Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CA63

Protein Details
Accession Q6CA63    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-97KTDMAPRKSKNQLRREKAKAAKLAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-96RKSKNQLRREKAKAAKL
Subcellular Location(s) nucl 7, mito 6, cyto 6, cyto_mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007180  DUF382  
IPR006568  PSP_pro-rich  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG yli:YALI0D05577g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04037  DUF382  
PF04046  PSP  
Amino Acid Sequences MWFLPAVKNGGAIAIFRSPHPISIVALSCVVLSLLHQGCRICTLKIHRQYHDSTTTLQQVQVQVQVLAPFISLKTDMAPRKSKNQLRREKAKAAKLAAKEESVKPTEQAASATTVPSTTTSATTKPASTSWTAFTVEIDENDEKFAEFQRIFEKFDPANVQTEPEEKPTATDSMMYSDDEEYEDDDYVDEKQQTLVRSKKREKIPLAELKASTSKPDLVDWHDADAMEPFLLVHLKSAPNVIPVPSHWTQKREYLSLKRGFAKQPFELPQFIKDTGIMDMRETGAEDESTLKQRARERVQPKMGKMDIDYQKLHDAFFKFQTKPRLYEYGDQYFEGKEFEPDLSKYRPGVLSKELREALNMPPNTPPPWLLQMQRFGPPPSYKDLRIPGVNAPIPSSAQWGFHPGGYGKPPLDENNQPLYGDVFGQNVVKRSTDVDKSLWGQPGEDEESSEDEDDDEEEEVEEEIDDEGQGYVDGDVAEAQERYQEEQKRYRGPTEQAREEAPLDLRKRRHEEVEEDSGEKTLYRVLPTKKKAITQLMDTDFVYDMSGEGAKGDKKEKEKEKGTETSRDDLQSNIDNLFDSVRGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.15
4 0.23
5 0.22
6 0.23
7 0.25
8 0.24
9 0.21
10 0.26
11 0.28
12 0.22
13 0.22
14 0.2
15 0.17
16 0.16
17 0.14
18 0.08
19 0.07
20 0.14
21 0.16
22 0.18
23 0.2
24 0.2
25 0.21
26 0.28
27 0.29
28 0.22
29 0.26
30 0.33
31 0.41
32 0.51
33 0.58
34 0.56
35 0.6
36 0.64
37 0.64
38 0.61
39 0.53
40 0.46
41 0.44
42 0.46
43 0.41
44 0.38
45 0.34
46 0.31
47 0.31
48 0.31
49 0.27
50 0.21
51 0.21
52 0.2
53 0.17
54 0.14
55 0.13
56 0.09
57 0.08
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.11
62 0.19
63 0.24
64 0.31
65 0.39
66 0.41
67 0.49
68 0.59
69 0.65
70 0.67
71 0.73
72 0.77
73 0.78
74 0.85
75 0.84
76 0.84
77 0.83
78 0.82
79 0.77
80 0.73
81 0.7
82 0.64
83 0.62
84 0.54
85 0.48
86 0.44
87 0.41
88 0.41
89 0.37
90 0.34
91 0.29
92 0.3
93 0.28
94 0.25
95 0.22
96 0.17
97 0.18
98 0.18
99 0.17
100 0.14
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.1
106 0.12
107 0.14
108 0.15
109 0.19
110 0.2
111 0.2
112 0.2
113 0.2
114 0.21
115 0.22
116 0.23
117 0.21
118 0.22
119 0.22
120 0.21
121 0.2
122 0.2
123 0.18
124 0.16
125 0.19
126 0.17
127 0.16
128 0.17
129 0.17
130 0.13
131 0.13
132 0.14
133 0.15
134 0.14
135 0.15
136 0.21
137 0.23
138 0.27
139 0.27
140 0.31
141 0.25
142 0.29
143 0.33
144 0.27
145 0.28
146 0.25
147 0.25
148 0.21
149 0.24
150 0.21
151 0.2
152 0.21
153 0.17
154 0.18
155 0.19
156 0.19
157 0.16
158 0.16
159 0.13
160 0.14
161 0.15
162 0.14
163 0.13
164 0.12
165 0.12
166 0.11
167 0.11
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.11
179 0.14
180 0.16
181 0.23
182 0.29
183 0.35
184 0.45
185 0.52
186 0.58
187 0.63
188 0.7
189 0.68
190 0.67
191 0.69
192 0.68
193 0.66
194 0.61
195 0.53
196 0.47
197 0.45
198 0.38
199 0.3
200 0.23
201 0.2
202 0.17
203 0.18
204 0.18
205 0.19
206 0.24
207 0.23
208 0.23
209 0.21
210 0.21
211 0.19
212 0.18
213 0.13
214 0.07
215 0.07
216 0.05
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.1
225 0.1
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.1
230 0.1
231 0.17
232 0.18
233 0.23
234 0.23
235 0.26
236 0.27
237 0.33
238 0.35
239 0.32
240 0.36
241 0.38
242 0.44
243 0.47
244 0.48
245 0.45
246 0.46
247 0.47
248 0.45
249 0.43
250 0.35
251 0.35
252 0.37
253 0.35
254 0.35
255 0.31
256 0.29
257 0.27
258 0.26
259 0.21
260 0.17
261 0.15
262 0.13
263 0.15
264 0.12
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.11
277 0.12
278 0.12
279 0.16
280 0.21
281 0.28
282 0.31
283 0.39
284 0.4
285 0.48
286 0.57
287 0.57
288 0.54
289 0.53
290 0.49
291 0.4
292 0.37
293 0.37
294 0.33
295 0.33
296 0.32
297 0.26
298 0.29
299 0.29
300 0.27
301 0.22
302 0.19
303 0.18
304 0.23
305 0.27
306 0.25
307 0.29
308 0.38
309 0.36
310 0.37
311 0.39
312 0.4
313 0.37
314 0.42
315 0.44
316 0.41
317 0.39
318 0.37
319 0.34
320 0.28
321 0.25
322 0.2
323 0.14
324 0.08
325 0.09
326 0.09
327 0.1
328 0.11
329 0.15
330 0.16
331 0.17
332 0.16
333 0.18
334 0.21
335 0.2
336 0.22
337 0.25
338 0.3
339 0.3
340 0.35
341 0.34
342 0.3
343 0.3
344 0.29
345 0.26
346 0.27
347 0.26
348 0.21
349 0.22
350 0.25
351 0.25
352 0.24
353 0.21
354 0.16
355 0.2
356 0.22
357 0.23
358 0.25
359 0.29
360 0.3
361 0.32
362 0.32
363 0.29
364 0.31
365 0.3
366 0.28
367 0.3
368 0.31
369 0.29
370 0.32
371 0.35
372 0.34
373 0.33
374 0.33
375 0.29
376 0.32
377 0.32
378 0.27
379 0.24
380 0.21
381 0.2
382 0.18
383 0.19
384 0.14
385 0.13
386 0.13
387 0.16
388 0.16
389 0.16
390 0.18
391 0.14
392 0.17
393 0.18
394 0.2
395 0.16
396 0.16
397 0.18
398 0.19
399 0.24
400 0.25
401 0.28
402 0.31
403 0.32
404 0.3
405 0.29
406 0.26
407 0.21
408 0.19
409 0.14
410 0.09
411 0.09
412 0.12
413 0.13
414 0.15
415 0.15
416 0.14
417 0.14
418 0.17
419 0.21
420 0.22
421 0.24
422 0.23
423 0.25
424 0.28
425 0.32
426 0.33
427 0.28
428 0.25
429 0.23
430 0.26
431 0.26
432 0.22
433 0.18
434 0.15
435 0.17
436 0.18
437 0.17
438 0.13
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.09
443 0.08
444 0.07
445 0.06
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.04
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.06
465 0.07
466 0.06
467 0.06
468 0.09
469 0.1
470 0.14
471 0.21
472 0.28
473 0.33
474 0.42
475 0.49
476 0.55
477 0.58
478 0.59
479 0.58
480 0.59
481 0.63
482 0.63
483 0.63
484 0.56
485 0.54
486 0.51
487 0.45
488 0.41
489 0.35
490 0.33
491 0.32
492 0.37
493 0.4
494 0.47
495 0.53
496 0.55
497 0.58
498 0.57
499 0.58
500 0.59
501 0.62
502 0.56
503 0.5
504 0.46
505 0.38
506 0.32
507 0.26
508 0.19
509 0.15
510 0.15
511 0.18
512 0.25
513 0.33
514 0.44
515 0.49
516 0.58
517 0.57
518 0.6
519 0.64
520 0.66
521 0.62
522 0.58
523 0.61
524 0.55
525 0.53
526 0.48
527 0.42
528 0.32
529 0.27
530 0.22
531 0.13
532 0.09
533 0.09
534 0.09
535 0.07
536 0.07
537 0.11
538 0.13
539 0.17
540 0.23
541 0.28
542 0.35
543 0.45
544 0.54
545 0.61
546 0.67
547 0.72
548 0.73
549 0.76
550 0.74
551 0.74
552 0.69
553 0.64
554 0.59
555 0.55
556 0.48
557 0.39
558 0.39
559 0.35
560 0.32
561 0.27
562 0.23
563 0.21
564 0.21
565 0.21