Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CH80

Protein Details
Accession Q6CH80    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
303-329DEDVVRRVKRLKRNVEKKHKERETLGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-177KKSR
309-323RVKRLKRNVEKKHKE
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026846  Nse2(Mms21)  
IPR004181  Znf_MIZ  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0061665  F:SUMO ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
GO:0016925  P:protein sumoylation  
KEGG yli:YALI0A11517g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11789  zf-Nse  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51044  ZF_SP_RING  
CDD cd16651  SPL-RING_NSE2  
Amino Acid Sequences MTAIFTKEAANALKSHKAKENLGCESLTQQIHTLQTELLRLSRETVDAFDNDLDVESSDLPIYDRQSTISQLDRAATELALTQGRVDVHSDIFDKVVNQVTEASEKWVAWEKTNKEKENQSPDHTPDDDEQEGDGVKDANENAPKVPDITKLYATTLAKSLPEPTKKSRALMLKKSRDLRKHKETLLWMLMPEIDLGDSDKWWISLGSLVSKHVGREGLAPEPNGYGLSEDDSDDELFVSRKSNLKCPITRDYLENPVRAIVCKHLFSGEAFKQWLQQTQGRNQCPVAGCNNHLRRMADVEADEDVVRRVKRLKRNVEKKHKERETLGTQRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.37
3 0.41
4 0.44
5 0.49
6 0.54
7 0.58
8 0.54
9 0.54
10 0.5
11 0.43
12 0.4
13 0.39
14 0.32
15 0.24
16 0.2
17 0.21
18 0.23
19 0.23
20 0.22
21 0.17
22 0.18
23 0.19
24 0.19
25 0.17
26 0.17
27 0.17
28 0.19
29 0.18
30 0.18
31 0.17
32 0.18
33 0.18
34 0.17
35 0.18
36 0.15
37 0.14
38 0.13
39 0.12
40 0.11
41 0.08
42 0.09
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.08
48 0.1
49 0.12
50 0.13
51 0.14
52 0.16
53 0.17
54 0.2
55 0.22
56 0.24
57 0.23
58 0.21
59 0.22
60 0.2
61 0.2
62 0.18
63 0.15
64 0.11
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.09
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.13
77 0.14
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.11
83 0.16
84 0.14
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.16
89 0.16
90 0.17
91 0.14
92 0.13
93 0.15
94 0.22
95 0.21
96 0.23
97 0.3
98 0.31
99 0.41
100 0.5
101 0.5
102 0.46
103 0.52
104 0.56
105 0.59
106 0.59
107 0.53
108 0.5
109 0.51
110 0.52
111 0.45
112 0.39
113 0.3
114 0.31
115 0.26
116 0.21
117 0.18
118 0.14
119 0.13
120 0.11
121 0.1
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.09
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.12
131 0.12
132 0.13
133 0.14
134 0.14
135 0.16
136 0.18
137 0.19
138 0.19
139 0.19
140 0.23
141 0.22
142 0.19
143 0.16
144 0.14
145 0.13
146 0.13
147 0.16
148 0.17
149 0.22
150 0.25
151 0.29
152 0.37
153 0.37
154 0.38
155 0.39
156 0.42
157 0.45
158 0.51
159 0.57
160 0.55
161 0.6
162 0.67
163 0.68
164 0.68
165 0.69
166 0.68
167 0.68
168 0.66
169 0.63
170 0.6
171 0.56
172 0.52
173 0.47
174 0.38
175 0.28
176 0.23
177 0.2
178 0.15
179 0.13
180 0.07
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.07
193 0.08
194 0.11
195 0.11
196 0.12
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.1
203 0.13
204 0.15
205 0.17
206 0.18
207 0.19
208 0.17
209 0.17
210 0.17
211 0.14
212 0.12
213 0.08
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.1
228 0.16
229 0.18
230 0.26
231 0.33
232 0.4
233 0.44
234 0.48
235 0.53
236 0.54
237 0.53
238 0.5
239 0.46
240 0.49
241 0.49
242 0.44
243 0.37
244 0.33
245 0.32
246 0.28
247 0.25
248 0.22
249 0.23
250 0.23
251 0.23
252 0.21
253 0.22
254 0.22
255 0.29
256 0.24
257 0.24
258 0.25
259 0.24
260 0.29
261 0.3
262 0.33
263 0.3
264 0.33
265 0.36
266 0.43
267 0.53
268 0.5
269 0.51
270 0.46
271 0.46
272 0.44
273 0.4
274 0.39
275 0.34
276 0.34
277 0.42
278 0.47
279 0.47
280 0.48
281 0.46
282 0.41
283 0.42
284 0.41
285 0.34
286 0.29
287 0.25
288 0.23
289 0.23
290 0.2
291 0.16
292 0.15
293 0.17
294 0.17
295 0.18
296 0.25
297 0.33
298 0.43
299 0.53
300 0.63
301 0.69
302 0.8
303 0.88
304 0.91
305 0.94
306 0.93
307 0.94
308 0.91
309 0.87
310 0.81
311 0.79
312 0.78