Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C5G2

Protein Details
Accession Q6C5G2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-85EEFNRKRFSSKKLEKSKAEKMAKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-120RKRFSSKKLEKSKAEKMAKSEPPKKKASWATRTAGEKVEEEKQKKEKTPRNRLAG
353-361RDARKKGKK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 9.333, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0045893  P:positive regulation of DNA-templated transcription  
KEGG yli:YALI0E18326g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MEKYTVTEEYAKDMVGRLLGGFDKETVAQLVDQGMKKTDPLEVHSYFVELLGESEPVFRFVEEFNRKRFSSKKLEKSKAEKMAKSEPPKKKASWATRTAGEKVEEEKQKKEKTPRNRLAGVGKGGATTSELLDLKPKTKAKNKIKVDSIAEIDQALRDLELVEHGDVRKDGTTARAKCDCMASRHPLLEVAPNCMNCGKIHCLKEGLGPCTFCGTPLLSAEERNEISSVLYQQKEDIRSVNAPKQAVPKKKQKAIKYNLSNAGGRAAQEEAIKQMEEENRQAQEAKEKELQQAKERLDTLMAFQDSQAERTRIIDNVGDFELPSAGVNQWASATERALQLKKQQRQMAKMEERDARKKGKKHVISLGLDGKIREQEMEDDSTDDEELRELESKIKSEKQEVAELNSQNVWNPAMADSKLKRVKYVSRGDVQERRVEERGIIDIDGEDDEERLMRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.16
3 0.15
4 0.1
5 0.12
6 0.13
7 0.14
8 0.13
9 0.13
10 0.13
11 0.13
12 0.14
13 0.13
14 0.13
15 0.11
16 0.11
17 0.14
18 0.19
19 0.2
20 0.21
21 0.22
22 0.22
23 0.23
24 0.23
25 0.24
26 0.2
27 0.24
28 0.3
29 0.29
30 0.3
31 0.3
32 0.29
33 0.24
34 0.22
35 0.17
36 0.1
37 0.1
38 0.08
39 0.09
40 0.08
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.13
45 0.11
46 0.12
47 0.13
48 0.23
49 0.31
50 0.35
51 0.39
52 0.45
53 0.46
54 0.5
55 0.54
56 0.52
57 0.53
58 0.59
59 0.64
60 0.69
61 0.77
62 0.81
63 0.83
64 0.85
65 0.84
66 0.81
67 0.74
68 0.69
69 0.7
70 0.7
71 0.72
72 0.72
73 0.71
74 0.7
75 0.72
76 0.68
77 0.68
78 0.69
79 0.69
80 0.68
81 0.66
82 0.64
83 0.64
84 0.66
85 0.59
86 0.53
87 0.44
88 0.37
89 0.33
90 0.36
91 0.38
92 0.37
93 0.42
94 0.47
95 0.52
96 0.58
97 0.65
98 0.66
99 0.69
100 0.78
101 0.79
102 0.79
103 0.75
104 0.72
105 0.67
106 0.64
107 0.55
108 0.45
109 0.36
110 0.28
111 0.25
112 0.21
113 0.16
114 0.11
115 0.08
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.15
120 0.16
121 0.17
122 0.24
123 0.28
124 0.32
125 0.41
126 0.52
127 0.57
128 0.66
129 0.72
130 0.73
131 0.74
132 0.72
133 0.66
134 0.59
135 0.51
136 0.42
137 0.34
138 0.26
139 0.21
140 0.15
141 0.12
142 0.09
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.14
159 0.23
160 0.24
161 0.29
162 0.32
163 0.32
164 0.32
165 0.38
166 0.34
167 0.31
168 0.35
169 0.34
170 0.33
171 0.33
172 0.32
173 0.27
174 0.25
175 0.26
176 0.21
177 0.21
178 0.2
179 0.2
180 0.2
181 0.2
182 0.2
183 0.14
184 0.16
185 0.17
186 0.21
187 0.23
188 0.23
189 0.24
190 0.24
191 0.29
192 0.29
193 0.27
194 0.22
195 0.21
196 0.19
197 0.21
198 0.2
199 0.15
200 0.12
201 0.1
202 0.09
203 0.1
204 0.13
205 0.11
206 0.12
207 0.13
208 0.14
209 0.13
210 0.13
211 0.12
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.11
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.14
220 0.17
221 0.18
222 0.18
223 0.17
224 0.15
225 0.18
226 0.22
227 0.25
228 0.25
229 0.23
230 0.25
231 0.33
232 0.38
233 0.43
234 0.46
235 0.52
236 0.57
237 0.63
238 0.68
239 0.68
240 0.71
241 0.7
242 0.74
243 0.7
244 0.69
245 0.68
246 0.64
247 0.55
248 0.45
249 0.38
250 0.28
251 0.22
252 0.16
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.09
258 0.1
259 0.09
260 0.08
261 0.12
262 0.14
263 0.16
264 0.18
265 0.2
266 0.2
267 0.2
268 0.22
269 0.18
270 0.23
271 0.22
272 0.24
273 0.26
274 0.27
275 0.33
276 0.38
277 0.4
278 0.38
279 0.44
280 0.4
281 0.39
282 0.38
283 0.33
284 0.27
285 0.25
286 0.21
287 0.19
288 0.18
289 0.14
290 0.13
291 0.19
292 0.18
293 0.2
294 0.22
295 0.18
296 0.18
297 0.2
298 0.22
299 0.16
300 0.18
301 0.17
302 0.14
303 0.16
304 0.16
305 0.14
306 0.12
307 0.12
308 0.1
309 0.08
310 0.08
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.12
322 0.15
323 0.2
324 0.21
325 0.23
326 0.3
327 0.39
328 0.45
329 0.51
330 0.54
331 0.56
332 0.6
333 0.65
334 0.66
335 0.65
336 0.62
337 0.6
338 0.61
339 0.61
340 0.62
341 0.6
342 0.6
343 0.6
344 0.62
345 0.66
346 0.7
347 0.71
348 0.7
349 0.74
350 0.73
351 0.67
352 0.66
353 0.62
354 0.53
355 0.47
356 0.4
357 0.33
358 0.26
359 0.24
360 0.19
361 0.15
362 0.16
363 0.18
364 0.21
365 0.19
366 0.18
367 0.18
368 0.19
369 0.17
370 0.14
371 0.11
372 0.08
373 0.08
374 0.09
375 0.11
376 0.11
377 0.16
378 0.18
379 0.21
380 0.25
381 0.31
382 0.33
383 0.36
384 0.42
385 0.4
386 0.47
387 0.46
388 0.47
389 0.48
390 0.45
391 0.42
392 0.38
393 0.34
394 0.27
395 0.27
396 0.21
397 0.14
398 0.14
399 0.14
400 0.16
401 0.17
402 0.23
403 0.24
404 0.33
405 0.4
406 0.39
407 0.41
408 0.44
409 0.52
410 0.54
411 0.62
412 0.59
413 0.6
414 0.66
415 0.7
416 0.72
417 0.66
418 0.63
419 0.57
420 0.55
421 0.5
422 0.45
423 0.39
424 0.34
425 0.34
426 0.29
427 0.26
428 0.2
429 0.17
430 0.17
431 0.16
432 0.14
433 0.1
434 0.08
435 0.09