FuNGI

Q6C6C0

Protein Details

Accession

Q6C6C0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
55-81	ETQSKHQKQLKTQPKVKEQTKVKEQTK	Hydrophilic
378-398	AINCLTKWRHDWKKHGWKTSE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
173-173	K

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 8.5, nucl 7.5, mito 7, cyto 6.5, pero 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009027 Ribosomal_L9/RNase_H1_N IPR011320 RNase_H1_N IPR037056 RNase_H1_N_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity GO:0043137 P:DNA replication, removal of RNA primer GO:0090502 P:RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic
KEGG	yli:YALI0E10725g -
Pfam	View protein in Pfam PF01693 Cauli_VI PF00075 RNase_H
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1
CDD	cd09280 RNase_HI_eukaryote_like

Amino Acid Sequences

MPKKFYAVRAGHKPGIYDYADAQKQVRGYSRSDWKGFNVLQDATDYLHATKSESETQSKHQKQLKTQPKVKEQTKVKEQTKVKEQTKVQTKAQNQSKSRPEAKSQPEAKTKTQSKTRDQSQTQSKLKFQDQPKTRDQSKSKDRSKTAVQSQVNHKTQSGVQPETKTGAKAKTKAKGKPEAETDIETATNELLSAQADVKSLTKALLEAQDRVKSHKQALQLARDNIKGGDSAEPKQSFYIVDCFIFDTREAAVMYYGGSKGVVKAASWDEATEKVRKAGYDQNHKAFSEDISYVNKQGNTVYQVFVDGACSNNGGPDAKAGYGLYFGENNPWNVAASVMGTVHTSQRAELQAIMKAYQVIEKKDNGHSYEIMSDSSYAINCLTKWRHDWKKHGWKTSEGKPVENVDLIQDCIKIMDRLVKRGIALKKVQAHGDSKGNKRADVLARQGVQVARGHVGGNDASKSWSVLGLSPVSK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.48
3	0.41
4	0.33
5	0.28
6	0.32
7	0.33
8	0.32
9	0.31
10	0.27
11	0.28
12	0.3
13	0.34
14	0.28
15	0.3
16	0.38
17	0.47
18	0.52
19	0.54
20	0.52
21	0.49
22	0.54
23	0.51
24	0.47
25	0.41
26	0.34
27	0.31
28	0.3
29	0.27
30	0.2
31	0.21
32	0.17
33	0.13
34	0.15
35	0.14
36	0.15
37	0.17
38	0.2
39	0.26
40	0.29
41	0.33
42	0.34
43	0.42
44	0.52
45	0.54
46	0.58
47	0.57
48	0.6
49	0.64
50	0.72
51	0.75
52	0.74
53	0.77
54	0.78
55	0.81
56	0.85
57	0.8
58	0.79
59	0.77
60	0.76
61	0.79
62	0.8
63	0.74
64	0.73
65	0.74
66	0.73
67	0.74
68	0.74
69	0.68
70	0.66
71	0.66
72	0.66
73	0.71
74	0.68
75	0.65
76	0.63
77	0.64
78	0.66
79	0.71
80	0.71
81	0.64
82	0.67
83	0.69
84	0.69
85	0.71
86	0.65
87	0.62
88	0.62
89	0.65
90	0.67
91	0.65
92	0.64
93	0.66
94	0.67
95	0.65
96	0.66
97	0.66
98	0.63
99	0.66
100	0.65
101	0.66
102	0.7
103	0.73
104	0.73
105	0.69
106	0.7
107	0.71
108	0.74
109	0.72
110	0.67
111	0.62
112	0.58
113	0.59
114	0.58
115	0.54
116	0.54
117	0.55
118	0.58
119	0.62
120	0.64
121	0.64
122	0.65
123	0.65
124	0.65
125	0.68
126	0.72
127	0.72
128	0.73
129	0.71
130	0.67
131	0.7
132	0.68
133	0.65
134	0.64
135	0.58
136	0.56
137	0.62
138	0.66
139	0.61
140	0.54
141	0.46
142	0.39
143	0.38
144	0.39
145	0.36
146	0.3
147	0.31
148	0.31
149	0.32
150	0.33
151	0.31
152	0.25
153	0.23
154	0.27
155	0.28
156	0.33
157	0.38
158	0.44
159	0.5
160	0.54
161	0.58
162	0.61
163	0.58
164	0.57
165	0.55
166	0.51
167	0.46
168	0.42
169	0.36
170	0.26
171	0.24
172	0.19
173	0.14
174	0.1
175	0.07
176	0.05
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.05
181	0.05
182	0.06
183	0.06
184	0.07
185	0.08
186	0.08
187	0.08
188	0.07
189	0.07
190	0.06
191	0.08
192	0.12
193	0.13
194	0.15
195	0.18
196	0.22
197	0.22
198	0.27
199	0.3
200	0.27
201	0.29
202	0.3
203	0.31
204	0.35
205	0.39
206	0.41
207	0.42
208	0.43
209	0.42
210	0.39
211	0.36
212	0.28
213	0.24
214	0.16
215	0.12
216	0.14
217	0.14
218	0.15
219	0.21
220	0.21
221	0.21
222	0.21
223	0.2
224	0.15
225	0.14
226	0.15
227	0.11
228	0.1
229	0.1
230	0.11
231	0.11
232	0.11
233	0.1
234	0.07
235	0.07
236	0.08
237	0.08
238	0.07
239	0.07
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.07
249	0.07
250	0.06
251	0.09
252	0.1
253	0.11
254	0.11
255	0.11
256	0.1
257	0.13
258	0.15
259	0.16
260	0.15
261	0.16
262	0.17
263	0.17
264	0.19
265	0.23
266	0.29
267	0.37
268	0.42
269	0.45
270	0.46
271	0.46
272	0.44
273	0.37
274	0.3
275	0.22
276	0.18
277	0.14
278	0.16
279	0.17
280	0.17
281	0.19
282	0.19
283	0.16
284	0.16
285	0.16
286	0.16
287	0.17
288	0.16
289	0.14
290	0.14
291	0.14
292	0.13
293	0.12
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.07
299	0.08
300	0.09
301	0.08
302	0.07
303	0.08
304	0.09
305	0.08
306	0.09
307	0.09
308	0.08
309	0.08
310	0.09
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.13
315	0.15
316	0.15
317	0.15
318	0.15
319	0.14
320	0.13
321	0.13
322	0.08
323	0.07
324	0.07
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.07
329	0.08
330	0.1
331	0.1
332	0.09
333	0.13
334	0.15
335	0.15
336	0.17
337	0.17
338	0.18
339	0.19
340	0.19
341	0.16
342	0.15
343	0.14
344	0.16
345	0.18
346	0.19
347	0.22
348	0.24
349	0.28
350	0.33
351	0.37
352	0.35
353	0.35
354	0.32
355	0.3
356	0.3
357	0.27
358	0.21
359	0.17
360	0.15
361	0.13
362	0.13
363	0.11
364	0.09
365	0.09
366	0.1
367	0.1
368	0.17
369	0.19
370	0.22
371	0.29
372	0.38
373	0.48
374	0.55
375	0.64
376	0.68
377	0.76
378	0.81
379	0.84
380	0.77
381	0.76
382	0.75
383	0.75
384	0.74
385	0.64
386	0.58
387	0.52
388	0.52
389	0.46
390	0.39
391	0.3
392	0.24
393	0.23
394	0.23
395	0.2
396	0.16
397	0.13
398	0.13
399	0.15
400	0.12
401	0.12
402	0.2
403	0.21
404	0.26
405	0.3
406	0.3
407	0.29
408	0.37
409	0.41
410	0.4
411	0.42
412	0.44
413	0.48
414	0.5
415	0.53
416	0.49
417	0.47
418	0.44
419	0.49
420	0.5
421	0.49
422	0.55
423	0.52
424	0.48
425	0.47
426	0.5
427	0.48
428	0.48
429	0.48
430	0.47
431	0.47
432	0.46
433	0.48
434	0.41
435	0.36
436	0.31
437	0.27
438	0.21
439	0.2
440	0.21
441	0.17
442	0.19
443	0.18
444	0.18
445	0.17
446	0.16
447	0.17
448	0.17
449	0.17
450	0.15
451	0.15
452	0.14
453	0.15
454	0.18

Q6C6C0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer