Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C0Y9

Protein Details
Accession Q6C0Y9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1016-1049GTAKTGVSRRTAKNKRRMDRKKAKGKKGTVFEEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1023-1042SRRTAKNKRRMDRKKAKGKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.166, cyto 13.5, nucl 12.5, cyto_mito 7.999, mito_nucl 7.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006849  Elp1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0033588  C:elongator holoenzyme complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0043621  F:protein self-association  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0002926  P:tRNA wobble base 5-methoxycarbonylmethyl-2-thiouridinylation  
KEGG yli:YALI0F20658g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04762  IKI3  
Amino Acid Sequences MRNLQCVHRGIIKPESVEAPDLNLVKTIYDPLSDAMVFVFDGLDTVEVQQFSKTEGTQVWANFPVSGHVLACDFLWESQTCVIFLSDGNVYSVEQGDQVINLGEMEGVESAAWSPDQQVVALGAKDKVLVLSRTFDPLSETPVSVDDLKLSRHVSVGWGSADTQFRGRGAKRDPTVPEHVDIGHVTESDESNITLCWRPDGEWLAQSSCDDVEGGKRRVVRVYSRDGQLFSVSEPVDGLLDLVAWGTSLIACVAKQEVVFFERNGLRHGGFHIGDFVPIGMQWNSTGEILALWSHETVRLYTTKNYRWYLKQEVVSRLPGNPKTLTWHPEKPRTIIINYDDHVEIHEYTDTVTSEPVNGVTCVIDGKLLLVTPLKLACVPPPMSRDEIHMEENIVAVSSSASHIAVLTREAVYIYDSLTVTHVTTHRLDLNNETVKAVVIHGEVPYVLAESASASRVITPAKSFPLHSDCIAFAKSHKAPLLQLLDGYVYLLQDTLEPLAKLPRCSTIAYTDEIYGLTSKGKLYKGDQVEASHVTSLLSSDDTLLYTTAERLYLAGESREIEKSSLLVSVHPSTYSVVLQAPRGNLETIHPRPLVLKRVSEALKNRDFKAALTICRTHRVDLNFLHDHDSELFMTHVSEFVDQVSSNHLDLFLTEVGVKNNPKGNEICDAVLTNTKNLLNQITAHSFKNPPDVAAALALVDSEESLEHLCFLHDVNHLYDTSLGLYDLEKTLLVAQQSQKDPKEYLPFLQKLQVMSEDRRKFTIDDHLEKYAKALESLIADKAEHEEIDTYITRHVLYNEALKLYTDKSDTQRVLNIYAAFLESTREYKEAGIIYESLEKWEEALEAYKAGVYWEEALCLCHAVEGFEDRVRDVADELAPQLVSAHCYKEASTLYADYLGDIMEAVRCLCLGSNFVAARALAARKAGGEKQRIFREIDSLLSDAFGTHSEFLADCQTQVKNQVSRLHEVRQLAQVSMSRELERLEDDNMVPDDISLADTASTSGTFLTKYTGKTAGTAKTGVSRRTAKNKRRMDRKKAKGKKGTVFEEEYLVASLGRLVERLEQSKVEIYNVIQALYSRDRRPLAHQLQQSLVALAASLTENVQFVFNRTMEDRKRIDDDGAVYYLDEVPVPEIKKVEVFASL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.41
3 0.34
4 0.33
5 0.28
6 0.24
7 0.26
8 0.25
9 0.23
10 0.22
11 0.2
12 0.17
13 0.18
14 0.19
15 0.15
16 0.14
17 0.15
18 0.14
19 0.17
20 0.16
21 0.16
22 0.12
23 0.11
24 0.1
25 0.09
26 0.08
27 0.05
28 0.05
29 0.05
30 0.06
31 0.06
32 0.08
33 0.1
34 0.11
35 0.12
36 0.13
37 0.13
38 0.15
39 0.18
40 0.16
41 0.17
42 0.17
43 0.21
44 0.24
45 0.25
46 0.26
47 0.27
48 0.27
49 0.25
50 0.24
51 0.22
52 0.2
53 0.2
54 0.16
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.13
59 0.12
60 0.1
61 0.09
62 0.13
63 0.12
64 0.13
65 0.17
66 0.18
67 0.16
68 0.16
69 0.16
70 0.13
71 0.13
72 0.14
73 0.11
74 0.11
75 0.12
76 0.12
77 0.11
78 0.12
79 0.13
80 0.1
81 0.09
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.05
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.1
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.13
107 0.15
108 0.15
109 0.16
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.13
114 0.12
115 0.14
116 0.16
117 0.16
118 0.2
119 0.21
120 0.25
121 0.25
122 0.23
123 0.25
124 0.23
125 0.28
126 0.25
127 0.24
128 0.21
129 0.22
130 0.24
131 0.19
132 0.18
133 0.16
134 0.16
135 0.17
136 0.2
137 0.2
138 0.18
139 0.18
140 0.18
141 0.17
142 0.18
143 0.19
144 0.16
145 0.16
146 0.16
147 0.2
148 0.22
149 0.2
150 0.2
151 0.19
152 0.19
153 0.25
154 0.26
155 0.3
156 0.34
157 0.42
158 0.43
159 0.48
160 0.52
161 0.52
162 0.57
163 0.52
164 0.47
165 0.39
166 0.36
167 0.31
168 0.27
169 0.23
170 0.16
171 0.13
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.12
176 0.13
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.12
181 0.14
182 0.14
183 0.15
184 0.15
185 0.17
186 0.21
187 0.25
188 0.24
189 0.24
190 0.26
191 0.25
192 0.24
193 0.23
194 0.2
195 0.15
196 0.13
197 0.1
198 0.08
199 0.15
200 0.23
201 0.25
202 0.27
203 0.29
204 0.3
205 0.35
206 0.39
207 0.39
208 0.37
209 0.44
210 0.48
211 0.49
212 0.5
213 0.46
214 0.43
215 0.37
216 0.31
217 0.22
218 0.21
219 0.17
220 0.15
221 0.14
222 0.13
223 0.11
224 0.1
225 0.09
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.1
245 0.13
246 0.15
247 0.14
248 0.19
249 0.21
250 0.22
251 0.24
252 0.24
253 0.21
254 0.21
255 0.22
256 0.21
257 0.19
258 0.18
259 0.2
260 0.17
261 0.17
262 0.16
263 0.14
264 0.08
265 0.08
266 0.11
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.11
286 0.14
287 0.16
288 0.22
289 0.29
290 0.33
291 0.4
292 0.43
293 0.46
294 0.48
295 0.52
296 0.54
297 0.53
298 0.53
299 0.52
300 0.55
301 0.53
302 0.52
303 0.47
304 0.42
305 0.43
306 0.39
307 0.37
308 0.31
309 0.29
310 0.31
311 0.34
312 0.35
313 0.35
314 0.42
315 0.45
316 0.53
317 0.55
318 0.52
319 0.54
320 0.53
321 0.48
322 0.44
323 0.4
324 0.36
325 0.33
326 0.33
327 0.26
328 0.22
329 0.22
330 0.19
331 0.15
332 0.11
333 0.11
334 0.09
335 0.09
336 0.1
337 0.1
338 0.08
339 0.09
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.06
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.1
365 0.15
366 0.17
367 0.19
368 0.21
369 0.24
370 0.25
371 0.25
372 0.27
373 0.26
374 0.26
375 0.25
376 0.22
377 0.2
378 0.18
379 0.17
380 0.14
381 0.09
382 0.06
383 0.05
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.09
406 0.09
407 0.08
408 0.1
409 0.11
410 0.11
411 0.12
412 0.14
413 0.17
414 0.19
415 0.2
416 0.2
417 0.26
418 0.27
419 0.26
420 0.24
421 0.2
422 0.19
423 0.18
424 0.15
425 0.09
426 0.06
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.05
440 0.06
441 0.05
442 0.06
443 0.07
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.1
448 0.13
449 0.14
450 0.14
451 0.17
452 0.21
453 0.21
454 0.2
455 0.2
456 0.17
457 0.18
458 0.18
459 0.14
460 0.11
461 0.16
462 0.17
463 0.18
464 0.19
465 0.18
466 0.18
467 0.23
468 0.26
469 0.19
470 0.18
471 0.15
472 0.14
473 0.13
474 0.13
475 0.07
476 0.04
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.05
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.12
487 0.13
488 0.14
489 0.15
490 0.17
491 0.18
492 0.19
493 0.2
494 0.19
495 0.2
496 0.2
497 0.2
498 0.17
499 0.15
500 0.14
501 0.13
502 0.09
503 0.07
504 0.07
505 0.06
506 0.07
507 0.1
508 0.11
509 0.12
510 0.14
511 0.21
512 0.23
513 0.25
514 0.25
515 0.23
516 0.24
517 0.24
518 0.21
519 0.14
520 0.12
521 0.1
522 0.08
523 0.08
524 0.06
525 0.05
526 0.04
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.06
542 0.05
543 0.06
544 0.06
545 0.08
546 0.09
547 0.09
548 0.09
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.1
553 0.08
554 0.08
555 0.1
556 0.11
557 0.11
558 0.1
559 0.1
560 0.09
561 0.1
562 0.09
563 0.08
564 0.08
565 0.09
566 0.1
567 0.11
568 0.11
569 0.11
570 0.12
571 0.11
572 0.1
573 0.11
574 0.18
575 0.18
576 0.22
577 0.21
578 0.2
579 0.23
580 0.26
581 0.31
582 0.25
583 0.24
584 0.21
585 0.26
586 0.27
587 0.28
588 0.3
589 0.3
590 0.36
591 0.38
592 0.38
593 0.36
594 0.35
595 0.31
596 0.34
597 0.3
598 0.25
599 0.26
600 0.29
601 0.27
602 0.33
603 0.34
604 0.26
605 0.27
606 0.27
607 0.28
608 0.25
609 0.31
610 0.26
611 0.26
612 0.28
613 0.24
614 0.23
615 0.2
616 0.19
617 0.12
618 0.11
619 0.11
620 0.07
621 0.07
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.06
626 0.05
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.09
632 0.09
633 0.09
634 0.09
635 0.09
636 0.08
637 0.08
638 0.1
639 0.07
640 0.06
641 0.06
642 0.07
643 0.08
644 0.11
645 0.12
646 0.12
647 0.16
648 0.16
649 0.18
650 0.18
651 0.2
652 0.2
653 0.21
654 0.19
655 0.15
656 0.15
657 0.14
658 0.17
659 0.15
660 0.12
661 0.13
662 0.13
663 0.13
664 0.13
665 0.14
666 0.1
667 0.11
668 0.14
669 0.16
670 0.18
671 0.18
672 0.2
673 0.21
674 0.21
675 0.27
676 0.24
677 0.2
678 0.19
679 0.19
680 0.16
681 0.14
682 0.13
683 0.06
684 0.06
685 0.05
686 0.04
687 0.03
688 0.03
689 0.02
690 0.02
691 0.03
692 0.04
693 0.04
694 0.04
695 0.05
696 0.05
697 0.05
698 0.06
699 0.08
700 0.1
701 0.11
702 0.12
703 0.13
704 0.13
705 0.13
706 0.13
707 0.1
708 0.09
709 0.08
710 0.06
711 0.05
712 0.06
713 0.06
714 0.06
715 0.06
716 0.06
717 0.06
718 0.07
719 0.08
720 0.08
721 0.11
722 0.13
723 0.19
724 0.23
725 0.27
726 0.28
727 0.29
728 0.3
729 0.3
730 0.35
731 0.3
732 0.31
733 0.35
734 0.35
735 0.34
736 0.37
737 0.35
738 0.28
739 0.28
740 0.29
741 0.24
742 0.27
743 0.35
744 0.35
745 0.35
746 0.35
747 0.36
748 0.31
749 0.3
750 0.36
751 0.33
752 0.35
753 0.37
754 0.41
755 0.4
756 0.39
757 0.37
758 0.31
759 0.24
760 0.18
761 0.15
762 0.11
763 0.13
764 0.14
765 0.15
766 0.11
767 0.11
768 0.11
769 0.12
770 0.12
771 0.09
772 0.09
773 0.08
774 0.08
775 0.11
776 0.12
777 0.1
778 0.1
779 0.11
780 0.11
781 0.11
782 0.12
783 0.11
784 0.12
785 0.16
786 0.17
787 0.17
788 0.17
789 0.16
790 0.17
791 0.15
792 0.17
793 0.14
794 0.16
795 0.19
796 0.27
797 0.28
798 0.28
799 0.31
800 0.3
801 0.3
802 0.29
803 0.25
804 0.18
805 0.17
806 0.16
807 0.12
808 0.1
809 0.1
810 0.08
811 0.09
812 0.11
813 0.11
814 0.11
815 0.11
816 0.14
817 0.14
818 0.13
819 0.13
820 0.12
821 0.13
822 0.17
823 0.16
824 0.15
825 0.14
826 0.13
827 0.12
828 0.12
829 0.11
830 0.08
831 0.09
832 0.09
833 0.08
834 0.08
835 0.08
836 0.08
837 0.08
838 0.07
839 0.06
840 0.08
841 0.08
842 0.09
843 0.09
844 0.1
845 0.1
846 0.1
847 0.09
848 0.08
849 0.08
850 0.07
851 0.08
852 0.1
853 0.11
854 0.13
855 0.13
856 0.12
857 0.13
858 0.13
859 0.12
860 0.11
861 0.11
862 0.1
863 0.1
864 0.11
865 0.11
866 0.1
867 0.1
868 0.1
869 0.08
870 0.1
871 0.1
872 0.12
873 0.12
874 0.13
875 0.13
876 0.17
877 0.18
878 0.18
879 0.18
880 0.17
881 0.16
882 0.18
883 0.17
884 0.12
885 0.11
886 0.09
887 0.07
888 0.06
889 0.06
890 0.05
891 0.05
892 0.05
893 0.05
894 0.05
895 0.05
896 0.06
897 0.07
898 0.08
899 0.09
900 0.15
901 0.15
902 0.16
903 0.16
904 0.15
905 0.15
906 0.17
907 0.16
908 0.11
909 0.12
910 0.12
911 0.12
912 0.16
913 0.21
914 0.25
915 0.33
916 0.38
917 0.45
918 0.51
919 0.52
920 0.51
921 0.46
922 0.44
923 0.36
924 0.33
925 0.27
926 0.22
927 0.19
928 0.16
929 0.16
930 0.11
931 0.1
932 0.09
933 0.08
934 0.08
935 0.08
936 0.09
937 0.09
938 0.1
939 0.14
940 0.13
941 0.12
942 0.15
943 0.16
944 0.17
945 0.23
946 0.29
947 0.27
948 0.33
949 0.4
950 0.4
951 0.46
952 0.49
953 0.47
954 0.45
955 0.44
956 0.42
957 0.41
958 0.39
959 0.32
960 0.3
961 0.29
962 0.28
963 0.3
964 0.29
965 0.23
966 0.23
967 0.23
968 0.22
969 0.22
970 0.2
971 0.17
972 0.18
973 0.17
974 0.2
975 0.2
976 0.19
977 0.16
978 0.14
979 0.13
980 0.1
981 0.11
982 0.07
983 0.06
984 0.06
985 0.06
986 0.07
987 0.07
988 0.06
989 0.06
990 0.06
991 0.07
992 0.07
993 0.07
994 0.12
995 0.14
996 0.16
997 0.2
998 0.23
999 0.23
1000 0.26
1001 0.31
1002 0.31
1003 0.31
1004 0.3
1005 0.27
1006 0.32
1007 0.36
1008 0.35
1009 0.37
1010 0.4
1011 0.45
1012 0.55
1013 0.65
1014 0.67
1015 0.73
1016 0.81
1017 0.84
1018 0.87
1019 0.9
1020 0.91
1021 0.91
1022 0.92
1023 0.93
1024 0.93
1025 0.94
1026 0.93
1027 0.92
1028 0.89
1029 0.87
1030 0.83
1031 0.79
1032 0.73
1033 0.63
1034 0.56
1035 0.47
1036 0.38
1037 0.3
1038 0.23
1039 0.16
1040 0.11
1041 0.11
1042 0.09
1043 0.09
1044 0.09
1045 0.09
1046 0.15
1047 0.2
1048 0.23
1049 0.24
1050 0.24
1051 0.26
1052 0.31
1053 0.3
1054 0.26
1055 0.23
1056 0.21
1057 0.25
1058 0.25
1059 0.23
1060 0.18
1061 0.18
1062 0.22
1063 0.28
1064 0.34
1065 0.29
1066 0.35
1067 0.37
1068 0.4
1069 0.47
1070 0.52
1071 0.52
1072 0.55
1073 0.58
1074 0.56
1075 0.55
1076 0.56
1077 0.49
1078 0.38
1079 0.3
1080 0.21
1081 0.15
1082 0.11
1083 0.09
1084 0.07
1085 0.07
1086 0.07
1087 0.07
1088 0.08
1089 0.08
1090 0.11
1091 0.1
1092 0.13
1093 0.18
1094 0.18
1095 0.21
1096 0.24
1097 0.33
1098 0.36
1099 0.45
1100 0.45
1101 0.44
1102 0.49
1103 0.47
1104 0.47
1105 0.42
1106 0.4
1107 0.35
1108 0.33
1109 0.28
1110 0.23
1111 0.22
1112 0.2
1113 0.16
1114 0.13
1115 0.09
1116 0.1
1117 0.15
1118 0.17
1119 0.18
1120 0.18
1121 0.19
1122 0.21
1123 0.22