Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A072PLD0

Protein Details
Accession A0A072PLD0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MAKDKEKKTKDTLKNPKGTRDWSHydrophilic
437-456YSAKERPKPQLQFKNSEKYGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
326-328KKA
Subcellular Location(s) nucl 9cyto 9cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045864  aa-tRNA-synth_II/BPL/LPL  
IPR004154  Anticodon-bd  
IPR036621  Anticodon-bd_dom_sf  
IPR041715  HisRS-like_core  
IPR004516  HisRS/HisZ  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0004821  F:histidine-tRNA ligase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF03129  HGTP_anticodon  
PF13393  tRNA-synt_His  
CDD cd00773  HisRS-like_core  
Amino Acid Sequences MAKDKEKKTKDTLKNPKGTRDWSDQDSSLLNDIFHRIRTVLSRYATQLDTPVFELADVLKGKYGEDSKLIYDLADQGGEMLSLRYDLTVPFARWLAMHPEVREYKRFAIGKVYRRDQPAIAKGRMREFYQCDVDFAGSGSSTMWDSKIVAIVVEVFEALEWQGHYTIKLNHRKILDGIFEVCGVPEDKIRAISSAVDKLDKSPWEKVRTEMVETKGLDEAVADKIRTYVVQRGEKWEGSKQLLDTLKKDEALQANAKAKQGIDEMDVILRILEVLGAHRDISFDLCLARGLDYYTGIIYEVVTEGSAPATVNGGDAQQVQREGKSKKAKKDLKEDDDRSDDPSVGVGSVAAGGRYDNLVERFLPGSDMQCVGVSFGVDRIFSITKARIAQGQKFTYVSSTATDVYIMAFGGKDFSGMSAERLLIEQMLARAGLKVEYSAKERPKPQLQFKNSEKYGAKYAVILGEDEQARGEVRVKQLGLPDGHPEKEGVLVKMENLVSEVTVRIKGLAVTEQVKGLDVIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.85
3 0.84
4 0.81
5 0.77
6 0.72
7 0.7
8 0.66
9 0.61
10 0.62
11 0.53
12 0.48
13 0.43
14 0.38
15 0.32
16 0.27
17 0.21
18 0.18
19 0.22
20 0.21
21 0.21
22 0.21
23 0.17
24 0.19
25 0.24
26 0.28
27 0.3
28 0.31
29 0.33
30 0.35
31 0.39
32 0.37
33 0.32
34 0.31
35 0.25
36 0.24
37 0.23
38 0.21
39 0.16
40 0.15
41 0.15
42 0.11
43 0.16
44 0.15
45 0.13
46 0.15
47 0.15
48 0.15
49 0.2
50 0.22
51 0.18
52 0.2
53 0.22
54 0.21
55 0.23
56 0.23
57 0.17
58 0.16
59 0.16
60 0.14
61 0.12
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.06
73 0.06
74 0.11
75 0.15
76 0.16
77 0.17
78 0.18
79 0.18
80 0.17
81 0.19
82 0.21
83 0.23
84 0.25
85 0.24
86 0.31
87 0.37
88 0.41
89 0.43
90 0.4
91 0.37
92 0.42
93 0.43
94 0.36
95 0.41
96 0.45
97 0.5
98 0.55
99 0.56
100 0.53
101 0.56
102 0.58
103 0.5
104 0.51
105 0.51
106 0.5
107 0.49
108 0.48
109 0.47
110 0.51
111 0.5
112 0.44
113 0.41
114 0.38
115 0.4
116 0.43
117 0.4
118 0.34
119 0.32
120 0.31
121 0.24
122 0.2
123 0.14
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.1
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.06
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.11
153 0.17
154 0.26
155 0.35
156 0.37
157 0.4
158 0.41
159 0.42
160 0.4
161 0.38
162 0.31
163 0.23
164 0.22
165 0.18
166 0.18
167 0.16
168 0.14
169 0.11
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.13
180 0.14
181 0.17
182 0.17
183 0.17
184 0.16
185 0.17
186 0.21
187 0.21
188 0.22
189 0.26
190 0.32
191 0.36
192 0.37
193 0.37
194 0.41
195 0.4
196 0.41
197 0.38
198 0.34
199 0.34
200 0.33
201 0.32
202 0.25
203 0.23
204 0.18
205 0.13
206 0.12
207 0.1
208 0.11
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.13
216 0.19
217 0.25
218 0.26
219 0.31
220 0.34
221 0.35
222 0.35
223 0.33
224 0.3
225 0.26
226 0.26
227 0.21
228 0.24
229 0.26
230 0.26
231 0.24
232 0.25
233 0.24
234 0.23
235 0.23
236 0.21
237 0.19
238 0.21
239 0.21
240 0.21
241 0.24
242 0.26
243 0.26
244 0.22
245 0.2
246 0.18
247 0.17
248 0.14
249 0.11
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.07
255 0.06
256 0.05
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.02
261 0.03
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.03
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.07
303 0.07
304 0.08
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.18
309 0.19
310 0.26
311 0.37
312 0.42
313 0.49
314 0.6
315 0.65
316 0.66
317 0.76
318 0.77
319 0.75
320 0.78
321 0.73
322 0.67
323 0.65
324 0.59
325 0.51
326 0.42
327 0.33
328 0.23
329 0.2
330 0.15
331 0.1
332 0.09
333 0.05
334 0.04
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.11
348 0.12
349 0.12
350 0.13
351 0.11
352 0.12
353 0.12
354 0.13
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.1
359 0.09
360 0.08
361 0.06
362 0.08
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.1
367 0.11
368 0.11
369 0.14
370 0.14
371 0.17
372 0.19
373 0.2
374 0.23
375 0.27
376 0.33
377 0.38
378 0.38
379 0.36
380 0.35
381 0.35
382 0.3
383 0.27
384 0.21
385 0.14
386 0.14
387 0.13
388 0.12
389 0.12
390 0.11
391 0.1
392 0.09
393 0.07
394 0.06
395 0.05
396 0.05
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.08
403 0.09
404 0.1
405 0.1
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.09
411 0.09
412 0.08
413 0.07
414 0.08
415 0.08
416 0.07
417 0.08
418 0.08
419 0.09
420 0.08
421 0.09
422 0.13
423 0.15
424 0.2
425 0.27
426 0.34
427 0.4
428 0.45
429 0.52
430 0.58
431 0.65
432 0.71
433 0.74
434 0.74
435 0.77
436 0.78
437 0.8
438 0.71
439 0.7
440 0.61
441 0.54
442 0.53
443 0.47
444 0.4
445 0.31
446 0.31
447 0.26
448 0.24
449 0.22
450 0.16
451 0.19
452 0.19
453 0.18
454 0.16
455 0.14
456 0.14
457 0.14
458 0.17
459 0.16
460 0.2
461 0.25
462 0.26
463 0.28
464 0.31
465 0.36
466 0.35
467 0.32
468 0.36
469 0.35
470 0.36
471 0.34
472 0.3
473 0.24
474 0.29
475 0.3
476 0.23
477 0.22
478 0.22
479 0.22
480 0.26
481 0.26
482 0.19
483 0.17
484 0.16
485 0.12
486 0.13
487 0.14
488 0.12
489 0.13
490 0.13
491 0.13
492 0.13
493 0.14
494 0.15
495 0.17
496 0.19
497 0.21
498 0.22
499 0.23
500 0.22
501 0.22