Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C1X4

Protein Details
Accession Q6C1X4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
414-447SEVEMPQPSKKQQKKAAKAARKNKKVKVTIEKDNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
423-440KKQQKKAAKAARKNKKVK
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 10.333, nucl 6.5, cyto_nucl 5.833, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
KEGG yli:YALI0F12661g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MSKITKPKSALKGSKSDKKQVKMAAEAVEKIVAEKPVEETPADLSKTIVSTSSSTSSVDPAFRIVTGSYEHNLFCVSLLLGTSPVFSPIFHFTPHIQSIKCLATSGRYLVSGSADENIRIYDLQKRKELGTLTHHSGTITALEFYKRKWLLTAGEDGKIFVLRTKDWEVLAELKGHARAAVGKAKVGVVDISVHPTGRLALSVGQDRKLILWNLMTAKKASVMACYPDVLKVAWNLAGDRYAVTYTTSISFFSPETGKLIGAIRSPKDGLYHSEYVSIDGKEYFAFSNSRGVIRFVDTNEFEGKTNDTKNEFKTEDEDIDTISFKVQPHATRVKDFSFLIPDNVPEADRHVYMTSVSTDSKLVITDMNTRETVGAYNTGDRLNCCVMVQEDVEMEIKKALPIPESDHDMSASESEVEMPQPSKKQQKKAAKAARKNKKVKVTIEKDN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.77
3 0.78
4 0.76
5 0.73
6 0.74
7 0.71
8 0.68
9 0.64
10 0.61
11 0.58
12 0.52
13 0.48
14 0.41
15 0.35
16 0.29
17 0.25
18 0.23
19 0.18
20 0.16
21 0.15
22 0.18
23 0.19
24 0.21
25 0.19
26 0.17
27 0.2
28 0.24
29 0.25
30 0.21
31 0.19
32 0.19
33 0.2
34 0.19
35 0.16
36 0.13
37 0.14
38 0.17
39 0.19
40 0.18
41 0.19
42 0.19
43 0.21
44 0.21
45 0.2
46 0.17
47 0.16
48 0.16
49 0.15
50 0.16
51 0.13
52 0.12
53 0.13
54 0.16
55 0.15
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.16
60 0.14
61 0.12
62 0.1
63 0.09
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.07
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.12
75 0.17
76 0.18
77 0.18
78 0.2
79 0.2
80 0.26
81 0.31
82 0.32
83 0.26
84 0.27
85 0.3
86 0.3
87 0.28
88 0.23
89 0.18
90 0.18
91 0.2
92 0.2
93 0.17
94 0.15
95 0.15
96 0.15
97 0.16
98 0.13
99 0.11
100 0.12
101 0.12
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.17
109 0.22
110 0.27
111 0.3
112 0.32
113 0.32
114 0.36
115 0.37
116 0.32
117 0.34
118 0.36
119 0.36
120 0.36
121 0.35
122 0.31
123 0.29
124 0.25
125 0.19
126 0.14
127 0.1
128 0.09
129 0.11
130 0.12
131 0.12
132 0.21
133 0.2
134 0.19
135 0.2
136 0.22
137 0.23
138 0.25
139 0.33
140 0.26
141 0.28
142 0.27
143 0.26
144 0.23
145 0.2
146 0.18
147 0.12
148 0.12
149 0.1
150 0.15
151 0.18
152 0.19
153 0.18
154 0.19
155 0.19
156 0.2
157 0.2
158 0.17
159 0.14
160 0.13
161 0.14
162 0.13
163 0.11
164 0.08
165 0.09
166 0.11
167 0.16
168 0.15
169 0.15
170 0.16
171 0.16
172 0.16
173 0.14
174 0.11
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.05
187 0.07
188 0.09
189 0.15
190 0.16
191 0.16
192 0.16
193 0.16
194 0.16
195 0.17
196 0.15
197 0.11
198 0.1
199 0.11
200 0.15
201 0.16
202 0.16
203 0.14
204 0.13
205 0.13
206 0.15
207 0.13
208 0.11
209 0.1
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.08
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.11
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.12
247 0.11
248 0.13
249 0.16
250 0.15
251 0.16
252 0.17
253 0.16
254 0.16
255 0.16
256 0.18
257 0.21
258 0.23
259 0.21
260 0.24
261 0.24
262 0.24
263 0.25
264 0.21
265 0.15
266 0.13
267 0.13
268 0.1
269 0.11
270 0.09
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.15
275 0.15
276 0.16
277 0.16
278 0.17
279 0.17
280 0.18
281 0.2
282 0.15
283 0.19
284 0.18
285 0.2
286 0.21
287 0.21
288 0.19
289 0.18
290 0.19
291 0.18
292 0.2
293 0.21
294 0.23
295 0.26
296 0.28
297 0.34
298 0.32
299 0.29
300 0.3
301 0.3
302 0.27
303 0.26
304 0.23
305 0.17
306 0.17
307 0.17
308 0.13
309 0.11
310 0.12
311 0.1
312 0.14
313 0.17
314 0.19
315 0.25
316 0.33
317 0.35
318 0.38
319 0.41
320 0.39
321 0.38
322 0.37
323 0.32
324 0.3
325 0.28
326 0.26
327 0.23
328 0.22
329 0.2
330 0.2
331 0.18
332 0.12
333 0.15
334 0.15
335 0.14
336 0.15
337 0.14
338 0.14
339 0.14
340 0.15
341 0.14
342 0.14
343 0.14
344 0.13
345 0.13
346 0.13
347 0.13
348 0.12
349 0.11
350 0.1
351 0.12
352 0.19
353 0.21
354 0.23
355 0.23
356 0.23
357 0.23
358 0.22
359 0.21
360 0.14
361 0.16
362 0.14
363 0.16
364 0.17
365 0.18
366 0.19
367 0.18
368 0.21
369 0.2
370 0.19
371 0.17
372 0.17
373 0.17
374 0.18
375 0.18
376 0.15
377 0.13
378 0.13
379 0.16
380 0.14
381 0.13
382 0.12
383 0.12
384 0.12
385 0.16
386 0.16
387 0.16
388 0.18
389 0.24
390 0.26
391 0.33
392 0.34
393 0.31
394 0.3
395 0.28
396 0.27
397 0.21
398 0.18
399 0.11
400 0.1
401 0.1
402 0.11
403 0.11
404 0.13
405 0.14
406 0.18
407 0.23
408 0.31
409 0.41
410 0.49
411 0.58
412 0.66
413 0.75
414 0.8
415 0.86
416 0.89
417 0.89
418 0.91
419 0.92
420 0.93
421 0.92
422 0.92
423 0.89
424 0.89
425 0.86
426 0.86
427 0.86