Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q99160

Protein Details
Accession Q99160    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-30MDKKRSKKSTLTQQQRNNKRQRANAQQLDVHydrophilic
61-85QIWFQNTRAKQKKAMRGRESREDDFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 27
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017970  Homeobox_CS  
IPR001356  Homeobox_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0030154  P:cell differentiation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG yli:YALI0A18469g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00027  HOMEOBOX_1  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MDKKRSKKSTLTQQQRNNKRQRANAQQLDVLRHEYRLCATPDAATRRRISALIDMTERSVQIWFQNTRAKQKKAMRGRESREDDFDDGLADVSVDDVSVDDVSMTADVINSPVDVIHHRTDVSSSADMLHHFGADLVTTPIQTHFNHLLATPPTSSSSSHVTTVDSPASSITDFSTLGHMTPNLTPTTPHHVTLPPIFFPTLSLTIGNWRRLSPQLSLAYYPSTDTMLYHMTSEKTQFRMQFPFSAIEEIHVSRNPNDTLGALNLTLNCSPSFSIQTPKAPGRWVGCHDFSEGKQASNVTTHVCNGPATVLQQQLSRVFALRSNHVNGHVSRRRLADVIGSSDIIGSADVMGTVAVDTSNHMISSHVGDFELSVTSHCEPSHMIEPTPTPTPVANHHHHRSADSVAHVTNPSGHVTNHNHLSDPAANLTSTILGNVTPGHTTPVLDDGFELGHVTDINDLVSVAQLLPNHVTEAELASNCHMIANNAFTLDPSTPLSPFSGTLDYLEYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.91
3 0.92
4 0.91
5 0.89
6 0.87
7 0.86
8 0.86
9 0.87
10 0.87
11 0.84
12 0.78
13 0.74
14 0.68
15 0.63
16 0.55
17 0.5
18 0.39
19 0.34
20 0.3
21 0.27
22 0.27
23 0.28
24 0.28
25 0.25
26 0.25
27 0.27
28 0.34
29 0.41
30 0.43
31 0.43
32 0.42
33 0.42
34 0.44
35 0.4
36 0.35
37 0.35
38 0.35
39 0.33
40 0.33
41 0.31
42 0.31
43 0.31
44 0.28
45 0.21
46 0.16
47 0.14
48 0.15
49 0.22
50 0.21
51 0.25
52 0.34
53 0.37
54 0.47
55 0.56
56 0.56
57 0.58
58 0.66
59 0.71
60 0.73
61 0.8
62 0.79
63 0.8
64 0.83
65 0.84
66 0.82
67 0.76
68 0.7
69 0.63
70 0.56
71 0.46
72 0.39
73 0.29
74 0.22
75 0.18
76 0.13
77 0.08
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.04
82 0.04
83 0.03
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.08
102 0.13
103 0.15
104 0.16
105 0.16
106 0.16
107 0.17
108 0.18
109 0.2
110 0.16
111 0.14
112 0.15
113 0.15
114 0.16
115 0.16
116 0.14
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.09
128 0.12
129 0.13
130 0.17
131 0.18
132 0.19
133 0.19
134 0.19
135 0.22
136 0.2
137 0.22
138 0.16
139 0.14
140 0.16
141 0.17
142 0.17
143 0.15
144 0.19
145 0.19
146 0.2
147 0.19
148 0.19
149 0.19
150 0.21
151 0.19
152 0.14
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.1
166 0.09
167 0.1
168 0.11
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.14
174 0.23
175 0.22
176 0.22
177 0.22
178 0.23
179 0.25
180 0.29
181 0.28
182 0.2
183 0.2
184 0.19
185 0.17
186 0.17
187 0.17
188 0.14
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.19
193 0.23
194 0.25
195 0.23
196 0.21
197 0.23
198 0.26
199 0.28
200 0.22
201 0.25
202 0.25
203 0.25
204 0.25
205 0.24
206 0.21
207 0.19
208 0.18
209 0.11
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.14
221 0.15
222 0.16
223 0.19
224 0.21
225 0.23
226 0.26
227 0.27
228 0.26
229 0.25
230 0.24
231 0.22
232 0.2
233 0.17
234 0.14
235 0.14
236 0.13
237 0.12
238 0.11
239 0.12
240 0.11
241 0.15
242 0.14
243 0.13
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.07
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.08
259 0.11
260 0.11
261 0.16
262 0.16
263 0.2
264 0.23
265 0.24
266 0.24
267 0.22
268 0.25
269 0.23
270 0.25
271 0.26
272 0.27
273 0.27
274 0.26
275 0.27
276 0.26
277 0.23
278 0.28
279 0.24
280 0.2
281 0.19
282 0.19
283 0.17
284 0.17
285 0.17
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.11
290 0.12
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.08
295 0.09
296 0.11
297 0.12
298 0.12
299 0.13
300 0.15
301 0.15
302 0.16
303 0.14
304 0.13
305 0.11
306 0.14
307 0.15
308 0.17
309 0.2
310 0.22
311 0.23
312 0.23
313 0.26
314 0.24
315 0.32
316 0.34
317 0.32
318 0.33
319 0.33
320 0.33
321 0.3
322 0.3
323 0.24
324 0.21
325 0.22
326 0.2
327 0.18
328 0.16
329 0.15
330 0.15
331 0.1
332 0.08
333 0.04
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.04
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.12
352 0.12
353 0.11
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.11
358 0.11
359 0.07
360 0.06
361 0.09
362 0.1
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.12
367 0.16
368 0.23
369 0.21
370 0.2
371 0.21
372 0.22
373 0.25
374 0.27
375 0.22
376 0.17
377 0.17
378 0.19
379 0.24
380 0.3
381 0.34
382 0.4
383 0.44
384 0.49
385 0.48
386 0.47
387 0.43
388 0.39
389 0.35
390 0.29
391 0.27
392 0.21
393 0.22
394 0.21
395 0.19
396 0.17
397 0.16
398 0.16
399 0.15
400 0.15
401 0.21
402 0.27
403 0.32
404 0.36
405 0.36
406 0.34
407 0.33
408 0.37
409 0.32
410 0.28
411 0.24
412 0.19
413 0.18
414 0.17
415 0.17
416 0.14
417 0.11
418 0.1
419 0.08
420 0.07
421 0.08
422 0.08
423 0.09
424 0.08
425 0.09
426 0.12
427 0.12
428 0.13
429 0.13
430 0.17
431 0.16
432 0.15
433 0.15
434 0.13
435 0.12
436 0.12
437 0.12
438 0.06
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.06
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.08
452 0.08
453 0.1
454 0.12
455 0.13
456 0.13
457 0.13
458 0.13
459 0.12
460 0.14
461 0.16
462 0.14
463 0.15
464 0.15
465 0.16
466 0.15
467 0.16
468 0.14
469 0.12
470 0.14
471 0.17
472 0.16
473 0.16
474 0.16
475 0.15
476 0.18
477 0.17
478 0.17
479 0.16
480 0.17
481 0.17
482 0.18
483 0.2
484 0.18
485 0.18
486 0.2
487 0.2
488 0.18
489 0.19