Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A072PXH8

Protein Details
Accession A0A072PXH8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-38LPTTSLKRRQSERSKSPDSSKRPHydrophilic
229-251NREWEAWERKKRQQQQQEKTAVVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039853  Pinin  
IPR006786  Pinin_SDK_MemA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04696  Pinin_SDK_memA  
Amino Acid Sequences MISSAVVIPDEPEPSLPTTSLKRRQSERSKSPDSSKRPRLDSHSWTISSNHNGARSPSSPRAARNASSPTSTTSAVAVGGQAMSPPRRRATANNSDEKSRNRRLFGALLGNLAQPAASSRTKSSPAITATAARRREDIESRQRQRLQRENEEISEHARRKREELNRTRKVEQRRWDEEAIRTRHTNMSAMAEFLRTDTEPMLYYKPWEMRAQEEETVRRQKDEVEETINREWEAWERKKRQQQQQEKTAVVAGTPGDRQRDDGAVVQSGSTNGTMESRRGLRSEDVPMNGGVDGPANALPQAQNRAPSPASTREDAKDSSHSPARSRTEAKGAGGPGSDRPQSSKDDDHGGEELELGQEDDVIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.17
4 0.19
5 0.26
6 0.36
7 0.44
8 0.5
9 0.55
10 0.6
11 0.7
12 0.77
13 0.8
14 0.8
15 0.8
16 0.8
17 0.79
18 0.82
19 0.81
20 0.8
21 0.79
22 0.79
23 0.77
24 0.74
25 0.74
26 0.73
27 0.72
28 0.7
29 0.68
30 0.66
31 0.59
32 0.55
33 0.52
34 0.49
35 0.44
36 0.42
37 0.36
38 0.31
39 0.31
40 0.32
41 0.36
42 0.33
43 0.35
44 0.37
45 0.4
46 0.41
47 0.42
48 0.48
49 0.47
50 0.46
51 0.44
52 0.45
53 0.4
54 0.4
55 0.38
56 0.33
57 0.31
58 0.31
59 0.25
60 0.19
61 0.17
62 0.14
63 0.13
64 0.1
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.09
70 0.13
71 0.17
72 0.21
73 0.23
74 0.25
75 0.28
76 0.35
77 0.42
78 0.48
79 0.52
80 0.57
81 0.57
82 0.59
83 0.61
84 0.6
85 0.59
86 0.58
87 0.54
88 0.48
89 0.49
90 0.48
91 0.47
92 0.43
93 0.41
94 0.32
95 0.28
96 0.26
97 0.24
98 0.19
99 0.16
100 0.12
101 0.06
102 0.07
103 0.1
104 0.1
105 0.12
106 0.14
107 0.18
108 0.21
109 0.23
110 0.23
111 0.23
112 0.24
113 0.25
114 0.23
115 0.25
116 0.28
117 0.33
118 0.34
119 0.3
120 0.29
121 0.28
122 0.32
123 0.32
124 0.36
125 0.4
126 0.48
127 0.52
128 0.58
129 0.63
130 0.63
131 0.66
132 0.66
133 0.63
134 0.61
135 0.63
136 0.59
137 0.54
138 0.51
139 0.43
140 0.38
141 0.37
142 0.32
143 0.29
144 0.31
145 0.3
146 0.33
147 0.41
148 0.46
149 0.5
150 0.57
151 0.64
152 0.68
153 0.72
154 0.72
155 0.69
156 0.7
157 0.67
158 0.65
159 0.63
160 0.6
161 0.6
162 0.58
163 0.55
164 0.52
165 0.52
166 0.47
167 0.4
168 0.35
169 0.32
170 0.31
171 0.29
172 0.24
173 0.17
174 0.17
175 0.15
176 0.15
177 0.14
178 0.12
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.06
183 0.07
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.09
188 0.11
189 0.1
190 0.11
191 0.14
192 0.16
193 0.17
194 0.19
195 0.19
196 0.21
197 0.25
198 0.27
199 0.27
200 0.27
201 0.27
202 0.31
203 0.37
204 0.34
205 0.3
206 0.27
207 0.27
208 0.29
209 0.31
210 0.28
211 0.27
212 0.28
213 0.32
214 0.33
215 0.31
216 0.26
217 0.22
218 0.2
219 0.19
220 0.27
221 0.31
222 0.39
223 0.44
224 0.53
225 0.63
226 0.71
227 0.76
228 0.77
229 0.81
230 0.81
231 0.84
232 0.81
233 0.72
234 0.63
235 0.55
236 0.43
237 0.32
238 0.23
239 0.14
240 0.1
241 0.12
242 0.13
243 0.14
244 0.14
245 0.16
246 0.17
247 0.18
248 0.18
249 0.2
250 0.2
251 0.18
252 0.18
253 0.16
254 0.15
255 0.14
256 0.13
257 0.09
258 0.07
259 0.06
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.15
264 0.17
265 0.18
266 0.19
267 0.21
268 0.22
269 0.24
270 0.31
271 0.31
272 0.3
273 0.3
274 0.29
275 0.27
276 0.23
277 0.2
278 0.12
279 0.09
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.1
287 0.13
288 0.19
289 0.19
290 0.22
291 0.23
292 0.28
293 0.28
294 0.29
295 0.31
296 0.33
297 0.36
298 0.35
299 0.38
300 0.35
301 0.39
302 0.38
303 0.36
304 0.33
305 0.32
306 0.36
307 0.38
308 0.38
309 0.38
310 0.44
311 0.47
312 0.48
313 0.5
314 0.47
315 0.5
316 0.51
317 0.5
318 0.46
319 0.42
320 0.36
321 0.33
322 0.3
323 0.26
324 0.28
325 0.28
326 0.24
327 0.27
328 0.28
329 0.33
330 0.37
331 0.38
332 0.36
333 0.42
334 0.42
335 0.41
336 0.39
337 0.35
338 0.29
339 0.24
340 0.21
341 0.14
342 0.13
343 0.1
344 0.08