Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A072P4M8

Protein Details
Accession A0A072P4M8    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
382-406EAERERERARRERKQENERQMRQSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
221-238PPKFKHKKIPRGPPSPPP
339-362ARKAREERQNASGSGRRGSESRRR
390-393ARRE
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 12, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MATGLFASLPKPKYTGEHESVPVHAQPKGPRIVGPGVIDESQIVLKRSGPPSYGQRSGWRPRSAEDFGDGGAFPEIPVAQYPLDMGRKGTSSTSNALALQVDAEGKVKYDAIARQGHSENRVIHSSFKDLIPLRQQANAGDLNLDRPSQEEVAASAEKTRLALEKLVSGAVAAQKPKNVKGVNREEPTYVRYTPANQMGDNSIKNDRIFKIVKRQEDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWKIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEALFTADRHAREEVKLRTQMQQKLAEKEKLAKEDHLREMARKAREERQNASGSGRRGSESRRRSRSYSGSSYDSRSQDDSQDEAERERERARRERKQENERQMRQSRMGTEKKIQMMAREQNRDISEKVALGLAKPTQNKETMYDSRLFNQSSGFDTGFNEDQHYDKPLFAAQDAINSIYRPSTNQDDDDGEDAADSTMSRIQKSNRFDTLGTSKNFKGTELSERNEGPVQFEKDKDDPFGIDSLIGEASGRQTAESKKRYGLEEAGPSEREKKRARVDEDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.43
3 0.41
4 0.45
5 0.47
6 0.47
7 0.47
8 0.45
9 0.4
10 0.33
11 0.31
12 0.3
13 0.32
14 0.37
15 0.41
16 0.39
17 0.37
18 0.4
19 0.42
20 0.41
21 0.37
22 0.32
23 0.3
24 0.29
25 0.27
26 0.22
27 0.19
28 0.17
29 0.18
30 0.17
31 0.14
32 0.17
33 0.25
34 0.28
35 0.3
36 0.29
37 0.32
38 0.4
39 0.46
40 0.49
41 0.44
42 0.48
43 0.54
44 0.63
45 0.66
46 0.63
47 0.58
48 0.55
49 0.6
50 0.56
51 0.49
52 0.42
53 0.34
54 0.28
55 0.27
56 0.24
57 0.17
58 0.14
59 0.11
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.08
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.1
69 0.14
70 0.17
71 0.17
72 0.18
73 0.18
74 0.19
75 0.21
76 0.23
77 0.21
78 0.22
79 0.24
80 0.25
81 0.24
82 0.23
83 0.23
84 0.2
85 0.16
86 0.13
87 0.1
88 0.09
89 0.07
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.13
97 0.15
98 0.2
99 0.25
100 0.26
101 0.3
102 0.34
103 0.36
104 0.35
105 0.38
106 0.34
107 0.32
108 0.35
109 0.31
110 0.31
111 0.3
112 0.31
113 0.28
114 0.25
115 0.28
116 0.26
117 0.29
118 0.32
119 0.35
120 0.33
121 0.34
122 0.34
123 0.29
124 0.31
125 0.28
126 0.21
127 0.18
128 0.16
129 0.15
130 0.16
131 0.15
132 0.11
133 0.11
134 0.14
135 0.13
136 0.13
137 0.11
138 0.11
139 0.14
140 0.15
141 0.14
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.12
149 0.14
150 0.13
151 0.15
152 0.15
153 0.15
154 0.14
155 0.11
156 0.11
157 0.12
158 0.14
159 0.15
160 0.15
161 0.18
162 0.21
163 0.23
164 0.29
165 0.29
166 0.31
167 0.38
168 0.47
169 0.53
170 0.54
171 0.53
172 0.47
173 0.46
174 0.45
175 0.39
176 0.29
177 0.22
178 0.2
179 0.22
180 0.25
181 0.3
182 0.28
183 0.24
184 0.25
185 0.26
186 0.29
187 0.26
188 0.24
189 0.2
190 0.21
191 0.21
192 0.24
193 0.21
194 0.24
195 0.26
196 0.27
197 0.35
198 0.39
199 0.44
200 0.43
201 0.46
202 0.44
203 0.46
204 0.49
205 0.48
206 0.5
207 0.45
208 0.43
209 0.5
210 0.53
211 0.5
212 0.54
213 0.54
214 0.58
215 0.66
216 0.76
217 0.75
218 0.77
219 0.79
220 0.78
221 0.76
222 0.72
223 0.65
224 0.56
225 0.52
226 0.49
227 0.49
228 0.5
229 0.5
230 0.48
231 0.48
232 0.51
233 0.46
234 0.43
235 0.42
236 0.41
237 0.4
238 0.36
239 0.34
240 0.32
241 0.32
242 0.31
243 0.28
244 0.22
245 0.16
246 0.18
247 0.19
248 0.28
249 0.3
250 0.38
251 0.43
252 0.47
253 0.52
254 0.49
255 0.5
256 0.42
257 0.41
258 0.38
259 0.4
260 0.38
261 0.38
262 0.39
263 0.35
264 0.33
265 0.32
266 0.28
267 0.2
268 0.17
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.11
274 0.12
275 0.12
276 0.15
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.13
282 0.11
283 0.11
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.11
296 0.12
297 0.14
298 0.21
299 0.23
300 0.26
301 0.3
302 0.3
303 0.35
304 0.41
305 0.44
306 0.42
307 0.48
308 0.45
309 0.47
310 0.5
311 0.46
312 0.4
313 0.42
314 0.4
315 0.36
316 0.34
317 0.32
318 0.33
319 0.36
320 0.38
321 0.37
322 0.34
323 0.31
324 0.35
325 0.37
326 0.35
327 0.33
328 0.34
329 0.37
330 0.44
331 0.48
332 0.46
333 0.46
334 0.46
335 0.43
336 0.43
337 0.38
338 0.32
339 0.3
340 0.27
341 0.21
342 0.2
343 0.25
344 0.31
345 0.37
346 0.45
347 0.51
348 0.54
349 0.57
350 0.62
351 0.65
352 0.63
353 0.59
354 0.54
355 0.5
356 0.48
357 0.49
358 0.48
359 0.41
360 0.35
361 0.32
362 0.29
363 0.27
364 0.27
365 0.24
366 0.21
367 0.22
368 0.21
369 0.19
370 0.21
371 0.19
372 0.19
373 0.23
374 0.26
375 0.3
376 0.39
377 0.48
378 0.54
379 0.61
380 0.7
381 0.74
382 0.8
383 0.83
384 0.84
385 0.86
386 0.82
387 0.83
388 0.79
389 0.74
390 0.67
391 0.61
392 0.55
393 0.53
394 0.53
395 0.48
396 0.48
397 0.49
398 0.47
399 0.49
400 0.44
401 0.39
402 0.41
403 0.45
404 0.46
405 0.46
406 0.44
407 0.45
408 0.46
409 0.45
410 0.37
411 0.31
412 0.24
413 0.19
414 0.19
415 0.16
416 0.14
417 0.12
418 0.14
419 0.15
420 0.18
421 0.2
422 0.23
423 0.23
424 0.26
425 0.27
426 0.28
427 0.33
428 0.32
429 0.34
430 0.35
431 0.34
432 0.35
433 0.38
434 0.36
435 0.28
436 0.25
437 0.23
438 0.22
439 0.24
440 0.2
441 0.16
442 0.17
443 0.2
444 0.21
445 0.2
446 0.19
447 0.16
448 0.17
449 0.18
450 0.21
451 0.18
452 0.15
453 0.16
454 0.16
455 0.17
456 0.15
457 0.18
458 0.15
459 0.17
460 0.18
461 0.19
462 0.18
463 0.17
464 0.17
465 0.15
466 0.15
467 0.13
468 0.17
469 0.22
470 0.25
471 0.26
472 0.28
473 0.28
474 0.3
475 0.3
476 0.26
477 0.18
478 0.15
479 0.14
480 0.11
481 0.09
482 0.07
483 0.06
484 0.1
485 0.11
486 0.13
487 0.17
488 0.24
489 0.32
490 0.38
491 0.44
492 0.45
493 0.47
494 0.46
495 0.49
496 0.5
497 0.5
498 0.45
499 0.43
500 0.39
501 0.41
502 0.41
503 0.35
504 0.31
505 0.27
506 0.36
507 0.37
508 0.4
509 0.39
510 0.39
511 0.42
512 0.42
513 0.39
514 0.33
515 0.34
516 0.37
517 0.36
518 0.37
519 0.4
520 0.4
521 0.42
522 0.4
523 0.34
524 0.29
525 0.28
526 0.28
527 0.22
528 0.17
529 0.15
530 0.13
531 0.12
532 0.1
533 0.08
534 0.07
535 0.09
536 0.11
537 0.11
538 0.1
539 0.15
540 0.23
541 0.34
542 0.39
543 0.41
544 0.45
545 0.49
546 0.52
547 0.53
548 0.5
549 0.47
550 0.49
551 0.5
552 0.48
553 0.45
554 0.44
555 0.48
556 0.46
557 0.48
558 0.46
559 0.51
560 0.58
561 0.66