Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C6D1

Protein Details
Accession Q6C6D1    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-38AHIKKHGRRLDHDERKRKREAREGHRISKDBasic
134-158MFKVLKSGKRRNKSWKRMITKHTFVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-66KKHGRRLDHDERKRKREAREGHRISKDAQNLTGFRAKMFAKKRYAEKVAMKKKIR
139-150KSGKRRNKSWKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039411  NSA2_fam  
IPR022309  Ribosomal_S8e/biogenesis_NSA2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
KEGG yli:YALI0E10461g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01201  Ribosomal_S8e  
CDD cd11381  NSA2  
Amino Acid Sequences MPQNEYIEAHIKKHGRRLDHDERKRKREAREGHRISKDAQNLTGFRAKMFAKKRYAEKVAMKKKIREHEQSKVNGTPKEHNPEDGDALPTYLLDRQQPNSAKALSSSIKQKRLEKADKFSVPLPKVRGISEEEMFKVLKSGKRRNKSWKRMITKHTFVGEGFTRRPVKLERIIRPSALRQKKANVTHPELGVTVHLPILGVKKNPQSPMYTQLGVLTRGTIIEVNVSELGLVTAGGKVVWGKYAQITNEPDRDGCVNAVLLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.47
3 0.53
4 0.61
5 0.65
6 0.7
7 0.77
8 0.79
9 0.83
10 0.84
11 0.87
12 0.83
13 0.8
14 0.8
15 0.79
16 0.79
17 0.8
18 0.82
19 0.81
20 0.79
21 0.73
22 0.66
23 0.62
24 0.59
25 0.5
26 0.45
27 0.41
28 0.36
29 0.39
30 0.41
31 0.34
32 0.27
33 0.29
34 0.26
35 0.3
36 0.36
37 0.4
38 0.42
39 0.48
40 0.54
41 0.59
42 0.63
43 0.62
44 0.64
45 0.67
46 0.69
47 0.73
48 0.71
49 0.69
50 0.71
51 0.73
52 0.72
53 0.71
54 0.68
55 0.67
56 0.7
57 0.68
58 0.65
59 0.61
60 0.58
61 0.51
62 0.47
63 0.46
64 0.44
65 0.48
66 0.44
67 0.41
68 0.38
69 0.37
70 0.37
71 0.3
72 0.26
73 0.18
74 0.17
75 0.14
76 0.12
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.11
81 0.13
82 0.15
83 0.22
84 0.25
85 0.26
86 0.27
87 0.27
88 0.23
89 0.21
90 0.24
91 0.18
92 0.18
93 0.25
94 0.29
95 0.35
96 0.39
97 0.43
98 0.46
99 0.54
100 0.61
101 0.56
102 0.57
103 0.57
104 0.55
105 0.52
106 0.48
107 0.46
108 0.38
109 0.37
110 0.33
111 0.29
112 0.29
113 0.27
114 0.26
115 0.22
116 0.23
117 0.21
118 0.19
119 0.16
120 0.16
121 0.16
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.14
126 0.21
127 0.31
128 0.39
129 0.46
130 0.53
131 0.63
132 0.71
133 0.78
134 0.81
135 0.81
136 0.81
137 0.82
138 0.83
139 0.8
140 0.73
141 0.67
142 0.58
143 0.49
144 0.39
145 0.35
146 0.3
147 0.24
148 0.21
149 0.23
150 0.24
151 0.23
152 0.26
153 0.25
154 0.28
155 0.34
156 0.41
157 0.43
158 0.47
159 0.49
160 0.48
161 0.48
162 0.49
163 0.51
164 0.51
165 0.48
166 0.44
167 0.49
168 0.56
169 0.6
170 0.62
171 0.59
172 0.58
173 0.57
174 0.54
175 0.49
176 0.4
177 0.34
178 0.26
179 0.18
180 0.12
181 0.08
182 0.07
183 0.06
184 0.07
185 0.11
186 0.13
187 0.14
188 0.18
189 0.25
190 0.29
191 0.33
192 0.34
193 0.35
194 0.35
195 0.41
196 0.41
197 0.35
198 0.31
199 0.31
200 0.31
201 0.28
202 0.25
203 0.18
204 0.13
205 0.12
206 0.13
207 0.1
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.06
218 0.06
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.04
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.14
230 0.19
231 0.21
232 0.26
233 0.32
234 0.36
235 0.4
236 0.4
237 0.36
238 0.35
239 0.35
240 0.3
241 0.25
242 0.2