Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C6D2

Protein Details
Accession Q6C6D2    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
240-261VAPESKSMRKSKKKNATMEEYLHydrophilic
307-329VRLPGANKKERSKLKKARAGAFFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
248-252RKSKK
313-324NKKERSKLKKAR
344-360KRKRGGSSMWEKSKKRR
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007146  Sas10/Utp3/C1D  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG yli:YALI0E10439g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04000  Sas10_Utp3  
Amino Acid Sequences MTKLFFSGRRKNVQTGISSQIKTTQMEALLKEITTATDNSATKLKEEQQAYNALDDDVKAQIQRDSLSLLGLKNHTMLAYLHHLAVVTLAQVQRVEKEQKDDALEKGRQAAIQGTVKNRVVLEKGIKGLESKVNYQIDKMLKAYTQDKERKAEREKQRAEKALLGEEKDDDDEGDKDDRDDDDESESEDDNLAFKPNVSNLTRDKNARPVRDSRGKKSEQDDDRESASNTIYRPPKISAVAPESKSMRKSKKKNATMEEYLKYSSSAPMVEQSIGSGILEHGRGGEKTDRDRKREEEVQRYEEDNFVRLPGANKKERSKLKKARAGAFFGEDWGVGGDIGEATKRKRGGSSMWEKSKKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.56
3 0.55
4 0.53
5 0.49
6 0.43
7 0.43
8 0.41
9 0.37
10 0.34
11 0.3
12 0.26
13 0.29
14 0.29
15 0.26
16 0.24
17 0.23
18 0.21
19 0.18
20 0.15
21 0.14
22 0.14
23 0.13
24 0.19
25 0.19
26 0.21
27 0.26
28 0.25
29 0.24
30 0.29
31 0.32
32 0.32
33 0.36
34 0.37
35 0.36
36 0.42
37 0.41
38 0.38
39 0.33
40 0.26
41 0.22
42 0.19
43 0.17
44 0.12
45 0.12
46 0.11
47 0.11
48 0.13
49 0.14
50 0.14
51 0.13
52 0.14
53 0.13
54 0.14
55 0.15
56 0.14
57 0.16
58 0.16
59 0.16
60 0.15
61 0.15
62 0.13
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.16
67 0.17
68 0.16
69 0.16
70 0.16
71 0.14
72 0.15
73 0.11
74 0.06
75 0.08
76 0.08
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.17
82 0.22
83 0.2
84 0.25
85 0.26
86 0.29
87 0.32
88 0.33
89 0.31
90 0.33
91 0.33
92 0.28
93 0.3
94 0.28
95 0.24
96 0.22
97 0.21
98 0.18
99 0.21
100 0.23
101 0.22
102 0.27
103 0.27
104 0.28
105 0.26
106 0.23
107 0.2
108 0.21
109 0.23
110 0.2
111 0.21
112 0.2
113 0.2
114 0.19
115 0.2
116 0.21
117 0.19
118 0.19
119 0.23
120 0.26
121 0.26
122 0.26
123 0.29
124 0.26
125 0.25
126 0.24
127 0.19
128 0.16
129 0.19
130 0.23
131 0.22
132 0.29
133 0.34
134 0.36
135 0.41
136 0.44
137 0.49
138 0.51
139 0.57
140 0.57
141 0.62
142 0.66
143 0.69
144 0.72
145 0.69
146 0.64
147 0.58
148 0.49
149 0.44
150 0.38
151 0.3
152 0.24
153 0.19
154 0.18
155 0.14
156 0.13
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.08
184 0.13
185 0.13
186 0.17
187 0.19
188 0.25
189 0.28
190 0.3
191 0.31
192 0.36
193 0.41
194 0.41
195 0.42
196 0.42
197 0.47
198 0.54
199 0.58
200 0.55
201 0.58
202 0.57
203 0.58
204 0.57
205 0.58
206 0.53
207 0.54
208 0.51
209 0.44
210 0.43
211 0.4
212 0.36
213 0.27
214 0.23
215 0.18
216 0.15
217 0.2
218 0.21
219 0.21
220 0.23
221 0.24
222 0.26
223 0.26
224 0.27
225 0.25
226 0.28
227 0.34
228 0.32
229 0.34
230 0.34
231 0.35
232 0.38
233 0.41
234 0.45
235 0.49
236 0.57
237 0.64
238 0.72
239 0.78
240 0.83
241 0.82
242 0.8
243 0.78
244 0.75
245 0.67
246 0.57
247 0.5
248 0.41
249 0.34
250 0.26
251 0.19
252 0.14
253 0.12
254 0.11
255 0.12
256 0.14
257 0.13
258 0.12
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.09
263 0.07
264 0.06
265 0.07
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.09
270 0.09
271 0.13
272 0.18
273 0.21
274 0.3
275 0.4
276 0.46
277 0.49
278 0.55
279 0.55
280 0.58
281 0.63
282 0.63
283 0.64
284 0.64
285 0.64
286 0.61
287 0.59
288 0.52
289 0.47
290 0.39
291 0.3
292 0.23
293 0.19
294 0.17
295 0.16
296 0.2
297 0.25
298 0.32
299 0.38
300 0.44
301 0.5
302 0.59
303 0.68
304 0.73
305 0.75
306 0.77
307 0.8
308 0.82
309 0.83
310 0.83
311 0.78
312 0.75
313 0.66
314 0.6
315 0.49
316 0.42
317 0.35
318 0.25
319 0.2
320 0.15
321 0.12
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.09
328 0.11
329 0.13
330 0.19
331 0.22
332 0.23
333 0.26
334 0.3
335 0.35
336 0.43
337 0.52
338 0.57
339 0.65
340 0.72