Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C7G1

Protein Details
Accession Q6C7G1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-268LGERDEKDKKKKGKKTNKINAERHTDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
249-260KDKKKKGKKTNK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 11, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044285  PWP1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG yli:YALI0E01100g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MISATKWVPRGYATEFPVKYTMDDEELERLSELAKLKIEEAKNEMEDIEDATEEDVEALEEKAKLDEEIDNDPDLKEFGFDTYDDEPDSKLGLEGDGMDTDDDEDEDEDENNEDEEGGELNLGSKHKVEGKDGEDPYISLPTQQDLDEEREELQILPTDNLILATKTEDEISHLEVYVYDPEEANLYVHHDIMLPSFPLCVEWVNYNPREQGPGNFAAIGTFEPEIEIWNLDVVDGVYPEVILGERDEKDKKKKGKKTNKINAERHTDAVLSLSSNPHHVNLLCSGSADTTVKLWDLSNGKAASSFTFHSDKVSAVQWNPVEGTVLLSGGYDKKAIVSDLRSEDKKVWKVDSDVESMNWKPCGTQFLVGTDSGMLYNFDVRNESKPLWTLQAHDSPLSAFDYNKYIDGAIVTSSASTREVKIWRETNKDDKYSLSMVANRDLSCGKVFSVGFNPDQACAGTLCAGGHGGELKVWDMFGTKAVREAFDIKSSNHSNDVIGQAFDDEEEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.41
3 0.43
4 0.44
5 0.4
6 0.34
7 0.29
8 0.27
9 0.21
10 0.22
11 0.21
12 0.22
13 0.22
14 0.22
15 0.2
16 0.17
17 0.14
18 0.17
19 0.18
20 0.16
21 0.18
22 0.18
23 0.21
24 0.28
25 0.3
26 0.29
27 0.32
28 0.34
29 0.32
30 0.31
31 0.29
32 0.23
33 0.21
34 0.19
35 0.15
36 0.1
37 0.1
38 0.09
39 0.09
40 0.08
41 0.07
42 0.06
43 0.05
44 0.06
45 0.06
46 0.08
47 0.08
48 0.09
49 0.1
50 0.11
51 0.1
52 0.11
53 0.14
54 0.15
55 0.19
56 0.21
57 0.21
58 0.21
59 0.21
60 0.2
61 0.17
62 0.14
63 0.1
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.13
69 0.15
70 0.16
71 0.16
72 0.16
73 0.15
74 0.14
75 0.15
76 0.11
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.12
113 0.17
114 0.19
115 0.22
116 0.25
117 0.29
118 0.37
119 0.37
120 0.37
121 0.31
122 0.3
123 0.27
124 0.24
125 0.2
126 0.13
127 0.13
128 0.12
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.17
134 0.17
135 0.17
136 0.17
137 0.16
138 0.17
139 0.15
140 0.13
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.07
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.07
156 0.1
157 0.11
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.06
188 0.07
189 0.08
190 0.12
191 0.18
192 0.19
193 0.19
194 0.21
195 0.2
196 0.23
197 0.22
198 0.2
199 0.19
200 0.2
201 0.19
202 0.18
203 0.17
204 0.13
205 0.13
206 0.11
207 0.07
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.06
232 0.07
233 0.1
234 0.14
235 0.19
236 0.27
237 0.35
238 0.44
239 0.51
240 0.6
241 0.69
242 0.76
243 0.82
244 0.86
245 0.87
246 0.89
247 0.89
248 0.86
249 0.8
250 0.77
251 0.68
252 0.58
253 0.48
254 0.38
255 0.28
256 0.22
257 0.16
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.09
263 0.1
264 0.09
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.12
269 0.13
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.09
274 0.1
275 0.09
276 0.07
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.1
283 0.11
284 0.12
285 0.17
286 0.17
287 0.16
288 0.17
289 0.17
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.12
294 0.15
295 0.15
296 0.16
297 0.16
298 0.16
299 0.15
300 0.17
301 0.16
302 0.14
303 0.19
304 0.17
305 0.17
306 0.17
307 0.15
308 0.13
309 0.11
310 0.12
311 0.07
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.1
324 0.11
325 0.15
326 0.19
327 0.24
328 0.24
329 0.25
330 0.3
331 0.35
332 0.39
333 0.37
334 0.35
335 0.33
336 0.34
337 0.39
338 0.38
339 0.33
340 0.28
341 0.27
342 0.27
343 0.26
344 0.27
345 0.21
346 0.17
347 0.15
348 0.15
349 0.19
350 0.18
351 0.2
352 0.18
353 0.2
354 0.22
355 0.21
356 0.2
357 0.15
358 0.13
359 0.1
360 0.09
361 0.07
362 0.06
363 0.11
364 0.11
365 0.11
366 0.13
367 0.15
368 0.18
369 0.22
370 0.23
371 0.2
372 0.22
373 0.23
374 0.26
375 0.25
376 0.25
377 0.26
378 0.31
379 0.31
380 0.29
381 0.27
382 0.22
383 0.23
384 0.22
385 0.17
386 0.12
387 0.12
388 0.15
389 0.16
390 0.16
391 0.15
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.11
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.09
403 0.1
404 0.11
405 0.16
406 0.21
407 0.25
408 0.33
409 0.39
410 0.44
411 0.5
412 0.55
413 0.59
414 0.62
415 0.62
416 0.55
417 0.5
418 0.48
419 0.42
420 0.39
421 0.33
422 0.29
423 0.28
424 0.32
425 0.33
426 0.29
427 0.29
428 0.27
429 0.25
430 0.22
431 0.21
432 0.16
433 0.18
434 0.18
435 0.19
436 0.24
437 0.26
438 0.25
439 0.28
440 0.29
441 0.24
442 0.25
443 0.22
444 0.17
445 0.14
446 0.14
447 0.11
448 0.11
449 0.1
450 0.1
451 0.1
452 0.09
453 0.09
454 0.1
455 0.09
456 0.08
457 0.09
458 0.1
459 0.1
460 0.09
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.14
465 0.16
466 0.15
467 0.2
468 0.22
469 0.23
470 0.24
471 0.28
472 0.26
473 0.29
474 0.32
475 0.28
476 0.35
477 0.39
478 0.38
479 0.38
480 0.36
481 0.3
482 0.32
483 0.35
484 0.28
485 0.24
486 0.21
487 0.18
488 0.17
489 0.16