FuNGI

Q6C740

Protein Details

Accession

Q6C740

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
534-555	DVSLSTKKKKTKKHFVSNVTTI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 14.5, cyto 10.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005847 C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006378 P:mRNA polyadenylation
KEGG	yli:YALI0E03982g -
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MHIFKNLTEPTAVTHSLSCNFTGERNLVLVKGSQLLQIFRYKDDIPTKDEAPRLELITEYYLDGTVTGVTRIKTIDNYDLDSLYISVKHAKAVIVAWNASSFTIDTKSLHYYEKGLVESNFFEPECSSVAVSDEANSFYTCLLFQNDRMAFLPIIEKGLDDDEMPESGQVFDPSFIVKASRLDKRIENVMDICFLHEYRETTMGILFQPKRAWVGMKNILKDTVSYAIVSVDVHQKNSTVIGTLNGLPVDAQKVIPLPAPLGGSLIICANTILYIDSSASYTGVMVNNTHRQNSDLIVSRDQSTLDLRLEGAEVCFIQELGNTALLVTEDGQFFSLLFNKDGRRVASLELRPIEPDNFILSQPSSVAAGPDGTIFLGSRAGDSLLVKWYHGEPESQPEETLDDGNESDDDLYGGDTAQTEDTTNRPLKLRLADRMLGMGPMQSLALGKNRGSQGVEFVTTTGVGANSALAILTSALMPYKRKSLYKDMPGGQFWSVPVRFEEEGEVAKSRTYVVSSDSENSYLYYVDAAGVIEDVSLSTKKKKTKKHFVSNVTTIFSSSMLDSALLQVCLETVNIYDAKIGQPHKYSLPQGTTAVEARVLGNYVLVLLSDGQVKILEAVSINKRPFLKAAQVSIEPASESKAIGIYATDSSLTFGAPSKKRTRQGSPAQDSRPVVVVCYADGSLLLQGLNSDDRLILDASDLSGFIKEKDGQLYDAPLELVDIALSPLGDDHILRDYLVLLTPQQLVVYEPYHYNDKLRFRKIFLERTPTINSDRRLTQVPLINGKHTLGVTGETAYILVKTLHTSPRLIEFGETKGAVAFTSWDGKFAYLTQAGEVAECRFDPSFSLETNWPVKHVQLCGETISKVTYHETMDVYVIATHKTVPHVVRDEDDEVIESLTPDIMPATTYQGAIRIVNPYSWTVIDSYEFEMPAEAALCCESVKLSISDRKSQKREVVAVGTSILRGEDLAARGALYLFDVIEIVPEKERPETNRRLKKLVQDRVRGAFTAVCEVSGRLLAVQGQKLLVQALQDDLTLVPVAFLDMQTYVAVAKSLNSMLLLGDATRSVQFVGFSMDPYQMIPFARDLQRVLVTTCDFAIEGENLTFVVADLQKRLHILEYDPDDPQSYSGARLLRRSVFYSGKVIDSSAMVPINEDRFMVIGVCSDGSVTDVVPCPEDAYRRLYAIQTQITDKEAHVCGLHPRAYRYDPILPGTGNSPHRPILDGHTLIRFANLPRNKQNVYANRLGQRYQQLIWKDLELISDLFKKCI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.24
3	0.27
4	0.28
5	0.25
6	0.23
7	0.23
8	0.23
9	0.26
10	0.24
11	0.21
12	0.22
13	0.22
14	0.19
15	0.2
16	0.19
17	0.16
18	0.18
19	0.17
20	0.18
21	0.19
22	0.2
23	0.22
24	0.28
25	0.28
26	0.26
27	0.3
28	0.28
29	0.34
30	0.41
31	0.42
32	0.4
33	0.43
34	0.45
35	0.46
36	0.49
37	0.42
38	0.38
39	0.37
40	0.34
41	0.29
42	0.27
43	0.23
44	0.22
45	0.22
46	0.18
47	0.15
48	0.13
49	0.12
50	0.12
51	0.1
52	0.09
53	0.08
54	0.1
55	0.12
56	0.12
57	0.14
58	0.15
59	0.17
60	0.19
61	0.22
62	0.28
63	0.28
64	0.31
65	0.32
66	0.31
67	0.29
68	0.26
69	0.22
70	0.16
71	0.14
72	0.12
73	0.16
74	0.16
75	0.18
76	0.19
77	0.18
78	0.19
79	0.2
80	0.26
81	0.23
82	0.23
83	0.22
84	0.22
85	0.22
86	0.2
87	0.19
88	0.12
89	0.1
90	0.13
91	0.14
92	0.14
93	0.17
94	0.21
95	0.22
96	0.25
97	0.24
98	0.25
99	0.27
100	0.3
101	0.28
102	0.27
103	0.25
104	0.25
105	0.27
106	0.25
107	0.24
108	0.2
109	0.19
110	0.17
111	0.18
112	0.17
113	0.15
114	0.14
115	0.11
116	0.13
117	0.13
118	0.13
119	0.13
120	0.12
121	0.12
122	0.13
123	0.13
124	0.12
125	0.11
126	0.11
127	0.1
128	0.11
129	0.14
130	0.15
131	0.16
132	0.25
133	0.25
134	0.27
135	0.28
136	0.29
137	0.24
138	0.23
139	0.24
140	0.16
141	0.17
142	0.15
143	0.14
144	0.12
145	0.14
146	0.13
147	0.1
148	0.11
149	0.11
150	0.11
151	0.12
152	0.1
153	0.09
154	0.1
155	0.11
156	0.11
157	0.1
158	0.1
159	0.11
160	0.12
161	0.11
162	0.11
163	0.11
164	0.11
165	0.16
166	0.22
167	0.28
168	0.3
169	0.34
170	0.38
171	0.4
172	0.47
173	0.43
174	0.41
175	0.35
176	0.34
177	0.32
178	0.28
179	0.25
180	0.19
181	0.18
182	0.16
183	0.17
184	0.17
185	0.17
186	0.2
187	0.19
188	0.18
189	0.18
190	0.17
191	0.16
192	0.23
193	0.21
194	0.22
195	0.23
196	0.23
197	0.25
198	0.25
199	0.27
200	0.23
201	0.31
202	0.37
203	0.41
204	0.43
205	0.42
206	0.42
207	0.39
208	0.35
209	0.29
210	0.23
211	0.19
212	0.16
213	0.14
214	0.13
215	0.13
216	0.13
217	0.12
218	0.17
219	0.18
220	0.19
221	0.19
222	0.19
223	0.2
224	0.21
225	0.19
226	0.11
227	0.11
228	0.1
229	0.13
230	0.13
231	0.14
232	0.12
233	0.12
234	0.11
235	0.11
236	0.12
237	0.1
238	0.09
239	0.09
240	0.1
241	0.11
242	0.13
243	0.13
244	0.11
245	0.12
246	0.13
247	0.12
248	0.12
249	0.11
250	0.09
251	0.09
252	0.09
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.06
257	0.05
258	0.06
259	0.06
260	0.05
261	0.05
262	0.06
263	0.06
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.06
268	0.06
269	0.08
270	0.09
271	0.1
272	0.1
273	0.15
274	0.22
275	0.24
276	0.25
277	0.24
278	0.24
279	0.24
280	0.25
281	0.25
282	0.24
283	0.26
284	0.27
285	0.28
286	0.29
287	0.28
288	0.26
289	0.23
290	0.18
291	0.18
292	0.16
293	0.15
294	0.13
295	0.13
296	0.13
297	0.12
298	0.1
299	0.08
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.08
307	0.08
308	0.09
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.07
315	0.08
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.09
322	0.12
323	0.12
324	0.13
325	0.16
326	0.17
327	0.22
328	0.25
329	0.25
330	0.23
331	0.23
332	0.25
333	0.3
334	0.31
335	0.32
336	0.31
337	0.3
338	0.29
339	0.29
340	0.27
341	0.19
342	0.18
343	0.16
344	0.15
345	0.14
346	0.15
347	0.13
348	0.12
349	0.12
350	0.11
351	0.09
352	0.08
353	0.08
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.06
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.07
368	0.08
369	0.08
370	0.09
371	0.12
372	0.12
373	0.12
374	0.13
375	0.14
376	0.15
377	0.15
378	0.16
379	0.13
380	0.2
381	0.23
382	0.22
383	0.22
384	0.19
385	0.2
386	0.18
387	0.18
388	0.11
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.07
394	0.06
395	0.06
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.06
407	0.07
408	0.08
409	0.14
410	0.16
411	0.17
412	0.18
413	0.2
414	0.23
415	0.29
416	0.32
417	0.32
418	0.35
419	0.35
420	0.33
421	0.33
422	0.29
423	0.22
424	0.18
425	0.13
426	0.08
427	0.06
428	0.06
429	0.05
430	0.05
431	0.06
432	0.09
433	0.11
434	0.11
435	0.16
436	0.16
437	0.17
438	0.18
439	0.17
440	0.17
441	0.17
442	0.17
443	0.12
444	0.12
445	0.11
446	0.1
447	0.1
448	0.07
449	0.05
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.03
454	0.03
455	0.03
456	0.02
457	0.03
458	0.03
459	0.03
460	0.03
461	0.03
462	0.04
463	0.06
464	0.08
465	0.09
466	0.15
467	0.18
468	0.21
469	0.26
470	0.35
471	0.42
472	0.48
473	0.54
474	0.52
475	0.52
476	0.5
477	0.47
478	0.37
479	0.3
480	0.23
481	0.22
482	0.17
483	0.15
484	0.14
485	0.17
486	0.16
487	0.16
488	0.17
489	0.12
490	0.13
491	0.14
492	0.14
493	0.1
494	0.1
495	0.1
496	0.09
497	0.08
498	0.08
499	0.07
500	0.09
501	0.11
502	0.13
503	0.15
504	0.15
505	0.15
506	0.14
507	0.14
508	0.12
509	0.09
510	0.08
511	0.06
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.04
516	0.04
517	0.04
518	0.03
519	0.03
520	0.03
521	0.03
522	0.04
523	0.05
524	0.06
525	0.12
526	0.17
527	0.25
528	0.33
529	0.43
530	0.52
531	0.63
532	0.73
533	0.78
534	0.83
535	0.83
536	0.83
537	0.79
538	0.7
539	0.6
540	0.49
541	0.38
542	0.29
543	0.21
544	0.14
545	0.09
546	0.07
547	0.05
548	0.05
549	0.05
550	0.06
551	0.07
552	0.06
553	0.06
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.04
559	0.03
560	0.05
561	0.05
562	0.05
563	0.06
564	0.06
565	0.07
566	0.11
567	0.12
568	0.13
569	0.15
570	0.16
571	0.18
572	0.2
573	0.22
574	0.21
575	0.22
576	0.21
577	0.2
578	0.19
579	0.18
580	0.16
581	0.14
582	0.11
583	0.09
584	0.08
585	0.07
586	0.07
587	0.05
588	0.05
589	0.04
590	0.04
591	0.04
592	0.03
593	0.03
594	0.03
595	0.04
596	0.05
597	0.05
598	0.05
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.05
603	0.05
604	0.04
605	0.07
606	0.11
607	0.15
608	0.15
609	0.18
610	0.18
611	0.19
612	0.2
613	0.19
614	0.23
615	0.2
616	0.22
617	0.21
618	0.21
619	0.22
620	0.21
621	0.18
622	0.12
623	0.09
624	0.09
625	0.07
626	0.07
627	0.06
628	0.06
629	0.06
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.06
638	0.06
639	0.06
640	0.05
641	0.07
642	0.14
643	0.16
644	0.21
645	0.28
646	0.35
647	0.41
648	0.46
649	0.5
650	0.52
651	0.6
652	0.65
653	0.64
654	0.65
655	0.6
656	0.59
657	0.53
658	0.45
659	0.38
660	0.27
661	0.21
662	0.16
663	0.14
664	0.1
665	0.11
666	0.1
667	0.06
668	0.06
669	0.06
670	0.04
671	0.04
672	0.04
673	0.03
674	0.03
675	0.04
676	0.05
677	0.04
678	0.05
679	0.04
680	0.05
681	0.06
682	0.06
683	0.05
684	0.05
685	0.05
686	0.05
687	0.05
688	0.05
689	0.04
690	0.05
691	0.05
692	0.05
693	0.08
694	0.08
695	0.09
696	0.11
697	0.12
698	0.13
699	0.13
700	0.13
701	0.11
702	0.11
703	0.1
704	0.07
705	0.07
706	0.05
707	0.04
708	0.03
709	0.03
710	0.03
711	0.03
712	0.03
713	0.03
714	0.03
715	0.03
716	0.03
717	0.03
718	0.04
719	0.06
720	0.06
721	0.06
722	0.06
723	0.07
724	0.07
725	0.07
726	0.07
727	0.05
728	0.07
729	0.07
730	0.07
731	0.06
732	0.06
733	0.07
734	0.09
735	0.09
736	0.08
737	0.09
738	0.11
739	0.14
740	0.14
741	0.16
742	0.19
743	0.28
744	0.34
745	0.4
746	0.41
747	0.4
748	0.49
749	0.53
750	0.57
751	0.51
752	0.52
753	0.47
754	0.5
755	0.5
756	0.43
757	0.42
758	0.38
759	0.36
760	0.31
761	0.31
762	0.29
763	0.29
764	0.28
765	0.28
766	0.27
767	0.28
768	0.32
769	0.32
770	0.3
771	0.28
772	0.27
773	0.24
774	0.19
775	0.17
776	0.09
777	0.09
778	0.09
779	0.09
780	0.08
781	0.06
782	0.07
783	0.06
784	0.06
785	0.05
786	0.05
787	0.05
788	0.06
789	0.1
790	0.13
791	0.15
792	0.15
793	0.16
794	0.2
795	0.2
796	0.19
797	0.17
798	0.15
799	0.16
800	0.17
801	0.16
802	0.12
803	0.11
804	0.11
805	0.09
806	0.08
807	0.07
808	0.06
809	0.12
810	0.12
811	0.13
812	0.13
813	0.14
814	0.14
815	0.13
816	0.16
817	0.12
818	0.12
819	0.11
820	0.12
821	0.12
822	0.12
823	0.12
824	0.09
825	0.08
826	0.07
827	0.09
828	0.08
829	0.08
830	0.09
831	0.12
832	0.14
833	0.14
834	0.17
835	0.16
836	0.2
837	0.25
838	0.24
839	0.21
840	0.2
841	0.22
842	0.22
843	0.22
844	0.22
845	0.19
846	0.2
847	0.2
848	0.21
849	0.19
850	0.16
851	0.16
852	0.12
853	0.11
854	0.12
855	0.12
856	0.12
857	0.14
858	0.14
859	0.13
860	0.14
861	0.13
862	0.11
863	0.1
864	0.1
865	0.08
866	0.08
867	0.08
868	0.09
869	0.1
870	0.14
871	0.14
872	0.19
873	0.22
874	0.23
875	0.23
876	0.26
877	0.26
878	0.22
879	0.21
880	0.17
881	0.13
882	0.13
883	0.11
884	0.08
885	0.06
886	0.06
887	0.05
888	0.04
889	0.04
890	0.04
891	0.05
892	0.05
893	0.09
894	0.1
895	0.11
896	0.11
897	0.13
898	0.14
899	0.14
900	0.15
901	0.13
902	0.13
903	0.14
904	0.15
905	0.14
906	0.14
907	0.14
908	0.13
909	0.11
910	0.11
911	0.12
912	0.12
913	0.13
914	0.13
915	0.13
916	0.12
917	0.11
918	0.1
919	0.09
920	0.09
921	0.06
922	0.05
923	0.06
924	0.06
925	0.06
926	0.06
927	0.06
928	0.06
929	0.07
930	0.08
931	0.13
932	0.19
933	0.23
934	0.32
935	0.4
936	0.48
937	0.52
938	0.56
939	0.58
940	0.58
941	0.58
942	0.53
943	0.49
944	0.41
945	0.36
946	0.31
947	0.25
948	0.19
949	0.15
950	0.11
951	0.07
952	0.06
953	0.06
954	0.08
955	0.08
956	0.09
957	0.09
958	0.09
959	0.1
960	0.1
961	0.08
962	0.06
963	0.06
964	0.04
965	0.05
966	0.05
967	0.04
968	0.06
969	0.07
970	0.08
971	0.09
972	0.1
973	0.11
974	0.15
975	0.18
976	0.23
977	0.31
978	0.4
979	0.5
980	0.59
981	0.62
982	0.65
983	0.66
984	0.7
985	0.72
986	0.72
987	0.7
988	0.68
989	0.69
990	0.67
991	0.65
992	0.55
993	0.45
994	0.37
995	0.29
996	0.26
997	0.21
998	0.16
999	0.15
1000	0.15
1001	0.14
1002	0.13
1003	0.12
1004	0.07
1005	0.07
1006	0.11
1007	0.14
1008	0.15
1009	0.15
1010	0.14
1011	0.15
1012	0.15
1013	0.15
1014	0.12
1015	0.09
1016	0.08
1017	0.09
1018	0.09
1019	0.09
1020	0.09
1021	0.08
1022	0.08
1023	0.08
1024	0.07
1025	0.06
1026	0.05
1027	0.06
1028	0.06
1029	0.06
1030	0.06
1031	0.06
1032	0.07
1033	0.07
1034	0.07
1035	0.06
1036	0.06
1037	0.07
1038	0.06
1039	0.06
1040	0.07
1041	0.08
1042	0.08
1043	0.08
1044	0.08
1045	0.08
1046	0.08
1047	0.08
1048	0.06
1049	0.06
1050	0.06
1051	0.07
1052	0.07
1053	0.08
1054	0.07
1055	0.08
1056	0.08
1057	0.08
1058	0.13
1059	0.12
1060	0.13
1061	0.15
1062	0.15
1063	0.15
1064	0.15
1065	0.15
1066	0.12
1067	0.12
1068	0.12
1069	0.13
1070	0.18
1071	0.22
1072	0.24
1073	0.24
1074	0.25
1075	0.28
1076	0.28
1077	0.27
1078	0.24
1079	0.22
1080	0.2
1081	0.19
1082	0.16
1083	0.13
1084	0.12
1085	0.14
1086	0.1
1087	0.1
1088	0.09
1089	0.09
1090	0.09
1091	0.09
1092	0.08
1093	0.06
1094	0.1
1095	0.11
1096	0.12
1097	0.14
1098	0.15
1099	0.16
1100	0.17
1101	0.18
1102	0.16
1103	0.16
1104	0.17
1105	0.22
1106	0.27
1107	0.28
1108	0.28
1109	0.28
1110	0.27
1111	0.26
1112	0.24
1113	0.2
1114	0.15
1115	0.14
1116	0.17
1117	0.21
1118	0.22
1119	0.25
1120	0.3
1121	0.32
1122	0.35
1123	0.37
1124	0.39
1125	0.39
1126	0.39
1127	0.41
1128	0.38
1129	0.35
1130	0.32
1131	0.29
1132	0.23
1133	0.2
1134	0.18
1135	0.15
1136	0.15
1137	0.13
1138	0.14
1139	0.17
1140	0.18
1141	0.17
1142	0.17
1143	0.14
1144	0.13
1145	0.13
1146	0.13
1147	0.09
1148	0.08
1149	0.08
1150	0.09
1151	0.08
1152	0.07
1153	0.07
1154	0.08
1155	0.08
1156	0.07
1157	0.09
1158	0.11
1159	0.12
1160	0.13
1161	0.14
1162	0.15
1163	0.17
1164	0.2
1165	0.2
1166	0.23
1167	0.25
1168	0.25
1169	0.27
1170	0.27
1171	0.29
1172	0.33
1173	0.35
1174	0.32
1175	0.33
1176	0.33
1177	0.33
1178	0.33
1179	0.28
1180	0.27
1181	0.24
1182	0.22
1183	0.2
1184	0.2
1185	0.24
1186	0.29
1187	0.35
1188	0.31
1189	0.34
1190	0.39
1191	0.42
1192	0.45
1193	0.44
1194	0.45
1195	0.42
1196	0.43
1197	0.42
1198	0.37
1199	0.34
1200	0.33
1201	0.35
1202	0.33
1203	0.33
1204	0.33
1205	0.33
1206	0.34
1207	0.35
1208	0.33
1209	0.33
1210	0.37
1211	0.36
1212	0.35
1213	0.35
1214	0.35
1215	0.33
1216	0.33
1217	0.28
1218	0.22
1219	0.29
1220	0.33
1221	0.38
1222	0.46
1223	0.53
1224	0.53
1225	0.57
1226	0.64
1227	0.63
1228	0.65
1229	0.65
1230	0.63
1231	0.62
1232	0.64
1233	0.6
1234	0.57
1235	0.55
1236	0.51
1237	0.46
1238	0.45
1239	0.42
1240	0.43
1241	0.43
1242	0.38
1243	0.32
1244	0.29
1245	0.28
1246	0.23
1247	0.2
1248	0.2
1249	0.26

Q6C740

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer