Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C6F8

Protein Details
Accession Q6C6F8    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-93RERDRDFRDRDRERDRERDRYRNQRWRRRDDSVDRERERERHRDRDYRDRGDRBasic
105-137GRDRRDRRDDDRTRDRPRDRDRDRDRDRDRDRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-161RDRDFRDRDRERDRERDRYRNQRWRRRDDSVDRERERERHRDRDYRDRGDRGDRRDRYSRDGGRDRRDRRDDDRTRDRPRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRGDRERARDRTR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0000243  C:commitment complex  
GO:0016607  C:nuclear speck  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0089701  C:U2AF complex  
GO:0008187  F:poly-pyrimidine tract binding  
GO:0030628  F:pre-mRNA 3'-splice site binding  
KEGG yli:YALI0E09889g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MNNSVEEFLAQTQRGLDTQQPPRPRSHDSRDTERDVRDRERERDRDFRDRDRERDRERDRYRNQRWRRRDDSVDRERERERHRDRDYRDRGDRGDRRDRYSRDGGRDRRDRRDDDRTRDRPRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRGDRERARDRTRERDRDVSIDDSVVPLDERPLSAPTGWDVKARGYERVSSELAKRSGLFPLPGRPTQVNYNVLRGLVEGLPDQPTDHETAAMMPLVDTGPINNGKGSVRPEFSRVARRLILSGIPADQIDTVAIKSFFTDFIEGLELQGSKERIVDGVYKHPRLPEVLVEFFSAEMATLALALSGLGINYSGPPISIRRPSNYICPTPERSEVSRRSLDEEKEVASVVEDSNTKIIVWDIPFNVEEDQVRQLTASFGELSAFQLIRQLPSRESAGIALVDYKDPEVVKDAVSGLSGQVIGGKNLKVMLACEGPTQLSCSSNNGLKGIVTVMNDVKSRPESSVIVLFNLVTLDELLDDVAYREITEQVESECLKYGGGEEVQIKIPRPDPEAMKASYRRLIFETRPGVGKVYVKFASVETSRVAMQKLTGLRFSRRSVIASYYSEECFDMNVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.24
4 0.29
5 0.38
6 0.45
7 0.53
8 0.54
9 0.61
10 0.63
11 0.65
12 0.65
13 0.65
14 0.68
15 0.67
16 0.75
17 0.75
18 0.77
19 0.74
20 0.71
21 0.68
22 0.65
23 0.64
24 0.64
25 0.64
26 0.64
27 0.69
28 0.71
29 0.71
30 0.75
31 0.75
32 0.76
33 0.75
34 0.77
35 0.77
36 0.76
37 0.78
38 0.78
39 0.8
40 0.77
41 0.81
42 0.78
43 0.79
44 0.8
45 0.82
46 0.82
47 0.83
48 0.87
49 0.87
50 0.9
51 0.9
52 0.92
53 0.91
54 0.89
55 0.87
56 0.86
57 0.86
58 0.85
59 0.85
60 0.85
61 0.78
62 0.75
63 0.72
64 0.7
65 0.66
66 0.66
67 0.64
68 0.64
69 0.7
70 0.74
71 0.76
72 0.79
73 0.81
74 0.8
75 0.79
76 0.74
77 0.7
78 0.72
79 0.72
80 0.69
81 0.7
82 0.65
83 0.65
84 0.69
85 0.68
86 0.65
87 0.68
88 0.66
89 0.66
90 0.71
91 0.72
92 0.72
93 0.79
94 0.78
95 0.78
96 0.78
97 0.75
98 0.73
99 0.76
100 0.75
101 0.74
102 0.79
103 0.78
104 0.8
105 0.83
106 0.82
107 0.81
108 0.82
109 0.83
110 0.79
111 0.81
112 0.81
113 0.82
114 0.83
115 0.84
116 0.8
117 0.8
118 0.8
119 0.8
120 0.77
121 0.77
122 0.75
123 0.75
124 0.75
125 0.75
126 0.75
127 0.75
128 0.75
129 0.75
130 0.75
131 0.75
132 0.74
133 0.73
134 0.72
135 0.7
136 0.71
137 0.69
138 0.72
139 0.69
140 0.7
141 0.7
142 0.73
143 0.7
144 0.72
145 0.68
146 0.7
147 0.73
148 0.76
149 0.71
150 0.71
151 0.67
152 0.63
153 0.6
154 0.52
155 0.42
156 0.33
157 0.27
158 0.2
159 0.17
160 0.13
161 0.09
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.1
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.15
173 0.16
174 0.16
175 0.15
176 0.16
177 0.22
178 0.23
179 0.26
180 0.23
181 0.26
182 0.26
183 0.3
184 0.3
185 0.25
186 0.27
187 0.29
188 0.29
189 0.26
190 0.24
191 0.21
192 0.23
193 0.22
194 0.2
195 0.16
196 0.23
197 0.26
198 0.26
199 0.29
200 0.27
201 0.28
202 0.31
203 0.35
204 0.34
205 0.31
206 0.33
207 0.3
208 0.29
209 0.26
210 0.21
211 0.17
212 0.11
213 0.11
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.07
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.12
242 0.16
243 0.16
244 0.17
245 0.17
246 0.2
247 0.23
248 0.26
249 0.32
250 0.3
251 0.31
252 0.31
253 0.3
254 0.28
255 0.25
256 0.23
257 0.15
258 0.14
259 0.11
260 0.09
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.05
269 0.06
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.09
285 0.09
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.08
291 0.11
292 0.1
293 0.2
294 0.24
295 0.25
296 0.26
297 0.26
298 0.26
299 0.24
300 0.24
301 0.18
302 0.17
303 0.17
304 0.17
305 0.17
306 0.16
307 0.15
308 0.13
309 0.09
310 0.05
311 0.04
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.02
317 0.02
318 0.02
319 0.02
320 0.02
321 0.02
322 0.02
323 0.02
324 0.02
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.05
330 0.07
331 0.11
332 0.18
333 0.2
334 0.22
335 0.27
336 0.28
337 0.36
338 0.39
339 0.39
340 0.35
341 0.39
342 0.4
343 0.4
344 0.42
345 0.37
346 0.35
347 0.4
348 0.41
349 0.42
350 0.41
351 0.38
352 0.4
353 0.41
354 0.39
355 0.34
356 0.31
357 0.26
358 0.23
359 0.22
360 0.16
361 0.12
362 0.11
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.09
369 0.08
370 0.07
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.12
375 0.11
376 0.13
377 0.13
378 0.14
379 0.14
380 0.13
381 0.12
382 0.11
383 0.13
384 0.12
385 0.12
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.09
391 0.07
392 0.06
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.1
397 0.09
398 0.08
399 0.12
400 0.12
401 0.14
402 0.18
403 0.19
404 0.17
405 0.2
406 0.22
407 0.18
408 0.18
409 0.16
410 0.14
411 0.12
412 0.11
413 0.1
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.08
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.11
422 0.12
423 0.12
424 0.12
425 0.13
426 0.11
427 0.12
428 0.11
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.06
433 0.09
434 0.09
435 0.1
436 0.13
437 0.13
438 0.12
439 0.13
440 0.14
441 0.1
442 0.1
443 0.13
444 0.12
445 0.13
446 0.13
447 0.13
448 0.13
449 0.13
450 0.15
451 0.13
452 0.13
453 0.13
454 0.16
455 0.19
456 0.22
457 0.23
458 0.21
459 0.2
460 0.18
461 0.17
462 0.16
463 0.15
464 0.12
465 0.13
466 0.14
467 0.17
468 0.17
469 0.17
470 0.19
471 0.19
472 0.2
473 0.19
474 0.21
475 0.19
476 0.22
477 0.28
478 0.25
479 0.23
480 0.21
481 0.2
482 0.16
483 0.15
484 0.12
485 0.06
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.05
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.07
498 0.09
499 0.1
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.15
504 0.16
505 0.16
506 0.16
507 0.15
508 0.14
509 0.13
510 0.14
511 0.13
512 0.13
513 0.15
514 0.14
515 0.17
516 0.22
517 0.24
518 0.24
519 0.24
520 0.28
521 0.29
522 0.32
523 0.35
524 0.34
525 0.39
526 0.43
527 0.42
528 0.45
529 0.46
530 0.46
531 0.47
532 0.44
533 0.39
534 0.38
535 0.43
536 0.38
537 0.43
538 0.44
539 0.41
540 0.43
541 0.41
542 0.39
543 0.36
544 0.38
545 0.31
546 0.32
547 0.31
548 0.28
549 0.28
550 0.26
551 0.29
552 0.25
553 0.25
554 0.19
555 0.2
556 0.22
557 0.23
558 0.23
559 0.17
560 0.17
561 0.21
562 0.26
563 0.27
564 0.32
565 0.33
566 0.39
567 0.44
568 0.47
569 0.48
570 0.45
571 0.44
572 0.41
573 0.43
574 0.41
575 0.39
576 0.39
577 0.35
578 0.33
579 0.31
580 0.29
581 0.23