Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CGL6

Protein Details
Accession Q6CGL6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
355-385FASNPLYEDKPKPRRNNGKTRGGAKKRGGKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
364-385KPKPRRNNGKTRGGAKKRGGKR
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto_nucl 9, cyto 6, mito 5, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024337  tRNA_splic_suSen54  
IPR024336  tRNA_splic_suSen54_N  
Gene Ontology GO:0000214  C:tRNA-intron endonuclease complex  
GO:0090502  P:RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic  
GO:0000379  P:tRNA-type intron splice site recognition and cleavage  
KEGG yli:YALI0A18293g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12928  tRNA_int_end_N2  
Amino Acid Sequences MEDDTIDLADEQQDWSFLDAISGTKTTSPHDNNQSLPKRGEKDFEQDDTDYQQKVLQSSLDAMYGALGGERRHNAKNHVRAVWFDELQKAQVDVARGPHFKTIGTSDSQGKVWLYPEETIYLLERGSMELFWPNGVQISLQGAYAVCAGKMGEDGIDKIHTYSHLKRAGFVVQRAYQQSPPSVSVSRDRPLGSSSFSLFSYSWIYRFNVHNIPFLWTHPRQLIFGVYNDRDQIYRDLQLVQAYRHGGPRMSLETAAENPFKVTYFVWKPRAADFKKSSPPPPDFKIVVVNTERQNMPTLEQTEQLFEEAVRRHENGDVLDQRHIMQKLKFGKREIILAMLDYGVINFVTLADVSFASNPLYEDKPKPRRNNGKTRGGAKKRGGKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.12
3 0.12
4 0.1
5 0.11
6 0.1
7 0.11
8 0.13
9 0.12
10 0.11
11 0.13
12 0.14
13 0.17
14 0.26
15 0.3
16 0.36
17 0.45
18 0.48
19 0.5
20 0.6
21 0.65
22 0.61
23 0.59
24 0.58
25 0.54
26 0.53
27 0.54
28 0.48
29 0.49
30 0.49
31 0.48
32 0.45
33 0.41
34 0.4
35 0.39
36 0.38
37 0.3
38 0.25
39 0.24
40 0.21
41 0.21
42 0.2
43 0.16
44 0.14
45 0.16
46 0.16
47 0.14
48 0.13
49 0.11
50 0.1
51 0.1
52 0.08
53 0.06
54 0.07
55 0.07
56 0.11
57 0.15
58 0.19
59 0.24
60 0.27
61 0.35
62 0.43
63 0.52
64 0.54
65 0.56
66 0.53
67 0.5
68 0.53
69 0.5
70 0.41
71 0.33
72 0.31
73 0.27
74 0.27
75 0.26
76 0.2
77 0.15
78 0.15
79 0.16
80 0.13
81 0.18
82 0.23
83 0.23
84 0.24
85 0.26
86 0.25
87 0.23
88 0.24
89 0.22
90 0.19
91 0.2
92 0.21
93 0.22
94 0.24
95 0.24
96 0.23
97 0.2
98 0.18
99 0.17
100 0.17
101 0.15
102 0.14
103 0.14
104 0.14
105 0.14
106 0.13
107 0.13
108 0.12
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.05
125 0.08
126 0.08
127 0.07
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.09
132 0.08
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.08
148 0.13
149 0.16
150 0.23
151 0.28
152 0.28
153 0.29
154 0.3
155 0.35
156 0.33
157 0.31
158 0.28
159 0.25
160 0.28
161 0.29
162 0.3
163 0.25
164 0.24
165 0.24
166 0.2
167 0.2
168 0.2
169 0.19
170 0.18
171 0.2
172 0.23
173 0.23
174 0.23
175 0.22
176 0.2
177 0.2
178 0.2
179 0.17
180 0.14
181 0.14
182 0.13
183 0.12
184 0.13
185 0.12
186 0.12
187 0.14
188 0.13
189 0.13
190 0.14
191 0.15
192 0.16
193 0.18
194 0.21
195 0.23
196 0.24
197 0.26
198 0.25
199 0.27
200 0.24
201 0.24
202 0.27
203 0.21
204 0.22
205 0.22
206 0.22
207 0.2
208 0.2
209 0.21
210 0.15
211 0.17
212 0.2
213 0.18
214 0.18
215 0.18
216 0.18
217 0.15
218 0.16
219 0.17
220 0.14
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.16
225 0.19
226 0.18
227 0.15
228 0.16
229 0.16
230 0.17
231 0.19
232 0.19
233 0.16
234 0.16
235 0.18
236 0.18
237 0.17
238 0.17
239 0.14
240 0.15
241 0.17
242 0.19
243 0.17
244 0.14
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.11
250 0.15
251 0.23
252 0.3
253 0.35
254 0.37
255 0.38
256 0.43
257 0.53
258 0.48
259 0.5
260 0.48
261 0.51
262 0.57
263 0.6
264 0.6
265 0.57
266 0.6
267 0.56
268 0.55
269 0.53
270 0.46
271 0.43
272 0.45
273 0.38
274 0.38
275 0.34
276 0.35
277 0.31
278 0.34
279 0.33
280 0.26
281 0.29
282 0.24
283 0.23
284 0.24
285 0.25
286 0.22
287 0.25
288 0.24
289 0.23
290 0.23
291 0.21
292 0.15
293 0.12
294 0.16
295 0.16
296 0.19
297 0.2
298 0.2
299 0.21
300 0.23
301 0.25
302 0.22
303 0.28
304 0.3
305 0.29
306 0.31
307 0.3
308 0.29
309 0.33
310 0.34
311 0.3
312 0.26
313 0.32
314 0.4
315 0.49
316 0.53
317 0.5
318 0.55
319 0.52
320 0.54
321 0.48
322 0.41
323 0.32
324 0.27
325 0.25
326 0.17
327 0.16
328 0.11
329 0.09
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.07
340 0.08
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.1
345 0.11
346 0.14
347 0.18
348 0.22
349 0.3
350 0.4
351 0.5
352 0.59
353 0.68
354 0.75
355 0.82
356 0.88
357 0.91
358 0.9
359 0.9
360 0.88
361 0.88
362 0.88
363 0.85
364 0.84
365 0.82