Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A072P512

Protein Details
Accession A0A072P512    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-38ATPVIKRKKAQSDPFFKGPRKHydrophilic
140-159SEFPKPARLHRRDPRAPPPGBasic
536-560SGTDASVRKKKHKSKHLSSTQPTPGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-28IKRKKAQ
34-38KGPRK
419-439KREAEAKKKNFRELRKALERR
543-550RKKKHKSK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF05793  TFIIF_alpha  
Amino Acid Sequences MNPGPVPPGGPANRPPGATPVIKRKKAQSDPFFKGPRKPVPLGRPQQNGHLTPPVNGHLPPKSQALRPLTPSNVPDPSPSRSAVAENERVSGFSDPRLTAEGIPFKDYKLVTTKRDLLNNLRFHLLQLAGDKALDIRNESEFPKPARLHRRDPRAPPPGPQQKDEPELEPKDGLNATEREELTRRKEVRQKEREANLAQIAPSQNAGKKMYNFKRKTQQVFRAEFSTAEKRRIQTNYEEKLPWHLEDFDNKHCLVGHHQIGSMNTHAALIYEPTPDGSTGKFRMVPVEKYYQFKPRRELGLQMTIEEVEAAMKKRGSDPEWLVRQREARVAEAARELTAKQSRGLFSGAQAGGIAGRGGEEADLDFEDDFADDEEGALFVDKDEDEKLAEKKIKEDQLTANFLDFKDLKEYDEAEEREKREAEAKKKNFRELRKALERRERNYNHGSDSEDVSSTDSEEERERLERERVANIKREEEAAKAAAGISSSGTNTPSNRKEKLSAAGGLSDRETAGGIKKSSSSRSLKRPGSPNLSDASGTDASVRKKKHKSKHLSSTQPTPGPSRPMSPANVPPPGSAPQNLDPSSAAINKVRRRVAGSNAGSDTDNVLSDRDGGAMSDASRAHQRLKLKMSASPPPRAGGTSTPQPSSRAGTPPPPLSPQELPSEEEIRSAIPSEGITIKELMKLVAHPRNQRKAFVARVRSVAKIDKEKGLLYPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.41
3 0.38
4 0.4
5 0.41
6 0.42
7 0.46
8 0.53
9 0.58
10 0.61
11 0.65
12 0.71
13 0.75
14 0.79
15 0.78
16 0.78
17 0.79
18 0.85
19 0.83
20 0.77
21 0.76
22 0.74
23 0.73
24 0.71
25 0.7
26 0.69
27 0.71
28 0.77
29 0.78
30 0.78
31 0.77
32 0.7
33 0.73
34 0.72
35 0.65
36 0.58
37 0.57
38 0.48
39 0.42
40 0.44
41 0.38
42 0.33
43 0.32
44 0.32
45 0.29
46 0.32
47 0.32
48 0.36
49 0.37
50 0.38
51 0.45
52 0.48
53 0.48
54 0.5
55 0.54
56 0.5
57 0.51
58 0.5
59 0.47
60 0.43
61 0.39
62 0.39
63 0.37
64 0.37
65 0.36
66 0.35
67 0.31
68 0.28
69 0.3
70 0.31
71 0.34
72 0.36
73 0.34
74 0.35
75 0.33
76 0.32
77 0.32
78 0.28
79 0.22
80 0.19
81 0.22
82 0.2
83 0.22
84 0.24
85 0.24
86 0.22
87 0.27
88 0.3
89 0.27
90 0.31
91 0.29
92 0.27
93 0.31
94 0.29
95 0.26
96 0.29
97 0.33
98 0.34
99 0.41
100 0.48
101 0.48
102 0.53
103 0.54
104 0.54
105 0.57
106 0.58
107 0.53
108 0.48
109 0.43
110 0.38
111 0.38
112 0.29
113 0.21
114 0.18
115 0.18
116 0.16
117 0.15
118 0.15
119 0.12
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.13
124 0.15
125 0.18
126 0.19
127 0.23
128 0.25
129 0.27
130 0.34
131 0.35
132 0.41
133 0.5
134 0.55
135 0.61
136 0.65
137 0.74
138 0.74
139 0.79
140 0.8
141 0.79
142 0.74
143 0.69
144 0.71
145 0.71
146 0.66
147 0.6
148 0.56
149 0.52
150 0.56
151 0.52
152 0.45
153 0.43
154 0.42
155 0.41
156 0.35
157 0.3
158 0.27
159 0.25
160 0.22
161 0.18
162 0.17
163 0.19
164 0.24
165 0.24
166 0.24
167 0.28
168 0.32
169 0.33
170 0.41
171 0.4
172 0.42
173 0.49
174 0.57
175 0.63
176 0.69
177 0.71
178 0.71
179 0.73
180 0.72
181 0.67
182 0.6
183 0.51
184 0.43
185 0.34
186 0.29
187 0.25
188 0.18
189 0.18
190 0.17
191 0.16
192 0.19
193 0.22
194 0.22
195 0.26
196 0.36
197 0.45
198 0.53
199 0.55
200 0.59
201 0.66
202 0.71
203 0.75
204 0.74
205 0.75
206 0.74
207 0.74
208 0.69
209 0.61
210 0.53
211 0.45
212 0.4
213 0.4
214 0.33
215 0.33
216 0.34
217 0.33
218 0.38
219 0.4
220 0.38
221 0.38
222 0.46
223 0.45
224 0.46
225 0.46
226 0.4
227 0.43
228 0.42
229 0.33
230 0.25
231 0.23
232 0.2
233 0.27
234 0.31
235 0.28
236 0.29
237 0.28
238 0.26
239 0.25
240 0.24
241 0.22
242 0.25
243 0.24
244 0.22
245 0.23
246 0.24
247 0.24
248 0.25
249 0.2
250 0.13
251 0.11
252 0.1
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.11
266 0.12
267 0.14
268 0.15
269 0.15
270 0.22
271 0.24
272 0.26
273 0.27
274 0.33
275 0.33
276 0.35
277 0.37
278 0.4
279 0.44
280 0.45
281 0.46
282 0.44
283 0.47
284 0.45
285 0.48
286 0.43
287 0.44
288 0.41
289 0.35
290 0.3
291 0.24
292 0.23
293 0.17
294 0.12
295 0.05
296 0.06
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.12
302 0.16
303 0.17
304 0.21
305 0.24
306 0.31
307 0.38
308 0.39
309 0.38
310 0.37
311 0.38
312 0.33
313 0.34
314 0.27
315 0.21
316 0.22
317 0.21
318 0.2
319 0.19
320 0.17
321 0.13
322 0.12
323 0.11
324 0.12
325 0.15
326 0.15
327 0.15
328 0.17
329 0.17
330 0.18
331 0.2
332 0.15
333 0.13
334 0.18
335 0.16
336 0.13
337 0.12
338 0.11
339 0.09
340 0.09
341 0.08
342 0.02
343 0.02
344 0.02
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.03
360 0.04
361 0.04
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.04
368 0.03
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.08
374 0.09
375 0.13
376 0.17
377 0.16
378 0.19
379 0.25
380 0.29
381 0.28
382 0.3
383 0.31
384 0.33
385 0.36
386 0.33
387 0.27
388 0.23
389 0.22
390 0.23
391 0.18
392 0.13
393 0.15
394 0.15
395 0.15
396 0.15
397 0.17
398 0.15
399 0.21
400 0.21
401 0.2
402 0.24
403 0.24
404 0.26
405 0.25
406 0.24
407 0.25
408 0.31
409 0.36
410 0.43
411 0.5
412 0.57
413 0.6
414 0.68
415 0.67
416 0.67
417 0.69
418 0.64
419 0.65
420 0.66
421 0.69
422 0.68
423 0.71
424 0.71
425 0.64
426 0.69
427 0.63
428 0.58
429 0.59
430 0.54
431 0.46
432 0.41
433 0.4
434 0.31
435 0.3
436 0.24
437 0.18
438 0.16
439 0.14
440 0.13
441 0.11
442 0.1
443 0.08
444 0.09
445 0.1
446 0.1
447 0.11
448 0.13
449 0.14
450 0.16
451 0.2
452 0.22
453 0.23
454 0.29
455 0.34
456 0.35
457 0.41
458 0.4
459 0.39
460 0.36
461 0.37
462 0.31
463 0.26
464 0.25
465 0.17
466 0.15
467 0.13
468 0.12
469 0.1
470 0.09
471 0.07
472 0.06
473 0.05
474 0.06
475 0.07
476 0.08
477 0.1
478 0.12
479 0.19
480 0.26
481 0.32
482 0.34
483 0.36
484 0.38
485 0.4
486 0.43
487 0.39
488 0.35
489 0.3
490 0.3
491 0.28
492 0.25
493 0.23
494 0.17
495 0.13
496 0.11
497 0.1
498 0.07
499 0.11
500 0.14
501 0.14
502 0.14
503 0.18
504 0.21
505 0.24
506 0.31
507 0.34
508 0.38
509 0.47
510 0.56
511 0.58
512 0.63
513 0.67
514 0.67
515 0.68
516 0.63
517 0.56
518 0.49
519 0.44
520 0.37
521 0.29
522 0.27
523 0.18
524 0.16
525 0.17
526 0.19
527 0.22
528 0.28
529 0.32
530 0.36
531 0.46
532 0.55
533 0.63
534 0.7
535 0.76
536 0.81
537 0.88
538 0.89
539 0.88
540 0.84
541 0.82
542 0.78
543 0.71
544 0.62
545 0.56
546 0.5
547 0.46
548 0.43
549 0.37
550 0.35
551 0.35
552 0.37
553 0.37
554 0.41
555 0.4
556 0.44
557 0.41
558 0.37
559 0.36
560 0.36
561 0.34
562 0.28
563 0.28
564 0.28
565 0.34
566 0.34
567 0.32
568 0.29
569 0.28
570 0.3
571 0.26
572 0.23
573 0.21
574 0.29
575 0.33
576 0.4
577 0.41
578 0.4
579 0.45
580 0.47
581 0.49
582 0.51
583 0.48
584 0.46
585 0.44
586 0.44
587 0.38
588 0.34
589 0.28
590 0.18
591 0.16
592 0.12
593 0.11
594 0.1
595 0.11
596 0.11
597 0.09
598 0.09
599 0.08
600 0.09
601 0.09
602 0.09
603 0.11
604 0.11
605 0.13
606 0.18
607 0.2
608 0.23
609 0.26
610 0.31
611 0.36
612 0.42
613 0.47
614 0.43
615 0.47
616 0.49
617 0.54
618 0.54
619 0.53
620 0.49
621 0.44
622 0.44
623 0.39
624 0.37
625 0.33
626 0.33
627 0.35
628 0.37
629 0.38
630 0.38
631 0.39
632 0.39
633 0.38
634 0.37
635 0.33
636 0.34
637 0.38
638 0.44
639 0.46
640 0.47
641 0.47
642 0.45
643 0.45
644 0.45
645 0.4
646 0.42
647 0.39
648 0.38
649 0.38
650 0.38
651 0.32
652 0.29
653 0.26
654 0.19
655 0.18
656 0.17
657 0.13
658 0.11
659 0.11
660 0.13
661 0.15
662 0.16
663 0.16
664 0.17
665 0.17
666 0.19
667 0.19
668 0.17
669 0.16
670 0.19
671 0.26
672 0.32
673 0.39
674 0.46
675 0.56
676 0.66
677 0.67
678 0.67
679 0.65
680 0.65
681 0.69
682 0.68
683 0.67
684 0.61
685 0.65
686 0.64
687 0.6
688 0.56
689 0.54
690 0.52
691 0.53
692 0.52
693 0.51
694 0.51
695 0.49