FuNGI

Q6CDU9

Protein Details

Accession

Q6CDU9

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
439-464	EAMRRAPSKEEQAKQKKERLAKERAI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
443-468	RAPSKEEQAKQKKERLAKERAIGPGR

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045146 SF3A1 IPR022030 SF3A1_dom IPR000061 Surp IPR035967 SWAP/Surp_sf
Gene Ontology	GO:0071013 C:catalytic step 2 spliceosome GO:0005686 C:U2 snRNP GO:0071004 C:U2-type prespliceosome GO:0003723 F:RNA binding GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome
KEGG	yli:YALI0B21032g -
Pfam	View protein in Pfam PF12230 PRP21_like_P PF01805 Surp
PROSITE	View protein in PROSITE PS50128 SURP

Amino Acid Sequences

MNPPEGIIIPPPEIKAKIERTAEFVAKNGIAFEHRIREKEGSNALFSFLNNDDHYHLYYQWRCDEYASGRTRETDANTAQLKPKDTSDHLIEPPAFEFHTVLPPMSAVDHEVIHTTAQHTAEYGPSFSMLLAKNEARNPQYEFLKPSHSLHKFYQLLVEQYLKVGQALDAGFSALPESTRTNIEAAVKDKFYALGLAKRRAEWISHTEQKNQRAIEEAERERIAFAEIDWHDFVVAETIVFSDKDKTGELPAPLTLAQLQFSSLEQRSRGLKLEYAPNSDDDDEEENKEIVTKGKMEVKEDAKEEAKEDAKEGSTEVVVKEEPKVYSAPSNMKIRPAGTSKLNKLKNSSPATVVTPSGEVVPESSYDSHMRVYTLDPNWKAQKDLADSRAQSTNLATSGVTHNMKRMAEAKQGDGGRPTKKPVVAWDGRAGSSAAAQEEAMRRAPSKEEQAKQKKERLAKERAIGPGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.32
3	0.36
4	0.41
5	0.45
6	0.44
7	0.46
8	0.51
9	0.51
10	0.43
11	0.38
12	0.35
13	0.29
14	0.28
15	0.22
16	0.18
17	0.16
18	0.19
19	0.21
20	0.27
21	0.29
22	0.31
23	0.35
24	0.38
25	0.38
26	0.41
27	0.46
28	0.39
29	0.39
30	0.37
31	0.34
32	0.31
33	0.29
34	0.26
35	0.2
36	0.21
37	0.19
38	0.2
39	0.21
40	0.22
41	0.25
42	0.22
43	0.22
44	0.27
45	0.3
46	0.33
47	0.36
48	0.36
49	0.35
50	0.34
51	0.38
52	0.34
53	0.39
54	0.4
55	0.36
56	0.35
57	0.37
58	0.38
59	0.36
60	0.35
61	0.32
62	0.28
63	0.33
64	0.34
65	0.35
66	0.39
67	0.38
68	0.38
69	0.33
70	0.35
71	0.34
72	0.35
73	0.38
74	0.37
75	0.4
76	0.37
77	0.4
78	0.37
79	0.32
80	0.3
81	0.26
82	0.2
83	0.15
84	0.15
85	0.11
86	0.17
87	0.17
88	0.15
89	0.14
90	0.14
91	0.14
92	0.13
93	0.12
94	0.08
95	0.08
96	0.09
97	0.09
98	0.1
99	0.1
100	0.1
101	0.1
102	0.1
103	0.12
104	0.12
105	0.12
106	0.11
107	0.11
108	0.14
109	0.14
110	0.14
111	0.1
112	0.1
113	0.1
114	0.1
115	0.14
116	0.12
117	0.13
118	0.16
119	0.18
120	0.21
121	0.24
122	0.28
123	0.25
124	0.26
125	0.28
126	0.3
127	0.32
128	0.31
129	0.32
130	0.29
131	0.33
132	0.33
133	0.32
134	0.36
135	0.36
136	0.38
137	0.36
138	0.44
139	0.4
140	0.38
141	0.4
142	0.32
143	0.3
144	0.28
145	0.28
146	0.18
147	0.17
148	0.18
149	0.12
150	0.11
151	0.09
152	0.07
153	0.08
154	0.08
155	0.08
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.07
161	0.04
162	0.05
163	0.06
164	0.07
165	0.08
166	0.09
167	0.1
168	0.1
169	0.12
170	0.15
171	0.16
172	0.17
173	0.18
174	0.17
175	0.16
176	0.16
177	0.14
178	0.12
179	0.12
180	0.11
181	0.15
182	0.2
183	0.25
184	0.26
185	0.26
186	0.28
187	0.26
188	0.25
189	0.23
190	0.24
191	0.26
192	0.33
193	0.34
194	0.4
195	0.45
196	0.49
197	0.5
198	0.44
199	0.36
200	0.33
201	0.33
202	0.3
203	0.32
204	0.28
205	0.27
206	0.26
207	0.26
208	0.22
209	0.21
210	0.16
211	0.09
212	0.07
213	0.12
214	0.12
215	0.14
216	0.14
217	0.14
218	0.13
219	0.13
220	0.13
221	0.06
222	0.06
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.05
228	0.05
229	0.06
230	0.07
231	0.08
232	0.09
233	0.09
234	0.11
235	0.14
236	0.14
237	0.13
238	0.12
239	0.12
240	0.12
241	0.11
242	0.1
243	0.08
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.11
250	0.11
251	0.12
252	0.12
253	0.15
254	0.17
255	0.18
256	0.2
257	0.17
258	0.18
259	0.19
260	0.27
261	0.26
262	0.27
263	0.27
264	0.26
265	0.26
266	0.24
267	0.22
268	0.16
269	0.17
270	0.15
271	0.16
272	0.15
273	0.13
274	0.13
275	0.14
276	0.12
277	0.11
278	0.11
279	0.11
280	0.12
281	0.18
282	0.19
283	0.21
284	0.26
285	0.28
286	0.3
287	0.3
288	0.31
289	0.28
290	0.27
291	0.26
292	0.24
293	0.23
294	0.2
295	0.2
296	0.18
297	0.17
298	0.16
299	0.16
300	0.12
301	0.1
302	0.1
303	0.09
304	0.09
305	0.09
306	0.1
307	0.11
308	0.13
309	0.13
310	0.14
311	0.14
312	0.14
313	0.18
314	0.21
315	0.25
316	0.28
317	0.34
318	0.33
319	0.36
320	0.37
321	0.33
322	0.34
323	0.32
324	0.3
325	0.32
326	0.38
327	0.42
328	0.5
329	0.55
330	0.52
331	0.53
332	0.56
333	0.57
334	0.56
335	0.5
336	0.44
337	0.4
338	0.41
339	0.38
340	0.32
341	0.24
342	0.18
343	0.16
344	0.14
345	0.12
346	0.09
347	0.08
348	0.08
349	0.08
350	0.1
351	0.1
352	0.13
353	0.14
354	0.15
355	0.16
356	0.16
357	0.16
358	0.14
359	0.16
360	0.21
361	0.25
362	0.32
363	0.31
364	0.37
365	0.43
366	0.43
367	0.42
368	0.37
369	0.39
370	0.38
371	0.43
372	0.41
373	0.42
374	0.42
375	0.43
376	0.46
377	0.4
378	0.33
379	0.28
380	0.26
381	0.19
382	0.19
383	0.15
384	0.13
385	0.16
386	0.21
387	0.23
388	0.21
389	0.24
390	0.28
391	0.28
392	0.29
393	0.3
394	0.28
395	0.34
396	0.36
397	0.35
398	0.37
399	0.38
400	0.37
401	0.39
402	0.39
403	0.37
404	0.37
405	0.41
406	0.4
407	0.42
408	0.42
409	0.43
410	0.48
411	0.48
412	0.49
413	0.51
414	0.48
415	0.45
416	0.44
417	0.37
418	0.27
419	0.24
420	0.21
421	0.14
422	0.12
423	0.11
424	0.15
425	0.18
426	0.2
427	0.22
428	0.22
429	0.22
430	0.24
431	0.29
432	0.31
433	0.38
434	0.45
435	0.5
436	0.6
437	0.69
438	0.78
439	0.81
440	0.83
441	0.81
442	0.8
443	0.83
444	0.81
445	0.8
446	0.77
447	0.76
448	0.74

Q6CDU9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer