Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A072PM43

Protein Details
Accession A0A072PM43    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-58ALPFKTANKQRRQELHLKQKRARDALKRAERFGRKKEEAKNPKLKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-60KQRRQELHLKQKRARDALKRAERFGRKKEEAKNPKLKAER
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MPSRPLKLSDKAALPFKTANKQRRQELHLKQKRARDALKRAERFGRKKEEAKNPKLKAERLQRNVPATLDRKRVYDEVEQEPEDGGLGKVYDVERLKRRKLEEEQDLLEDDIQDEEAGDNDDEDDKDSMLDSDSDVQHEDEKGSLSDSETETAEDPLPSKAQLKSSTMRSQNQPHRSSSPTRSTTSTNLSLAPAALAAKFPTLFPSTDDDGGDTPAPPEPKILITTSINSTLHSEAAMLTSLFPNSKYIRRSSHRYGYKFSVREISQFAAKHGYTSVIVLEESQKKPSGMTIVHLPVGPTFHFSISNWYTSKSIPGHGRATGHIPELILNNFTTPLGLLTAHLFRSLFPATPDLQGRQVLTLHNQRDYIFLRRHRYVFREKRETEKAVVGADGREIQGAVKGIRAGLQELGPRLTLKLRRVDKGIQRASGQDWEWKSRMEMVRTKFQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.48
3 0.47
4 0.51
5 0.54
6 0.59
7 0.62
8 0.69
9 0.74
10 0.77
11 0.8
12 0.8
13 0.81
14 0.83
15 0.82
16 0.84
17 0.81
18 0.8
19 0.81
20 0.79
21 0.77
22 0.76
23 0.77
24 0.78
25 0.83
26 0.79
27 0.75
28 0.76
29 0.78
30 0.76
31 0.75
32 0.74
33 0.71
34 0.75
35 0.79
36 0.8
37 0.81
38 0.83
39 0.85
40 0.78
41 0.8
42 0.78
43 0.73
44 0.72
45 0.72
46 0.72
47 0.69
48 0.73
49 0.7
50 0.68
51 0.65
52 0.57
53 0.54
54 0.5
55 0.5
56 0.5
57 0.45
58 0.42
59 0.44
60 0.44
61 0.41
62 0.43
63 0.41
64 0.4
65 0.43
66 0.42
67 0.38
68 0.36
69 0.31
70 0.24
71 0.18
72 0.11
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.08
77 0.08
78 0.14
79 0.16
80 0.23
81 0.31
82 0.38
83 0.44
84 0.48
85 0.52
86 0.55
87 0.61
88 0.64
89 0.64
90 0.62
91 0.58
92 0.53
93 0.5
94 0.42
95 0.33
96 0.24
97 0.16
98 0.1
99 0.08
100 0.06
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.08
109 0.08
110 0.1
111 0.1
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.14
126 0.13
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.09
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.11
137 0.12
138 0.12
139 0.13
140 0.12
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.13
147 0.13
148 0.17
149 0.2
150 0.23
151 0.26
152 0.32
153 0.39
154 0.42
155 0.44
156 0.45
157 0.52
158 0.57
159 0.62
160 0.58
161 0.54
162 0.53
163 0.53
164 0.54
165 0.51
166 0.51
167 0.46
168 0.45
169 0.44
170 0.43
171 0.42
172 0.41
173 0.36
174 0.28
175 0.24
176 0.22
177 0.2
178 0.17
179 0.13
180 0.08
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.08
189 0.09
190 0.09
191 0.11
192 0.15
193 0.17
194 0.17
195 0.17
196 0.15
197 0.14
198 0.15
199 0.13
200 0.09
201 0.07
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.13
213 0.14
214 0.16
215 0.15
216 0.14
217 0.15
218 0.13
219 0.12
220 0.11
221 0.09
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.09
232 0.11
233 0.16
234 0.18
235 0.21
236 0.28
237 0.34
238 0.41
239 0.45
240 0.52
241 0.56
242 0.56
243 0.57
244 0.56
245 0.58
246 0.52
247 0.46
248 0.43
249 0.35
250 0.34
251 0.32
252 0.27
253 0.23
254 0.23
255 0.22
256 0.2
257 0.2
258 0.18
259 0.16
260 0.16
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.12
268 0.17
269 0.18
270 0.2
271 0.21
272 0.2
273 0.2
274 0.21
275 0.2
276 0.14
277 0.15
278 0.19
279 0.19
280 0.2
281 0.2
282 0.19
283 0.15
284 0.16
285 0.15
286 0.12
287 0.11
288 0.11
289 0.12
290 0.12
291 0.19
292 0.2
293 0.23
294 0.21
295 0.22
296 0.22
297 0.22
298 0.27
299 0.21
300 0.24
301 0.25
302 0.29
303 0.3
304 0.31
305 0.32
306 0.28
307 0.31
308 0.27
309 0.24
310 0.2
311 0.17
312 0.16
313 0.17
314 0.17
315 0.13
316 0.12
317 0.11
318 0.11
319 0.1
320 0.09
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.09
327 0.11
328 0.11
329 0.12
330 0.11
331 0.11
332 0.15
333 0.16
334 0.14
335 0.14
336 0.17
337 0.18
338 0.22
339 0.24
340 0.21
341 0.23
342 0.24
343 0.23
344 0.22
345 0.21
346 0.19
347 0.24
348 0.3
349 0.3
350 0.31
351 0.31
352 0.3
353 0.34
354 0.35
355 0.36
356 0.36
357 0.41
358 0.46
359 0.5
360 0.54
361 0.55
362 0.59
363 0.62
364 0.65
365 0.68
366 0.71
367 0.68
368 0.72
369 0.75
370 0.72
371 0.64
372 0.59
373 0.5
374 0.4
375 0.39
376 0.31
377 0.23
378 0.21
379 0.18
380 0.13
381 0.12
382 0.11
383 0.1
384 0.12
385 0.14
386 0.12
387 0.13
388 0.13
389 0.13
390 0.16
391 0.17
392 0.16
393 0.15
394 0.18
395 0.19
396 0.21
397 0.22
398 0.2
399 0.19
400 0.2
401 0.25
402 0.29
403 0.31
404 0.39
405 0.44
406 0.47
407 0.53
408 0.6
409 0.62
410 0.66
411 0.67
412 0.61
413 0.57
414 0.55
415 0.53
416 0.5
417 0.43
418 0.4
419 0.38
420 0.41
421 0.41
422 0.39
423 0.37
424 0.4
425 0.45
426 0.45
427 0.49
428 0.48