Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CH61

Protein Details
Accession Q6CH61    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-206PRALDRASRKKLVKKNQKQHERNLKRGVSKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-112REKPIPKPKAMTKW
116-125ALKKGIKSKA
182-206RASRKKLVKKNQKQHERNLKRGVSK
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007023  Ribosom_reg  
Gene Ontology GO:0034399  C:nuclear periphery  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
KEGG yli:YALI0A12067g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04939  RRS1  
Amino Acid Sequences MSEIKTVTVEKPVPVTYDLGNLAVFDTNPVEVDLNDLNVDGQAREEALQAVSRDNAQLLINQLLSQPIKNTTDSNSSSGNQNSTMSLIMLPQPSTRLPREKPIPKPKAMTKWQEFALKKGIKSKARDGKLVYDEATGKWVPKWGFNGKNKELDQQWCVEVDDGKGSKKNQEDVMLDPRALDRASRKKLVKKNQKQHERNLKRGVSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.2
4 0.22
5 0.21
6 0.18
7 0.17
8 0.15
9 0.14
10 0.13
11 0.11
12 0.09
13 0.09
14 0.08
15 0.08
16 0.09
17 0.09
18 0.08
19 0.12
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.1
24 0.09
25 0.09
26 0.1
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.07
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.1
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.1
42 0.11
43 0.09
44 0.1
45 0.11
46 0.12
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.13
51 0.13
52 0.12
53 0.11
54 0.13
55 0.15
56 0.16
57 0.17
58 0.17
59 0.23
60 0.24
61 0.25
62 0.24
63 0.23
64 0.25
65 0.25
66 0.23
67 0.18
68 0.16
69 0.14
70 0.12
71 0.12
72 0.09
73 0.08
74 0.07
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.1
80 0.11
81 0.14
82 0.17
83 0.21
84 0.22
85 0.29
86 0.38
87 0.44
88 0.53
89 0.6
90 0.63
91 0.59
92 0.63
93 0.61
94 0.61
95 0.6
96 0.59
97 0.51
98 0.49
99 0.49
100 0.52
101 0.46
102 0.4
103 0.42
104 0.36
105 0.34
106 0.38
107 0.43
108 0.4
109 0.44
110 0.52
111 0.51
112 0.51
113 0.54
114 0.48
115 0.48
116 0.45
117 0.42
118 0.33
119 0.26
120 0.24
121 0.21
122 0.22
123 0.16
124 0.13
125 0.12
126 0.17
127 0.15
128 0.18
129 0.24
130 0.29
131 0.38
132 0.45
133 0.54
134 0.52
135 0.6
136 0.58
137 0.57
138 0.53
139 0.48
140 0.42
141 0.35
142 0.32
143 0.25
144 0.25
145 0.21
146 0.17
147 0.14
148 0.18
149 0.17
150 0.18
151 0.22
152 0.22
153 0.27
154 0.31
155 0.34
156 0.32
157 0.36
158 0.36
159 0.37
160 0.43
161 0.39
162 0.35
163 0.31
164 0.28
165 0.24
166 0.22
167 0.2
168 0.22
169 0.3
170 0.38
171 0.46
172 0.52
173 0.6
174 0.7
175 0.78
176 0.8
177 0.81
178 0.85
179 0.87
180 0.92
181 0.89
182 0.91
183 0.91
184 0.89
185 0.87
186 0.87