Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C6B9

Protein Details
Accession Q6C6B9    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-38QAQKADGKKTSKNKAPPPWVEKYRPKSLDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 9, cyto 8, mito 5, cyto_pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR008921  DNA_pol3_clamp-load_cplx_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR013748  Rep_factorC_C  
Gene Ontology GO:0031390  C:Ctf18 RFC-like complex  
GO:0005663  C:DNA replication factor C complex  
GO:0031391  C:Elg1 RFC-like complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031389  C:Rad17 RFC-like complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003689  F:DNA clamp loader activity  
GO:0090618  P:DNA clamp unloading  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006261  P:DNA-templated DNA replication  
GO:0006272  P:leading strand elongation  
GO:0033314  P:mitotic DNA replication checkpoint signaling  
GO:0007062  P:sister chromatid cohesion  
GO:0070914  P:UV-damage excision repair  
KEGG yli:YALI0E10747g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF08542  Rep_fac_C  
CDD cd00009  AAA  
cd18140  HLD_clamp_RFC  
Amino Acid Sequences MQSFFAKSQQAQKADGKKTSKNKAPPPWVEKYRPKSLDDVSSQDHAVTVLKRTLGSANLPHMLFYGPPGTGKTSTVLALAKELYGPELMKDRVLELNASDERGIAIVRDSIKNFAAQKVVAPKDHIAEKYPCPPFKIIILDEADSMTTDAQSALRRTMETYSAQTRFCLICNYVTRIIDPLASRCSKFRFRLLDGNDALARLRHVSDAEQLSVEDGVLEKILEVANGDLRRAITILQSCSRLSGESSAAQNDEDGDATMAETRPITIADVNETAGVIPTETLKAIIKACKDSKGPIGDTVPDILVAVKELTYSGWSSAQITSQMHDLIITDVLIEGKEKSKIAELLSVTDKRLADGADESLAMLNLIVGIADVLGAAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.65
3 0.62
4 0.63
5 0.69
6 0.74
7 0.75
8 0.75
9 0.78
10 0.8
11 0.84
12 0.85
13 0.83
14 0.83
15 0.83
16 0.82
17 0.83
18 0.8
19 0.8
20 0.74
21 0.69
22 0.65
23 0.61
24 0.6
25 0.54
26 0.51
27 0.44
28 0.42
29 0.4
30 0.34
31 0.29
32 0.21
33 0.2
34 0.16
35 0.16
36 0.16
37 0.17
38 0.17
39 0.19
40 0.2
41 0.19
42 0.22
43 0.22
44 0.24
45 0.28
46 0.27
47 0.26
48 0.24
49 0.22
50 0.18
51 0.16
52 0.14
53 0.1
54 0.11
55 0.13
56 0.16
57 0.16
58 0.17
59 0.17
60 0.16
61 0.16
62 0.17
63 0.17
64 0.13
65 0.14
66 0.13
67 0.12
68 0.11
69 0.11
70 0.09
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.14
75 0.14
76 0.14
77 0.15
78 0.15
79 0.16
80 0.17
81 0.16
82 0.12
83 0.18
84 0.17
85 0.18
86 0.16
87 0.13
88 0.13
89 0.12
90 0.12
91 0.06
92 0.06
93 0.08
94 0.11
95 0.13
96 0.14
97 0.16
98 0.17
99 0.2
100 0.21
101 0.19
102 0.19
103 0.17
104 0.19
105 0.25
106 0.27
107 0.24
108 0.25
109 0.25
110 0.25
111 0.29
112 0.27
113 0.23
114 0.25
115 0.27
116 0.33
117 0.38
118 0.37
119 0.36
120 0.36
121 0.33
122 0.32
123 0.34
124 0.25
125 0.24
126 0.24
127 0.22
128 0.21
129 0.19
130 0.16
131 0.11
132 0.11
133 0.07
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.06
138 0.09
139 0.09
140 0.11
141 0.11
142 0.12
143 0.13
144 0.14
145 0.15
146 0.14
147 0.17
148 0.21
149 0.23
150 0.23
151 0.22
152 0.23
153 0.21
154 0.2
155 0.18
156 0.13
157 0.16
158 0.18
159 0.23
160 0.23
161 0.22
162 0.22
163 0.21
164 0.2
165 0.17
166 0.15
167 0.13
168 0.15
169 0.16
170 0.16
171 0.17
172 0.21
173 0.25
174 0.27
175 0.31
176 0.32
177 0.35
178 0.42
179 0.43
180 0.45
181 0.39
182 0.39
183 0.33
184 0.28
185 0.24
186 0.16
187 0.14
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.07
192 0.08
193 0.12
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.1
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.09
221 0.12
222 0.15
223 0.16
224 0.18
225 0.18
226 0.19
227 0.19
228 0.16
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.14
233 0.15
234 0.15
235 0.15
236 0.14
237 0.13
238 0.11
239 0.1
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.05
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.08
262 0.08
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.1
271 0.13
272 0.16
273 0.18
274 0.25
275 0.27
276 0.31
277 0.32
278 0.33
279 0.37
280 0.39
281 0.38
282 0.35
283 0.35
284 0.31
285 0.31
286 0.29
287 0.22
288 0.16
289 0.15
290 0.11
291 0.09
292 0.08
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.13
304 0.14
305 0.15
306 0.17
307 0.17
308 0.16
309 0.17
310 0.17
311 0.15
312 0.14
313 0.13
314 0.1
315 0.1
316 0.09
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.1
324 0.13
325 0.14
326 0.15
327 0.19
328 0.22
329 0.23
330 0.27
331 0.25
332 0.27
333 0.34
334 0.34
335 0.31
336 0.33
337 0.31
338 0.26
339 0.27
340 0.22
341 0.18
342 0.18
343 0.18
344 0.15
345 0.14
346 0.14
347 0.13
348 0.12
349 0.1
350 0.08
351 0.06
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03