVIKMAKHQSYSRLLEKCLRPSINTIERRKFLNKINGQCVDLARDPFASHVMDRLWNFTYKMNNFREKIANELVADEDLKENTYGKAVWRNWSLDKFLRRKSDWWVTLHATDDALAKEYEELGIPLDAKSLANPGQKRFGRGGARIITRGGGTFPRGGGRGRGGFRGGRGGAPRGGFGGSDRGGFKRANGGDGEDASGDRSRKKVRNE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.87
2	0.83
3	0.81
4	0.75
5	0.69
6	0.63
7	0.54
8	0.49
9	0.42
10	0.35
11	0.3
12	0.26
13	0.24
14	0.24
15	0.23
16	0.18
17	0.18
18	0.19
19	0.18
20	0.17
21	0.17
22	0.15
23	0.14
24	0.13
25	0.11
26	0.1
27	0.09
28	0.08
29	0.07
30	0.05
31	0.04
32	0.04
33	0.04
34	0.05
35	0.05
36	0.05
37	0.06
38	0.07
39	0.09
40	0.1
41	0.1
42	0.11
43	0.13
44	0.14
45	0.14
46	0.14
47	0.15
48	0.15
49	0.19
50	0.19
51	0.17
52	0.22
53	0.25
54	0.28
55	0.3
56	0.32
57	0.28
58	0.3
59	0.29
60	0.26
61	0.23
62	0.2
63	0.22
64	0.19
65	0.2
66	0.18
67	0.2
68	0.18
69	0.18
70	0.18
71	0.13
72	0.14
73	0.13
74	0.14
75	0.13
76	0.13
77	0.12
78	0.12
79	0.12
80	0.1
81	0.1
82	0.09
83	0.09
84	0.08
85	0.07
86	0.08
87	0.09
88	0.09
89	0.09
90	0.09
91	0.09
92	0.08
93	0.09
94	0.07
95	0.08
96	0.08
97	0.09
98	0.08
99	0.09
100	0.12
101	0.12
102	0.12
103	0.15
104	0.18
105	0.22
106	0.26
107	0.33
108	0.32
109	0.4
110	0.42
111	0.41
112	0.4
113	0.36
114	0.34
115	0.31
116	0.3
117	0.24
118	0.22
119	0.21
120	0.22
121	0.21
122	0.21
123	0.16
124	0.17
125	0.17
126	0.16
127	0.14
128	0.11
129	0.12
130	0.11
131	0.11
132	0.07
133	0.07
134	0.09
135	0.09
136	0.1
137	0.09
138	0.09
139	0.09
140	0.09
141	0.12
142	0.12
143	0.19
144	0.21
145	0.22
146	0.22
147	0.24
148	0.3
149	0.36
150	0.39
151	0.33
152	0.3
153	0.31
154	0.32
155	0.33
156	0.29
157	0.2
158	0.14
159	0.14
160	0.13
161	0.12
162	0.11
163	0.08
164	0.06
165	0.07
166	0.08
167	0.11
168	0.1
169	0.11
170	0.11
171	0.12
172	0.12
173	0.11
174	0.12
175	0.1
176	0.11
177	0.12
178	0.13
179	0.12
180	0.12
181	0.13
182	0.12
183	0.11
184	0.11
185	0.09
186	0.12
187	0.17
188	0.22
189	0.24
190	0.25
191	0.25
192	0.24
193	0.23
194	0.21
195	0.16
196	0.11
197	0.09
198	0.09
199	0.13
200	0.14
201	0.14
202	0.13
203	0.13
204	0.14
205	0.13
206	0.14
207	0.1
208	0.1
209	0.1
210	0.1
211	0.09
212	0.07
213	0.07
214	0.06
215	0.05
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.03
220	0.04
221	0.04
222	0.05
223	0.06
224	0.07
225	0.09
226	0.1
227	0.12
228	0.14
229	0.16
230	0.16
231	0.16
232	0.21
233	0.22
234	0.25
235	0.25
236	0.27
237	0.32
238	0.42
239	0.51
240	0.55
241	0.63
242	0.69
243	0.75
244	0.8
245	0.74
246	0.73
247	0.65
248	0.59
249	0.54
250	0.47
251	0.42
252	0.36
253	0.35
254	0.26
255	0.25
256	0.22
257	0.17
258	0.17
259	0.14
260	0.12
261	0.11
262	0.17
263	0.15
264	0.14
265	0.14
266	0.12
267	0.11
268	0.1
269	0.09
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.05
275	0.07
276	0.09
277	0.1
278	0.12
279	0.15
280	0.19
281	0.25
282	0.34
283	0.36
284	0.34
285	0.33
286	0.32
287	0.31
288	0.28
289	0.21
290	0.11
291	0.09
292	0.08
293	0.08
294	0.07
295	0.05
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.06
306	0.07
307	0.07
308	0.08
309	0.1
310	0.1
311	0.11
312	0.14
313	0.14
314	0.14
315	0.13
316	0.12
317	0.11
318	0.12
319	0.12
320	0.09
321	0.1
322	0.1
323	0.1
324	0.1
325	0.1
326	0.1
327	0.09
328	0.09
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.06
333	0.06
334	0.05
335	0.04
336	0.04
337	0.03
338	0.03
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.07
346	0.08
347	0.09
348	0.09
349	0.09
350	0.09
351	0.09
352	0.09
353	0.09
354	0.11
355	0.1
356	0.12
357	0.14
358	0.15
359	0.15
360	0.15
361	0.14
362	0.12
363	0.14
364	0.16
365	0.17
366	0.23
367	0.24
368	0.27
369	0.29
370	0.33
371	0.37
372	0.38
373	0.38
374	0.36
375	0.35
376	0.33
377	0.33
378	0.29
379	0.22
380	0.16
381	0.15
382	0.15
383	0.14
384	0.13
385	0.11
386	0.11
387	0.11
388	0.11
389	0.12
390	0.12
391	0.14
392	0.16
393	0.16
394	0.17
395	0.17
396	0.16
397	0.14
398	0.1
399	0.09
400	0.07
401	0.06
402	0.05
403	0.05
404	0.04
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.04
409	0.05
410	0.05
411	0.06
412	0.08
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.07
420	0.06
421	0.06
422	0.07
423	0.07
424	0.08
425	0.08
426	0.09
427	0.1
428	0.09
429	0.1
430	0.1
431	0.09
432	0.09
433	0.08
434	0.09
435	0.11
436	0.11
437	0.11
438	0.1
439	0.1
440	0.11
441	0.11
442	0.1
443	0.11
444	0.12
445	0.15
446	0.19
447	0.2
448	0.19
449	0.2
450	0.23
451	0.19
452	0.2
453	0.2
454	0.21
455	0.23
456	0.29
457	0.28
458	0.27
459	0.34
460	0.36
461	0.36
462	0.33
463	0.33
464	0.32
465	0.32
466	0.33
467	0.31
468	0.32
469	0.31
470	0.36
471	0.41
472	0.37
473	0.37
474	0.34
475	0.28
476	0.24
477	0.25
478	0.21
479	0.14
480	0.13
481	0.12
482	0.13
483	0.13
484	0.13
485	0.1
486	0.08
487	0.06
488	0.06
489	0.06
490	0.04
491	0.04
492	0.04
493	0.05
494	0.04
495	0.04
496	0.05
497	0.04
498	0.05
499	0.05
500	0.05
501	0.04
502	0.04
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.07
508	0.09
509	0.1
510	0.13
511	0.15
512	0.2
513	0.27
514	0.32
515	0.38
516	0.39
517	0.39
518	0.45
519	0.48
520	0.49
521	0.49
522	0.45
523	0.39
524	0.41
525	0.48
526	0.49
527	0.54
528	0.55
529	0.54
530	0.55
531	0.59
532	0.58
533	0.55
534	0.53
535	0.55
536	0.55
537	0.56
538	0.62
539	0.59
540	0.56
541	0.52
542	0.45
543	0.39
544	0.35
545	0.28
546	0.21
547	0.19
548	0.18
549	0.17
550	0.18
551	0.15
552	0.12
553	0.13
554	0.13
555	0.17
556	0.18
557	0.2
558	0.2
559	0.21
560	0.22
561	0.23
562	0.3
563	0.3
564	0.39
565	0.42
566	0.48
567	0.48
568	0.51
569	0.55
570	0.47
571	0.49
572	0.44
573	0.39
574	0.31
575	0.31
576	0.27
577	0.2
578	0.2
579	0.14
580	0.12
581	0.1
582	0.11
583	0.1
584	0.11
585	0.1
586	0.12
587	0.12
588	0.14
589	0.23
590	0.24
591	0.3
592	0.34
593	0.38
594	0.42
595	0.44
596	0.47
597	0.45
598	0.52
599	0.53
600	0.56
601	0.61
602	0.58
603	0.58
604	0.61
605	0.64
606	0.6
607	0.56
608	0.55
609	0.5
610	0.48
611	0.48
612	0.39
613	0.29
614	0.24
615	0.23
616	0.17
617	0.15
618	0.13
619	0.11
620	0.11
621	0.11
622	0.11
623	0.09
624	0.09
625	0.08
626	0.09
627	0.09
628	0.09
629	0.1
630	0.1
631	0.09
632	0.1
633	0.13
634	0.18
635	0.25
636	0.29
637	0.31
638	0.41
639	0.43
640	0.47
641	0.46
642	0.48
643	0.48
644	0.47
645	0.51
646	0.49
647	0.51
648	0.47
649	0.45
650	0.38
651	0.32
652	0.29
653	0.24
654	0.19
655	0.18
656	0.19
657	0.19
658	0.21
659	0.23
660	0.24
661	0.25
662	0.29
663	0.33
664	0.33
665	0.36
666	0.36
667	0.36
668	0.37
669	0.4
670	0.34
671	0.32
672	0.33
673	0.34
674	0.34
675	0.33
676	0.32
677	0.25
678	0.24
679	0.2
680	0.18
681	0.21
682	0.18
683	0.2
684	0.21
685	0.22
686	0.24
687	0.25
688	0.24
689	0.27
690	0.27
691	0.27
692	0.27
693	0.29
694	0.29
695	0.3
696	0.3
697	0.21
698	0.2
699	0.19
700	0.22
701	0.21
702	0.21
703	0.27
704	0.35

Q6C9H2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer