Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A074WHE3

Protein Details
Accession A0A074WHE3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MGKNKKKRKDPAPHARRAAPSEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-20KNKKKRKDPAPHARRAAP
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11, cyto 6, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MGKNKKKRKDPAPHARRAAPSERRQVISYDDIEGEAAPPIPRQKVSYGSDDNDDEGDHAPDQRHAVVSKEALKERERPQTDVTYGQVGAFPGLDPRDKDVFYGPANDGLDYLRMVRSEARGIPHIVRAPPPQPPQPIDYEDDDYEEHVDDYGGYYEEDSEGEDQDGWYEDGAYVAPPIAAPVIGPVQPGIKAQDAFYNYLEACFETLRRNLRASPSVQAVQILDDQHPISLPSGNKMADKEWKYHLLNTTPLPAQLASLDSPSILRLLKLVEGQLENCRKSNIPKNLGLWAWSLLAKLDDVGLLQTREVSVVRDLAKMAIWVRMMHHKAKHGRSNDPDYEHIDNYPDENAAQHEEGEVVDADQADATAAGAPEVKSVEDALAAQIQKEIAPEQDAQGDIAMDLDSEDQLSDAIAAKKRELQTQAEAEAKKENQKQEEFPDTNTCVTIDMLVTVASEFYGQKDLLVGRLPWDHPTTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.86
3 0.81
4 0.77
5 0.76
6 0.74
7 0.73
8 0.73
9 0.72
10 0.68
11 0.63
12 0.58
13 0.53
14 0.49
15 0.42
16 0.34
17 0.28
18 0.25
19 0.24
20 0.23
21 0.17
22 0.12
23 0.12
24 0.1
25 0.12
26 0.16
27 0.2
28 0.21
29 0.24
30 0.27
31 0.33
32 0.37
33 0.42
34 0.43
35 0.42
36 0.45
37 0.43
38 0.4
39 0.32
40 0.28
41 0.21
42 0.17
43 0.16
44 0.13
45 0.14
46 0.14
47 0.16
48 0.18
49 0.18
50 0.2
51 0.18
52 0.2
53 0.22
54 0.25
55 0.3
56 0.34
57 0.36
58 0.38
59 0.4
60 0.46
61 0.49
62 0.55
63 0.51
64 0.49
65 0.5
66 0.53
67 0.52
68 0.46
69 0.41
70 0.34
71 0.31
72 0.27
73 0.23
74 0.17
75 0.15
76 0.12
77 0.1
78 0.1
79 0.12
80 0.14
81 0.14
82 0.19
83 0.22
84 0.22
85 0.23
86 0.23
87 0.25
88 0.24
89 0.27
90 0.23
91 0.24
92 0.24
93 0.23
94 0.2
95 0.17
96 0.16
97 0.12
98 0.13
99 0.09
100 0.09
101 0.1
102 0.12
103 0.14
104 0.17
105 0.19
106 0.21
107 0.22
108 0.25
109 0.26
110 0.28
111 0.29
112 0.27
113 0.28
114 0.3
115 0.3
116 0.35
117 0.38
118 0.4
119 0.41
120 0.42
121 0.41
122 0.41
123 0.42
124 0.37
125 0.35
126 0.33
127 0.28
128 0.28
129 0.25
130 0.2
131 0.18
132 0.15
133 0.12
134 0.08
135 0.08
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.03
167 0.03
168 0.04
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.15
181 0.16
182 0.17
183 0.17
184 0.17
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.1
189 0.09
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.13
194 0.17
195 0.19
196 0.2
197 0.21
198 0.25
199 0.28
200 0.27
201 0.26
202 0.25
203 0.24
204 0.22
205 0.21
206 0.17
207 0.14
208 0.15
209 0.13
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.1
218 0.09
219 0.1
220 0.12
221 0.13
222 0.14
223 0.14
224 0.15
225 0.19
226 0.21
227 0.22
228 0.23
229 0.28
230 0.28
231 0.31
232 0.32
233 0.26
234 0.28
235 0.25
236 0.26
237 0.2
238 0.19
239 0.17
240 0.13
241 0.11
242 0.09
243 0.1
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.06
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.1
260 0.11
261 0.17
262 0.21
263 0.21
264 0.21
265 0.22
266 0.21
267 0.26
268 0.35
269 0.37
270 0.38
271 0.4
272 0.42
273 0.44
274 0.43
275 0.38
276 0.3
277 0.22
278 0.17
279 0.14
280 0.12
281 0.09
282 0.09
283 0.07
284 0.06
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.07
298 0.11
299 0.12
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.13
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.13
310 0.21
311 0.24
312 0.28
313 0.3
314 0.35
315 0.43
316 0.5
317 0.56
318 0.52
319 0.57
320 0.59
321 0.64
322 0.61
323 0.56
324 0.51
325 0.48
326 0.47
327 0.4
328 0.33
329 0.27
330 0.22
331 0.2
332 0.18
333 0.13
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.12
338 0.12
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.09
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.07
358 0.07
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.12
372 0.12
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.09
377 0.12
378 0.13
379 0.13
380 0.15
381 0.15
382 0.14
383 0.14
384 0.12
385 0.09
386 0.09
387 0.08
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.09
399 0.14
400 0.18
401 0.2
402 0.21
403 0.28
404 0.31
405 0.36
406 0.37
407 0.37
408 0.4
409 0.43
410 0.45
411 0.45
412 0.44
413 0.38
414 0.41
415 0.39
416 0.41
417 0.43
418 0.46
419 0.48
420 0.52
421 0.56
422 0.56
423 0.64
424 0.56
425 0.53
426 0.54
427 0.48
428 0.44
429 0.4
430 0.33
431 0.23
432 0.22
433 0.19
434 0.12
435 0.1
436 0.09
437 0.08
438 0.08
439 0.07
440 0.07
441 0.06
442 0.07
443 0.07
444 0.08
445 0.12
446 0.12
447 0.12
448 0.15
449 0.16
450 0.17
451 0.21
452 0.19
453 0.19
454 0.25
455 0.26
456 0.28