Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C164

Protein Details
Accession Q6C164    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-87YYPPVASYTQPKPKRKRKPSNPNAPLSQPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-80KPKRKRKPSNP
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:1990247  F:N6-methyladenosine-containing RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0000381  P:regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG yli:YALI0F18876g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50882  YTH  
CDD cd00590  RRM_SF  
cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MSAPNPNSYNDFDEFRDQYQQQAIPSELPSQPMPPLATYDQQQPHLPIVYPVPVPICSYYPPVASYTQPKPKRKRKPSNPNAPLSQPPTARPKPRQSAYALWVGNIPSNSPIDSLRTLFATKDIESIFMIPRSRCAFVNYKSEEGVVAGIEAFNQRGGQIRSNKLVVKRRTKDPDTDSPEPLTDSERSQTSSPPLTDRYFVCKSLTVRDLEVSRENSLWSTQSHNEAMLNKAFRDGSNVYLIFSANRTGEFFGCAKMIEPIPPKEKTISSVITTSSSHVYSPVITMTPSSGEIPAGRIVHDVERASLFWEVLDSVSKPVEEESNWTSPFRIQWLGNRNRRVHFSETRHLRNSLNSGREVKVARDGTEIEPSVGRTIVEMFN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.35
3 0.39
4 0.34
5 0.36
6 0.39
7 0.38
8 0.33
9 0.34
10 0.33
11 0.27
12 0.29
13 0.3
14 0.25
15 0.26
16 0.25
17 0.23
18 0.23
19 0.24
20 0.24
21 0.19
22 0.23
23 0.23
24 0.25
25 0.26
26 0.34
27 0.35
28 0.37
29 0.38
30 0.35
31 0.35
32 0.34
33 0.32
34 0.25
35 0.23
36 0.24
37 0.21
38 0.2
39 0.19
40 0.17
41 0.19
42 0.19
43 0.19
44 0.17
45 0.21
46 0.22
47 0.21
48 0.22
49 0.22
50 0.22
51 0.24
52 0.29
53 0.33
54 0.42
55 0.5
56 0.59
57 0.67
58 0.76
59 0.84
60 0.88
61 0.91
62 0.92
63 0.94
64 0.95
65 0.96
66 0.94
67 0.89
68 0.82
69 0.75
70 0.7
71 0.63
72 0.58
73 0.48
74 0.43
75 0.46
76 0.49
77 0.54
78 0.56
79 0.61
80 0.65
81 0.67
82 0.67
83 0.63
84 0.62
85 0.57
86 0.56
87 0.46
88 0.37
89 0.35
90 0.31
91 0.28
92 0.21
93 0.18
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.13
100 0.14
101 0.15
102 0.14
103 0.15
104 0.15
105 0.14
106 0.16
107 0.15
108 0.13
109 0.15
110 0.14
111 0.14
112 0.14
113 0.15
114 0.15
115 0.15
116 0.17
117 0.14
118 0.19
119 0.21
120 0.22
121 0.21
122 0.24
123 0.28
124 0.3
125 0.39
126 0.37
127 0.35
128 0.34
129 0.33
130 0.29
131 0.22
132 0.18
133 0.08
134 0.06
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.09
144 0.11
145 0.17
146 0.23
147 0.26
148 0.28
149 0.31
150 0.34
151 0.36
152 0.43
153 0.45
154 0.49
155 0.51
156 0.57
157 0.63
158 0.63
159 0.63
160 0.61
161 0.63
162 0.61
163 0.59
164 0.53
165 0.45
166 0.42
167 0.36
168 0.3
169 0.22
170 0.15
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.13
176 0.14
177 0.15
178 0.16
179 0.16
180 0.17
181 0.19
182 0.19
183 0.2
184 0.2
185 0.24
186 0.23
187 0.24
188 0.23
189 0.23
190 0.23
191 0.26
192 0.27
193 0.21
194 0.2
195 0.21
196 0.2
197 0.19
198 0.22
199 0.19
200 0.17
201 0.17
202 0.16
203 0.15
204 0.15
205 0.13
206 0.11
207 0.13
208 0.13
209 0.16
210 0.17
211 0.17
212 0.18
213 0.18
214 0.19
215 0.18
216 0.18
217 0.15
218 0.16
219 0.16
220 0.14
221 0.18
222 0.17
223 0.16
224 0.19
225 0.19
226 0.18
227 0.18
228 0.18
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.1
243 0.11
244 0.12
245 0.14
246 0.18
247 0.22
248 0.27
249 0.28
250 0.3
251 0.3
252 0.3
253 0.28
254 0.29
255 0.27
256 0.24
257 0.24
258 0.23
259 0.23
260 0.22
261 0.21
262 0.18
263 0.15
264 0.14
265 0.13
266 0.13
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.09
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.12
281 0.15
282 0.14
283 0.13
284 0.13
285 0.14
286 0.16
287 0.19
288 0.17
289 0.15
290 0.16
291 0.16
292 0.17
293 0.16
294 0.13
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.08
299 0.1
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.14
307 0.12
308 0.17
309 0.2
310 0.26
311 0.27
312 0.27
313 0.27
314 0.26
315 0.27
316 0.26
317 0.26
318 0.22
319 0.29
320 0.4
321 0.49
322 0.56
323 0.63
324 0.64
325 0.64
326 0.67
327 0.65
328 0.62
329 0.62
330 0.61
331 0.63
332 0.67
333 0.7
334 0.69
335 0.66
336 0.6
337 0.56
338 0.57
339 0.55
340 0.5
341 0.47
342 0.47
343 0.46
344 0.5
345 0.46
346 0.39
347 0.4
348 0.38
349 0.34
350 0.33
351 0.34
352 0.31
353 0.37
354 0.35
355 0.28
356 0.27
357 0.26
358 0.25
359 0.22
360 0.19
361 0.13