Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CHT5

Protein Details
Accession Q6CHT5    Localization Confidence High Confidence Score 24
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MSKQTSRKGKKAWRKNIDLEDLNHydrophilic
59-81DVETYHSKKKEKRLKSDEILARRBasic
84-106VPGVIGKKTKKEKKMSKEQLDMLHydrophilic
318-349NAPAKEKRKSMAKRRQMREHKEKERIRKQMKMBasic
430-464RSLQQRGKIEARKRHNLKPRYKKKVTEKWSFKDFKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-100KKKEKRLKSDEILARRSAVPGVIGKKTKKEKKMSK
321-356AKEKRKSMAKRRQMREHKEKERIRKQMKMEMKKIHE
434-456QRGKIEARKRHNLKPRYKKKVTE
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG yli:YALI0A05181g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MSKQTSRKGKKAWRKNIDLEDLNAGLDSARENERQFGSKNLEQAGDALFTVDTAGTSGDVETYHSKKKEKRLKSDEILARRSAVPGVIGKKTKKEKKMSKEQLDMLLKKAGRRDVDNKMTEAALQADSVLETPVYDAWDEAPAPVVPKKKTITASKVVKPRSEFQGFPQSMTKVKNAGSRVAYMPKSAKPENIMRATFANGDHREATSRTRSTVRPSTLDHKPLVFGATDKAIEVPHEGRSYNPSLEAWQALLKEELAKEEALEEERLQLEADQARVQHLMDTMEDHEDKQMDYSSEEEEEEASDEELEGGSVGLSINAPAKEKRKSMAKRRQMREHKEKERIRKQMKMEMKKIHEKMQQLAKRSEKSEQEKQDLKDLIAGGEAAEKVRTRRYGKYEILEPTLDVKLSGELTDSLRRLKPEGSLMRDRFRSLQQRGKIEARKRHNLKPRYKKKVTEKWSFKDFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.89
3 0.87
4 0.85
5 0.77
6 0.68
7 0.62
8 0.52
9 0.43
10 0.33
11 0.24
12 0.15
13 0.12
14 0.11
15 0.09
16 0.13
17 0.16
18 0.17
19 0.22
20 0.26
21 0.29
22 0.3
23 0.33
24 0.38
25 0.38
26 0.41
27 0.38
28 0.36
29 0.32
30 0.32
31 0.27
32 0.19
33 0.16
34 0.13
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.08
39 0.06
40 0.05
41 0.06
42 0.05
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.09
48 0.15
49 0.19
50 0.26
51 0.3
52 0.38
53 0.44
54 0.55
55 0.62
56 0.67
57 0.74
58 0.75
59 0.81
60 0.8
61 0.83
62 0.8
63 0.78
64 0.72
65 0.61
66 0.54
67 0.45
68 0.4
69 0.3
70 0.23
71 0.17
72 0.18
73 0.22
74 0.25
75 0.3
76 0.32
77 0.4
78 0.5
79 0.57
80 0.61
81 0.68
82 0.72
83 0.76
84 0.86
85 0.88
86 0.86
87 0.84
88 0.78
89 0.77
90 0.75
91 0.65
92 0.56
93 0.51
94 0.43
95 0.38
96 0.4
97 0.36
98 0.3
99 0.36
100 0.4
101 0.43
102 0.51
103 0.51
104 0.48
105 0.43
106 0.41
107 0.34
108 0.29
109 0.21
110 0.12
111 0.1
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.05
118 0.04
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.08
130 0.1
131 0.14
132 0.19
133 0.18
134 0.24
135 0.26
136 0.29
137 0.35
138 0.41
139 0.44
140 0.48
141 0.54
142 0.56
143 0.61
144 0.59
145 0.57
146 0.53
147 0.5
148 0.49
149 0.45
150 0.39
151 0.37
152 0.45
153 0.41
154 0.39
155 0.38
156 0.31
157 0.31
158 0.32
159 0.29
160 0.21
161 0.23
162 0.26
163 0.25
164 0.28
165 0.26
166 0.26
167 0.27
168 0.3
169 0.28
170 0.25
171 0.26
172 0.25
173 0.29
174 0.28
175 0.27
176 0.25
177 0.31
178 0.35
179 0.37
180 0.34
181 0.3
182 0.3
183 0.29
184 0.26
185 0.21
186 0.22
187 0.18
188 0.19
189 0.19
190 0.18
191 0.19
192 0.18
193 0.21
194 0.21
195 0.21
196 0.21
197 0.24
198 0.25
199 0.3
200 0.36
201 0.35
202 0.31
203 0.34
204 0.38
205 0.39
206 0.41
207 0.35
208 0.28
209 0.26
210 0.24
211 0.21
212 0.15
213 0.11
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.15
228 0.17
229 0.15
230 0.15
231 0.12
232 0.13
233 0.13
234 0.13
235 0.1
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.1
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.04
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.04
304 0.07
305 0.08
306 0.1
307 0.14
308 0.19
309 0.24
310 0.26
311 0.3
312 0.37
313 0.46
314 0.56
315 0.63
316 0.68
317 0.74
318 0.8
319 0.87
320 0.87
321 0.88
322 0.88
323 0.88
324 0.87
325 0.87
326 0.86
327 0.86
328 0.85
329 0.86
330 0.81
331 0.78
332 0.74
333 0.73
334 0.76
335 0.74
336 0.73
337 0.71
338 0.71
339 0.73
340 0.71
341 0.7
342 0.65
343 0.58
344 0.57
345 0.59
346 0.56
347 0.52
348 0.56
349 0.55
350 0.55
351 0.54
352 0.54
353 0.53
354 0.57
355 0.61
356 0.61
357 0.62
358 0.64
359 0.63
360 0.64
361 0.56
362 0.49
363 0.43
364 0.36
365 0.28
366 0.21
367 0.19
368 0.11
369 0.12
370 0.12
371 0.08
372 0.1
373 0.11
374 0.13
375 0.19
376 0.27
377 0.29
378 0.37
379 0.44
380 0.51
381 0.56
382 0.59
383 0.6
384 0.57
385 0.56
386 0.48
387 0.41
388 0.36
389 0.31
390 0.26
391 0.19
392 0.15
393 0.13
394 0.13
395 0.13
396 0.11
397 0.11
398 0.15
399 0.21
400 0.21
401 0.25
402 0.27
403 0.29
404 0.3
405 0.3
406 0.31
407 0.35
408 0.41
409 0.44
410 0.52
411 0.55
412 0.6
413 0.6
414 0.59
415 0.53
416 0.54
417 0.56
418 0.55
419 0.59
420 0.59
421 0.64
422 0.67
423 0.73
424 0.73
425 0.72
426 0.73
427 0.73
428 0.77
429 0.77
430 0.81
431 0.81
432 0.83
433 0.84
434 0.86
435 0.88
436 0.88
437 0.9
438 0.9
439 0.9
440 0.91
441 0.89
442 0.89
443 0.88
444 0.85