Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A074X7E2

Protein Details
Accession A0A074X7E2    Localization Confidence High Confidence Score 25.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-56QGAIRRRKPTGPFAPKPSRNQAKRPPAPPPQKLTHydrophilic
392-424EEQLEKKKEREEKKKAKKLRKKLVKIEKNYEYDBasic
508-529GSESINHKRMKKQHRHNMSGAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-52RRRKPTGPFAPKPSRNQAKRPPAPPP
176-184AKKRQPFKK
397-416KKKEREEKKKAKKLRKKLVK
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF05793  TFIIF_alpha  
Amino Acid Sequences MSALPSGVSPASRQPSTTPNNGQGAIRRRKPTGPFAPKPSRNQAKRPPAPPPQKLTGATKPLAATAVQSQPEPEDDPSTYNEIPLKATKKALLEGLRFHAIKFISNNVVNPYDKEQFERPVKLHRRFPQDTPNMPVDANPEDDKEREKEAIRKAEKAAEREATQAQIAPTDKAAAAKKRQPFKKKTEDVYYPTDTPEAQKRARLRYEEGRPWHLEDFENKNIWIGTYEEPLSESNVMFVFDNGSFRMVPIEKWYRFNPTGRVPLLSLVEAEAFMEKREKNPRWFMDNEHGREKKRAELARQERLTRGRVGTRGENRVKDEDDDDNENVDVADDVDELDFEAEDEFQDDDEGKLFGDDEEEAKEAASKIKKERHEANIFAGTGVKDEKDWYEEEQLEKKKEREEKKKAKKLRKKLVKIEKNYEYDDDESDNPYSEEEESDDSDIERQREEDERKKEEELKANGDKQASQMSTNANTPSGRAEKHGGLQPKPSMSSLKRPGSPNLSETSGSESINHKRMKKQHRHNMSGAASPMGRLAGSGSDTETERRSRPMTLNPRSAPGSPGNATPIGSRAGSPVPMPTADEIRAAVPPTGISIPDLIARFREQVPRTKDGNRAFIQLVLSVARVKPDDRSLVCLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.37
3 0.43
4 0.5
5 0.48
6 0.49
7 0.53
8 0.53
9 0.52
10 0.5
11 0.55
12 0.56
13 0.58
14 0.56
15 0.56
16 0.62
17 0.66
18 0.69
19 0.69
20 0.7
21 0.7
22 0.75
23 0.81
24 0.81
25 0.83
26 0.83
27 0.83
28 0.79
29 0.81
30 0.82
31 0.82
32 0.84
33 0.82
34 0.8
35 0.8
36 0.83
37 0.81
38 0.78
39 0.73
40 0.71
41 0.69
42 0.67
43 0.65
44 0.61
45 0.54
46 0.5
47 0.43
48 0.38
49 0.35
50 0.27
51 0.21
52 0.19
53 0.24
54 0.22
55 0.21
56 0.21
57 0.22
58 0.24
59 0.25
60 0.21
61 0.19
62 0.19
63 0.21
64 0.23
65 0.28
66 0.25
67 0.25
68 0.26
69 0.23
70 0.25
71 0.3
72 0.31
73 0.28
74 0.31
75 0.32
76 0.32
77 0.33
78 0.37
79 0.36
80 0.36
81 0.36
82 0.38
83 0.4
84 0.38
85 0.36
86 0.33
87 0.27
88 0.28
89 0.26
90 0.25
91 0.26
92 0.27
93 0.29
94 0.28
95 0.32
96 0.29
97 0.3
98 0.31
99 0.3
100 0.3
101 0.32
102 0.32
103 0.37
104 0.42
105 0.45
106 0.41
107 0.46
108 0.55
109 0.59
110 0.64
111 0.64
112 0.68
113 0.67
114 0.71
115 0.71
116 0.7
117 0.66
118 0.62
119 0.57
120 0.48
121 0.44
122 0.39
123 0.32
124 0.25
125 0.24
126 0.2
127 0.19
128 0.2
129 0.21
130 0.23
131 0.22
132 0.23
133 0.24
134 0.26
135 0.31
136 0.38
137 0.47
138 0.46
139 0.48
140 0.47
141 0.51
142 0.51
143 0.48
144 0.45
145 0.38
146 0.36
147 0.36
148 0.35
149 0.28
150 0.24
151 0.22
152 0.17
153 0.17
154 0.17
155 0.15
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.16
160 0.21
161 0.24
162 0.3
163 0.36
164 0.43
165 0.51
166 0.59
167 0.66
168 0.69
169 0.72
170 0.77
171 0.78
172 0.78
173 0.77
174 0.75
175 0.7
176 0.68
177 0.62
178 0.52
179 0.45
180 0.38
181 0.3
182 0.26
183 0.3
184 0.29
185 0.26
186 0.31
187 0.35
188 0.42
189 0.47
190 0.48
191 0.46
192 0.49
193 0.56
194 0.59
195 0.58
196 0.55
197 0.52
198 0.51
199 0.47
200 0.39
201 0.32
202 0.3
203 0.32
204 0.31
205 0.3
206 0.27
207 0.26
208 0.25
209 0.23
210 0.18
211 0.14
212 0.12
213 0.13
214 0.13
215 0.12
216 0.14
217 0.14
218 0.14
219 0.12
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.08
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.12
234 0.1
235 0.1
236 0.16
237 0.24
238 0.25
239 0.29
240 0.3
241 0.34
242 0.36
243 0.39
244 0.37
245 0.34
246 0.39
247 0.36
248 0.36
249 0.29
250 0.28
251 0.27
252 0.21
253 0.16
254 0.1
255 0.09
256 0.08
257 0.07
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.09
262 0.09
263 0.15
264 0.24
265 0.29
266 0.34
267 0.42
268 0.45
269 0.47
270 0.48
271 0.47
272 0.47
273 0.5
274 0.48
275 0.48
276 0.48
277 0.44
278 0.47
279 0.44
280 0.39
281 0.39
282 0.39
283 0.35
284 0.43
285 0.48
286 0.53
287 0.54
288 0.51
289 0.47
290 0.46
291 0.44
292 0.36
293 0.31
294 0.25
295 0.25
296 0.27
297 0.3
298 0.32
299 0.38
300 0.39
301 0.39
302 0.39
303 0.39
304 0.37
305 0.31
306 0.28
307 0.22
308 0.2
309 0.21
310 0.19
311 0.17
312 0.16
313 0.15
314 0.12
315 0.1
316 0.07
317 0.04
318 0.04
319 0.03
320 0.04
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.04
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.06
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.07
351 0.12
352 0.14
353 0.16
354 0.22
355 0.29
356 0.33
357 0.38
358 0.45
359 0.49
360 0.52
361 0.5
362 0.48
363 0.45
364 0.41
365 0.35
366 0.29
367 0.2
368 0.15
369 0.14
370 0.1
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.09
375 0.1
376 0.12
377 0.16
378 0.17
379 0.2
380 0.26
381 0.3
382 0.32
383 0.35
384 0.34
385 0.36
386 0.44
387 0.51
388 0.55
389 0.62
390 0.69
391 0.77
392 0.85
393 0.88
394 0.9
395 0.91
396 0.91
397 0.91
398 0.9
399 0.88
400 0.89
401 0.91
402 0.89
403 0.86
404 0.84
405 0.8
406 0.73
407 0.65
408 0.56
409 0.48
410 0.4
411 0.34
412 0.28
413 0.21
414 0.19
415 0.18
416 0.16
417 0.13
418 0.12
419 0.12
420 0.1
421 0.09
422 0.08
423 0.1
424 0.1
425 0.11
426 0.11
427 0.1
428 0.13
429 0.16
430 0.15
431 0.14
432 0.13
433 0.15
434 0.22
435 0.29
436 0.35
437 0.39
438 0.44
439 0.46
440 0.49
441 0.53
442 0.52
443 0.54
444 0.49
445 0.5
446 0.51
447 0.51
448 0.5
449 0.44
450 0.38
451 0.31
452 0.33
453 0.26
454 0.21
455 0.2
456 0.21
457 0.22
458 0.24
459 0.23
460 0.19
461 0.18
462 0.18
463 0.21
464 0.21
465 0.2
466 0.21
467 0.24
468 0.24
469 0.29
470 0.34
471 0.34
472 0.32
473 0.37
474 0.37
475 0.36
476 0.35
477 0.32
478 0.34
479 0.32
480 0.4
481 0.44
482 0.47
483 0.5
484 0.52
485 0.56
486 0.56
487 0.55
488 0.48
489 0.42
490 0.38
491 0.33
492 0.31
493 0.32
494 0.27
495 0.24
496 0.24
497 0.25
498 0.28
499 0.36
500 0.4
501 0.37
502 0.43
503 0.53
504 0.62
505 0.68
506 0.73
507 0.76
508 0.82
509 0.85
510 0.81
511 0.8
512 0.71
513 0.65
514 0.54
515 0.46
516 0.35
517 0.28
518 0.25
519 0.16
520 0.12
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.09
525 0.09
526 0.09
527 0.11
528 0.12
529 0.15
530 0.17
531 0.2
532 0.2
533 0.25
534 0.26
535 0.29
536 0.34
537 0.42
538 0.49
539 0.54
540 0.62
541 0.59
542 0.61
543 0.59
544 0.55
545 0.49
546 0.42
547 0.39
548 0.31
549 0.31
550 0.3
551 0.28
552 0.27
553 0.24
554 0.22
555 0.18
556 0.17
557 0.16
558 0.15
559 0.16
560 0.17
561 0.17
562 0.17
563 0.17
564 0.17
565 0.19
566 0.18
567 0.2
568 0.19
569 0.2
570 0.18
571 0.17
572 0.19
573 0.19
574 0.17
575 0.13
576 0.12
577 0.14
578 0.15
579 0.14
580 0.12
581 0.12
582 0.12
583 0.16
584 0.17
585 0.15
586 0.17
587 0.19
588 0.21
589 0.24
590 0.33
591 0.32
592 0.41
593 0.47
594 0.51
595 0.53
596 0.56
597 0.61
598 0.59
599 0.65
600 0.58
601 0.55
602 0.5
603 0.47
604 0.42
605 0.34
606 0.29
607 0.2
608 0.19
609 0.17
610 0.17
611 0.18
612 0.18
613 0.19
614 0.22
615 0.27
616 0.35
617 0.33