FuNGI

A0A072P823

Protein Details

Accession

A0A072P823

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
12-33	RTRAAKPRAGIQRKTREEREQF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-28	KAPAARTRAAKPRAGIQRKTRE
56-67	GGARGGRGGRAG
216-242	KRKQKAVQRPPRSANSLRPVRAPRAPR
307-312	RRNLKK

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPEEPPKAPAARTRAAKPRAGIQRKTREEREQFARQEAERQQARNAEASKNTSTRGGARGGRGGRAGRAGAVGVGGVGDSRASNTPGLGGGVFGAGGGGLRSSMRSRTVPEGYSEMIVGSQSSKRADAALLNTLEGEEAKLSAGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGSSSGNSRLTAATRQAEGVDIATDDEPDETERDIERIWISTDEDEDAIVAGKRKQKAVQRPPRSANSLRPVRAPRAPREEEESTSAGRRRLNTRGPAVVKKSESDNMIHEVEDEDEHAMDVDEQPSALGKEPHNRLSSPEMRRRNLKKSSSARSRDGARGATETIEERAERLRIAEDTHKLRDIFLSHGNSPSHHHVSHPAIANGDEMHDGNDVGTEQDEEETTLKKGKLFLFQLPPLTPFLYDPATDPPAEPDVKQEPGMGGETISKLPTATTATSSSHGKYSDTGAPGNKPGIKKEGDADPAASVSASASASASRHPLQLDGLLTASEPTRLPAGLVGKLRVHASGKVSLDWGGTDMEVRYGTEVDFLQDAVLIQTKKQKGDQQGNRDGEAAAAAVEKAEDDEHLDLRTSGKTYALGQVRRKMVLIPDWARLYD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.61
3	0.63
4	0.58
5	0.6
6	0.63
7	0.67
8	0.67
9	0.68
10	0.73
11	0.78
12	0.84
13	0.82
14	0.81
15	0.79
16	0.79
17	0.77
18	0.75
19	0.69
20	0.66
21	0.64
22	0.54
23	0.56
24	0.53
25	0.54
26	0.5
27	0.49
28	0.48
29	0.48
30	0.49
31	0.48
32	0.46
33	0.42
34	0.41
35	0.44
36	0.45
37	0.42
38	0.41
39	0.36
40	0.35
41	0.34
42	0.32
43	0.33
44	0.31
45	0.33
46	0.39
47	0.38
48	0.38
49	0.38
50	0.36
51	0.32
52	0.31
53	0.28
54	0.21
55	0.2
56	0.18
57	0.14
58	0.12
59	0.09
60	0.06
61	0.05
62	0.04
63	0.03
64	0.03
65	0.03
66	0.03
67	0.06
68	0.08
69	0.1
70	0.1
71	0.1
72	0.11
73	0.11
74	0.12
75	0.1
76	0.08
77	0.07
78	0.06
79	0.06
80	0.05
81	0.04
82	0.03
83	0.03
84	0.03
85	0.03
86	0.03
87	0.04
88	0.06
89	0.08
90	0.11
91	0.15
92	0.17
93	0.21
94	0.28
95	0.32
96	0.31
97	0.32
98	0.32
99	0.3
100	0.28
101	0.24
102	0.17
103	0.13
104	0.12
105	0.1
106	0.09
107	0.1
108	0.12
109	0.13
110	0.14
111	0.14
112	0.15
113	0.16
114	0.17
115	0.18
116	0.21
117	0.2
118	0.19
119	0.19
120	0.18
121	0.17
122	0.14
123	0.11
124	0.05
125	0.05
126	0.05
127	0.05
128	0.05
129	0.05
130	0.05
131	0.04
132	0.04
133	0.03
134	0.03
135	0.03
136	0.03
137	0.02
138	0.02
139	0.02
140	0.02
141	0.01
142	0.01
143	0.01
144	0.01
145	0.01
146	0.01
147	0.01
148	0.01
149	0.01
150	0.01
151	0.02
152	0.02
153	0.02
154	0.03
155	0.05
156	0.06
157	0.07
158	0.08
159	0.09
160	0.11
161	0.14
162	0.18
163	0.18
164	0.18
165	0.19
166	0.18
167	0.17
168	0.15
169	0.13
170	0.09
171	0.07
172	0.07
173	0.07
174	0.07
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.07
179	0.08
180	0.07
181	0.08
182	0.08
183	0.09
184	0.09
185	0.1
186	0.1
187	0.1
188	0.11
189	0.1
190	0.11
191	0.11
192	0.12
193	0.11
194	0.1
195	0.09
196	0.08
197	0.07
198	0.06
199	0.07
200	0.08
201	0.11
202	0.16
203	0.18
204	0.2
205	0.25
206	0.33
207	0.43
208	0.53
209	0.6
210	0.64
211	0.7
212	0.74
213	0.73
214	0.72
215	0.65
216	0.61
217	0.6
218	0.58
219	0.51
220	0.52
221	0.5
222	0.48
223	0.5
224	0.48
225	0.45
226	0.47
227	0.49
228	0.44
229	0.48
230	0.46
231	0.42
232	0.4
233	0.34
234	0.26
235	0.27
236	0.27
237	0.23
238	0.23
239	0.24
240	0.25
241	0.3
242	0.36
243	0.38
244	0.39
245	0.43
246	0.44
247	0.46
248	0.45
249	0.43
250	0.37
251	0.32
252	0.32
253	0.28
254	0.25
255	0.22
256	0.2
257	0.19
258	0.19
259	0.18
260	0.15
261	0.13
262	0.12
263	0.11
264	0.09
265	0.06
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.04
270	0.04
271	0.05
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.06
279	0.08
280	0.09
281	0.17
282	0.2
283	0.25
284	0.26
285	0.26
286	0.27
287	0.32
288	0.39
289	0.39
290	0.45
291	0.46
292	0.47
293	0.56
294	0.59
295	0.61
296	0.61
297	0.58
298	0.59
299	0.6
300	0.68
301	0.69
302	0.68
303	0.63
304	0.57
305	0.57
306	0.5
307	0.45
308	0.37
309	0.28
310	0.24
311	0.21
312	0.18
313	0.15
314	0.12
315	0.11
316	0.1
317	0.09
318	0.08
319	0.09
320	0.09
321	0.09
322	0.09
323	0.09
324	0.09
325	0.12
326	0.15
327	0.19
328	0.22
329	0.24
330	0.26
331	0.25
332	0.24
333	0.23
334	0.2
335	0.19
336	0.2
337	0.22
338	0.2
339	0.24
340	0.24
341	0.23
342	0.26
343	0.29
344	0.27
345	0.23
346	0.23
347	0.25
348	0.28
349	0.32
350	0.3
351	0.25
352	0.22
353	0.22
354	0.22
355	0.16
356	0.14
357	0.09
358	0.07
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.04
369	0.05
370	0.05
371	0.06
372	0.07
373	0.08
374	0.09
375	0.13
376	0.13
377	0.14
378	0.18
379	0.2
380	0.26
381	0.28
382	0.33
383	0.35
384	0.36
385	0.38
386	0.35
387	0.33
388	0.28
389	0.26
390	0.2
391	0.14
392	0.15
393	0.13
394	0.13
395	0.13
396	0.16
397	0.17
398	0.17
399	0.16
400	0.16
401	0.19
402	0.19
403	0.18
404	0.18
405	0.2
406	0.22
407	0.22
408	0.2
409	0.17
410	0.17
411	0.19
412	0.13
413	0.1
414	0.1
415	0.11
416	0.11
417	0.11
418	0.09
419	0.08
420	0.08
421	0.09
422	0.11
423	0.1
424	0.12
425	0.14
426	0.16
427	0.18
428	0.21
429	0.2
430	0.2
431	0.2
432	0.18
433	0.17
434	0.2
435	0.23
436	0.23
437	0.24
438	0.24
439	0.25
440	0.26
441	0.3
442	0.29
443	0.25
444	0.26
445	0.29
446	0.29
447	0.28
448	0.3
449	0.32
450	0.32
451	0.31
452	0.29
453	0.24
454	0.22
455	0.21
456	0.17
457	0.1
458	0.07
459	0.07
460	0.06
461	0.06
462	0.06
463	0.07
464	0.08
465	0.09
466	0.14
467	0.13
468	0.15
469	0.16
470	0.16
471	0.17
472	0.19
473	0.19
474	0.15
475	0.14
476	0.12
477	0.12
478	0.11
479	0.1
480	0.09
481	0.08
482	0.08
483	0.09
484	0.09
485	0.1
486	0.13
487	0.16
488	0.19
489	0.21
490	0.23
491	0.23
492	0.25
493	0.25
494	0.24
495	0.23
496	0.22
497	0.23
498	0.27
499	0.27
500	0.26
501	0.26
502	0.25
503	0.23
504	0.19
505	0.17
506	0.11
507	0.09
508	0.1
509	0.09
510	0.1
511	0.1
512	0.1
513	0.1
514	0.1
515	0.1
516	0.11
517	0.11
518	0.11
519	0.11
520	0.11
521	0.09
522	0.09
523	0.09
524	0.08
525	0.13
526	0.12
527	0.14
528	0.23
529	0.27
530	0.3
531	0.36
532	0.42
533	0.47
534	0.58
535	0.65
536	0.66
537	0.72
538	0.72
539	0.68
540	0.61
541	0.51
542	0.4
543	0.31
544	0.21
545	0.11
546	0.08
547	0.07
548	0.06
549	0.06
550	0.05
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.09
555	0.11
556	0.13
557	0.14
558	0.15
559	0.14
560	0.16
561	0.18
562	0.17
563	0.15
564	0.16
565	0.17
566	0.18
567	0.26
568	0.32
569	0.37
570	0.43
571	0.5
572	0.53
573	0.52
574	0.51
575	0.46
576	0.43
577	0.43
578	0.45
579	0.41
580	0.44

A0A072P823

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer