Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C7A2

Protein Details
Accession Q6C7A2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
351-372DGRPIPPSKRGPRKKSDKTTLVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
337-378KKEHRPRKYWGKMRDGRPIPPSKRGPRKKSDKTTLVKAEKKP
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042403  Spt21/Ams2  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000183  P:rDNA heterochromatin formation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0030466  P:silent mating-type cassette heterochromatin formation  
KEGG yli:YALI0E02442g  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MSTPNPMHSRRAAPTMRPKIKLKLLYELNGSSCLARTQFPVDVFAANDIAFANFKQCFSAINSASPEILASASETDYAVYVADCTEADEPMVGRGLLSQLLARPEVDISDTSTLLTGGVVSGRITSSLLSFIPGHAQETVEIRLRFVTIHKASQIASLMSMFLYSSIQQSLSDEQVSQICDGRWISDLQEQGIWEQLLEFKNSVLAEDDNPTRRIISPKKALSPFQSSPITVAPALSAPSVNPDEGIRLVGKISDPQSSSGLLSSSPSRHQTIIRSGRAQEIDKAKEQGQVEKENGNECYNCRTLHASSWRKCTTHDDDGVFTIILCNPCGLWFVNKKEHRPRKYWGKMRDGRPIPPSKRGPRKKSDKTTLVKAEKKPVLKLHDKPLGIQTSIDLTNDARKSTPSSQNPTPVSSHTMAPTPMGSTPVPSHHTQGLNRTHVQENPHLNKRPFQALTQSLQQPPEFESSQTLASRTASLPVSDRGAKRHKTDVASRPSCDAVHSAAIYKPTQFQAATSSPAVTPTMESTATMPSSPGTQTRSNRASAPGSPPRTNSASSSTPFLQPKALPPLPPITPQKVRLTPSKKDKTPDFLVGLSPSRWLSAYLGSSRSPSQFSSHTSPVDHNTVNFFSESDLFTESPFRGLYQGVRSEPFTQSTAGSMPPPSADDDYNMNVLPSSPSIFRMYKDNSDLFSSSSQSTEATSPINKLQQIARNSPDAHKSLEESEEIGNTNKTNKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.69
3 0.72
4 0.71
5 0.72
6 0.71
7 0.75
8 0.74
9 0.66
10 0.65
11 0.63
12 0.6
13 0.6
14 0.54
15 0.46
16 0.4
17 0.37
18 0.27
19 0.22
20 0.21
21 0.18
22 0.17
23 0.18
24 0.2
25 0.24
26 0.24
27 0.27
28 0.26
29 0.26
30 0.25
31 0.23
32 0.2
33 0.15
34 0.14
35 0.11
36 0.11
37 0.1
38 0.09
39 0.13
40 0.13
41 0.13
42 0.14
43 0.14
44 0.16
45 0.2
46 0.29
47 0.26
48 0.3
49 0.32
50 0.31
51 0.31
52 0.29
53 0.23
54 0.15
55 0.13
56 0.09
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.08
72 0.09
73 0.08
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.1
78 0.11
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.11
87 0.13
88 0.14
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.13
94 0.12
95 0.13
96 0.14
97 0.14
98 0.13
99 0.13
100 0.12
101 0.11
102 0.1
103 0.06
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.11
118 0.1
119 0.15
120 0.15
121 0.16
122 0.14
123 0.15
124 0.14
125 0.16
126 0.19
127 0.21
128 0.21
129 0.2
130 0.2
131 0.2
132 0.19
133 0.18
134 0.25
135 0.21
136 0.25
137 0.25
138 0.26
139 0.26
140 0.28
141 0.28
142 0.18
143 0.16
144 0.13
145 0.12
146 0.1
147 0.1
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.08
154 0.09
155 0.09
156 0.11
157 0.13
158 0.14
159 0.14
160 0.13
161 0.13
162 0.15
163 0.16
164 0.15
165 0.15
166 0.13
167 0.15
168 0.15
169 0.15
170 0.14
171 0.14
172 0.15
173 0.16
174 0.17
175 0.15
176 0.17
177 0.16
178 0.15
179 0.17
180 0.14
181 0.1
182 0.1
183 0.13
184 0.13
185 0.14
186 0.14
187 0.11
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.15
195 0.19
196 0.2
197 0.21
198 0.21
199 0.2
200 0.21
201 0.29
202 0.32
203 0.37
204 0.43
205 0.46
206 0.54
207 0.56
208 0.57
209 0.54
210 0.56
211 0.48
212 0.45
213 0.42
214 0.34
215 0.32
216 0.3
217 0.27
218 0.18
219 0.17
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.08
225 0.06
226 0.1
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.11
233 0.13
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.11
240 0.12
241 0.14
242 0.15
243 0.16
244 0.17
245 0.17
246 0.17
247 0.14
248 0.13
249 0.09
250 0.1
251 0.11
252 0.12
253 0.14
254 0.17
255 0.18
256 0.19
257 0.21
258 0.25
259 0.32
260 0.39
261 0.39
262 0.39
263 0.38
264 0.41
265 0.41
266 0.38
267 0.33
268 0.31
269 0.31
270 0.3
271 0.32
272 0.28
273 0.31
274 0.3
275 0.3
276 0.28
277 0.28
278 0.28
279 0.28
280 0.27
281 0.25
282 0.26
283 0.22
284 0.19
285 0.16
286 0.19
287 0.19
288 0.18
289 0.17
290 0.19
291 0.19
292 0.24
293 0.33
294 0.38
295 0.4
296 0.48
297 0.49
298 0.46
299 0.47
300 0.49
301 0.46
302 0.43
303 0.43
304 0.36
305 0.34
306 0.34
307 0.33
308 0.25
309 0.18
310 0.12
311 0.1
312 0.09
313 0.08
314 0.07
315 0.06
316 0.07
317 0.08
318 0.08
319 0.11
320 0.15
321 0.2
322 0.3
323 0.33
324 0.4
325 0.49
326 0.59
327 0.6
328 0.6
329 0.63
330 0.65
331 0.71
332 0.73
333 0.7
334 0.71
335 0.73
336 0.73
337 0.75
338 0.67
339 0.61
340 0.59
341 0.6
342 0.52
343 0.53
344 0.56
345 0.55
346 0.64
347 0.69
348 0.7
349 0.71
350 0.79
351 0.8
352 0.82
353 0.82
354 0.8
355 0.74
356 0.74
357 0.73
358 0.7
359 0.67
360 0.59
361 0.59
362 0.54
363 0.51
364 0.47
365 0.43
366 0.42
367 0.42
368 0.44
369 0.44
370 0.46
371 0.44
372 0.42
373 0.42
374 0.38
375 0.31
376 0.27
377 0.19
378 0.15
379 0.15
380 0.14
381 0.1
382 0.08
383 0.14
384 0.14
385 0.14
386 0.12
387 0.13
388 0.18
389 0.24
390 0.33
391 0.32
392 0.39
393 0.41
394 0.48
395 0.48
396 0.46
397 0.4
398 0.33
399 0.32
400 0.27
401 0.25
402 0.19
403 0.19
404 0.17
405 0.16
406 0.14
407 0.11
408 0.09
409 0.11
410 0.1
411 0.1
412 0.11
413 0.14
414 0.17
415 0.17
416 0.19
417 0.21
418 0.24
419 0.24
420 0.31
421 0.34
422 0.35
423 0.35
424 0.36
425 0.34
426 0.33
427 0.35
428 0.34
429 0.36
430 0.39
431 0.45
432 0.48
433 0.47
434 0.49
435 0.49
436 0.49
437 0.41
438 0.36
439 0.35
440 0.33
441 0.35
442 0.36
443 0.37
444 0.32
445 0.32
446 0.31
447 0.25
448 0.23
449 0.25
450 0.2
451 0.16
452 0.17
453 0.16
454 0.19
455 0.19
456 0.17
457 0.13
458 0.14
459 0.15
460 0.13
461 0.14
462 0.12
463 0.12
464 0.14
465 0.14
466 0.17
467 0.2
468 0.2
469 0.24
470 0.32
471 0.35
472 0.37
473 0.42
474 0.44
475 0.44
476 0.52
477 0.54
478 0.57
479 0.56
480 0.54
481 0.49
482 0.46
483 0.41
484 0.33
485 0.26
486 0.17
487 0.15
488 0.15
489 0.14
490 0.14
491 0.16
492 0.16
493 0.15
494 0.16
495 0.15
496 0.17
497 0.15
498 0.14
499 0.18
500 0.19
501 0.21
502 0.19
503 0.19
504 0.17
505 0.18
506 0.18
507 0.12
508 0.11
509 0.1
510 0.11
511 0.1
512 0.11
513 0.11
514 0.13
515 0.13
516 0.12
517 0.11
518 0.09
519 0.11
520 0.12
521 0.13
522 0.16
523 0.23
524 0.26
525 0.34
526 0.37
527 0.37
528 0.38
529 0.39
530 0.38
531 0.34
532 0.39
533 0.4
534 0.43
535 0.43
536 0.43
537 0.44
538 0.43
539 0.42
540 0.35
541 0.32
542 0.3
543 0.29
544 0.33
545 0.3
546 0.33
547 0.33
548 0.31
549 0.29
550 0.26
551 0.3
552 0.35
553 0.35
554 0.3
555 0.31
556 0.35
557 0.33
558 0.39
559 0.39
560 0.37
561 0.41
562 0.45
563 0.5
564 0.51
565 0.52
566 0.56
567 0.58
568 0.59
569 0.65
570 0.69
571 0.66
572 0.67
573 0.69
574 0.67
575 0.65
576 0.62
577 0.54
578 0.45
579 0.42
580 0.38
581 0.35
582 0.28
583 0.24
584 0.18
585 0.16
586 0.15
587 0.15
588 0.13
589 0.15
590 0.19
591 0.2
592 0.22
593 0.22
594 0.24
595 0.25
596 0.26
597 0.24
598 0.21
599 0.22
600 0.23
601 0.29
602 0.34
603 0.35
604 0.35
605 0.35
606 0.36
607 0.37
608 0.39
609 0.34
610 0.28
611 0.28
612 0.27
613 0.26
614 0.24
615 0.19
616 0.16
617 0.17
618 0.16
619 0.13
620 0.15
621 0.14
622 0.14
623 0.18
624 0.16
625 0.16
626 0.16
627 0.15
628 0.13
629 0.15
630 0.18
631 0.21
632 0.26
633 0.27
634 0.29
635 0.31
636 0.33
637 0.34
638 0.33
639 0.28
640 0.23
641 0.21
642 0.21
643 0.2
644 0.17
645 0.17
646 0.15
647 0.14
648 0.14
649 0.15
650 0.16
651 0.18
652 0.17
653 0.17
654 0.21
655 0.22
656 0.23
657 0.22
658 0.18
659 0.16
660 0.15
661 0.15
662 0.13
663 0.14
664 0.13
665 0.16
666 0.22
667 0.23
668 0.23
669 0.3
670 0.34
671 0.37
672 0.42
673 0.42
674 0.39
675 0.42
676 0.41
677 0.36
678 0.32
679 0.29
680 0.24
681 0.22
682 0.2
683 0.16
684 0.18
685 0.16
686 0.16
687 0.17
688 0.18
689 0.2
690 0.25
691 0.3
692 0.28
693 0.3
694 0.35
695 0.39
696 0.44
697 0.48
698 0.46
699 0.47
700 0.49
701 0.52
702 0.52
703 0.46
704 0.43
705 0.38
706 0.38
707 0.35
708 0.35
709 0.31
710 0.26
711 0.25
712 0.23
713 0.22
714 0.21
715 0.2
716 0.19