Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C5E8

Protein Details
Accession Q6C5E8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-44TDWTHDDKRRKIEKPVKQTHGHAHPRHSHSHTRQTPRPVFNBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005818  Histone_H1/H5_H15  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000786  C:nucleosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006334  P:nucleosome assembly  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG yli:YALI0E18678g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51504  H15  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15502  PHD_Phf1p_Phf2p_like  
Amino Acid Sequences MSDTDWTHDDKRRKIEKPVKQTHGHAHPRHSHSHTRQTPRPVFNDDGDFDFNSGAGEDEEGPTGTSAGTDSADSDLSPIERGPRKHSAVLKTQMQQPPSRERHNSNHAGYTSDTGGSVLDNVCRLCHRGNSPKSNQIVFCDECRTPYHQLCHNPPIDRLVVDVADAQWFCKYCQPKRRERPLETGKSGEGFSTQVKKTYLSSLSKAQLVELILYAENNVPKLPIYSPQTHSIVLQMQLENSNKTDTTKSNRRLLSSINYEDLLIDTLKAKSNGEEASAQQIWKWIASDTNPDTVDPKFVQAATMALQRALREGKILKRGKSYRVNPDYQKSSEISLSLLISLDDEAMFSDEVVLKLPPATEEDLYYTIDDNDDVFSARLHDEQEQEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.77
3 0.79
4 0.82
5 0.85
6 0.83
7 0.79
8 0.8
9 0.78
10 0.78
11 0.78
12 0.73
13 0.71
14 0.72
15 0.72
16 0.73
17 0.7
18 0.7
19 0.68
20 0.74
21 0.74
22 0.74
23 0.76
24 0.78
25 0.81
26 0.77
27 0.74
28 0.7
29 0.64
30 0.58
31 0.57
32 0.48
33 0.43
34 0.38
35 0.34
36 0.28
37 0.23
38 0.19
39 0.14
40 0.12
41 0.09
42 0.06
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.06
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.09
65 0.08
66 0.15
67 0.21
68 0.23
69 0.29
70 0.37
71 0.41
72 0.47
73 0.53
74 0.51
75 0.55
76 0.59
77 0.59
78 0.55
79 0.59
80 0.56
81 0.53
82 0.51
83 0.48
84 0.51
85 0.51
86 0.54
87 0.52
88 0.55
89 0.6
90 0.65
91 0.68
92 0.6
93 0.59
94 0.52
95 0.48
96 0.42
97 0.35
98 0.27
99 0.19
100 0.17
101 0.11
102 0.1
103 0.08
104 0.09
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.12
112 0.13
113 0.17
114 0.24
115 0.33
116 0.41
117 0.49
118 0.53
119 0.58
120 0.6
121 0.58
122 0.51
123 0.44
124 0.42
125 0.34
126 0.31
127 0.28
128 0.25
129 0.24
130 0.26
131 0.27
132 0.26
133 0.29
134 0.32
135 0.34
136 0.4
137 0.44
138 0.48
139 0.47
140 0.44
141 0.4
142 0.38
143 0.33
144 0.27
145 0.22
146 0.16
147 0.12
148 0.1
149 0.1
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.14
158 0.2
159 0.26
160 0.35
161 0.42
162 0.52
163 0.62
164 0.73
165 0.77
166 0.75
167 0.78
168 0.79
169 0.79
170 0.7
171 0.62
172 0.51
173 0.42
174 0.37
175 0.27
176 0.17
177 0.11
178 0.11
179 0.15
180 0.15
181 0.16
182 0.17
183 0.17
184 0.18
185 0.21
186 0.24
187 0.21
188 0.23
189 0.26
190 0.27
191 0.28
192 0.26
193 0.22
194 0.18
195 0.16
196 0.14
197 0.09
198 0.09
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.08
209 0.08
210 0.12
211 0.17
212 0.22
213 0.25
214 0.29
215 0.3
216 0.29
217 0.28
218 0.25
219 0.22
220 0.18
221 0.18
222 0.14
223 0.13
224 0.16
225 0.17
226 0.16
227 0.15
228 0.15
229 0.13
230 0.15
231 0.17
232 0.18
233 0.26
234 0.34
235 0.39
236 0.46
237 0.48
238 0.48
239 0.47
240 0.46
241 0.44
242 0.41
243 0.38
244 0.31
245 0.3
246 0.27
247 0.25
248 0.22
249 0.16
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.15
259 0.15
260 0.16
261 0.16
262 0.14
263 0.2
264 0.21
265 0.2
266 0.17
267 0.2
268 0.18
269 0.17
270 0.17
271 0.11
272 0.12
273 0.14
274 0.21
275 0.2
276 0.25
277 0.25
278 0.24
279 0.26
280 0.24
281 0.27
282 0.19
283 0.19
284 0.16
285 0.15
286 0.15
287 0.14
288 0.15
289 0.12
290 0.16
291 0.14
292 0.14
293 0.15
294 0.14
295 0.18
296 0.18
297 0.16
298 0.17
299 0.22
300 0.27
301 0.36
302 0.42
303 0.42
304 0.5
305 0.55
306 0.59
307 0.65
308 0.66
309 0.68
310 0.69
311 0.73
312 0.7
313 0.73
314 0.71
315 0.63
316 0.58
317 0.48
318 0.44
319 0.37
320 0.31
321 0.24
322 0.19
323 0.17
324 0.14
325 0.13
326 0.1
327 0.09
328 0.09
329 0.08
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.09
337 0.1
338 0.1
339 0.12
340 0.11
341 0.1
342 0.11
343 0.11
344 0.1
345 0.12
346 0.16
347 0.15
348 0.17
349 0.2
350 0.21
351 0.22
352 0.22
353 0.19
354 0.16
355 0.15
356 0.14
357 0.11
358 0.11
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.12
364 0.13
365 0.14
366 0.16
367 0.19