Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C1T6

Protein Details
Accession Q6C1T6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-36ANPTQQPQHPHQHQHQHQHSLHydrophilic
361-381LKNVDRPPKWRSKLCQNWLRTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045877  ZFP36-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
KEGG yli:YALI0F13497g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MLMSFEYGDGKGGNPANPTQQPQHPHQHQHQHQHSLLAHPKPVSFASSTVSSMDGSAQSSPVGSTADLTASQNGAAPGTGSSKQHDRLFSGFLSRPTSTRISSPFSLGIKSDIWGDDSSTTSQTSASSTSKFAPFEAPTPSSSSGSTVSQPAAPVAPQQQQQGAPRPSVVAAMSQANDFPGIDISYLDDPAAAPGAAGSAHSSNFATHTNSSVSLSALGYGTGFGTPTSATVPPGAPNAAYFEEYPQQPFDPWGEDKRRGHMGGPMMQPNVHQANGMPPNGMPNPMAMQQPLANGMHMQGMMPQMAPVTPTAANAVPQQQPRRKANINSELYKTEMCSSFQKTGSCSYGEKCQFAHGEHELKNVDRPPKWRSKLCQNWLRTGTCAYNDRCCFKHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.24
3 0.31
4 0.34
5 0.39
6 0.39
7 0.43
8 0.46
9 0.5
10 0.58
11 0.59
12 0.63
13 0.68
14 0.73
15 0.75
16 0.8
17 0.81
18 0.78
19 0.71
20 0.7
21 0.62
22 0.6
23 0.59
24 0.52
25 0.48
26 0.41
27 0.4
28 0.36
29 0.35
30 0.29
31 0.23
32 0.2
33 0.2
34 0.21
35 0.21
36 0.19
37 0.19
38 0.16
39 0.14
40 0.15
41 0.12
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.09
54 0.1
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.11
61 0.1
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.11
66 0.14
67 0.13
68 0.17
69 0.22
70 0.28
71 0.32
72 0.33
73 0.32
74 0.32
75 0.34
76 0.31
77 0.32
78 0.29
79 0.28
80 0.31
81 0.28
82 0.27
83 0.28
84 0.31
85 0.26
86 0.27
87 0.28
88 0.29
89 0.29
90 0.31
91 0.31
92 0.29
93 0.28
94 0.25
95 0.23
96 0.18
97 0.17
98 0.16
99 0.12
100 0.13
101 0.12
102 0.13
103 0.12
104 0.13
105 0.14
106 0.13
107 0.13
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.15
116 0.17
117 0.2
118 0.2
119 0.19
120 0.2
121 0.2
122 0.21
123 0.24
124 0.23
125 0.21
126 0.24
127 0.25
128 0.22
129 0.21
130 0.2
131 0.17
132 0.17
133 0.17
134 0.14
135 0.13
136 0.13
137 0.13
138 0.11
139 0.1
140 0.09
141 0.1
142 0.12
143 0.16
144 0.17
145 0.18
146 0.2
147 0.23
148 0.26
149 0.33
150 0.31
151 0.27
152 0.26
153 0.25
154 0.23
155 0.2
156 0.17
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.05
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.08
193 0.1
194 0.09
195 0.11
196 0.11
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.1
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.1
221 0.11
222 0.11
223 0.08
224 0.08
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.15
231 0.16
232 0.17
233 0.15
234 0.14
235 0.14
236 0.15
237 0.14
238 0.14
239 0.16
240 0.23
241 0.28
242 0.35
243 0.36
244 0.39
245 0.42
246 0.39
247 0.37
248 0.34
249 0.33
250 0.33
251 0.35
252 0.33
253 0.29
254 0.28
255 0.28
256 0.28
257 0.25
258 0.18
259 0.15
260 0.12
261 0.19
262 0.24
263 0.24
264 0.2
265 0.18
266 0.22
267 0.23
268 0.24
269 0.16
270 0.13
271 0.15
272 0.17
273 0.18
274 0.13
275 0.14
276 0.14
277 0.15
278 0.16
279 0.14
280 0.12
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.09
290 0.09
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.09
296 0.08
297 0.09
298 0.11
299 0.12
300 0.13
301 0.15
302 0.2
303 0.22
304 0.29
305 0.38
306 0.42
307 0.5
308 0.55
309 0.61
310 0.63
311 0.65
312 0.69
313 0.7
314 0.71
315 0.67
316 0.65
317 0.58
318 0.53
319 0.45
320 0.37
321 0.31
322 0.26
323 0.24
324 0.26
325 0.29
326 0.33
327 0.36
328 0.36
329 0.33
330 0.37
331 0.37
332 0.34
333 0.31
334 0.28
335 0.35
336 0.36
337 0.36
338 0.31
339 0.34
340 0.34
341 0.33
342 0.37
343 0.33
344 0.37
345 0.36
346 0.41
347 0.37
348 0.36
349 0.4
350 0.4
351 0.42
352 0.4
353 0.44
354 0.48
355 0.57
356 0.64
357 0.67
358 0.69
359 0.72
360 0.79
361 0.84
362 0.84
363 0.78
364 0.8
365 0.77
366 0.71
367 0.62
368 0.56
369 0.5
370 0.47
371 0.49
372 0.43
373 0.47
374 0.5
375 0.52