Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C6U4

Protein Details
Accession Q6C6U4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
212-255EEVLQKEKEEREKNRKRKPADKSKGPRKKQPKLTFNKGAKKDLDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
219-252KEEREKNRKRKPADKSKGPRKKQPKLTFNKGAKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.999, mito 4.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR015966  tRNA_lig_kin_fungi  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003972  F:RNA ligase (ATP) activity  
GO:0006388  P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation  
KEGG yli:YALI0E06171g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08303  tRNA_lig_kinase  
Amino Acid Sequences MPKYVIVPVASVGCGKSTVGKTLASVCGFGQVQNDDITGTNRRPKFLQAILEQLESHQVVYADRNNSSVKERKELVDGLRKELGNEVDMVGLQFVHNQQTIPALKKITQERVFARKDHQTVSTATLAPQKIYMIMGGFIKRLEPFTDAEKKEYKLIVDLPVEKDNTADNVLRLLEKIKDNSATAPMLEDPKYTDQEVRDTVQNLIVSETKSEEVLQKEKEEREKNRKRKPADKSKGPRKKQPKLTFNKGAKKDLDKSSGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.16
4 0.16
5 0.2
6 0.21
7 0.21
8 0.22
9 0.26
10 0.3
11 0.24
12 0.23
13 0.19
14 0.22
15 0.22
16 0.22
17 0.2
18 0.16
19 0.17
20 0.17
21 0.17
22 0.12
23 0.13
24 0.16
25 0.17
26 0.2
27 0.28
28 0.28
29 0.31
30 0.32
31 0.35
32 0.39
33 0.39
34 0.42
35 0.36
36 0.42
37 0.42
38 0.41
39 0.36
40 0.3
41 0.28
42 0.21
43 0.18
44 0.13
45 0.11
46 0.1
47 0.14
48 0.19
49 0.18
50 0.18
51 0.21
52 0.21
53 0.22
54 0.28
55 0.31
56 0.29
57 0.31
58 0.33
59 0.32
60 0.35
61 0.36
62 0.36
63 0.38
64 0.36
65 0.35
66 0.38
67 0.36
68 0.32
69 0.32
70 0.27
71 0.18
72 0.18
73 0.14
74 0.1
75 0.1
76 0.09
77 0.06
78 0.05
79 0.04
80 0.05
81 0.05
82 0.07
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.13
87 0.16
88 0.17
89 0.19
90 0.18
91 0.2
92 0.25
93 0.3
94 0.34
95 0.35
96 0.37
97 0.39
98 0.46
99 0.45
100 0.41
101 0.41
102 0.38
103 0.36
104 0.34
105 0.31
106 0.25
107 0.24
108 0.26
109 0.24
110 0.18
111 0.17
112 0.2
113 0.19
114 0.17
115 0.16
116 0.12
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.05
121 0.06
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.1
132 0.15
133 0.24
134 0.24
135 0.27
136 0.29
137 0.29
138 0.3
139 0.29
140 0.24
141 0.18
142 0.19
143 0.19
144 0.19
145 0.2
146 0.21
147 0.23
148 0.23
149 0.2
150 0.19
151 0.16
152 0.15
153 0.15
154 0.12
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.12
162 0.14
163 0.16
164 0.17
165 0.18
166 0.19
167 0.2
168 0.21
169 0.18
170 0.15
171 0.15
172 0.14
173 0.15
174 0.15
175 0.14
176 0.15
177 0.18
178 0.2
179 0.2
180 0.22
181 0.2
182 0.24
183 0.26
184 0.25
185 0.25
186 0.24
187 0.24
188 0.24
189 0.24
190 0.2
191 0.19
192 0.19
193 0.16
194 0.15
195 0.16
196 0.13
197 0.13
198 0.14
199 0.16
200 0.19
201 0.24
202 0.25
203 0.28
204 0.33
205 0.38
206 0.46
207 0.51
208 0.57
209 0.63
210 0.72
211 0.78
212 0.83
213 0.87
214 0.86
215 0.87
216 0.88
217 0.88
218 0.88
219 0.88
220 0.89
221 0.91
222 0.93
223 0.91
224 0.91
225 0.9
226 0.9
227 0.9
228 0.9
229 0.89
230 0.89
231 0.91
232 0.91
233 0.9
234 0.89
235 0.84
236 0.8
237 0.76
238 0.73
239 0.71
240 0.68