FuNGI

A0A072PSA4

Protein Details

Accession

A0A072PSA4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
225-246	GSTVEATGRKRKKRWDVSSEAT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
233-238	RKRKKR

Subcellular Location(s)

plas 16, nucl 4, cyto 4, cyto_nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDGKSALESTADLPLTPSADFDTVRRLQAERNSQSAGKKGSKTFDPSSQRADSSTKASFTESFDTQLYDRNGSDKFAGYHTSLPTDDDDEEMPDAGDSRRLIGQYTATKDQMNEFSRGNGVEEEDILLGREKSARIADRETDYQKRRFDRGPLTPTRADPFAANKHAGVSEGSTYREVMQLQDLEREEERVNKLIAEKQTDSDAVEEHKPSLKEEANKENADAGSTVEATGRKRKKRWDVSSEATPASGGAEEKKRSRWDQAPGPEEGSASTKRSRWDQAPALGSATPAGSAGLATPMHPTQSGFGTDITGRSTVWSDEDLDLMLPTEGYTVLEPPPGYARVRIATRKNVATPAAVSSSTGIGGFMMQEPENPRMMGKQLPTDIPGVGDLQFFKTEDMAYFGKLVDGADENAMSVEELKERKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARQFGAGPLFNQILPLLMEKTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLIRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLSKAAGLAHMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAVLPHLKGLVDCIADNLSDEQAKVRTVTSLAIAALAEAANPYGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYANYYTSQIMEILLREFASPDEEMKKVVLKVISQCASTDGVTAGYLKEHVLHEFFKSFWVRRMALDKRNYRQVVETTVDLGQKVGVSEIVERIVNNLKDESEAYRKMTVETIEKVIASLGAADIGERLEERLVDGILHAFQEQSIEDIVMLNGFGTVVNALGTRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATVRQQAADLISRIAMVMKQCGEDALMGKLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGALRSIVTVVGINQMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHVALGVVGLGCEDAMVHLLNLLYPNLFETSPHVIDRIIEAIEAIRMAVGTGIVMNYVWAGLFHPARKVRTPYWRLYNDAYVHSADSMVPYYPNMKDEGLPRDELFIVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.17
3	0.17
4	0.16
5	0.15
6	0.13
7	0.15
8	0.16
9	0.15
10	0.23
11	0.24
12	0.27
13	0.28
14	0.27
15	0.31
16	0.39
17	0.49
18	0.45
19	0.46
20	0.48
21	0.49
22	0.52
23	0.52
24	0.51
25	0.48
26	0.5
27	0.5
28	0.52
29	0.55
30	0.58
31	0.57
32	0.59
33	0.6
34	0.58
35	0.6
36	0.58
37	0.52
38	0.48
39	0.47
40	0.4
41	0.38
42	0.37
43	0.32
44	0.29
45	0.31
46	0.3
47	0.31
48	0.33
49	0.28
50	0.27
51	0.26
52	0.28
53	0.25
54	0.3
55	0.28
56	0.26
57	0.25
58	0.26
59	0.26
60	0.26
61	0.28
62	0.23
63	0.22
64	0.21
65	0.24
66	0.23
67	0.27
68	0.26
69	0.28
70	0.25
71	0.25
72	0.25
73	0.24
74	0.22
75	0.2
76	0.18
77	0.17
78	0.17
79	0.16
80	0.14
81	0.1
82	0.12
83	0.1
84	0.14
85	0.12
86	0.14
87	0.16
88	0.16
89	0.18
90	0.18
91	0.25
92	0.27
93	0.34
94	0.36
95	0.35
96	0.36
97	0.35
98	0.38
99	0.4
100	0.37
101	0.33
102	0.3
103	0.3
104	0.31
105	0.3
106	0.27
107	0.2
108	0.18
109	0.16
110	0.16
111	0.15
112	0.13
113	0.12
114	0.11
115	0.12
116	0.1
117	0.1
118	0.13
119	0.12
120	0.15
121	0.21
122	0.25
123	0.27
124	0.32
125	0.35
126	0.38
127	0.45
128	0.48
129	0.51
130	0.54
131	0.57
132	0.6
133	0.6
134	0.61
135	0.59
136	0.61
137	0.61
138	0.64
139	0.67
140	0.67
141	0.69
142	0.66
143	0.64
144	0.59
145	0.5
146	0.42
147	0.35
148	0.34
149	0.34
150	0.36
151	0.34
152	0.3
153	0.31
154	0.3
155	0.28
156	0.22
157	0.17
158	0.16
159	0.16
160	0.18
161	0.17
162	0.18
163	0.17
164	0.19
165	0.17
166	0.15
167	0.18
168	0.19
169	0.19
170	0.24
171	0.24
172	0.25
173	0.25
174	0.26
175	0.23
176	0.26
177	0.28
178	0.26
179	0.25
180	0.23
181	0.26
182	0.29
183	0.32
184	0.33
185	0.31
186	0.29
187	0.32
188	0.31
189	0.28
190	0.23
191	0.2
192	0.17
193	0.19
194	0.19
195	0.18
196	0.22
197	0.22
198	0.23
199	0.28
200	0.3
201	0.34
202	0.39
203	0.47
204	0.48
205	0.48
206	0.47
207	0.44
208	0.39
209	0.33
210	0.27
211	0.19
212	0.13
213	0.13
214	0.12
215	0.11
216	0.13
217	0.15
218	0.25
219	0.33
220	0.4
221	0.46
222	0.56
223	0.65
224	0.74
225	0.81
226	0.8
227	0.8
228	0.78
229	0.8
230	0.74
231	0.63
232	0.51
233	0.41
234	0.31
235	0.24
236	0.18
237	0.1
238	0.12
239	0.18
240	0.22
241	0.25
242	0.31
243	0.37
244	0.39
245	0.47
246	0.48
247	0.5
248	0.56
249	0.61
250	0.59
251	0.55
252	0.53
253	0.45
254	0.38
255	0.31
256	0.26
257	0.19
258	0.19
259	0.21
260	0.21
261	0.24
262	0.29
263	0.34
264	0.34
265	0.4
266	0.43
267	0.46
268	0.46
269	0.44
270	0.41
271	0.35
272	0.31
273	0.23
274	0.17
275	0.1
276	0.07
277	0.06
278	0.05
279	0.04
280	0.04
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.1
285	0.1
286	0.11
287	0.11
288	0.12
289	0.11
290	0.13
291	0.14
292	0.12
293	0.12
294	0.13
295	0.14
296	0.14
297	0.14
298	0.12
299	0.1
300	0.1
301	0.11
302	0.1
303	0.11
304	0.11
305	0.12
306	0.12
307	0.13
308	0.12
309	0.11
310	0.1
311	0.09
312	0.08
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.06
320	0.07
321	0.09
322	0.09
323	0.1
324	0.13
325	0.14
326	0.15
327	0.15
328	0.17
329	0.19
330	0.25
331	0.31
332	0.34
333	0.39
334	0.43
335	0.45
336	0.44
337	0.43
338	0.39
339	0.33
340	0.29
341	0.23
342	0.2
343	0.17
344	0.15
345	0.13
346	0.12
347	0.11
348	0.1
349	0.07
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.07
356	0.09
357	0.12
358	0.15
359	0.16
360	0.15
361	0.15
362	0.14
363	0.16
364	0.18
365	0.17
366	0.19
367	0.2
368	0.21
369	0.23
370	0.22
371	0.2
372	0.17
373	0.15
374	0.12
375	0.1
376	0.1
377	0.09
378	0.09
379	0.1
380	0.1
381	0.1
382	0.09
383	0.09
384	0.08
385	0.12
386	0.11
387	0.11
388	0.11
389	0.11
390	0.1
391	0.1
392	0.1
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.07
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.07
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.08
405	0.09
406	0.1
407	0.14
408	0.15
409	0.17
410	0.2
411	0.24
412	0.25
413	0.34
414	0.41
415	0.43
416	0.48
417	0.49
418	0.47
419	0.48
420	0.48
421	0.45
422	0.44
423	0.42
424	0.42
425	0.44
426	0.44
427	0.42
428	0.47
429	0.5
430	0.45
431	0.43
432	0.41
433	0.45
434	0.52
435	0.51
436	0.41
437	0.33
438	0.31
439	0.3
440	0.29
441	0.23
442	0.15
443	0.12
444	0.13
445	0.14
446	0.13
447	0.13
448	0.1
449	0.08
450	0.08
451	0.09
452	0.07
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.1
457	0.12
458	0.13
459	0.12
460	0.13
461	0.16
462	0.17
463	0.18
464	0.16
465	0.15
466	0.14
467	0.18
468	0.19
469	0.17
470	0.18
471	0.17
472	0.18
473	0.17
474	0.17
475	0.13
476	0.13
477	0.14
478	0.14
479	0.15
480	0.17
481	0.16
482	0.16
483	0.18
484	0.18
485	0.16
486	0.14
487	0.13
488	0.13
489	0.14
490	0.13
491	0.12
492	0.09
493	0.09
494	0.09
495	0.08
496	0.06
497	0.04
498	0.03
499	0.04
500	0.05
501	0.05
502	0.06
503	0.06
504	0.06
505	0.07
506	0.09
507	0.1
508	0.12
509	0.12
510	0.13
511	0.14
512	0.14
513	0.14
514	0.12
515	0.1
516	0.07
517	0.07
518	0.06
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.05
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.05
529	0.06
530	0.08
531	0.1
532	0.11
533	0.1
534	0.13
535	0.13
536	0.15
537	0.15
538	0.14
539	0.11
540	0.11
541	0.11
542	0.11
543	0.1
544	0.1
545	0.09
546	0.08
547	0.09
548	0.08
549	0.07
550	0.06
551	0.05
552	0.04
553	0.04
554	0.03
555	0.03
556	0.03
557	0.03
558	0.02
559	0.03
560	0.03
561	0.04
562	0.06
563	0.07
564	0.11
565	0.16
566	0.2
567	0.22
568	0.27
569	0.37
570	0.45
571	0.52
572	0.55
573	0.57
574	0.6
575	0.65
576	0.62
577	0.57
578	0.49
579	0.45
580	0.44
581	0.37
582	0.33
583	0.25
584	0.23
585	0.19
586	0.17
587	0.13
588	0.08
589	0.06
590	0.04
591	0.04
592	0.04
593	0.05
594	0.04
595	0.04
596	0.05
597	0.05
598	0.05
599	0.06
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.07
604	0.07
605	0.07
606	0.07
607	0.07
608	0.06
609	0.06
610	0.06
611	0.06
612	0.07
613	0.07
614	0.07
615	0.07
616	0.07
617	0.07
618	0.08
619	0.07
620	0.07
621	0.07
622	0.06
623	0.06
624	0.05
625	0.05
626	0.04
627	0.04
628	0.03
629	0.03
630	0.03
631	0.03
632	0.03
633	0.03
634	0.03
635	0.04
636	0.04
637	0.05
638	0.05
639	0.06
640	0.06
641	0.06
642	0.06
643	0.06
644	0.05
645	0.05
646	0.06
647	0.08
648	0.13
649	0.22
650	0.24
651	0.25
652	0.31
653	0.34
654	0.36
655	0.36
656	0.37
657	0.32
658	0.31
659	0.3
660	0.24
661	0.2
662	0.18
663	0.15
664	0.08
665	0.05
666	0.04
667	0.03
668	0.04
669	0.03
670	0.04
671	0.05
672	0.05
673	0.04
674	0.07
675	0.08
676	0.08
677	0.08
678	0.08
679	0.08
680	0.08
681	0.08
682	0.06
683	0.06
684	0.06
685	0.06
686	0.06
687	0.06
688	0.06
689	0.06
690	0.06
691	0.06
692	0.07
693	0.07
694	0.08
695	0.11
696	0.11
697	0.11
698	0.11
699	0.13
700	0.11
701	0.14
702	0.13
703	0.12
704	0.15
705	0.2
706	0.21
707	0.19
708	0.19
709	0.18
710	0.19
711	0.17
712	0.14
713	0.09
714	0.08
715	0.08
716	0.08
717	0.06
718	0.05
719	0.06
720	0.05
721	0.07
722	0.07
723	0.08
724	0.1
725	0.11
726	0.12
727	0.12
728	0.12
729	0.14
730	0.17
731	0.17
732	0.2
733	0.24
734	0.24
735	0.25
736	0.33
737	0.36
738	0.41
739	0.48
740	0.51
741	0.5
742	0.58
743	0.57
744	0.5
745	0.47
746	0.41
747	0.36
748	0.31
749	0.27
750	0.2
751	0.21
752	0.2
753	0.17
754	0.15
755	0.1
756	0.09
757	0.08
758	0.07
759	0.05
760	0.05
761	0.06
762	0.07
763	0.08
764	0.08
765	0.07
766	0.09
767	0.15
768	0.15
769	0.15
770	0.15
771	0.14
772	0.15
773	0.16
774	0.18
775	0.18
776	0.19
777	0.2
778	0.22
779	0.22
780	0.22
781	0.23
782	0.21
783	0.19
784	0.19
785	0.19
786	0.17
787	0.17
788	0.16
789	0.14
790	0.12
791	0.08
792	0.06
793	0.04
794	0.04
795	0.03
796	0.03
797	0.04
798	0.04
799	0.04
800	0.04
801	0.04
802	0.04
803	0.04
804	0.05
805	0.06
806	0.06
807	0.06
808	0.06
809	0.06
810	0.06
811	0.07
812	0.06
813	0.05
814	0.05
815	0.06
816	0.06
817	0.06
818	0.06
819	0.05
820	0.05
821	0.06
822	0.06
823	0.05
824	0.05
825	0.04
826	0.03
827	0.03
828	0.03
829	0.03
830	0.03
831	0.03
832	0.04
833	0.04
834	0.04
835	0.08
836	0.09
837	0.12
838	0.12
839	0.13
840	0.14
841	0.2
842	0.3
843	0.29
844	0.31
845	0.3
846	0.33
847	0.33
848	0.32
849	0.29
850	0.22
851	0.22
852	0.21
853	0.22
854	0.25
855	0.26
856	0.27
857	0.3
858	0.32
859	0.37
860	0.41
861	0.39
862	0.33
863	0.33
864	0.33
865	0.29
866	0.26
867	0.2
868	0.15
869	0.12
870	0.12
871	0.1
872	0.1
873	0.09
874	0.08
875	0.1
876	0.1
877	0.11
878	0.11
879	0.11
880	0.11
881	0.1
882	0.11
883	0.09
884	0.09
885	0.08
886	0.08
887	0.09
888	0.08
889	0.07
890	0.06
891	0.05
892	0.04
893	0.05
894	0.06
895	0.06
896	0.06
897	0.06
898	0.06
899	0.06
900	0.06
901	0.05
902	0.05
903	0.04
904	0.04
905	0.04
906	0.04
907	0.05
908	0.04
909	0.04
910	0.04
911	0.04
912	0.04
913	0.04
914	0.04
915	0.04
916	0.04
917	0.05
918	0.08
919	0.08
920	0.09
921	0.1
922	0.13
923	0.14
924	0.14
925	0.16
926	0.16
927	0.16
928	0.19
929	0.2
930	0.24
931	0.26
932	0.27
933	0.28
934	0.29
935	0.34
936	0.37
937	0.46
938	0.45
939	0.51
940	0.53
941	0.59
942	0.62
943	0.64
944	0.61
945	0.61
946	0.57
947	0.53
948	0.5
949	0.42
950	0.35
951	0.28
952	0.23
953	0.14
954	0.11
955	0.08
956	0.08
957	0.08
958	0.09
959	0.1
960	0.11
961	0.14
962	0.18
963	0.2
964	0.22
965	0.23
966	0.23
967	0.26
968	0.25
969	0.24
970	0.24
971	0.22
972	0.21
973	0.19
974	0.18
975	0.19
976	0.19
977	0.19
978	0.15
979	0.18
980	0.22
981	0.22
982	0.24
983	0.22
984	0.27
985	0.33
986	0.43
987	0.5
988	0.51
989	0.59
990	0.65
991	0.72
992	0.67
993	0.6
994	0.51
995	0.41
996	0.36
997	0.28
998	0.2
999	0.11
1000	0.13
1001	0.13
1002	0.12
1003	0.11
1004	0.11
1005	0.11
1006	0.1
1007	0.1
1008	0.07
1009	0.07
1010	0.08
1011	0.1
1012	0.12
1013	0.12
1014	0.13
1015	0.14
1016	0.16
1017	0.19
1018	0.26
1019	0.31
1020	0.35
1021	0.38
1022	0.42
1023	0.42
1024	0.41
1025	0.38
1026	0.29
1027	0.25
1028	0.19
1029	0.15
1030	0.11
1031	0.09
1032	0.08
1033	0.07
1034	0.06
1035	0.04
1036	0.04
1037	0.04
1038	0.05
1039	0.05
1040	0.06
1041	0.09
1042	0.1
1043	0.1
1044	0.11
1045	0.16
1046	0.16
1047	0.18
1048	0.18
1049	0.17
1050	0.18
1051	0.18
1052	0.19
1053	0.2
1054	0.23
1055	0.25
1056	0.26
1057	0.25
1058	0.28
1059	0.27
1060	0.26
1061	0.2
1062	0.17
1063	0.14
1064	0.14
1065	0.15
1066	0.11
1067	0.11
1068	0.11
1069	0.11
1070	0.13
1071	0.12
1072	0.13
1073	0.11
1074	0.11
1075	0.11
1076	0.1
1077	0.1
1078	0.09
1079	0.08
1080	0.07
1081	0.08
1082	0.08
1083	0.08
1084	0.08
1085	0.08
1086	0.08
1087	0.07
1088	0.06
1089	0.07
1090	0.1
1091	0.1
1092	0.1
1093	0.11
1094	0.14
1095	0.19
1096	0.21
1097	0.23
1098	0.2
1099	0.2
1100	0.22
1101	0.27
1102	0.3
1103	0.27
1104	0.27
1105	0.26
1106	0.26
1107	0.25
1108	0.23
1109	0.18
1110	0.11
1111	0.1
1112	0.08
1113	0.06
1114	0.05
1115	0.05
1116	0.05
1117	0.04
1118	0.04
1119	0.04
1120	0.03
1121	0.05
1122	0.05
1123	0.05
1124	0.06
1125	0.06
1126	0.07
1127	0.09
1128	0.09
1129	0.08
1130	0.08
1131	0.1
1132	0.11
1133	0.11
1134	0.1
1135	0.14
1136	0.21
1137	0.23
1138	0.24
1139	0.23
1140	0.21
1141	0.22
1142	0.24
1143	0.21
1144	0.14
1145	0.11
1146	0.11
1147	0.11
1148	0.11
1149	0.1
1150	0.08
1151	0.06
1152	0.05
1153	0.05
1154	0.05
1155	0.05
1156	0.04
1157	0.05
1158	0.05
1159	0.05
1160	0.05
1161	0.05
1162	0.05
1163	0.05
1164	0.05
1165	0.04
1166	0.06
1167	0.11
1168	0.15
1169	0.17
1170	0.25
1171	0.31
1172	0.36
1173	0.43
1174	0.49
1175	0.52
1176	0.59
1177	0.65
1178	0.66
1179	0.7
1180	0.7
1181	0.68
1182	0.66
1183	0.66
1184	0.58
1185	0.54
1186	0.48
1187	0.39
1188	0.35
1189	0.3
1190	0.26
1191	0.18
1192	0.16
1193	0.15
1194	0.13
1195	0.12
1196	0.13
1197	0.17
1198	0.18
1199	0.19
1200	0.2
1201	0.2
1202	0.23
1203	0.28
1204	0.35
1205	0.34
1206	0.35
1207	0.34
1208	0.35

A0A072PSA4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer