Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CH79

Protein Details
Accession Q6CH79    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
118-143QILEREKQRAKKRAHASSKDSPKKRIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
122-142REKQRAKKRAHASSKDSPKKR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010285  DNA_helicase_pif1-like  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0043596  C:nuclear replication fork  
GO:0043139  F:5'-3' DNA helicase activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0044806  P:G-quadruplex DNA unwinding  
GO:0000002  P:mitochondrial genome maintenance  
GO:0071932  P:replication fork reversal  
GO:0000723  P:telomere maintenance  
KEGG yli:YALI0A11539g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05970  PIF1  
CDD cd18809  SF1_C_RecD  
Amino Acid Sequences MARLNEYAADISRGHATARTEEAERYQRQRLEERAVQINSLMHQLREKESSDGAGASSGRQNTVEDRMDVDEPEDDETDLLLERERLLEEEQRLLGRVEEPERQSQGRREPRYRDVAQILEREKQRAKKRAHASSKDSPKKRIAPPVQIQDENMFVRGDWWTEWTSEELMMVVAYYKQDLHRAMQGHSGLNHAELTALQLGEIKRLVRRDAKKMLLAQYSSSLNKINEAQVRQEQSEKRGGERSEPVVAQYPSTTSSQNTNLYTGMPKSSQQTDMNCESTASDDETNAVVANTTTLSLLEPQNITLTEEQQVIFDLVAKGESLFFTGGAGTGKSVLIKEIKNHCESKGVVCKVTAPTGLAAVNVDGITIHRWTGLGLMKESAEVCIAKLFKNPRAAAMWKFTDVLIIDECSMISGAMFDMIDTISRAVRSNFFQIAHTAVVQYEKELRCKKKARNYNFLKEMLQYTEKDHARDQVLRDLPFGGMQIVCVGDFYQLPPVPSFEDKNTYARKHGASAQLPPDFLFNSEAFQKVFGDKRLRLTVAKRQTEGSVFASMLNMFRTYKGTTPETDALRNYFSQFIGRHPPGQQTVHLQSTTTGVEATNQRELQLLDGPEVFFYASDMRNTTEGYSQEFIDRAMRDINAEDRLCLKPGAQVMYLKNDYDKGLVNGHMGQVAFLMTYEMYSLYKDDLDVLFVIYHYIKSRNLRSLSRNAKVPPDLEQHLGMRLEHYQWSYYRYALMHIDEVYRQEALAQKKKNRELEEQKKVGRENTKLLVVFRLADEYIADGESDQQFILVPTAEFAKLDYSRLLARENRDANAPKYPTICSRVQLPMSLSWALTIHKCQGQTLIRTVVDMKGMFTEGQAYVAMTRVRSPDDLRLTCFEVPKVTRPEVIKFDESIKDSLTVKKEGANGVGGFALPNNAPHHSTPSKRSSPPPSSYESAISDFDSNAETCSGTHYYRTRAQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.19
3 0.2
4 0.21
5 0.25
6 0.27
7 0.26
8 0.27
9 0.34
10 0.39
11 0.43
12 0.44
13 0.48
14 0.49
15 0.53
16 0.59
17 0.58
18 0.58
19 0.58
20 0.58
21 0.59
22 0.56
23 0.5
24 0.45
25 0.4
26 0.32
27 0.33
28 0.28
29 0.2
30 0.24
31 0.27
32 0.29
33 0.31
34 0.32
35 0.29
36 0.28
37 0.29
38 0.26
39 0.23
40 0.19
41 0.18
42 0.16
43 0.15
44 0.19
45 0.18
46 0.18
47 0.18
48 0.19
49 0.2
50 0.28
51 0.28
52 0.24
53 0.26
54 0.28
55 0.28
56 0.27
57 0.25
58 0.2
59 0.17
60 0.19
61 0.18
62 0.14
63 0.13
64 0.13
65 0.12
66 0.1
67 0.1
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.1
72 0.1
73 0.12
74 0.14
75 0.2
76 0.22
77 0.25
78 0.26
79 0.26
80 0.26
81 0.25
82 0.23
83 0.19
84 0.22
85 0.22
86 0.27
87 0.3
88 0.34
89 0.38
90 0.4
91 0.43
92 0.45
93 0.52
94 0.56
95 0.62
96 0.64
97 0.67
98 0.72
99 0.76
100 0.71
101 0.67
102 0.62
103 0.59
104 0.56
105 0.56
106 0.51
107 0.49
108 0.48
109 0.47
110 0.49
111 0.52
112 0.57
113 0.59
114 0.62
115 0.65
116 0.73
117 0.78
118 0.82
119 0.81
120 0.8
121 0.81
122 0.85
123 0.86
124 0.81
125 0.77
126 0.75
127 0.75
128 0.74
129 0.74
130 0.71
131 0.71
132 0.75
133 0.78
134 0.76
135 0.68
136 0.62
137 0.53
138 0.49
139 0.39
140 0.31
141 0.21
142 0.15
143 0.15
144 0.14
145 0.14
146 0.1
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.15
151 0.15
152 0.15
153 0.14
154 0.13
155 0.1
156 0.09
157 0.08
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.08
164 0.09
165 0.14
166 0.16
167 0.18
168 0.22
169 0.24
170 0.25
171 0.29
172 0.3
173 0.28
174 0.27
175 0.26
176 0.21
177 0.19
178 0.18
179 0.12
180 0.1
181 0.08
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.12
187 0.12
188 0.14
189 0.16
190 0.14
191 0.16
192 0.19
193 0.24
194 0.3
195 0.36
196 0.43
197 0.5
198 0.53
199 0.54
200 0.57
201 0.58
202 0.54
203 0.49
204 0.41
205 0.36
206 0.35
207 0.31
208 0.27
209 0.24
210 0.19
211 0.21
212 0.22
213 0.24
214 0.26
215 0.27
216 0.3
217 0.32
218 0.36
219 0.35
220 0.4
221 0.37
222 0.36
223 0.42
224 0.38
225 0.35
226 0.38
227 0.38
228 0.36
229 0.38
230 0.37
231 0.33
232 0.32
233 0.31
234 0.31
235 0.3
236 0.25
237 0.21
238 0.18
239 0.17
240 0.18
241 0.17
242 0.12
243 0.16
244 0.2
245 0.24
246 0.24
247 0.23
248 0.22
249 0.23
250 0.24
251 0.2
252 0.18
253 0.15
254 0.15
255 0.18
256 0.21
257 0.25
258 0.26
259 0.28
260 0.31
261 0.34
262 0.35
263 0.31
264 0.28
265 0.23
266 0.21
267 0.2
268 0.16
269 0.13
270 0.11
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.1
275 0.08
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.08
285 0.09
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.12
290 0.12
291 0.14
292 0.12
293 0.13
294 0.12
295 0.13
296 0.13
297 0.11
298 0.12
299 0.1
300 0.09
301 0.1
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.08
323 0.11
324 0.12
325 0.19
326 0.27
327 0.31
328 0.35
329 0.37
330 0.35
331 0.36
332 0.36
333 0.36
334 0.37
335 0.34
336 0.31
337 0.29
338 0.32
339 0.28
340 0.29
341 0.22
342 0.14
343 0.12
344 0.13
345 0.13
346 0.1
347 0.08
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.05
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.09
361 0.12
362 0.12
363 0.12
364 0.13
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.1
369 0.08
370 0.07
371 0.06
372 0.09
373 0.09
374 0.1
375 0.14
376 0.18
377 0.21
378 0.29
379 0.29
380 0.28
381 0.31
382 0.34
383 0.32
384 0.33
385 0.3
386 0.23
387 0.24
388 0.21
389 0.18
390 0.16
391 0.14
392 0.1
393 0.09
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.06
398 0.06
399 0.04
400 0.04
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.04
409 0.04
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.06
414 0.07
415 0.09
416 0.11
417 0.15
418 0.16
419 0.16
420 0.16
421 0.16
422 0.17
423 0.15
424 0.14
425 0.1
426 0.08
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.13
431 0.14
432 0.21
433 0.28
434 0.31
435 0.39
436 0.47
437 0.54
438 0.57
439 0.66
440 0.67
441 0.7
442 0.75
443 0.74
444 0.71
445 0.65
446 0.56
447 0.48
448 0.41
449 0.33
450 0.27
451 0.2
452 0.17
453 0.23
454 0.23
455 0.23
456 0.23
457 0.23
458 0.24
459 0.26
460 0.25
461 0.25
462 0.27
463 0.26
464 0.26
465 0.23
466 0.2
467 0.18
468 0.16
469 0.09
470 0.06
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.04
475 0.04
476 0.04
477 0.04
478 0.04
479 0.05
480 0.09
481 0.1
482 0.11
483 0.11
484 0.11
485 0.13
486 0.14
487 0.16
488 0.13
489 0.17
490 0.18
491 0.23
492 0.27
493 0.26
494 0.27
495 0.29
496 0.28
497 0.25
498 0.29
499 0.3
500 0.26
501 0.29
502 0.32
503 0.3
504 0.29
505 0.27
506 0.23
507 0.17
508 0.16
509 0.15
510 0.09
511 0.1
512 0.11
513 0.11
514 0.1
515 0.11
516 0.1
517 0.1
518 0.12
519 0.16
520 0.21
521 0.21
522 0.26
523 0.28
524 0.29
525 0.29
526 0.32
527 0.36
528 0.4
529 0.41
530 0.37
531 0.36
532 0.36
533 0.34
534 0.32
535 0.26
536 0.17
537 0.15
538 0.14
539 0.13
540 0.12
541 0.11
542 0.09
543 0.08
544 0.07
545 0.08
546 0.1
547 0.11
548 0.13
549 0.17
550 0.18
551 0.19
552 0.23
553 0.27
554 0.27
555 0.27
556 0.25
557 0.23
558 0.22
559 0.22
560 0.18
561 0.15
562 0.13
563 0.15
564 0.15
565 0.17
566 0.23
567 0.24
568 0.25
569 0.26
570 0.29
571 0.29
572 0.3
573 0.29
574 0.26
575 0.29
576 0.29
577 0.27
578 0.23
579 0.2
580 0.2
581 0.19
582 0.13
583 0.09
584 0.07
585 0.1
586 0.13
587 0.15
588 0.18
589 0.17
590 0.18
591 0.19
592 0.19
593 0.17
594 0.18
595 0.16
596 0.12
597 0.13
598 0.13
599 0.11
600 0.11
601 0.1
602 0.05
603 0.06
604 0.08
605 0.08
606 0.09
607 0.1
608 0.11
609 0.12
610 0.13
611 0.13
612 0.14
613 0.13
614 0.16
615 0.16
616 0.16
617 0.16
618 0.16
619 0.15
620 0.15
621 0.15
622 0.13
623 0.13
624 0.13
625 0.13
626 0.14
627 0.16
628 0.17
629 0.17
630 0.16
631 0.18
632 0.19
633 0.19
634 0.18
635 0.16
636 0.14
637 0.16
638 0.19
639 0.17
640 0.2
641 0.2
642 0.27
643 0.27
644 0.24
645 0.23
646 0.21
647 0.2
648 0.18
649 0.18
650 0.13
651 0.14
652 0.15
653 0.15
654 0.15
655 0.14
656 0.14
657 0.13
658 0.11
659 0.09
660 0.08
661 0.06
662 0.05
663 0.06
664 0.04
665 0.04
666 0.04
667 0.05
668 0.05
669 0.06
670 0.06
671 0.07
672 0.07
673 0.07
674 0.09
675 0.08
676 0.09
677 0.09
678 0.09
679 0.08
680 0.08
681 0.09
682 0.07
683 0.09
684 0.09
685 0.12
686 0.15
687 0.21
688 0.26
689 0.33
690 0.37
691 0.41
692 0.45
693 0.53
694 0.58
695 0.56
696 0.56
697 0.51
698 0.52
699 0.49
700 0.44
701 0.4
702 0.37
703 0.35
704 0.32
705 0.32
706 0.27
707 0.27
708 0.27
709 0.21
710 0.17
711 0.16
712 0.16
713 0.17
714 0.17
715 0.16
716 0.16
717 0.21
718 0.21
719 0.19
720 0.2
721 0.18
722 0.2
723 0.2
724 0.2
725 0.18
726 0.17
727 0.18
728 0.16
729 0.18
730 0.16
731 0.14
732 0.12
733 0.12
734 0.17
735 0.24
736 0.31
737 0.38
738 0.43
739 0.52
740 0.6
741 0.66
742 0.66
743 0.69
744 0.72
745 0.75
746 0.78
747 0.76
748 0.72
749 0.69
750 0.65
751 0.62
752 0.58
753 0.51
754 0.47
755 0.44
756 0.45
757 0.41
758 0.4
759 0.36
760 0.29
761 0.26
762 0.2
763 0.19
764 0.14
765 0.13
766 0.12
767 0.1
768 0.1
769 0.09
770 0.09
771 0.06
772 0.1
773 0.1
774 0.11
775 0.09
776 0.08
777 0.09
778 0.09
779 0.1
780 0.07
781 0.07
782 0.07
783 0.09
784 0.09
785 0.09
786 0.09
787 0.14
788 0.14
789 0.15
790 0.15
791 0.15
792 0.17
793 0.19
794 0.23
795 0.22
796 0.26
797 0.34
798 0.36
799 0.35
800 0.4
801 0.43
802 0.41
803 0.45
804 0.43
805 0.37
806 0.36
807 0.38
808 0.36
809 0.38
810 0.37
811 0.3
812 0.34
813 0.37
814 0.37
815 0.37
816 0.34
817 0.31
818 0.32
819 0.31
820 0.26
821 0.2
822 0.19
823 0.18
824 0.18
825 0.18
826 0.19
827 0.21
828 0.22
829 0.22
830 0.28
831 0.32
832 0.34
833 0.36
834 0.37
835 0.34
836 0.35
837 0.35
838 0.29
839 0.27
840 0.23
841 0.19
842 0.15
843 0.16
844 0.15
845 0.14
846 0.16
847 0.12
848 0.13
849 0.12
850 0.11
851 0.1
852 0.14
853 0.15
854 0.12
855 0.15
856 0.16
857 0.19
858 0.22
859 0.25
860 0.3
861 0.38
862 0.4
863 0.41
864 0.42
865 0.44
866 0.44
867 0.43
868 0.36
869 0.34
870 0.35
871 0.39
872 0.43
873 0.4
874 0.43
875 0.44
876 0.49
877 0.48
878 0.51
879 0.45
880 0.4
881 0.43
882 0.43
883 0.42
884 0.37
885 0.32
886 0.29
887 0.28
888 0.33
889 0.33
890 0.3
891 0.28
892 0.31
893 0.33
894 0.32
895 0.32
896 0.3
897 0.26
898 0.24
899 0.23
900 0.19
901 0.15
902 0.13
903 0.13
904 0.09
905 0.12
906 0.14
907 0.16
908 0.2
909 0.21
910 0.29
911 0.35
912 0.41
913 0.45
914 0.52
915 0.58
916 0.6
917 0.68
918 0.69
919 0.71
920 0.71
921 0.68
922 0.65
923 0.61
924 0.58
925 0.54
926 0.47
927 0.41
928 0.35
929 0.33
930 0.27
931 0.23
932 0.21
933 0.19
934 0.16
935 0.14
936 0.14
937 0.12
938 0.11
939 0.16
940 0.19
941 0.17
942 0.24
943 0.27