FuNGI

Q6CB53

Protein Details

Accession

Q6CB53

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-25	QSNKEHRTSRDKTKMAKAKL	Hydrophilic
41-64	GKLDRQARRSHDHKEKRYHAPMVD	Basic
322-341	ISAGAKRKRRLDEKQKSIYA	Hydrophilic
758-779	FSQVRIKRHRWHKKVLKSNDPL	Hydrophilic
1051-1072	VITIRNDKEKRAKEKWTAQHDA	Hydrophilic
1081-1106	EAERLEREKTKKKEFFQQNKKRGASQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
328-330	RKR
1058-1066	KEKRAKEKW
1073-1117	YEKKKAAAEAERLEREKTKKKEFFQQNKKRGASQGGDHGSNKRRK

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 12.5, cyto 10.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003593 AAA+_ATPase IPR012948 AARP2CN IPR039761 Bms1/Tsr1 IPR037875 Bms1_N IPR007034 BMS1_TSR1_C IPR030387 G_Bms1/Tsr1_dom IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0005730 C:nucleolus GO:0005525 F:GTP binding GO:0003924 F:GTPase activity GO:0034511 F:U3 snoRNA binding GO:0000479 P:endonucleolytic cleavage of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	yli:YALI0C21846g -
Pfam	View protein in Pfam PF08142 AARP2CN PF04950 RIBIOP_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51714 G_BMS1
CDD	cd01882 BMS1

Amino Acid Sequences

MGAEEQSNKEHRTSRDKTKMAKAKLHANGFNAKAFAVANPGKLDRQARRSHDHKEKRYHAPMVDRTTEDPPPVIVAVVGPPGTGKTTLIKSLVRRYTKQTLNDIRGPITVVSGKRRRLTFLECNNDLSSMIDVAKIADLVLLVMDGNFGFEMETMEFLNILSPHGFPRILGVTTHLDLFKNPATMRASKKRLKTRFWTEVYAGAKLFYLSGVINGRYPDREILNLCRFINIMKFRPLKWRNEHPYLLADRVVDITHPSLIEKNPKVDRKVTMYGWVHGTPLPYVNAKVHVPGIGDLVVKEAERLPDPCPTPYAVKMAEEAAISAGAKRKRRLDEKQKSIYAPMSDVGGVLMDKDAVYIDVGSKSFVPGQEKGIGEQMVTSLQSAKHGLGETERVFRLFNDKEFDEALEEDIDDDEEDNGDHGRTGMRSGRATEKITEIGDDEEGDEQEQDEEYDFQESDSDMELGMDEDELSQLRAQALDGASKFKKQTRKSWDINRVLYQDDVSPADAISKWKGDFEEQEEDIEADEEEFLKRADFVDNSGLDSSVPIYGDCLDSWTQEAIAGLSDRFITAVFDKDGNVIQDKDEDEEGEGDDDEIYSDFEDMETGEKFVGGKKAGSDDEDDEDDEDNEEEDSESEPAAMSLAQQREANAAKKEKLKKQFEQEQGDDREFGAEDPEGGEETSWYDLEKAKIAKQLEINEAEYKEMDQNTRDRIEGFRAGTYLRLVFEGVPCEFIQHFDPSFPVLIGGLLANEDQFGFSQVRIKRHRWHKKVLKSNDPLVVSLGWRRFQTIPLYSTSDSRTRNRLLKYTPEHMHCFGTFYGPLVSPNTGFCAVPAVASANKTGAFRIAATGTVLEVDASVEIVKKLKLVGHPAKVFKNTAFIKDMFNSSLEVAKFEGAQIKTVSGIRGHIKRALASPEGQFRATFEDKILMSDIVFLKTWYPIQPRKFYNPVTSLLLQDKANWAGMRLTGQVRAEEGIETPLLENSKYNKIERKERFFQPLKVPRAIQSGLPFAAQPKNVADPKKRDYYLQKRAVVLSEEEQKARDLLKKVITIRNDKEKRAKEKWTAQHDAYEKKKAAAEAERLEREKTKKKEFFQQNKKRGASQGGDHGSNKRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.66
3	0.71
4	0.74
5	0.78
6	0.81
7	0.78
8	0.79
9	0.73
10	0.73
11	0.74
12	0.75
13	0.68
14	0.62
15	0.62
16	0.56
17	0.53
18	0.43
19	0.35
20	0.27
21	0.24
22	0.2
23	0.21
24	0.2
25	0.2
26	0.23
27	0.26
28	0.26
29	0.31
30	0.39
31	0.39
32	0.46
33	0.52
34	0.56
35	0.62
36	0.67
37	0.72
38	0.75
39	0.78
40	0.78
41	0.8
42	0.82
43	0.83
44	0.85
45	0.82
46	0.76
47	0.75
48	0.74
49	0.71
50	0.67
51	0.59
52	0.55
53	0.53
54	0.5
55	0.41
56	0.33
57	0.26
58	0.23
59	0.21
60	0.17
61	0.12
62	0.1
63	0.1
64	0.12
65	0.12
66	0.09
67	0.09
68	0.1
69	0.12
70	0.12
71	0.12
72	0.15
73	0.18
74	0.22
75	0.25
76	0.29
77	0.33
78	0.42
79	0.5
80	0.51
81	0.51
82	0.56
83	0.62
84	0.65
85	0.65
86	0.66
87	0.67
88	0.67
89	0.7
90	0.64
91	0.56
92	0.49
93	0.45
94	0.35
95	0.28
96	0.26
97	0.24
98	0.31
99	0.37
100	0.43
101	0.47
102	0.48
103	0.5
104	0.51
105	0.56
106	0.56
107	0.59
108	0.62
109	0.57
110	0.6
111	0.55
112	0.5
113	0.42
114	0.32
115	0.23
116	0.15
117	0.14
118	0.1
119	0.1
120	0.1
121	0.1
122	0.08
123	0.07
124	0.06
125	0.06
126	0.05
127	0.05
128	0.04
129	0.04
130	0.04
131	0.04
132	0.04
133	0.04
134	0.04
135	0.04
136	0.04
137	0.05
138	0.07
139	0.07
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.08
144	0.08
145	0.1
146	0.09
147	0.1
148	0.1
149	0.1
150	0.12
151	0.15
152	0.15
153	0.12
154	0.16
155	0.18
156	0.18
157	0.17
158	0.19
159	0.21
160	0.21
161	0.24
162	0.2
163	0.17
164	0.17
165	0.21
166	0.2
167	0.2
168	0.2
169	0.23
170	0.27
171	0.33
172	0.41
173	0.47
174	0.54
175	0.56
176	0.65
177	0.71
178	0.75
179	0.77
180	0.78
181	0.78
182	0.79
183	0.76
184	0.72
185	0.63
186	0.61
187	0.55
188	0.47
189	0.37
190	0.27
191	0.23
192	0.18
193	0.16
194	0.09
195	0.08
196	0.06
197	0.09
198	0.12
199	0.12
200	0.14
201	0.15
202	0.17
203	0.17
204	0.19
205	0.19
206	0.18
207	0.2
208	0.22
209	0.3
210	0.34
211	0.37
212	0.35
213	0.33
214	0.32
215	0.29
216	0.34
217	0.32
218	0.29
219	0.34
220	0.37
221	0.38
222	0.49
223	0.54
224	0.55
225	0.58
226	0.65
227	0.64
228	0.69
229	0.69
230	0.6
231	0.61
232	0.55
233	0.48
234	0.38
235	0.3
236	0.22
237	0.21
238	0.19
239	0.12
240	0.11
241	0.1
242	0.1
243	0.1
244	0.1
245	0.12
246	0.16
247	0.24
248	0.25
249	0.31
250	0.38
251	0.44
252	0.47
253	0.49
254	0.5
255	0.49
256	0.52
257	0.46
258	0.47
259	0.43
260	0.41
261	0.41
262	0.36
263	0.3
264	0.25
265	0.25
266	0.17
267	0.17
268	0.16
269	0.13
270	0.15
271	0.15
272	0.17
273	0.16
274	0.17
275	0.16
276	0.16
277	0.15
278	0.14
279	0.14
280	0.12
281	0.12
282	0.1
283	0.11
284	0.1
285	0.09
286	0.09
287	0.09
288	0.1
289	0.12
290	0.14
291	0.14
292	0.2
293	0.22
294	0.22
295	0.22
296	0.23
297	0.24
298	0.24
299	0.27
300	0.21
301	0.2
302	0.2
303	0.19
304	0.18
305	0.15
306	0.13
307	0.09
308	0.08
309	0.08
310	0.08
311	0.13
312	0.17
313	0.22
314	0.26
315	0.33
316	0.41
317	0.5
318	0.6
319	0.66
320	0.72
321	0.76
322	0.81
323	0.77
324	0.7
325	0.64
326	0.57
327	0.46
328	0.36
329	0.27
330	0.19
331	0.15
332	0.14
333	0.11
334	0.08
335	0.06
336	0.05
337	0.05
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.05
346	0.07
347	0.07
348	0.08
349	0.08
350	0.09
351	0.1
352	0.12
353	0.15
354	0.15
355	0.18
356	0.23
357	0.23
358	0.23
359	0.24
360	0.22
361	0.18
362	0.16
363	0.14
364	0.09
365	0.09
366	0.08
367	0.07
368	0.07
369	0.09
370	0.1
371	0.1
372	0.11
373	0.11
374	0.11
375	0.11
376	0.15
377	0.15
378	0.18
379	0.18
380	0.17
381	0.17
382	0.17
383	0.23
384	0.2
385	0.21
386	0.22
387	0.22
388	0.23
389	0.23
390	0.23
391	0.17
392	0.15
393	0.13
394	0.09
395	0.08
396	0.07
397	0.07
398	0.07
399	0.05
400	0.05
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.05
406	0.05
407	0.04
408	0.04
409	0.05
410	0.06
411	0.08
412	0.12
413	0.14
414	0.15
415	0.18
416	0.23
417	0.26
418	0.28
419	0.27
420	0.25
421	0.24
422	0.23
423	0.21
424	0.16
425	0.13
426	0.11
427	0.1
428	0.08
429	0.07
430	0.07
431	0.07
432	0.06
433	0.05
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.06
440	0.07
441	0.07
442	0.06
443	0.07
444	0.07
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.04
454	0.03
455	0.03
456	0.04
457	0.04
458	0.04
459	0.04
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.07
465	0.08
466	0.1
467	0.1
468	0.14
469	0.15
470	0.17
471	0.19
472	0.21
473	0.3
474	0.32
475	0.41
476	0.46
477	0.55
478	0.6
479	0.68
480	0.73
481	0.71
482	0.7
483	0.64
484	0.55
485	0.47
486	0.4
487	0.31
488	0.21
489	0.16
490	0.13
491	0.1
492	0.09
493	0.07
494	0.08
495	0.08
496	0.09
497	0.09
498	0.1
499	0.1
500	0.11
501	0.11
502	0.12
503	0.13
504	0.16
505	0.2
506	0.18
507	0.18
508	0.18
509	0.17
510	0.16
511	0.14
512	0.09
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.04
517	0.04
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.05
522	0.07
523	0.06
524	0.08
525	0.11
526	0.12
527	0.12
528	0.12
529	0.12
530	0.1
531	0.1
532	0.09
533	0.06
534	0.05
535	0.04
536	0.05
537	0.05
538	0.06
539	0.06
540	0.08
541	0.07
542	0.07
543	0.08
544	0.08
545	0.07
546	0.07
547	0.07
548	0.05
549	0.05
550	0.05
551	0.04
552	0.04
553	0.04
554	0.04
555	0.04
556	0.04
557	0.05
558	0.05
559	0.07
560	0.07
561	0.08
562	0.08
563	0.09
564	0.1
565	0.09
566	0.1
567	0.09
568	0.08
569	0.1
570	0.1
571	0.1
572	0.1
573	0.09
574	0.08
575	0.08
576	0.08
577	0.07
578	0.06
579	0.05
580	0.05
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.03
588	0.03
589	0.04
590	0.04
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.05
595	0.05
596	0.05
597	0.07
598	0.1
599	0.09
600	0.09
601	0.09
602	0.12
603	0.13
604	0.14
605	0.14
606	0.13
607	0.14
608	0.14
609	0.14
610	0.12
611	0.12
612	0.11
613	0.09
614	0.08
615	0.06
616	0.05
617	0.05
618	0.05
619	0.05
620	0.06
621	0.05
622	0.05
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.05
627	0.04
628	0.04
629	0.09
630	0.09
631	0.11
632	0.11
633	0.12
634	0.15
635	0.18
636	0.2
637	0.2
638	0.23
639	0.26
640	0.33
641	0.4
642	0.45
643	0.53
644	0.57
645	0.58
646	0.64
647	0.69
648	0.7
649	0.69
650	0.64
651	0.61
652	0.57
653	0.52
654	0.43
655	0.34
656	0.26
657	0.19
658	0.17
659	0.1
660	0.07
661	0.06
662	0.06
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.05
667	0.04
668	0.05
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.08
674	0.1
675	0.13
676	0.14
677	0.16
678	0.21
679	0.21
680	0.23
681	0.25
682	0.28
683	0.28
684	0.29
685	0.28
686	0.26
687	0.26
688	0.23
689	0.19
690	0.17
691	0.15
692	0.15
693	0.14
694	0.13
695	0.16
696	0.19
697	0.21
698	0.2
699	0.18
700	0.18
701	0.22
702	0.24
703	0.22
704	0.18
705	0.18
706	0.18
707	0.17
708	0.17
709	0.13
710	0.09
711	0.09
712	0.09
713	0.09
714	0.1
715	0.12
716	0.11
717	0.12
718	0.11
719	0.13
720	0.12
721	0.13
722	0.14
723	0.14
724	0.14
725	0.13
726	0.13
727	0.13
728	0.13
729	0.11
730	0.09
731	0.06
732	0.06
733	0.06
734	0.05
735	0.04
736	0.04
737	0.04
738	0.04
739	0.04
740	0.04
741	0.04
742	0.04
743	0.06
744	0.07
745	0.07
746	0.14
747	0.18
748	0.26
749	0.32
750	0.37
751	0.44
752	0.55
753	0.66
754	0.66
755	0.74
756	0.75
757	0.8
758	0.85
759	0.85
760	0.84
761	0.78
762	0.76
763	0.71
764	0.62
765	0.52
766	0.42
767	0.34
768	0.25
769	0.24
770	0.22
771	0.19
772	0.18
773	0.21
774	0.2
775	0.23
776	0.28
777	0.27
778	0.26
779	0.27
780	0.32
781	0.29
782	0.3
783	0.31
784	0.31
785	0.31
786	0.33
787	0.36
788	0.37
789	0.43
790	0.45
791	0.48
792	0.45
793	0.51
794	0.53
795	0.55
796	0.55
797	0.53
798	0.54
799	0.5
800	0.49
801	0.39
802	0.35
803	0.27
804	0.24
805	0.19
806	0.16
807	0.16
808	0.13
809	0.14
810	0.14
811	0.14
812	0.12
813	0.13
814	0.15
815	0.14
816	0.13
817	0.12
818	0.14
819	0.13
820	0.13
821	0.12
822	0.11
823	0.11
824	0.12
825	0.13
826	0.1
827	0.12
828	0.12
829	0.12
830	0.11
831	0.11
832	0.1
833	0.12
834	0.11
835	0.1
836	0.11
837	0.1
838	0.09
839	0.08
840	0.08
841	0.05
842	0.05
843	0.05
844	0.04
845	0.04
846	0.05
847	0.05
848	0.06
849	0.07
850	0.08
851	0.08
852	0.09
853	0.13
854	0.16
855	0.25
856	0.32
857	0.39
858	0.44
859	0.48
860	0.51
861	0.51
862	0.5
863	0.4
864	0.42
865	0.35
866	0.34
867	0.34
868	0.3
869	0.31
870	0.31
871	0.33
872	0.25
873	0.24
874	0.21
875	0.17
876	0.21
877	0.17
878	0.16
879	0.14
880	0.14
881	0.13
882	0.13
883	0.19
884	0.15
885	0.17
886	0.17
887	0.16
888	0.18
889	0.19
890	0.2
891	0.14
892	0.17
893	0.22
894	0.25
895	0.28
896	0.3
897	0.3
898	0.31
899	0.34
900	0.35
901	0.3
902	0.29
903	0.3
904	0.34
905	0.35
906	0.33
907	0.29
908	0.25
909	0.31
910	0.3
911	0.27
912	0.2
913	0.22
914	0.22
915	0.23
916	0.24
917	0.16
918	0.14
919	0.18
920	0.18
921	0.16
922	0.16
923	0.14
924	0.14
925	0.15
926	0.18
927	0.19
928	0.26
929	0.32
930	0.4
931	0.48
932	0.53
933	0.59
934	0.64
935	0.62
936	0.62
937	0.58
938	0.55
939	0.52
940	0.48
941	0.43
942	0.38
943	0.37
944	0.29
945	0.27
946	0.27
947	0.22
948	0.24
949	0.21
950	0.19
951	0.17
952	0.18
953	0.19
954	0.19
955	0.19
956	0.19
957	0.21
958	0.2
959	0.19
960	0.19
961	0.18
962	0.15
963	0.14
964	0.12
965	0.11
966	0.11
967	0.1
968	0.12
969	0.12
970	0.12
971	0.14
972	0.17
973	0.26
974	0.29
975	0.34
976	0.39
977	0.45
978	0.56
979	0.62
980	0.67
981	0.66
982	0.69
983	0.75
984	0.73
985	0.73
986	0.74
987	0.74
988	0.71
989	0.68
990	0.63
991	0.57
992	0.57
993	0.51
994	0.44
995	0.38
996	0.36
997	0.31
998	0.3
999	0.27
1000	0.24
1001	0.28
1002	0.25
1003	0.23
1004	0.21
1005	0.29
1006	0.33
1007	0.41
1008	0.46
1009	0.49
1010	0.55
1011	0.62
1012	0.61
1013	0.6
1014	0.66
1015	0.69
1016	0.71
1017	0.72
1018	0.7
1019	0.64
1020	0.64
1021	0.6
1022	0.52
1023	0.45
1024	0.39
1025	0.39
1026	0.37
1027	0.35
1028	0.33
1029	0.31
1030	0.3
1031	0.3
1032	0.31
1033	0.26
1034	0.3
1035	0.35
1036	0.41
1037	0.46
1038	0.51
1039	0.55
1040	0.58
1041	0.61
1042	0.66
1043	0.66
1044	0.67
1045	0.71
1046	0.74
1047	0.77
1048	0.76
1049	0.78
1050	0.76
1051	0.81
1052	0.83
1053	0.82
1054	0.8
1055	0.72
1056	0.72
1057	0.69
1058	0.68
1059	0.64
1060	0.63
1061	0.55
1062	0.51
1063	0.52
1064	0.46
1065	0.46
1066	0.45
1067	0.47
1068	0.45
1069	0.52
1070	0.56
1071	0.55
1072	0.56
1073	0.57
1074	0.58
1075	0.6
1076	0.61
1077	0.64
1078	0.66
1079	0.69
1080	0.77
1081	0.81
1082	0.84
1083	0.85
1084	0.87
1085	0.86
1086	0.87
1087	0.85
1088	0.79
1089	0.74
1090	0.71
1091	0.65
1092	0.59
1093	0.6
1094	0.55
1095	0.55
1096	0.52
1097	0.55

Q6CB53

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer