Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C9S5

Protein Details
Accession Q6C9S5    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-87AEKMEKEGKTPKKKPATPRKKTTTTSSHydrophilic
228-247STFNKPKEELLRKRRRYDEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-81KAQRAAERAEKMEKEGKTPKKKPATPRKK
121-129APPAKPRKK
151-217IKVAKKKEVAKEREREKGASGSGEREARASPSVGGRPGATARGTPSKPSRSDRPTPSDRPTAGKRPP
239-241RKR
326-341EEKRRAEEKRRRLGKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0006334  P:nucleosome assembly  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
KEGG yli:YALI0D08734g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MPVRRSSEPEKKPTNGSSAKPAASSSSSSAAIPVARQTEAERREQMERVMRLKAQRAAERAEKMEKEGKTPKKKPATPRKKTTTTSSSTARDTNTSATASNTSTRRGPGRGASGGGRVYEAPPAKPRKKMSFKELMQEADNIKADDLKIGIKVAKKKEVAKEREREKGASGSGEREARASPSVGGRPGATARGTPSKPSRSDRPTPSDRPTAGKRPPSTAIPEYKPPSTFNKPKEELLRKRRRYDEEEDDSMDDFIDEDEEEEQHRDVGYDRDEIWRLLNRGRSRQQYYNDYSDDDDMEAGGDDIFEEEERSSKLARLEDRREEMEEKRRAEEKRRRLGKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.63
3 0.57
4 0.57
5 0.55
6 0.53
7 0.46
8 0.43
9 0.37
10 0.33
11 0.32
12 0.26
13 0.23
14 0.23
15 0.22
16 0.22
17 0.2
18 0.18
19 0.16
20 0.17
21 0.15
22 0.15
23 0.16
24 0.19
25 0.26
26 0.29
27 0.34
28 0.35
29 0.36
30 0.4
31 0.41
32 0.43
33 0.43
34 0.45
35 0.42
36 0.42
37 0.42
38 0.43
39 0.48
40 0.48
41 0.46
42 0.46
43 0.46
44 0.48
45 0.51
46 0.5
47 0.47
48 0.48
49 0.41
50 0.4
51 0.44
52 0.39
53 0.4
54 0.45
55 0.52
56 0.56
57 0.62
58 0.67
59 0.71
60 0.77
61 0.81
62 0.83
63 0.84
64 0.83
65 0.87
66 0.86
67 0.84
68 0.81
69 0.79
70 0.75
71 0.69
72 0.64
73 0.59
74 0.53
75 0.48
76 0.46
77 0.39
78 0.33
79 0.29
80 0.26
81 0.22
82 0.2
83 0.18
84 0.17
85 0.17
86 0.16
87 0.2
88 0.19
89 0.19
90 0.2
91 0.22
92 0.24
93 0.24
94 0.25
95 0.24
96 0.28
97 0.27
98 0.27
99 0.26
100 0.25
101 0.24
102 0.21
103 0.18
104 0.13
105 0.12
106 0.15
107 0.15
108 0.15
109 0.21
110 0.31
111 0.34
112 0.41
113 0.46
114 0.52
115 0.61
116 0.64
117 0.64
118 0.65
119 0.63
120 0.63
121 0.6
122 0.51
123 0.42
124 0.39
125 0.32
126 0.24
127 0.24
128 0.17
129 0.13
130 0.12
131 0.11
132 0.09
133 0.09
134 0.07
135 0.06
136 0.07
137 0.1
138 0.13
139 0.19
140 0.21
141 0.27
142 0.3
143 0.34
144 0.42
145 0.49
146 0.53
147 0.55
148 0.6
149 0.58
150 0.63
151 0.6
152 0.53
153 0.45
154 0.4
155 0.32
156 0.26
157 0.22
158 0.16
159 0.17
160 0.17
161 0.15
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.12
166 0.11
167 0.09
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.1
177 0.09
178 0.11
179 0.18
180 0.18
181 0.21
182 0.27
183 0.31
184 0.36
185 0.4
186 0.46
187 0.46
188 0.54
189 0.56
190 0.58
191 0.6
192 0.61
193 0.62
194 0.6
195 0.54
196 0.51
197 0.51
198 0.51
199 0.5
200 0.52
201 0.48
202 0.46
203 0.48
204 0.45
205 0.45
206 0.42
207 0.42
208 0.37
209 0.42
210 0.41
211 0.41
212 0.39
213 0.36
214 0.38
215 0.41
216 0.46
217 0.45
218 0.51
219 0.52
220 0.55
221 0.63
222 0.65
223 0.66
224 0.7
225 0.75
226 0.73
227 0.78
228 0.81
229 0.78
230 0.75
231 0.73
232 0.72
233 0.68
234 0.63
235 0.57
236 0.5
237 0.43
238 0.36
239 0.28
240 0.18
241 0.1
242 0.07
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.13
256 0.14
257 0.15
258 0.16
259 0.2
260 0.22
261 0.22
262 0.24
263 0.26
264 0.26
265 0.28
266 0.35
267 0.36
268 0.44
269 0.52
270 0.57
271 0.58
272 0.64
273 0.66
274 0.68
275 0.69
276 0.66
277 0.59
278 0.52
279 0.47
280 0.41
281 0.35
282 0.26
283 0.19
284 0.13
285 0.11
286 0.1
287 0.08
288 0.06
289 0.05
290 0.04
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.09
297 0.1
298 0.12
299 0.13
300 0.15
301 0.19
302 0.25
303 0.33
304 0.4
305 0.47
306 0.54
307 0.59
308 0.59
309 0.59
310 0.57
311 0.56
312 0.57
313 0.57
314 0.51
315 0.52
316 0.55
317 0.56
318 0.63
319 0.66
320 0.67
321 0.7