Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CCH7

Protein Details
Accession Q6CCH7    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-91TEPQAEKKGKPARNPRPDRRSQTGKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-52KK
61-103NRSKSTEPQAEKKGKPARNPRPDRRSQTGKSDSAKKVGKGWGD
219-249SRGDRSDRAPRENRGGRDGKRGGDKKGFRTQ
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG yli:YALI0C09262g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSVSKNLYEILGNVEEDSNKVIVTKELTKNSGSSKKNAAPKDPGAAIGASKKSNQPLRDQNRSKSTEPQAEKKGKPARNPRPDRRSQTGKSDSAKKVGKGWGDSKGKLADEKAGDAIATKDEAEPETPVEAPVEEPDNTKTLEEYLAEQKAATAKLASGRSVRQANAGAESKYSEASKLDKDEVADLVAGTKAKNVRTRARKEKVLLEIEPAFPANRESRGDRSDRAPRENRGGRDGKRGGDKKGFRTQERKAPSVNLSSASDFPALGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.16
4 0.17
5 0.12
6 0.1
7 0.11
8 0.11
9 0.11
10 0.16
11 0.24
12 0.29
13 0.34
14 0.36
15 0.37
16 0.39
17 0.45
18 0.49
19 0.43
20 0.41
21 0.45
22 0.49
23 0.56
24 0.58
25 0.55
26 0.54
27 0.54
28 0.55
29 0.47
30 0.41
31 0.34
32 0.3
33 0.26
34 0.24
35 0.24
36 0.19
37 0.2
38 0.23
39 0.29
40 0.35
41 0.36
42 0.39
43 0.47
44 0.54
45 0.63
46 0.66
47 0.67
48 0.69
49 0.73
50 0.67
51 0.65
52 0.63
53 0.62
54 0.61
55 0.61
56 0.61
57 0.64
58 0.62
59 0.63
60 0.65
61 0.6
62 0.65
63 0.68
64 0.7
65 0.72
66 0.82
67 0.83
68 0.83
69 0.87
70 0.85
71 0.83
72 0.81
73 0.73
74 0.73
75 0.7
76 0.66
77 0.61
78 0.63
79 0.56
80 0.54
81 0.54
82 0.44
83 0.42
84 0.41
85 0.39
86 0.33
87 0.34
88 0.36
89 0.37
90 0.36
91 0.34
92 0.32
93 0.3
94 0.27
95 0.25
96 0.2
97 0.17
98 0.17
99 0.15
100 0.12
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.06
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.08
121 0.07
122 0.08
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.13
139 0.1
140 0.07
141 0.07
142 0.12
143 0.13
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.19
148 0.21
149 0.21
150 0.19
151 0.21
152 0.2
153 0.22
154 0.23
155 0.19
156 0.17
157 0.17
158 0.15
159 0.14
160 0.14
161 0.1
162 0.09
163 0.12
164 0.14
165 0.16
166 0.17
167 0.17
168 0.18
169 0.18
170 0.17
171 0.15
172 0.12
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.09
179 0.12
180 0.16
181 0.22
182 0.28
183 0.36
184 0.46
185 0.56
186 0.64
187 0.68
188 0.71
189 0.69
190 0.7
191 0.68
192 0.63
193 0.54
194 0.48
195 0.43
196 0.37
197 0.34
198 0.27
199 0.2
200 0.15
201 0.18
202 0.15
203 0.16
204 0.19
205 0.22
206 0.28
207 0.33
208 0.36
209 0.36
210 0.41
211 0.47
212 0.5
213 0.55
214 0.55
215 0.55
216 0.62
217 0.66
218 0.63
219 0.62
220 0.64
221 0.58
222 0.62
223 0.61
224 0.55
225 0.59
226 0.59
227 0.57
228 0.59
229 0.62
230 0.59
231 0.66
232 0.68
233 0.65
234 0.7
235 0.71
236 0.7
237 0.72
238 0.67
239 0.6
240 0.59
241 0.56
242 0.54
243 0.48
244 0.42
245 0.38
246 0.38
247 0.35
248 0.32
249 0.28