Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C707

Protein Details
Accession Q6C707    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
216-238DDIFSTKKKTKKNIEKPRVVEENHydrophilic
301-325ILDSTDGMKKKKKKSKKNAIDDIFGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
278-287KDKKKKNPAS
292-317LEPPKKKKKILDSTDGMKKKKKKSKK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 9.5, cyto 6.5, plas 3, mito 2, pero 1, E.R. 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047205  RMP1  
IPR047204  RMP1_RBD  
Gene Ontology GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000294  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, RNase MRP-dependent  
KEGG yli:YALI0E04741g  -  
CDD cd22573  RMP1_RBD  
Amino Acid Sequences MLSVYADQHREAPFPKKAYKAELQKTTENAGLGLQVSEFLSEAEIIHSLYYRYRNAHHCAEWFRPFSMLHRRVSQVANWIVDLHKATKKRAPRLITAIKISIQKIQTRYLQPAFWSFYSVLALGQYVTVGFALLGTVARIASLLAQVHPIPRTVGKVLDAAVKKGAEVMSDDIGEVLVRVTSEKPAKSDKIKKMTKSTVTKTTTGGKKLLKNMDIDDIFSTKKKTKKNIEKPRVVEENVEESIITNDDIEDNSMLTEPAPKAKKVKVAKVENFFEESKDKKKKNPASLDDSLEPPKKKKKILDSTDGMKKKKKKSKKNAIDDIFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.48
3 0.51
4 0.52
5 0.56
6 0.61
7 0.64
8 0.65
9 0.68
10 0.67
11 0.65
12 0.64
13 0.6
14 0.53
15 0.42
16 0.33
17 0.24
18 0.2
19 0.16
20 0.13
21 0.1
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.07
26 0.06
27 0.06
28 0.06
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.08
35 0.08
36 0.12
37 0.16
38 0.18
39 0.21
40 0.26
41 0.33
42 0.38
43 0.44
44 0.43
45 0.45
46 0.47
47 0.51
48 0.52
49 0.48
50 0.42
51 0.38
52 0.35
53 0.36
54 0.41
55 0.4
56 0.37
57 0.39
58 0.4
59 0.42
60 0.44
61 0.39
62 0.36
63 0.35
64 0.32
65 0.27
66 0.26
67 0.23
68 0.23
69 0.22
70 0.18
71 0.2
72 0.22
73 0.25
74 0.3
75 0.38
76 0.45
77 0.52
78 0.52
79 0.52
80 0.59
81 0.63
82 0.61
83 0.55
84 0.48
85 0.43
86 0.42
87 0.37
88 0.33
89 0.28
90 0.29
91 0.29
92 0.31
93 0.34
94 0.34
95 0.39
96 0.36
97 0.34
98 0.31
99 0.32
100 0.31
101 0.25
102 0.24
103 0.19
104 0.17
105 0.17
106 0.16
107 0.12
108 0.08
109 0.08
110 0.06
111 0.05
112 0.04
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.02
119 0.02
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.07
133 0.07
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.16
146 0.16
147 0.14
148 0.15
149 0.14
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.07
154 0.08
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.04
167 0.04
168 0.09
169 0.12
170 0.13
171 0.15
172 0.2
173 0.24
174 0.32
175 0.41
176 0.45
177 0.52
178 0.57
179 0.59
180 0.63
181 0.66
182 0.66
183 0.64
184 0.61
185 0.6
186 0.58
187 0.55
188 0.49
189 0.51
190 0.46
191 0.41
192 0.42
193 0.37
194 0.38
195 0.44
196 0.47
197 0.41
198 0.38
199 0.37
200 0.38
201 0.33
202 0.3
203 0.24
204 0.2
205 0.19
206 0.18
207 0.2
208 0.19
209 0.25
210 0.31
211 0.39
212 0.49
213 0.6
214 0.7
215 0.78
216 0.83
217 0.86
218 0.83
219 0.82
220 0.76
221 0.66
222 0.57
223 0.48
224 0.43
225 0.34
226 0.3
227 0.22
228 0.16
229 0.16
230 0.14
231 0.12
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.11
244 0.1
245 0.18
246 0.21
247 0.23
248 0.28
249 0.32
250 0.41
251 0.44
252 0.53
253 0.55
254 0.63
255 0.68
256 0.71
257 0.71
258 0.64
259 0.61
260 0.52
261 0.45
262 0.4
263 0.36
264 0.38
265 0.45
266 0.46
267 0.5
268 0.6
269 0.67
270 0.73
271 0.79
272 0.77
273 0.76
274 0.77
275 0.75
276 0.67
277 0.61
278 0.58
279 0.54
280 0.5
281 0.49
282 0.53
283 0.54
284 0.59
285 0.64
286 0.68
287 0.72
288 0.77
289 0.79
290 0.76
291 0.77
292 0.8
293 0.78
294 0.72
295 0.7
296 0.71
297 0.72
298 0.76
299 0.78
300 0.8
301 0.84
302 0.9
303 0.93
304 0.95
305 0.95