FuNGI

Q6CD04

Protein Details

Accession

Q6CD04

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
29-68	PENTPSKSFLKRERRDKSEFETPKKKPCSKTVFSRRSPSE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 18, nucl 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003593 AAA+_ATPase IPR032423 AAA_assoc_2 IPR008921 DNA_pol3_clamp-load_cplx_C IPR021886 MgsA_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR006642 Rad18_UBZ4 IPR008824 RuvB-like_N
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0008047 F:enzyme activator activity GO:0009378 F:four-way junction helicase activity GO:0046872 F:metal ion binding GO:0017116 F:single-stranded DNA helicase activity GO:0006310 P:DNA recombination GO:0033567 P:DNA replication, Okazaki fragment processing GO:0000731 P:DNA synthesis involved in DNA repair GO:0006261 P:DNA-templated DNA replication GO:0006282 P:regulation of DNA repair
KEGG	yli:YALI0C05038g -
Pfam	View protein in Pfam PF16193 AAA_assoc_2 PF12002 MgsA_C PF05496 RuvB_N
CDD	cd00009 AAA cd18139 HLD_clamp_RarA

Amino Acid Sequences

MVSCPVCGKSVDLARVNAHLDEGCPDEAPENTPSKSFLKRERRDKSEFETPKKKPCSKTVFSRRSPSESESDFTQRQRMTLGPKPEGRKLDFGAPASVDPSPAAPPTPAAPKSAATKEPARHTPLPELCRPQTLDDISGQKELMAVLRRFVAYGRIPSIIFWGPPGVGKTTLARILAKTSGNRFVELSATQNNVADVKKVIDQANNEWKLLKRGTILFIDELHRFSKAQQDVLLPAVEKGDITLIGATTENPSFRLVGALTSRCRVLTLKKLSMKDIKEVVERSLVKYNDTAEHEVILPTEVIDYIAGIADGDVRSALNILELVVSVCDIVEEQPEKAVEEEKPEETKDTTTEACAANDTTDATNEATPDDSAILSDSEAAENPASSSQDASSQLTVTASPPKRYRTTTLREIKNVIRRTHVLYDKNGDNHYDAISAFHKSIRGSDPDATLFYLGKMLKSGEDPLYIARRMVRIASEDIGLADDSLLPLCTAAYTGIQQVGMPEGDCILAHAAVKLALADKSVKVYKAWGMVKEALSDEHGLLAAEIPIHLRNAPTKLMKELGYGKEYKYNPRFLGGKVKQDYMPEGYENVKFMPERHLGTEIDPELEGEIIDEETEAEYYGGVMI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.4
3	0.4
4	0.32
5	0.27
6	0.21
7	0.17
8	0.17
9	0.19
10	0.17
11	0.15
12	0.15
13	0.15
14	0.16
15	0.18
16	0.2
17	0.21
18	0.22
19	0.22
20	0.25
21	0.29
22	0.36
23	0.4
24	0.45
25	0.52
26	0.61
27	0.71
28	0.78
29	0.81
30	0.8
31	0.8
32	0.77
33	0.77
34	0.76
35	0.75
36	0.76
37	0.73
38	0.76
39	0.8
40	0.8
41	0.76
42	0.77
43	0.77
44	0.74
45	0.8
46	0.81
47	0.82
48	0.8
49	0.83
50	0.78
51	0.75
52	0.71
53	0.64
54	0.6
55	0.53
56	0.48
57	0.43
58	0.45
59	0.43
60	0.4
61	0.43
62	0.36
63	0.33
64	0.33
65	0.33
66	0.33
67	0.36
68	0.42
69	0.43
70	0.49
71	0.54
72	0.58
73	0.6
74	0.57
75	0.55
76	0.5
77	0.5
78	0.47
79	0.44
80	0.39
81	0.34
82	0.3
83	0.27
84	0.24
85	0.17
86	0.13
87	0.13
88	0.12
89	0.11
90	0.12
91	0.1
92	0.12
93	0.14
94	0.22
95	0.22
96	0.22
97	0.23
98	0.25
99	0.31
100	0.35
101	0.34
102	0.31
103	0.37
104	0.4
105	0.46
106	0.49
107	0.51
108	0.5
109	0.51
110	0.56
111	0.56
112	0.56
113	0.55
114	0.56
115	0.5
116	0.51
117	0.49
118	0.42
119	0.41
120	0.37
121	0.33
122	0.29
123	0.32
124	0.29
125	0.28
126	0.25
127	0.19
128	0.17
129	0.16
130	0.16
131	0.19
132	0.17
133	0.17
134	0.19
135	0.19
136	0.19
137	0.19
138	0.21
139	0.17
140	0.2
141	0.21
142	0.21
143	0.21
144	0.21
145	0.25
146	0.2
147	0.17
148	0.14
149	0.13
150	0.11
151	0.13
152	0.15
153	0.12
154	0.12
155	0.13
156	0.14
157	0.16
158	0.18
159	0.18
160	0.18
161	0.16
162	0.18
163	0.21
164	0.22
165	0.22
166	0.24
167	0.3
168	0.3
169	0.3
170	0.28
171	0.25
172	0.25
173	0.22
174	0.21
175	0.16
176	0.17
177	0.16
178	0.16
179	0.16
180	0.15
181	0.15
182	0.13
183	0.11
184	0.11
185	0.13
186	0.16
187	0.18
188	0.19
189	0.21
190	0.27
191	0.36
192	0.36
193	0.33
194	0.32
195	0.31
196	0.33
197	0.31
198	0.26
199	0.19
200	0.2
201	0.22
202	0.22
203	0.22
204	0.18
205	0.19
206	0.2
207	0.18
208	0.18
209	0.15
210	0.15
211	0.13
212	0.13
213	0.2
214	0.19
215	0.19
216	0.2
217	0.2
218	0.21
219	0.22
220	0.22
221	0.13
222	0.12
223	0.11
224	0.09
225	0.07
226	0.06
227	0.05
228	0.04
229	0.04
230	0.05
231	0.04
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.07
236	0.08
237	0.07
238	0.08
239	0.09
240	0.09
241	0.08
242	0.09
243	0.08
244	0.09
245	0.12
246	0.14
247	0.15
248	0.15
249	0.15
250	0.14
251	0.15
252	0.15
253	0.16
254	0.23
255	0.29
256	0.35
257	0.4
258	0.41
259	0.45
260	0.5
261	0.47
262	0.41
263	0.38
264	0.32
265	0.3
266	0.3
267	0.27
268	0.27
269	0.26
270	0.24
271	0.27
272	0.25
273	0.23
274	0.23
275	0.23
276	0.21
277	0.23
278	0.23
279	0.16
280	0.17
281	0.16
282	0.15
283	0.14
284	0.1
285	0.07
286	0.05
287	0.05
288	0.04
289	0.04
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.02
296	0.02
297	0.03
298	0.03
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.04
304	0.04
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.02
316	0.03
317	0.03
318	0.05
319	0.06
320	0.06
321	0.07
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.1
326	0.08
327	0.12
328	0.14
329	0.15
330	0.16
331	0.16
332	0.17
333	0.16
334	0.16
335	0.13
336	0.14
337	0.12
338	0.12
339	0.14
340	0.13
341	0.12
342	0.12
343	0.11
344	0.09
345	0.09
346	0.1
347	0.07
348	0.07
349	0.08
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.08
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.1
377	0.12
378	0.13
379	0.12
380	0.12
381	0.12
382	0.11
383	0.11
384	0.1
385	0.17
386	0.18
387	0.23
388	0.26
389	0.31
390	0.35
391	0.38
392	0.44
393	0.43
394	0.48
395	0.54
396	0.6
397	0.6
398	0.58
399	0.59
400	0.59
401	0.59
402	0.58
403	0.49
404	0.44
405	0.41
406	0.44
407	0.47
408	0.48
409	0.42
410	0.39
411	0.43
412	0.42
413	0.43
414	0.39
415	0.32
416	0.27
417	0.24
418	0.22
419	0.17
420	0.13
421	0.13
422	0.13
423	0.13
424	0.12
425	0.12
426	0.13
427	0.13
428	0.16
429	0.17
430	0.2
431	0.22
432	0.24
433	0.25
434	0.24
435	0.25
436	0.22
437	0.19
438	0.16
439	0.12
440	0.14
441	0.12
442	0.11
443	0.11
444	0.12
445	0.12
446	0.13
447	0.16
448	0.13
449	0.14
450	0.14
451	0.17
452	0.21
453	0.2
454	0.19
455	0.18
456	0.18
457	0.18
458	0.18
459	0.17
460	0.15
461	0.18
462	0.18
463	0.16
464	0.15
465	0.14
466	0.14
467	0.12
468	0.09
469	0.07
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.04
475	0.04
476	0.04
477	0.04
478	0.05
479	0.05
480	0.06
481	0.07
482	0.08
483	0.09
484	0.09
485	0.09
486	0.09
487	0.1
488	0.1
489	0.09
490	0.08
491	0.07
492	0.07
493	0.07
494	0.08
495	0.07
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.07
500	0.07
501	0.08
502	0.07
503	0.08
504	0.07
505	0.08
506	0.1
507	0.1
508	0.16
509	0.19
510	0.19
511	0.18
512	0.21
513	0.23
514	0.29
515	0.33
516	0.29
517	0.32
518	0.36
519	0.36
520	0.35
521	0.32
522	0.25
523	0.23
524	0.22
525	0.17
526	0.13
527	0.12
528	0.1
529	0.09
530	0.09
531	0.07
532	0.06
533	0.06
534	0.07
535	0.08
536	0.09
537	0.1
538	0.11
539	0.15
540	0.18
541	0.24
542	0.28
543	0.29
544	0.32
545	0.35
546	0.34
547	0.34
548	0.39
549	0.38
550	0.38
551	0.37
552	0.35
553	0.4
554	0.42
555	0.48
556	0.47
557	0.49
558	0.46
559	0.5
560	0.51
561	0.45
562	0.54
563	0.49
564	0.53
565	0.49
566	0.51
567	0.47
568	0.47
569	0.49
570	0.42
571	0.39
572	0.3
573	0.29
574	0.28
575	0.28
576	0.26
577	0.23
578	0.22
579	0.2
580	0.2
581	0.25
582	0.27
583	0.29
584	0.31
585	0.33
586	0.31
587	0.32
588	0.38
589	0.31
590	0.28
591	0.25
592	0.22
593	0.19
594	0.18
595	0.15
596	0.08
597	0.08
598	0.07
599	0.07
600	0.06
601	0.06
602	0.07
603	0.07
604	0.07
605	0.06
606	0.06

Q6CD04

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer